More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_28234 on replicon NC_011679
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011679  PHATR_28234  predicted protein  100 
 
 		 257 aa  521  1e-147  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.638688  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31116  Ribosomal protein L8, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  63.14 
 
 		 255 aa  352  2e-96  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.155376  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02275  hypothetical protein similar to 60S ribosomal protein L2 (Broad)  63.1 
 
 		 254 aa  340  1e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86991  60S large subunit ribosomal protein L2B  67.45 
 
 		 254 aa  339  2.9999999999999998e-92  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.32837 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28309  60S large subunit ribosomal protein L2A  67.45 
 
 		 254 aa  339  2.9999999999999998e-92  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.24055 
 
 
-
 
NC_006681  CNL03960  conserved hypothetical protein  63.2 
 
 		 255 aa  326  3e-88  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.139278  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0030  50S ribosomal protein L2P  50.41 
 
 		 240 aa  228  1e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.291148  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0794  50S ribosomal protein L2P  50.41 
 
 		 240 aa  226  3e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.097706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1124  50S ribosomal protein L2P  50 
 
 		 240 aa  224  7e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0860  50S ribosomal protein L2P  48.78 
 
 		 240 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.480475  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0804  50S ribosomal protein L2P  47.15 
 
 		 240 aa  215  4e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.712432  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1725  50S ribosomal protein L2P  45.53 
 
 		 236 aa  208  5e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0310662  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0213  ribosomal protein L2  45.97 
 
 		 240 aa  206  3e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1775  ribosomal protein L2  47.39 
 
 		 238 aa  204  1e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0107  50S ribosomal protein L2P  43.55 
 
 		 238 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2221  ribosomal protein L2  48.61 
 
 		 240 aa  198  7e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2295  50S ribosomal protein L2P  45.06 
 
 		 242 aa  192  4e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0004  50S ribosomal protein L2P  42.68 
 
 		 237 aa  191  8e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000454303  n/a   
 
 
 
NC_012029  Hlac_2446  50S ribosomal protein L2P  44.83 
 
 		 240 aa  191  1e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1831  50S ribosomal protein L2P  44.35 
 
 		 240 aa  189  4e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.548496 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0084  50S ribosomal protein L2P  43.15 
 
 		 240 aa  187  2e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.33391 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0018  50S ribosomal protein L2P  44.31 
 
 		 244 aa  186  4e-46  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1518  ribosomal protein L2  44.73 
 
 		 234 aa  183  2.0000000000000003e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  6.90355e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0227  50S ribosomal protein L2P  42.91 
 
 		 248 aa  182  6e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0052  50S ribosomal protein L2P  42.68 
 
 		 246 aa  180  2e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.946037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1094  50S ribosomal protein L2P  43.9 
 
 		 246 aa  180  2e-44  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0094  50S ribosomal protein L2P  43.9 
 
 		 238 aa  179  4e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000127555  unclonable  0.000000429528 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0049  50S ribosomal protein L2P  43.5 
 
 		 245 aa  178  9e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0336538 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0535  50S ribosomal protein L2P  39.92 
 
 		 238 aa  175  5e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.393685  normal  0.694231 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2250  50S ribosomal protein L2P  42.68 
 
 		 236 aa  175  6e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000000353713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0567  50S ribosomal protein L2P  39.11 
 
 		 239 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0425344  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0445  50S ribosomal protein L2P  39.84 
 
 		 239 aa  160  1e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0154826  normal  0.478034 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0102  50S ribosomal protein L2P  40.28 
 
 		 244 aa  160  2e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00140338 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1278  50S ribosomal protein L2P  41.7 
 
 		 255 aa  157  2e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000789854 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4541  50S ribosomal protein L2  36.13 
 
 		 274 aa  106  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000106039  hitchhiker  0.00201461 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf440  50S ribosomal protein L2  33.02 
 
 		 281 aa  104  2e-21  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2457  50S ribosomal protein L2  36.76 
 
 		 276 aa  103  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0871736 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3819  50S ribosomal protein L2  35.23 
 
 		 273 aa  104  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000104624  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3998  50S ribosomal protein L2  35.6 
 
 		 273 aa  102  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000302361  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0326  50S ribosomal protein L2  35.23 
 
 		 273 aa  102  4e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000291678  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0286  50S ribosomal protein L2  35.6 
 
 		 274 aa  103  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000315964  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0587  50S ribosomal protein L2  35.6 
 
 		 274 aa  103  4e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000050829  normal  0.227169 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3912  50S ribosomal protein L2  35.6 
 
 		 274 aa  103  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.5044e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0598  50S ribosomal protein L2  33.17 
 
 		 279 aa  102  7e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000263643  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0331  50S ribosomal protein L2  34.2 
 
 		 272 aa  102  8e-21  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3804  50S ribosomal protein L2  35.08 
 
 		 273 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00899018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3633  50S ribosomal protein L2  35.08 
 
 		 273 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000993877  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3706  50S ribosomal protein L2  35.08 
 
 		 273 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00279259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3633  50S ribosomal protein L2  35.08 
 
 		 273 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0350833  normal  0.361481 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0408  50S ribosomal protein L2  34.72 
 
 		 273 aa  101  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00399178  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3741  50S ribosomal protein L2  35.08 
 
 		 273 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.69026  normal  0.0152471 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0693  50S ribosomal protein L2  33.94 
 
 		 281 aa  101  1e-20  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03168  50S ribosomal protein L2  35.08 
 
 		 273 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00146365  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0396  ribosomal protein L2  35.08 
 
 		 273 aa  100  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000401214  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl126  50S ribosomal protein L2  33.48 
 
 		 281 aa  100  2e-20  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0445797  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3612  50S ribosomal protein L2  35.08 
 
 		 273 aa  100  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000120655  hitchhiker  0.00428222 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0396  50S ribosomal protein L2  35.08 
 
 		 273 aa  100  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000072222  hitchhiker  0.000353424 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3511  50S ribosomal protein L2  35.08 
 
 		 273 aa  100  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112597  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4640  50S ribosomal protein L2  35.08 
 
 		 273 aa  100  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0685659  normal  0.0584567 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3800  50S ribosomal protein L2  35.08 
 
 		 273 aa  100  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000757775  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03119  hypothetical protein  35.08 
 
 		 273 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00128631  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3702  50S ribosomal protein L2  35.08 
 
 		 273 aa  100  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237187  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001739  LSU ribosomal protein L2p (L8e)  33.79 
 
 		 274 aa  100  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000188228  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3748  50S ribosomal protein L2  34.55 
 
 		 273 aa  100  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000108731  hitchhiker  0.00494792 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1521  ribosomal protein L2  33.84 
 
 		 275 aa  99.8  4e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2562  50S ribosomal protein L2  38.1 
 
 		 287 aa  99.8  4e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.244819  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1343  ribosomal protein L2  32.83 
 
 		 279 aa  99.8  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0062  50S ribosomal protein L2  34.55 
 
 		 273 aa  99.4  5e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000394369  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3009  50S ribosomal protein L2  36.22 
 
 		 287 aa  99  7e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.141186  hitchhiker  0.00819024 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0718  ribosomal protein L2  35.64 
 
 		 273 aa  98.6  8e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2315  50S ribosomal protein L2  34.65 
 
 		 277 aa  98.6  9e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000290927  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2226  50S ribosomal protein L2  33.51 
 
 		 264 aa  98.6  9e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000549007  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2274  50S ribosomal protein L2  34.65 
 
 		 277 aa  98.6  9e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000299614  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2321  50S ribosomal protein L2  34.2 
 
 		 274 aa  97.8  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000099496  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1571  ribosomal protein L2  31.65 
 
 		 277 aa  97.8  1e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000641133  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4346  ribosomal protein L2  34.43 
 
 		 275 aa  98.2  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000143902  normal  0.0828967 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1904  50S ribosomal protein L2  33.86 
 
 		 277 aa  98.6  1e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0216  50S ribosomal protein L2  35.71 
 
 		 274 aa  97.8  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000116204  unclonable  0.00000865154 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2293  50S ribosomal protein L2  33.16 
 
 		 279 aa  97.4  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0106582  normal  0.012024 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0228  50S ribosomal protein L2  33.33 
 
 		 275 aa  97.1  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0285  50S ribosomal protein L2  34.04 
 
 		 280 aa  97.4  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2739  50S ribosomal protein L2  33.7 
 
 		 278 aa  97.4  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.236416  normal  0.312063 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0288  50S ribosomal protein L2  33.33 
 
 		 274 aa  97.4  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.101113  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0199  50S ribosomal protein L2  33.65 
 
 		 277 aa  97.4  2e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0675116  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0770  50S ribosomal protein L2  34.22 
 
 		 276 aa  96.7  3e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00209717  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2531  50S ribosomal protein L2  34.74 
 
 		 279 aa  96.7  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.445887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1480  50S ribosomal protein L2  33.02 
 
 		 281 aa  97.1  3e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000349234  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0061  50S ribosomal protein L2  33.33 
 
 		 277 aa  96.7  4e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.41006  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0694  50S ribosomal protein L2  36.51 
 
 		 287 aa  96.3  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00211234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1959  50S ribosomal protein L2  35.33 
 
 		 277 aa  96.7  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0386068  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0294  50S ribosomal protein L2  33.69 
 
 		 278 aa  96.7  4e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  3.4720999999999997e-28 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00733  50S ribosomal protein L2  36.26 
 
 		 274 aa  96.3  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0762  50S ribosomal protein L2  33.51 
 
 		 279 aa  96.3  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.052515  normal  0.51938 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1719  50S ribosomal protein L2  34.74 
 
 		 279 aa  95.9  5e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.238282  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2152  50S ribosomal protein L2  31.55 
 
 		 279 aa  96.3  5e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0924201  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0364  50S ribosomal protein L2  34.74 
 
 		 279 aa  95.9  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.838149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2708  ribosomal protein L2  32.8 
 
 		 276 aa  96.3  5e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000275562  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0761  50S ribosomal protein L2  31.5 
 
 		 277 aa  95.5  6e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000295488  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0870  50S ribosomal protein L2  32.98 
 
 		 275 aa  95.5  7e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000015035  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0588  50S ribosomal protein L2  34.57 
 
 		 280 aa  95.5  7e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>