More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0084 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0084  50S ribosomal protein L2P  100 
 
 		 240 aa  483  1e-135  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.33391 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0445  50S ribosomal protein L2P  73.33 
 
 		 239 aa  351  5e-96  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0154826  normal  0.478034 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2250  50S ribosomal protein L2P  69.04 
 
 		 236 aa  343  2e-93  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000000353713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0535  50S ribosomal protein L2P  65.83 
 
 		 238 aa  341  5.999999999999999e-93  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.393685  normal  0.694231 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0567  50S ribosomal protein L2P  67.65 
 
 		 239 aa  325  4.0000000000000003e-88  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0425344  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1725  50S ribosomal protein L2P  57.74 
 
 		 236 aa  295  4e-79  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0310662  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0004  50S ribosomal protein L2P  58.75 
 
 		 237 aa  290  2e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000454303  n/a   
 
 
 
NC_013922  Nmag_0213  ribosomal protein L2  56.72 
 
 		 240 aa  275  5e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0107  50S ribosomal protein L2P  55.19 
 
 		 238 aa  268  4e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2295  50S ribosomal protein L2P  53.54 
 
 		 242 aa  253  2.0000000000000002e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2221  ribosomal protein L2  53.81 
 
 		 240 aa  249  2e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2446  50S ribosomal protein L2P  52.68 
 
 		 240 aa  244  9.999999999999999e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1831  50S ribosomal protein L2P  52.91 
 
 		 240 aa  243  1.9999999999999999e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.548496 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0030  50S ribosomal protein L2P  51.45 
 
 		 240 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.291148  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1124  50S ribosomal protein L2P  50.62 
 
 		 240 aa  237  1e-61  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0794  50S ribosomal protein L2P  50.21 
 
 		 240 aa  236  2e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.097706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0860  50S ribosomal protein L2P  49.38 
 
 		 240 aa  235  4e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.480475  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0804  50S ribosomal protein L2P  50.62 
 
 		 240 aa  231  5e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.712432  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1775  ribosomal protein L2  45.45 
 
 		 238 aa  201  9.999999999999999e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1518  ribosomal protein L2  47.84 
 
 		 234 aa  198  5e-50  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  6.90355e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL03960  conserved hypothetical protein  44.94 
 
 		 255 aa  190  2e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.139278  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28234  predicted protein  43.15 
 
 		 257 aa  187  2e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.638688  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0094  50S ribosomal protein L2P  43.51 
 
 		 238 aa  184  1.0000000000000001e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000127555  unclonable  0.000000429528 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31116  Ribosomal protein L8, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  41.13 
 
 		 255 aa  175  7e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.155376  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0227  50S ribosomal protein L2P  40 
 
 		 248 aa  171  6.999999999999999e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0049  50S ribosomal protein L2P  43.57 
 
 		 245 aa  170  2e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0336538 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0052  50S ribosomal protein L2P  41.42 
 
 		 246 aa  170  2e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.946037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0018  50S ribosomal protein L2P  41.42 
 
 		 244 aa  169  4e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1094  50S ribosomal protein L2P  41.42 
 
 		 246 aa  165  5e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02275  hypothetical protein similar to 60S ribosomal protein L2 (Broad)  39.11 
 
 		 254 aa  161  1e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28309  60S large subunit ribosomal protein L2A  46.38 
 
 		 254 aa  158  6e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.24055 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86991  60S large subunit ribosomal protein L2B  46.38 
 
 		 254 aa  158  6e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.32837 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1278  50S ribosomal protein L2P  40.25 
 
 		 255 aa  152  5.9999999999999996e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000789854 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0102  50S ribosomal protein L2P  37.04 
 
 		 244 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00140338 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0694  50S ribosomal protein L2  36.15 
 
 		 287 aa  123  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00211234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2457  50S ribosomal protein L2  37.32 
 
 		 276 aa  122  6e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0871736 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2562  50S ribosomal protein L2  36.15 
 
 		 287 aa  120  9.999999999999999e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.244819  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1521  ribosomal protein L2  37.39 
 
 		 275 aa  121  9.999999999999999e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0301  50S ribosomal protein L2  37.1 
 
 		 278 aa  117  9.999999999999999e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.302391  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0812  50S ribosomal protein L2  38.5 
 
 		 284 aa  116  3e-25  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.237121  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1295  50S ribosomal protein L2  37.5 
 
 		 287 aa  116  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000231184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0288  50S ribosomal protein L2  36.06 
 
 		 274 aa  115  5e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.101113  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0228  50S ribosomal protein L2  36.87 
 
 		 275 aa  114  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0718  ribosomal protein L2  34.26 
 
 		 273 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2399  50S ribosomal protein L2  36.65 
 
 		 276 aa  114  1.0000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00287166  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0588  50S ribosomal protein L2  37.57 
 
 		 280 aa  113  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0984  50S ribosomal protein L2  34.93 
 
 		 280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.619761  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1229  50S ribosomal protein L2  37.17 
 
 		 275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.624705  unclonable  0.0000121783 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0787  50S ribosomal protein L2  35.1 
 
 		 274 aa  113  3e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.469967  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0134  50S ribosomal protein L2  36.41 
 
 		 276 aa  113  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000249417  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0107  50S ribosomal protein L2  36.92 
 
 		 276 aa  113  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000204251  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4346  ribosomal protein L2  36.41 
 
 		 275 aa  113  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000143902  normal  0.0828967 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5192  50S ribosomal protein L2  36.41 
 
 		 276 aa  113  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000180933  unclonable  2.65522e-25 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0762  50S ribosomal protein L2  37.95 
 
 		 279 aa  113  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.052515  normal  0.51938 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0770  50S ribosomal protein L2  37.07 
 
 		 276 aa  112  4.0000000000000004e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00209717  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0125  50S ribosomal protein L2  36.92 
 
 		 276 aa  112  5e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.14187e-61 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0113  50S ribosomal protein L2  36.92 
 
 		 276 aa  112  5e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000200839  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0113  50S ribosomal protein L2  36.92 
 
 		 276 aa  112  5e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000138046  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0109  50S ribosomal protein L2  36.92 
 
 		 276 aa  112  5e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.27306e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0144  50S ribosomal protein L2  36.92 
 
 		 276 aa  112  5e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000100516  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0107  50S ribosomal protein L2  36.92 
 
 		 276 aa  112  5e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000901221  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0113  50S ribosomal protein L2  36.92 
 
 		 276 aa  112  5e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000512601  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1742  50S ribosomal protein L2  34.27 
 
 		 276 aa  112  5e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000110614  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0394  50S ribosomal protein L2  35.32 
 
 		 274 aa  112  5e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2152  50S ribosomal protein L2  35.85 
 
 		 279 aa  112  6e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0924201  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4918  50S ribosomal protein L2  36.19 
 
 		 275 aa  112  6e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.113284  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0108  50S ribosomal protein L2  35.9 
 
 		 276 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000187869  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0252  50S ribosomal protein L2  37.95 
 
 		 280 aa  111  9e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0425  50S ribosomal protein L2  36.41 
 
 		 276 aa  111  9e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000111287  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0114  50S ribosomal protein L2  36.41 
 
 		 276 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000290971  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0331  50S ribosomal protein L2  33.5 
 
 		 272 aa  110  3e-23  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0110  50S ribosomal protein L2  34.67 
 
 		 276 aa  109  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0061  50S ribosomal protein L2  36.41 
 
 		 277 aa  109  4.0000000000000004e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.41006  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29034  Putative mitochondrial ribosomal protein L2  38.76 
 
 		 283 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0175318  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0289  50S ribosomal protein L2  35.9 
 
 		 275 aa  109  5e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0283371  normal  0.0481443 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23051  50S ribosomal protein L2  33.85 
 
 		 287 aa  108  8.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1617  50S ribosomal protein L2  37.2 
 
 		 279 aa  108  8.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.134416 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0252  50S ribosomal protein L2  35.1 
 
 		 275 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000167103  normal  0.0370671 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16751  50S ribosomal protein L2  33.49 
 
 		 287 aa  107  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3021  50S ribosomal protein L2  34.84 
 
 		 274 aa  107  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0478203  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3065  50S ribosomal protein L2  35.1 
 
 		 275 aa  108  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000040785  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1904  50S ribosomal protein L2  35.9 
 
 		 277 aa  108  1e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1391  50S ribosomal protein L2  39.29 
 
 		 276 aa  108  1e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000232502  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1295  50S ribosomal protein L2  39.29 
 
 		 276 aa  108  1e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000122183  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1480  50S ribosomal protein L2  36.89 
 
 		 281 aa  107  2e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000349234  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2629  50S ribosomal protein L2  35.1 
 
 		 275 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00000217343  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3743  50S ribosomal protein L2  35.1 
 
 		 275 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000272978  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3773  50S ribosomal protein L2  35.1 
 
 		 275 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000105761  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0373  50S ribosomal protein L2  34 
 
 		 287 aa  107  2e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2315  50S ribosomal protein L2  35.68 
 
 		 277 aa  107  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000290927  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3801  50S ribosomal protein L2  35.1 
 
 		 275 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0211596  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2906  50S ribosomal protein L2  36 
 
 		 275 aa  107  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0172805  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2711  50S ribosomal protein L2  37.06 
 
 		 277 aa  107  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2396  50S ribosomal protein L2  37.06 
 
 		 277 aa  107  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.445207  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0577  50S ribosomal protein L2  34.03 
 
 		 279 aa  107  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0761  50S ribosomal protein L2  34.98 
 
 		 277 aa  107  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000295488  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0351  50S ribosomal protein L2  34.62 
 
 		 275 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000123883  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1558  50S ribosomal protein L2  35.94 
 
 		 273 aa  107  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.49018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2837  50S ribosomal protein L2  35.26 
 
 		 275 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000326026  normal  0.198819 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2274  50S ribosomal protein L2  35.68 
 
 		 277 aa  107  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000299614  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>