More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1775 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1775  ribosomal protein L2  100 
 
 		 238 aa  476  1e-133  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0094  50S ribosomal protein L2P  70.17 
 
 		 238 aa  341  5.999999999999999e-93  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000127555  unclonable  0.000000429528 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0227  50S ribosomal protein L2P  53.5 
 
 		 248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0049  50S ribosomal protein L2P  53.81 
 
 		 245 aa  242  3.9999999999999997e-63  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0336538 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0018  50S ribosomal protein L2P  51.9 
 
 		 244 aa  232  5e-60  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1094  50S ribosomal protein L2P  52.72 
 
 		 246 aa  226  3e-58  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0052  50S ribosomal protein L2P  51.9 
 
 		 246 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.946037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0860  50S ribosomal protein L2P  48.75 
 
 		 240 aa  223  2e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.480475  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0004  50S ribosomal protein L2P  46.41 
 
 		 237 aa  222  4e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000454303  n/a   
 
 
 
NC_013922  Nmag_0213  ribosomal protein L2  47.88 
 
 		 240 aa  220  9.999999999999999e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1725  50S ribosomal protein L2P  47.46 
 
 		 236 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0310662  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0030  50S ribosomal protein L2P  48.75 
 
 		 240 aa  219  3e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.291148  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1124  50S ribosomal protein L2P  48.75 
 
 		 240 aa  218  6e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0794  50S ribosomal protein L2P  48.75 
 
 		 240 aa  218  7.999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.097706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0107  50S ribosomal protein L2P  47.68 
 
 		 238 aa  217  1e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0535  50S ribosomal protein L2P  46.06 
 
 		 238 aa  213  1.9999999999999998e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.393685  normal  0.694231 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0804  50S ribosomal protein L2P  47.08 
 
 		 240 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.712432  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0567  50S ribosomal protein L2P  46.61 
 
 		 239 aa  210  2e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0425344  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0102  50S ribosomal protein L2P  46.41 
 
 		 244 aa  205  4e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00140338 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1278  50S ribosomal protein L2P  48.54 
 
 		 255 aa  204  1e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000789854 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28234  predicted protein  47.39 
 
 		 257 aa  204  1e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.638688  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2250  50S ribosomal protein L2P  44.92 
 
 		 236 aa  202  3e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000000353713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1518  ribosomal protein L2  48.25 
 
 		 234 aa  201  8e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  6.90355e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0084  50S ribosomal protein L2P  45.45 
 
 		 240 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.33391 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2221  ribosomal protein L2  46.15 
 
 		 240 aa  199  1.9999999999999998e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL03960  conserved hypothetical protein  46.28 
 
 		 255 aa  196  2.0000000000000003e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.139278  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2295  50S ribosomal protein L2P  45.45 
 
 		 242 aa  196  2.0000000000000003e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1831  50S ribosomal protein L2P  44.8 
 
 		 240 aa  195  5.000000000000001e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.548496 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2446  50S ribosomal protein L2P  43.81 
 
 		 240 aa  194  1e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0445  50S ribosomal protein L2P  45.8 
 
 		 239 aa  192  3e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0154826  normal  0.478034 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31116  Ribosomal protein L8, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  43.78 
 
 		 255 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.155376  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02275  hypothetical protein similar to 60S ribosomal protein L2 (Broad)  41.87 
 
 		 254 aa  175  6e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86991  60S large subunit ribosomal protein L2B  44.49 
 
 		 254 aa  170  2e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.32837 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28309  60S large subunit ribosomal protein L2A  44.49 
 
 		 254 aa  170  2e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.24055 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23051  50S ribosomal protein L2  40.24 
 
 		 287 aa  109  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0197  50S ribosomal protein L2  39 
 
 		 283 aa  109  4.0000000000000004e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00345154  normal  0.0626583 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0694  50S ribosomal protein L2  41.72 
 
 		 287 aa  108  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00211234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0199  50S ribosomal protein L2  39.77 
 
 		 277 aa  108  8.000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0675116  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1828  50S ribosomal protein L2  39.34 
 
 		 277 aa  108  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.256739  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2562  50S ribosomal protein L2  40.49 
 
 		 287 aa  107  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.244819  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2321  50S ribosomal protein L2  39.26 
 
 		 274 aa  107  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000391561  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2229  50S ribosomal protein L2  40 
 
 		 287 aa  107  1e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.425308 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2274  50S ribosomal protein L2  41.11 
 
 		 277 aa  107  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000299614  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2315  50S ribosomal protein L2  41.11 
 
 		 277 aa  107  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000290927  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0331  50S ribosomal protein L2  39.39 
 
 		 272 aa  106  3e-22  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00448  50S ribosomal protein L2  37.89 
 
 		 274 aa  106  4e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0129739  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0761  50S ribosomal protein L2  38.67 
 
 		 277 aa  105  5e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000295488  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0598  50S ribosomal protein L2  39.33 
 
 		 279 aa  105  7e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000263643  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2904  ribosomal protein L2  39.02 
 
 		 275 aa  105  8e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0062  50S ribosomal protein L2  38.75 
 
 		 273 aa  105  8e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000394369  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3819  50S ribosomal protein L2  38.65 
 
 		 273 aa  104  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000104624  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0326  50S ribosomal protein L2  38.65 
 
 		 273 aa  104  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000291678  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3641  50S ribosomal protein L2  39.02 
 
 		 275 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000585895  hitchhiker  0.0000000000261127 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0286  50S ribosomal protein L2  38.65 
 
 		 274 aa  104  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000315964  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3998  50S ribosomal protein L2  38.65 
 
 		 273 aa  103  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000302361  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3450  50S ribosomal protein L2  39.02 
 
 		 275 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000764843  decreased coverage  0.00435128 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3912  50S ribosomal protein L2  38.65 
 
 		 274 aa  104  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.5044e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0330  50S ribosomal protein L2  39.02 
 
 		 275 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000414315  normal  0.021485 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1521  ribosomal protein L2  40.36 
 
 		 275 aa  103  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2756  50S ribosomal protein L2  39.02 
 
 		 275 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000162377  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1295  50S ribosomal protein L2  38.79 
 
 		 287 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000231184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0270  50S ribosomal protein L2  39.02 
 
 		 275 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00297501  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0279  50S ribosomal protein L2  39.02 
 
 		 275 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000000000585498  normal  0.0839884 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0351  50S ribosomal protein L2  39.63 
 
 		 275 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000123883  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0587  50S ribosomal protein L2  38.65 
 
 		 274 aa  104  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000050829  normal  0.227169 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2906  50S ribosomal protein L2  38.98 
 
 		 275 aa  103  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0172805  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0373  50S ribosomal protein L2  38.41 
 
 		 287 aa  103  3e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0408  50S ribosomal protein L2  38.65 
 
 		 273 aa  103  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00399178  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5067  50S ribosomal protein L2  38.85 
 
 		 277 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.828543  normal  0.381768 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2837  50S ribosomal protein L2  38.41 
 
 		 275 aa  103  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000326026  normal  0.198819 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03168  50S ribosomal protein L2  38.65 
 
 		 273 aa  102  4e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00146365  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0396  ribosomal protein L2  38.65 
 
 		 273 aa  102  4e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000401214  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3748  50S ribosomal protein L2  38.65 
 
 		 273 aa  102  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000108731  hitchhiker  0.00494792 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3702  50S ribosomal protein L2  38.65 
 
 		 273 aa  102  4e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237187  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1958  50S ribosomal protein L2  39.02 
 
 		 287 aa  102  4e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3804  50S ribosomal protein L2  38.65 
 
 		 273 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00899018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3633  50S ribosomal protein L2  38.65 
 
 		 273 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0350833  normal  0.361481 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3511  50S ribosomal protein L2  38.65 
 
 		 273 aa  102  4e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112597  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3633  50S ribosomal protein L2  38.65 
 
 		 273 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000993877  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4640  50S ribosomal protein L2  38.65 
 
 		 273 aa  102  4e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0685659  normal  0.0584567 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0396  50S ribosomal protein L2  38.65 
 
 		 273 aa  102  4e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000072222  hitchhiker  0.000353424 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03119  hypothetical protein  38.65 
 
 		 273 aa  102  4e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00128631  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3706  50S ribosomal protein L2  38.65 
 
 		 273 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00279259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3800  50S ribosomal protein L2  38.65 
 
 		 273 aa  102  4e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000757775  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3612  50S ribosomal protein L2  38.65 
 
 		 273 aa  102  4e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000120655  hitchhiker  0.00428222 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3741  50S ribosomal protein L2  38.65 
 
 		 273 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.69026  normal  0.0152471 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0288  50S ribosomal protein L2  39.29 
 
 		 274 aa  102  5e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.101113  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0317  50S ribosomal protein L2  38.41 
 
 		 275 aa  102  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000380441  decreased coverage  0.00287275 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1548  50S ribosomal protein L2  34.67 
 
 		 277 aa  102  6e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0113  50S ribosomal protein L2  39.33 
 
 		 276 aa  102  7e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000200839  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0125  50S ribosomal protein L2  39.33 
 
 		 276 aa  102  7e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.14187e-61 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0113  50S ribosomal protein L2  39.33 
 
 		 276 aa  102  7e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000138046  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0109  50S ribosomal protein L2  39.33 
 
 		 276 aa  102  7e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.27306e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0107  50S ribosomal protein L2  39.33 
 
 		 276 aa  102  7e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000901221  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0113  50S ribosomal protein L2  39.33 
 
 		 276 aa  102  7e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000512601  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3445  50S ribosomal protein L2  35.68 
 
 		 277 aa  102  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0144  50S ribosomal protein L2  39.33 
 
 		 276 aa  102  7e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000100516  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2629  50S ribosomal protein L2  37.8 
 
 		 275 aa  101  8e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00000217343  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0609  50S ribosomal protein L2  41.94 
 
 		 276 aa  101  8e-21  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3801  50S ribosomal protein L2  37.8 
 
 		 275 aa  101  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0211596  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>