More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_3270 on replicon NC_009373
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009373  OSTLU_3270  predicted protein  100 
 
 		 478 aa  956    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.37953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3255  DNA repair protein RadA  43.51 
 
 		 465 aa  384  1e-105  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0080  DNA repair protein RadA  42.57 
 
 		 484 aa  373  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0994  DNA repair protein RadA  43.6 
 
 		 457 aa  372  1e-102  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2341  DNA repair protein RadA  44.4 
 
 		 453 aa  374  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0130  DNA repair protein RadA  44.06 
 
 		 453 aa  372  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000766532  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0285  DNA repair protein RadA  45.4 
 
 		 450 aa  369  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0463822  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2764  DNA repair protein RadA  44.91 
 
 		 460 aa  372  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000385269  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3455  DNA repair protein RadA  46.23 
 
 		 462 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0396  DNA repair protein RadA  46.41 
 
 		 443 aa  367  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0184  DNA repair protein RadA  42.06 
 
 		 476 aa  366  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00274159  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0084  DNA repair protein RadA  41.6 
 
 		 457 aa  368  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.391084  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2017  DNA repair protein RadA  45.57 
 
 		 464 aa  366  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.404277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1188  DNA repair protein RadA  42.86 
 
 		 458 aa  363  3e-99  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1045  DNA repair protein RadA  42.74 
 
 		 454 aa  363  4e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.665867  normal  0.0445974 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1110  DNA repair protein RadA  42.74 
 
 		 454 aa  363  4e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1049  DNA repair protein RadA  42.74 
 
 		 454 aa  363  4e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.357607 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1226  DNA repair protein RadA  42.74 
 
 		 454 aa  363  5.0000000000000005e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0256  DNA repair protein RadA  40.37 
 
 		 457 aa  362  6e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00319082  normal  0.307702 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01540  DNA repair protein RadA  43.32 
 
 		 464 aa  362  6e-99  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.850923  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04265  predicted repair protein  42.15 
 
 		 460 aa  362  1e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04230  hypothetical protein  42.15 
 
 		 460 aa  362  1e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4938  DNA repair protein RadA  42.15 
 
 		 460 aa  362  1e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.664332 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2814  DNA repair protein RadA  42.32 
 
 		 454 aa  362  1e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4988  DNA repair protein RadA  42.15 
 
 		 460 aa  362  1e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3667  DNA repair protein RadA  42.15 
 
 		 460 aa  362  1e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.696085 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4936  DNA repair protein RadA  42.15 
 
 		 460 aa  362  1e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4624  DNA repair protein RadA  42.15 
 
 		 460 aa  362  1e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5903  DNA repair protein RadA  42.15 
 
 		 460 aa  362  1e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3219  DNA repair protein RadA  42.53 
 
 		 454 aa  360  2e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3219  DNA repair protein RadA  42.53 
 
 		 454 aa  361  2e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2490  DNA repair protein RadA  43.15 
 
 		 489 aa  360  2e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.858464  normal  0.0874227 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1148  DNA repair protein RadA  42.53 
 
 		 454 aa  360  2e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0384904 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3358  DNA repair protein RadA  42.53 
 
 		 454 aa  360  2e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.918494 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0077  DNA repair protein RadA  40.9 
 
 		 458 aa  360  3e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4991  DNA repair protein RadA  42.36 
 
 		 460 aa  360  3e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0422  DNA repair protein RadA  45.09 
 
 		 448 aa  360  4e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00757431  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4937  DNA repair protein RadA  42.36 
 
 		 460 aa  359  5e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4903  DNA repair protein RadA  42.36 
 
 		 460 aa  359  5e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4830  DNA repair protein RadA  42.36 
 
 		 460 aa  359  5e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3609  DNA repair protein RadA  41.94 
 
 		 460 aa  359  6e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002636  DNA repair protein RadA  42.47 
 
 		 459 aa  359  7e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00949545  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0227  DNA repair protein RadA  42.65 
 
 		 461 aa  358  8e-98  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5223  DNA repair protein RadA  40.98 
 
 		 458 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00190969  unclonable  1.94383e-25 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0110  DNA repair protein RadA  40.53 
 
 		 454 aa  358  1.9999999999999998e-97  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.242522  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4989  DNA repair protein RadA  42.36 
 
 		 460 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.541639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0667  DNA repair protein RadA  41.08 
 
 		 461 aa  358  1.9999999999999998e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0301  DNA repair protein RadA  39.55 
 
 		 457 aa  357  1.9999999999999998e-97  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_58  DNA repair protein RadA  41.3 
 
 		 462 aa  357  2.9999999999999997e-97  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03370  DNA repair protein RadA  42.27 
 
 		 459 aa  357  2.9999999999999997e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0400  DNA repair protein RadA  44.32 
 
 		 450 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000197198  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0082  DNA repair protein RadA  40.78 
 
 		 458 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0081  DNA repair protein RadA  40.78 
 
 		 458 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0103  DNA repair protein RadA  40.7 
 
 		 458 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00530334  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0058  DNA repair protein RadA  41.72 
 
 		 462 aa  356  5.999999999999999e-97  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0082  DNA repair protein RadA  40.78 
 
 		 458 aa  356  5.999999999999999e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0079  DNA repair protein RadA  40.78 
 
 		 458 aa  356  5.999999999999999e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0078  DNA repair protein RadA  40.78 
 
 		 458 aa  356  5.999999999999999e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0112  DNA repair protein RadA  40.78 
 
 		 458 aa  356  5.999999999999999e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.328977  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0092  DNA repair protein RadA  40.78 
 
 		 458 aa  356  5.999999999999999e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.92971e-61 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0548  DNA repair protein RadA  41.37 
 
 		 461 aa  355  7.999999999999999e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.342744 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0825  DNA repair protein RadA  41.82 
 
 		 460 aa  355  1e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3621  DNA repair protein RadA  41.82 
 
 		 460 aa  355  1e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3492  DNA repair protein RadA  41.82 
 
 		 460 aa  355  1e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1385  DNA repair protein RadA  43.49 
 
 		 447 aa  354  2e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.674348  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1145  DNA repair protein RadA  42.3 
 
 		 458 aa  354  2e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0077  DNA repair protein RadA  40.57 
 
 		 458 aa  354  2e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0052  DNA repair protein RadA  41.93 
 
 		 464 aa  354  2e-96  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.980062  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0125  DNA repair protein RadA  40.12 
 
 		 458 aa  354  2e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0390  DNA repair protein RadA  44.4 
 
 		 449 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0198908  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0251  DNA repair protein RadA  43.19 
 
 		 462 aa  353  2.9999999999999997e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336717  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0562  DNA repair protein RadA  41.27 
 
 		 454 aa  353  5e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0548  DNA repair protein RadA  41.27 
 
 		 454 aa  353  5e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0589  DNA repair protein RadA  43.27 
 
 		 451 aa  353  5e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.268839  hitchhiker  1.37134e-16 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1348  DNA repair protein RadA  42.86 
 
 		 460 aa  353  5e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0336  DNA repair protein RadA  39.83 
 
 		 459 aa  353  5e-96  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000102144 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0166  DNA repair protein RadA  40.82 
 
 		 457 aa  352  8e-96  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0836  DNA repair protein RadA  37.78 
 
 		 457 aa  352  8e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0984957  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3606  DNA repair protein RadA  45.61 
 
 		 462 aa  352  8.999999999999999e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1987  DNA repair protein RadA  44.01 
 
 		 453 aa  352  1e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.355792 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1786  DNA repair protein RadA  40.97 
 
 		 454 aa  351  1e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000301687  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3277  DNA repair protein RadA  42.39 
 
 		 449 aa  352  1e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.142573  normal  0.6246 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0318  DNA repair protein RadA  40.04 
 
 		 470 aa  352  1e-95  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02991  DNA repair protein RadA  40.12 
 
 		 455 aa  351  2e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2361  DNA repair protein RadA  40.71 
 
 		 453 aa  350  3e-95  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4206  DNA repair protein RadA  39.12 
 
 		 520 aa  350  3e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4772  DNA repair protein RadA  39.45 
 
 		 457 aa  350  3e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000283378 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0626  DNA repair protein RadA  40.62 
 
 		 459 aa  349  5e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.478337  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0731  DNA repair protein RadA  42.01 
 
 		 463 aa  349  8e-95  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0646  DNA repair protein RadA  42.01 
 
 		 463 aa  349  8e-95  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01480  putative DNA repair protein  38.33 
 
 		 453 aa  348  1e-94  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0510  DNA repair protein RadA  41.56 
 
 		 458 aa  348  1e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.150975  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0927  DNA repair protein RadA  39.09 
 
 		 482 aa  347  2e-94  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0827  DNA repair protein RadA  39.37 
 
 		 482 aa  348  2e-94  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3614  DNA repair protein RadA  38.84 
 
 		 455 aa  347  2e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.356128  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0449  DNA repair protein RadA  42.32 
 
 		 460 aa  347  3e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0204936  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3565  DNA repair protein RadA  46.04 
 
 		 471 aa  347  4e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.946618  normal  0.041039 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1487  DNA repair protein RadA  39.68 
 
 		 481 aa  346  5e-94  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.652724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3459  DNA repair protein RadA  40.21 
 
 		 452 aa  346  7e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.261832  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0546  DNA repair protein RadA  42.12 
 
 		 460 aa  345  8e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>