More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0018 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0018  50S ribosomal protein L2P  100 
 
 		 244 aa  485  1e-136  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0052  50S ribosomal protein L2P  85.77 
 
 		 246 aa  429  1e-119  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.946037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1094  50S ribosomal protein L2P  84.9 
 
 		 246 aa  422  1e-117  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0049  50S ribosomal protein L2P  84.49 
 
 		 245 aa  418  1e-116  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0336538 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1278  50S ribosomal protein L2P  67.76 
 
 		 255 aa  308  4e-83  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000789854 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0227  50S ribosomal protein L2P  57.5 
 
 		 248 aa  262  4e-69  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1775  ribosomal protein L2  51.9 
 
 		 238 aa  232  5e-60  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0094  50S ribosomal protein L2P  49.79 
 
 		 238 aa  227  1e-58  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000127555  unclonable  0.000000429528 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0860  50S ribosomal protein L2P  51.45 
 
 		 240 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.480475  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0030  50S ribosomal protein L2P  52.7 
 
 		 240 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.291148  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1124  50S ribosomal protein L2P  52.28 
 
 		 240 aa  211  7e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0794  50S ribosomal protein L2P  51.87 
 
 		 240 aa  210  1e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.097706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0107  50S ribosomal protein L2P  46.84 
 
 		 238 aa  209  3e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0213  ribosomal protein L2  50.63 
 
 		 240 aa  209  4e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1518  ribosomal protein L2  50 
 
 		 234 aa  205  4e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  6.90355e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0804  50S ribosomal protein L2P  46.89 
 
 		 240 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.712432  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0004  50S ribosomal protein L2P  45.38 
 
 		 237 aa  194  1e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000454303  n/a   
 
 
 
NC_008553  Mthe_1725  50S ribosomal protein L2P  46.22 
 
 		 236 aa  194  1e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0310662  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0102  50S ribosomal protein L2P  45.31 
 
 		 244 aa  192  4e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00140338 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2295  50S ribosomal protein L2P  48.92 
 
 		 242 aa  190  2e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2221  ribosomal protein L2  48.44 
 
 		 240 aa  187  1e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28234  predicted protein  44.31 
 
 		 257 aa  186  4e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.638688  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL03960  conserved hypothetical protein  45.53 
 
 		 255 aa  185  5e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.139278  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0535  50S ribosomal protein L2P  43.51 
 
 		 238 aa  185  5e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.393685  normal  0.694231 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2446  50S ribosomal protein L2P  47.83 
 
 		 240 aa  182  4.0000000000000006e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1831  50S ribosomal protein L2P  47.11 
 
 		 240 aa  181  1e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.548496 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0567  50S ribosomal protein L2P  43.46 
 
 		 239 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0425344  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02275  hypothetical protein similar to 60S ribosomal protein L2 (Broad)  42.91 
 
 		 254 aa  176  3e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2250  50S ribosomal protein L2P  42.68 
 
 		 236 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000000353713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0445  50S ribosomal protein L2P  43.28 
 
 		 239 aa  169  3e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0154826  normal  0.478034 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0084  50S ribosomal protein L2P  41.42 
 
 		 240 aa  169  4e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.33391 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31116  Ribosomal protein L8, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  38.62 
 
 		 255 aa  168  6e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.155376  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28309  60S large subunit ribosomal protein L2A  43.72 
 
 		 254 aa  165  5e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.24055 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86991  60S large subunit ribosomal protein L2B  43.72 
 
 		 254 aa  165  5e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.32837 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0598  50S ribosomal protein L2  42.54 
 
 		 279 aa  120  1.9999999999999998e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000263643  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2399  50S ribosomal protein L2  38.89 
 
 		 276 aa  116  3.9999999999999997e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00287166  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0199  50S ribosomal protein L2  41.99 
 
 		 277 aa  112  4.0000000000000004e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0675116  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1904  50S ribosomal protein L2  41.21 
 
 		 277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1480  50S ribosomal protein L2  39.73 
 
 		 281 aa  109  5e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000349234  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0061  50S ribosomal protein L2  41.21 
 
 		 277 aa  108  8.000000000000001e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.41006  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0718  ribosomal protein L2  36.51 
 
 		 273 aa  108  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0110  50S ribosomal protein L2  39.35 
 
 		 276 aa  107  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0454  50S ribosomal protein L2  37.04 
 
 		 274 aa  107  1e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000232989  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0114  50S ribosomal protein L2  40.28 
 
 		 276 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000290971  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2457  50S ribosomal protein L2  39.45 
 
 		 276 aa  106  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0871736 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2152  50S ribosomal protein L2  39.78 
 
 		 279 aa  106  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0924201  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1521  ribosomal protein L2  39.07 
 
 		 275 aa  106  4e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0294  50S ribosomal protein L2  36.36 
 
 		 278 aa  106  4e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  3.4720999999999997e-28 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_420  ribosomal protein L2  37.04 
 
 		 274 aa  105  6e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00663414  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2315  50S ribosomal protein L2  39.78 
 
 		 277 aa  105  7e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000290927  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2274  50S ribosomal protein L2  39.78 
 
 		 277 aa  105  7e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000299614  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1742  50S ribosomal protein L2  39.02 
 
 		 276 aa  105  9e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000110614  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0477  50S ribosomal protein L2  36.11 
 
 		 274 aa  104  1e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0481332  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0694  50S ribosomal protein L2  38.07 
 
 		 287 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00211234  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2562  50S ribosomal protein L2  38.53 
 
 		 287 aa  104  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.244819  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0107  50S ribosomal protein L2  38.53 
 
 		 276 aa  104  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000204251  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5192  50S ribosomal protein L2  38.07 
 
 		 276 aa  103  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000180933  unclonable  2.65522e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0134  50S ribosomal protein L2  38.07 
 
 		 276 aa  103  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000249417  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3009  50S ribosomal protein L2  39.78 
 
 		 287 aa  103  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.141186  hitchhiker  0.00819024 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1182  50S ribosomal protein L2  38.71 
 
 		 275 aa  103  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1828  50S ribosomal protein L2  38.67 
 
 		 277 aa  103  3e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.256739  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2904  ribosomal protein L2  38.71 
 
 		 275 aa  103  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl126  50S ribosomal protein L2  38.25 
 
 		 281 aa  102  4e-21  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0445797  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0108  50S ribosomal protein L2  37.61 
 
 		 276 aa  102  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000187869  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3741  50S ribosomal protein L2  38.67 
 
 		 273 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.69026  normal  0.0152471 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3633  50S ribosomal protein L2  38.67 
 
 		 273 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0350833  normal  0.361481 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf440  50S ribosomal protein L2  37.8 
 
 		 281 aa  102  6e-21  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3706  50S ribosomal protein L2  38.67 
 
 		 273 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00279259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3633  50S ribosomal protein L2  38.67 
 
 		 273 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000993877  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3804  50S ribosomal protein L2  38.67 
 
 		 273 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00899018  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3819  50S ribosomal protein L2  37.31 
 
 		 273 aa  102  6e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000104624  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0113  50S ribosomal protein L2  38.07 
 
 		 276 aa  101  9e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000200839  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0113  50S ribosomal protein L2  38.07 
 
 		 276 aa  101  9e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000138046  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0109  50S ribosomal protein L2  38.07 
 
 		 276 aa  101  9e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.27306e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0107  50S ribosomal protein L2  38.07 
 
 		 276 aa  101  9e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000901221  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0144  50S ribosomal protein L2  38.07 
 
 		 276 aa  101  9e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000100516  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0113  50S ribosomal protein L2  38.07 
 
 		 276 aa  101  9e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000512601  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0125  50S ribosomal protein L2  38.07 
 
 		 276 aa  101  9e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.14187e-61 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3998  50S ribosomal protein L2  38.12 
 
 		 273 aa  101  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000302361  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0288  50S ribosomal protein L2  38.35 
 
 		 274 aa  100  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.101113  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2616  50S ribosomal protein L2  40 
 
 		 275 aa  101  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0160883  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03168  50S ribosomal protein L2  38.67 
 
 		 273 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00146365  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0396  ribosomal protein L2  38.67 
 
 		 273 aa  100  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000401214  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3748  50S ribosomal protein L2  38.12 
 
 		 273 aa  100  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000108731  hitchhiker  0.00494792 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3612  50S ribosomal protein L2  38.67 
 
 		 273 aa  100  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000120655  hitchhiker  0.00428222 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3800  50S ribosomal protein L2  38.67 
 
 		 273 aa  100  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000757775  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3021  50S ribosomal protein L2  36.87 
 
 		 274 aa  100  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0478203  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1295  50S ribosomal protein L2  35.32 
 
 		 287 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000231184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0587  50S ribosomal protein L2  38.12 
 
 		 274 aa  100  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000050829  normal  0.227169 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3511  50S ribosomal protein L2  38.67 
 
 		 273 aa  100  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112597  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0326  50S ribosomal protein L2  38.12 
 
 		 273 aa  100  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000291678  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0408  50S ribosomal protein L2  38.67 
 
 		 273 aa  100  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00399178  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3702  50S ribosomal protein L2  38.67 
 
 		 273 aa  100  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237187  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4023  50S ribosomal protein L2  38.25 
 
 		 275 aa  100  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.796821  hitchhiker  0.00000688583 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0286  50S ribosomal protein L2  38.12 
 
 		 274 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000315964  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03119  hypothetical protein  38.67 
 
 		 273 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00128631  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0396  50S ribosomal protein L2  38.67 
 
 		 273 aa  100  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000072222  hitchhiker  0.000353424 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0870  50S ribosomal protein L2  38.42 
 
 		 275 aa  100  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000015035  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4640  50S ribosomal protein L2  38.67 
 
 		 273 aa  100  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0685659  normal  0.0584567 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3912  50S ribosomal protein L2  38.12 
 
 		 274 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.5044e-16  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>