More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0567 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0567  50S ribosomal protein L2P  100 
 
 		 239 aa  482  1e-135  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0425344  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0535  50S ribosomal protein L2P  70.71 
 
 		 238 aa  356  1.9999999999999998e-97  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.393685  normal  0.694231 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2250  50S ribosomal protein L2P  69.49 
 
 		 236 aa  345  3e-94  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000000353713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0445  50S ribosomal protein L2P  71.25 
 
 		 239 aa  332  4e-90  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0154826  normal  0.478034 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0084  50S ribosomal protein L2P  67.65 
 
 		 240 aa  325  4.0000000000000003e-88  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.33391 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1725  50S ribosomal protein L2P  59.32 
 
 		 236 aa  287  8e-77  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0310662  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0004  50S ribosomal protein L2P  56.12 
 
 		 237 aa  281  7.000000000000001e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000454303  n/a   
 
 
 
NC_013922  Nmag_0213  ribosomal protein L2  54.43 
 
 		 240 aa  264  8.999999999999999e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0107  50S ribosomal protein L2P  54.24 
 
 		 238 aa  263  1e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1124  50S ribosomal protein L2P  52.92 
 
 		 240 aa  250  2e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0794  50S ribosomal protein L2P  52.5 
 
 		 240 aa  249  3e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.097706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0860  50S ribosomal protein L2P  52.08 
 
 		 240 aa  248  4e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.480475  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2295  50S ribosomal protein L2P  52.89 
 
 		 242 aa  248  6e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0030  50S ribosomal protein L2P  52.5 
 
 		 240 aa  248  7e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.291148  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2221  ribosomal protein L2  53.15 
 
 		 240 aa  243  1.9999999999999999e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0804  50S ribosomal protein L2P  51.45 
 
 		 240 aa  243  3e-63  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.712432  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1831  50S ribosomal protein L2P  52.7 
 
 		 240 aa  241  1e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.548496 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2446  50S ribosomal protein L2P  52.47 
 
 		 240 aa  240  2e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1775  ribosomal protein L2  46.61 
 
 		 238 aa  210  2e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1518  ribosomal protein L2  46.09 
 
 		 234 aa  196  3e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  6.90355e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0094  50S ribosomal protein L2P  41.1 
 
 		 238 aa  186  3e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000127555  unclonable  0.000000429528 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0052  50S ribosomal protein L2P  43.04 
 
 		 246 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.946037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0049  50S ribosomal protein L2P  43.46 
 
 		 245 aa  181  8.000000000000001e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0336538 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0018  50S ribosomal protein L2P  43.46 
 
 		 244 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL03960  conserved hypothetical protein  42.62 
 
 		 255 aa  177  9e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.139278  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1094  50S ribosomal protein L2P  42.19 
 
 		 246 aa  174  9e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0227  50S ribosomal protein L2P  42.21 
 
 		 248 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28234  predicted protein  39.11 
 
 		 257 aa  165  5e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.638688  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0102  50S ribosomal protein L2P  37.1 
 
 		 244 aa  160  1e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00140338 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31116  Ribosomal protein L8, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  37.96 
 
 		 255 aa  157  2e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.155376  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1278  50S ribosomal protein L2P  39.58 
 
 		 255 aa  154  8e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000789854 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02275  hypothetical protein similar to 60S ribosomal protein L2 (Broad)  40.2 
 
 		 254 aa  140  9.999999999999999e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28309  60S large subunit ribosomal protein L2A  39.71 
 
 		 254 aa  132  5e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.24055 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86991  60S large subunit ribosomal protein L2B  39.71 
 
 		 254 aa  132  5e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.32837 
 
 
-
 
NC_002620  TC0812  50S ribosomal protein L2  41.53 
 
 		 284 aa  121  9.999999999999999e-27  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.237121  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0787  50S ribosomal protein L2  36.95 
 
 		 274 aa  120  1.9999999999999998e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.469967  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0288  50S ribosomal protein L2  42.44 
 
 		 274 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.101113  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0761  50S ribosomal protein L2  41.62 
 
 		 277 aa  120  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000295488  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0268  50S ribosomal protein L2  36.54 
 
 		 288 aa  119  3.9999999999999996e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000297487  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0762  50S ribosomal protein L2  41.82 
 
 		 279 aa  119  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.052515  normal  0.51938 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0669  50S ribosomal protein L2  42.26 
 
 		 277 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000171407  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0701  50S ribosomal protein L2  42.26 
 
 		 277 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000626221  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2906  50S ribosomal protein L2  41.62 
 
 		 275 aa  119  4.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0172805  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0588  50S ribosomal protein L2  42.68 
 
 		 280 aa  118  7.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2457  50S ribosomal protein L2  43.02 
 
 		 276 aa  117  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0871736 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1295  50S ribosomal protein L2  37.57 
 
 		 287 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000231184  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0114  50S ribosomal protein L2  38.81 
 
 		 276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000290971  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2685  50S ribosomal protein L2  40.24 
 
 		 279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00277969  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1571  ribosomal protein L2  39.32 
 
 		 277 aa  116  3e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000641133  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1719  50S ribosomal protein L2  42.42 
 
 		 279 aa  116  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.238282  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0364  50S ribosomal protein L2  42.42 
 
 		 279 aa  116  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.838149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2531  50S ribosomal protein L2  42.42 
 
 		 279 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.445887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1521  ribosomal protein L2  43.02 
 
 		 275 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0252  50S ribosomal protein L2  39.64 
 
 		 280 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0870  50S ribosomal protein L2  37.86 
 
 		 275 aa  115  5e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000015035  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0113  50S ribosomal protein L2  39.05 
 
 		 276 aa  115  6e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000200839  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0113  50S ribosomal protein L2  39.05 
 
 		 276 aa  115  6e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000138046  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0109  50S ribosomal protein L2  39.05 
 
 		 276 aa  115  6e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.27306e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0107  50S ribosomal protein L2  39.05 
 
 		 276 aa  115  6e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000901221  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0113  50S ribosomal protein L2  39.05 
 
 		 276 aa  115  6e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000512601  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0125  50S ribosomal protein L2  39.05 
 
 		 276 aa  115  6e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.14187e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0144  50S ribosomal protein L2  39.05 
 
 		 276 aa  115  6e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000100516  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0718  ribosomal protein L2  36.62 
 
 		 273 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1959  50S ribosomal protein L2  41.46 
 
 		 277 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0386068  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1230  50S ribosomal protein L2  40.85 
 
 		 277 aa  115  7.999999999999999e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.424988  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0289  50S ribosomal protein L2  41.57 
 
 		 279 aa  115  7.999999999999999e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0147738  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2399  50S ribosomal protein L2  38.78 
 
 		 276 aa  115  7.999999999999999e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00287166  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0984  50S ribosomal protein L2  40.83 
 
 		 280 aa  114  8.999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.619761  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0331  50S ribosomal protein L2  34.87 
 
 		 272 aa  115  8.999999999999998e-25  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01200  50S ribosomal protein L2  40.88 
 
 		 277 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0770167  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0108  50S ribosomal protein L2  38.76 
 
 		 276 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000187869  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5192  50S ribosomal protein L2  38.76 
 
 		 276 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000180933  unclonable  2.65522e-25 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1193  50S ribosomal protein L2  40.85 
 
 		 277 aa  114  1.0000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0134  50S ribosomal protein L2  38.76 
 
 		 276 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000249417  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0107  50S ribosomal protein L2  39.11 
 
 		 276 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000204251  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2562  50S ribosomal protein L2  38.95 
 
 		 287 aa  114  2.0000000000000002e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.244819  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1252  50S ribosomal protein L2  38.1 
 
 		 278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.275281  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf440  50S ribosomal protein L2  40 
 
 		 281 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3664  50S ribosomal protein L2  36.79 
 
 		 278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2815  50S ribosomal protein L2  39.88 
 
 		 278 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.477285 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2152  50S ribosomal protein L2  40.23 
 
 		 279 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0924201  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1943  50S ribosomal protein L2  40 
 
 		 277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3009  50S ribosomal protein L2  38.42 
 
 		 287 aa  113  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.141186  hitchhiker  0.00819024 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0082  50S ribosomal protein L2  39.77 
 
 		 276 aa  113  3e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.173583 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1675  50S ribosomal protein L2  40.24 
 
 		 278 aa  113  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2711  50S ribosomal protein L2  40.64 
 
 		 277 aa  113  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2396  50S ribosomal protein L2  40.64 
 
 		 277 aa  113  3e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.445207  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3021  50S ribosomal protein L2  42.26 
 
 		 274 aa  113  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0478203  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1181  ribosomal protein L2  41.15 
 
 		 274 aa  113  3e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000178958  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0301  50S ribosomal protein L2  39.13 
 
 		 278 aa  112  4.0000000000000004e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.302391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5784  ribosomal protein L2  39.88 
 
 		 274 aa  112  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.091769 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3181  50S ribosomal protein L2  36.79 
 
 		 278 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0577  50S ribosomal protein L2  37.06 
 
 		 279 aa  112  5e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0037  50S ribosomal protein L2  39.33 
 
 		 276 aa  112  5e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00257974  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4023  50S ribosomal protein L2  42.26 
 
 		 275 aa  112  6e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.796821  hitchhiker  0.00000688583 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4918  50S ribosomal protein L2  39.29 
 
 		 275 aa  112  6e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.113284  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1828  50S ribosomal protein L2  39.47 
 
 		 277 aa  112  7.000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.256739  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1742  50S ribosomal protein L2  36.95 
 
 		 276 aa  112  7.000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000110614  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1480  50S ribosomal protein L2  40.88 
 
 		 281 aa  112  7.000000000000001e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000349234  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2739  50S ribosomal protein L2  38.1 
 
 		 278 aa  112  7.000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.236416  normal  0.312063 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>