More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_31116 on replicon NC_009358
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009358  OSTLU_31116  Ribosomal protein L8, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  100 
 
 		 255 aa  521  1e-147  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.155376  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28234  predicted protein  63.14 
 
 		 257 aa  352  2e-96  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.638688  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28309  60S large subunit ribosomal protein L2A  67.98 
 
 		 254 aa  343  1e-93  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.24055 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86991  60S large subunit ribosomal protein L2B  67.98 
 
 		 254 aa  343  1e-93  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.32837 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02275  hypothetical protein similar to 60S ribosomal protein L2 (Broad)  64.03 
 
 		 254 aa  333  2e-90  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL03960  conserved hypothetical protein  63.92 
 
 		 255 aa  333  2e-90  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.139278  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0030  50S ribosomal protein L2P  46.75 
 
 		 240 aa  216  2e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.291148  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0794  50S ribosomal protein L2P  45.93 
 
 		 240 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.097706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1124  50S ribosomal protein L2P  45.53 
 
 		 240 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0860  50S ribosomal protein L2P  44.72 
 
 		 240 aa  209  5e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.480475  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0804  50S ribosomal protein L2P  45.53 
 
 		 240 aa  206  4e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.712432  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1725  50S ribosomal protein L2P  45.12 
 
 		 236 aa  202  5e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0310662  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0213  ribosomal protein L2  44.31 
 
 		 240 aa  201  8e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2221  ribosomal protein L2  43.53 
 
 		 240 aa  193  2e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1775  ribosomal protein L2  43.78 
 
 		 238 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1831  50S ribosomal protein L2P  44.83 
 
 		 240 aa  189  2.9999999999999997e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.548496 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2446  50S ribosomal protein L2P  42.61 
 
 		 240 aa  188  8e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0107  50S ribosomal protein L2P  41.13 
 
 		 238 aa  187  1e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0004  50S ribosomal protein L2P  41.46 
 
 		 237 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000454303  n/a   
 
 
 
NC_013158  Huta_2295  50S ribosomal protein L2P  43.91 
 
 		 242 aa  182  6e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1518  ribosomal protein L2  42.08 
 
 		 234 aa  177  1e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  6.90355e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0084  50S ribosomal protein L2P  41.13 
 
 		 240 aa  175  7e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.33391 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0227  50S ribosomal protein L2P  42.46 
 
 		 248 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0094  50S ribosomal protein L2P  42.11 
 
 		 238 aa  170  2e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000127555  unclonable  0.000000429528 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0018  50S ribosomal protein L2P  38.62 
 
 		 244 aa  168  7e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0445  50S ribosomal protein L2P  42.68 
 
 		 239 aa  166  4e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0154826  normal  0.478034 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0535  50S ribosomal protein L2P  38.71 
 
 		 238 aa  162  4.0000000000000004e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.393685  normal  0.694231 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0102  50S ribosomal protein L2P  39 
 
 		 244 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00140338 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0052  50S ribosomal protein L2P  39.02 
 
 		 246 aa  161  1e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.946037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0049  50S ribosomal protein L2P  39.43 
 
 		 245 aa  160  1e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0336538 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1094  50S ribosomal protein L2P  39.43 
 
 		 246 aa  160  2e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0567  50S ribosomal protein L2P  37.96 
 
 		 239 aa  157  2e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0425344  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2250  50S ribosomal protein L2P  38.27 
 
 		 236 aa  156  4e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000000353713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1278  50S ribosomal protein L2P  35.63 
 
 		 255 aa  140  9.999999999999999e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000789854 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0285  50S ribosomal protein L2  38.22 
 
 		 280 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2457  50S ribosomal protein L2  36.65 
 
 		 276 aa  108  6e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0871736 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3819  50S ribosomal protein L2  32.11 
 
 		 273 aa  107  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000104624  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4541  50S ribosomal protein L2  32.56 
 
 		 274 aa  107  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000106039  hitchhiker  0.00201461 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0761  50S ribosomal protein L2  33.33 
 
 		 277 aa  106  4e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000295488  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0870  50S ribosomal protein L2  35.68 
 
 		 275 aa  106  5e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000015035  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2531  50S ribosomal protein L2  36.32 
 
 		 279 aa  105  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.445887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0364  50S ribosomal protein L2  36.32 
 
 		 279 aa  105  7e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.838149  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0326  50S ribosomal protein L2  31.65 
 
 		 273 aa  105  7e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000291678  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1719  50S ribosomal protein L2  36.32 
 
 		 279 aa  105  7e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.238282  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0197  50S ribosomal protein L2  38.3 
 
 		 283 aa  105  7e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00345154  normal  0.0626583 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1521  ribosomal protein L2  35.94 
 
 		 275 aa  105  8e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3998  50S ribosomal protein L2  32.24 
 
 		 273 aa  105  9e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000302361  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0286  50S ribosomal protein L2  32.56 
 
 		 274 aa  104  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000315964  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0587  50S ribosomal protein L2  32.56 
 
 		 274 aa  104  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000050829  normal  0.227169 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3912  50S ribosomal protein L2  32.56 
 
 		 274 aa  104  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.5044e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2708  ribosomal protein L2  36.13 
 
 		 276 aa  104  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000275562  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2443  50S ribosomal protein L2  36.9 
 
 		 278 aa  103  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3804  50S ribosomal protein L2  31.78 
 
 		 273 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00899018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3633  50S ribosomal protein L2  31.78 
 
 		 273 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0350833  normal  0.361481 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3633  50S ribosomal protein L2  31.78 
 
 		 273 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000993877  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3741  50S ribosomal protein L2  31.78 
 
 		 273 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.69026  normal  0.0152471 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3706  50S ribosomal protein L2  31.78 
 
 		 273 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00279259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2165  50S ribosomal protein L2  36.9 
 
 		 278 aa  103  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.219576 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03168  50S ribosomal protein L2  31.78 
 
 		 273 aa  103  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00146365  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0396  ribosomal protein L2  31.78 
 
 		 273 aa  103  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000401214  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0396  50S ribosomal protein L2  31.78 
 
 		 273 aa  103  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000072222  hitchhiker  0.000353424 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3511  50S ribosomal protein L2  31.78 
 
 		 273 aa  103  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112597  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1742  50S ribosomal protein L2  35.47 
 
 		 276 aa  103  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000110614  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0718  ribosomal protein L2  36.27 
 
 		 273 aa  103  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03119  hypothetical protein  31.78 
 
 		 273 aa  103  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00128631  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3612  50S ribosomal protein L2  31.78 
 
 		 273 aa  103  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000120655  hitchhiker  0.00428222 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3800  50S ribosomal protein L2  31.78 
 
 		 273 aa  103  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000757775  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0331  50S ribosomal protein L2  33.33 
 
 		 272 aa  103  3e-21  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0408  50S ribosomal protein L2  31.19 
 
 		 273 aa  103  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00399178  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4640  50S ribosomal protein L2  31.78 
 
 		 273 aa  103  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0685659  normal  0.0584567 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3702  50S ribosomal protein L2  31.78 
 
 		 273 aa  103  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237187  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2739  50S ribosomal protein L2  32.09 
 
 		 278 aa  102  5e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.236416  normal  0.312063 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2906  50S ribosomal protein L2  35.29 
 
 		 275 aa  102  5e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0172805  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3748  50S ribosomal protein L2  31.31 
 
 		 273 aa  102  7e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000108731  hitchhiker  0.00494792 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29034  Putative mitochondrial ribosomal protein L2  31.75 
 
 		 283 aa  102  8e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0175318  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1070  50S ribosomal protein L2  36.51 
 
 		 274 aa  102  9e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000147453  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0487  50S ribosomal protein L2  32.88 
 
 		 275 aa  101  9e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000349566  normal  0.0292595 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01200  50S ribosomal protein L2  35.42 
 
 		 277 aa  101  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0770167  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1343  ribosomal protein L2  32.87 
 
 		 279 aa  101  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0492  50S ribosomal protein L2  32.88 
 
 		 275 aa  101  1e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000323805  hitchhiker  0.00406555 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0629  50S ribosomal protein L2  35.98 
 
 		 274 aa  101  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000833663  hitchhiker  0.00000000000856838 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0588  50S ribosomal protein L2  35.6 
 
 		 280 aa  101  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1349  50S ribosomal protein L2  37.3 
 
 		 274 aa  101  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0984  50S ribosomal protein L2  32.33 
 
 		 280 aa  101  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.619761  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2854  50S ribosomal protein L2  35.45 
 
 		 274 aa  100  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.16125  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1959  50S ribosomal protein L2  36.07 
 
 		 277 aa  100  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0386068  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2685  50S ribosomal protein L2  35.33 
 
 		 279 aa  100  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00277969  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0252  50S ribosomal protein L2  35.6 
 
 		 280 aa  100  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0762  50S ribosomal protein L2  34.43 
 
 		 279 aa  100  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.052515  normal  0.51938 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1828  50S ribosomal protein L2  34.9 
 
 		 277 aa  100  3e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.256739  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2969  50S ribosomal protein L2  31.08 
 
 		 276 aa  100  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0062  50S ribosomal protein L2  32.14 
 
 		 273 aa  100  3e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000394369  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0787  50S ribosomal protein L2  31.66 
 
 		 274 aa  100  3e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.469967  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0683  50S ribosomal protein L2  36.51 
 
 		 274 aa  100  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.660032  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0228  50S ribosomal protein L2  31.82 
 
 		 275 aa  100  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0288  50S ribosomal protein L2  32.14 
 
 		 274 aa  99.4  4e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.101113  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2274  50S ribosomal protein L2  33.85 
 
 		 277 aa  99.4  5e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000299614  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2315  50S ribosomal protein L2  33.85 
 
 		 277 aa  99.4  5e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000290927  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0693  50S ribosomal protein L2  32.81 
 
 		 281 aa  99  6e-20  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0412  50S ribosomal protein L2  32.86 
 
 		 276 aa  99  6e-20  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>