More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0094 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0094  50S ribosomal protein L2P  100 
 
 		 238 aa  476  1e-133  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000127555  unclonable  0.000000429528 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1775  ribosomal protein L2  70.17 
 
 		 238 aa  341  5.999999999999999e-93  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0018  50S ribosomal protein L2P  49.79 
 
 		 244 aa  227  1e-58  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0049  50S ribosomal protein L2P  50 
 
 		 245 aa  227  2e-58  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0336538 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0052  50S ribosomal protein L2P  49.37 
 
 		 246 aa  219  3e-56  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.946037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1094  50S ribosomal protein L2P  49.79 
 
 		 246 aa  217  1e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0227  50S ribosomal protein L2P  47.72 
 
 		 248 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1725  50S ribosomal protein L2P  45.34 
 
 		 236 aa  211  5.999999999999999e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0310662  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0860  50S ribosomal protein L2P  45.83 
 
 		 240 aa  211  1e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.480475  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0030  50S ribosomal protein L2P  46.25 
 
 		 240 aa  208  7e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.291148  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1124  50S ribosomal protein L2P  46.25 
 
 		 240 aa  207  1e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0794  50S ribosomal protein L2P  46.25 
 
 		 240 aa  206  3e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.097706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0213  ribosomal protein L2  44.49 
 
 		 240 aa  206  3e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0004  50S ribosomal protein L2P  41.35 
 
 		 237 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000454303  n/a   
 
 
 
NC_009635  Maeo_0804  50S ribosomal protein L2P  43.75 
 
 		 240 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.712432  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0107  50S ribosomal protein L2P  42.55 
 
 		 238 aa  191  8e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1518  ribosomal protein L2  46.52 
 
 		 234 aa  191  8e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  6.90355e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0102  50S ribosomal protein L2P  42.62 
 
 		 244 aa  191  1e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00140338 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2221  ribosomal protein L2  44.09 
 
 		 240 aa  189  2.9999999999999997e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1278  50S ribosomal protein L2P  40.59 
 
 		 255 aa  188  8e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000789854 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0567  50S ribosomal protein L2P  41.1 
 
 		 239 aa  186  3e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0425344  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0084  50S ribosomal protein L2P  43.51 
 
 		 240 aa  184  9e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.33391 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1831  50S ribosomal protein L2P  46.39 
 
 		 240 aa  184  1.0000000000000001e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.548496 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2295  50S ribosomal protein L2P  47.42 
 
 		 242 aa  183  2.0000000000000003e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2250  50S ribosomal protein L2P  41.53 
 
 		 236 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000000353713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0535  50S ribosomal protein L2P  40.59 
 
 		 238 aa  179  2e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.393685  normal  0.694231 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28234  predicted protein  43.9 
 
 		 257 aa  179  2.9999999999999997e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.638688  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2446  50S ribosomal protein L2P  44.83 
 
 		 240 aa  177  9e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0445  50S ribosomal protein L2P  41.98 
 
 		 239 aa  170  2e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0154826  normal  0.478034 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31116  Ribosomal protein L8, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  42.11 
 
 		 255 aa  170  2e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.155376  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02275  hypothetical protein similar to 60S ribosomal protein L2 (Broad)  42.51 
 
 		 254 aa  168  5e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL03960  conserved hypothetical protein  42.34 
 
 		 255 aa  167  2e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.139278  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86991  60S large subunit ribosomal protein L2B  44.31 
 
 		 254 aa  160  1e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.32837 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28309  60S large subunit ribosomal protein L2A  44.31 
 
 		 254 aa  160  1e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.24055 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5784  ribosomal protein L2  39.13 
 
 		 274 aa  107  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.091769 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2165  50S ribosomal protein L2  41.36 
 
 		 278 aa  105  8e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.219576 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2443  50S ribosomal protein L2  41.36 
 
 		 278 aa  105  8e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0062  50S ribosomal protein L2  37.72 
 
 		 273 aa  105  9e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000394369  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0984  50S ribosomal protein L2  38.18 
 
 		 280 aa  104  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.619761  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0429  50S ribosomal protein L2  35.86 
 
 		 276 aa  103  3e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000081496  decreased coverage  0.00000678891 
 
 
-
 
NC_002620  TC0812  50S ribosomal protein L2  36.97 
 
 		 284 aa  102  4e-21  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.237121  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf440  50S ribosomal protein L2  38.81 
 
 		 281 aa  102  4e-21  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0197  50S ribosomal protein L2  36 
 
 		 283 aa  101  9e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00345154  normal  0.0626583 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0598  50S ribosomal protein L2  36.46 
 
 		 279 aa  101  9e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000263643  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3748  50S ribosomal protein L2  35.76 
 
 		 273 aa  100  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000108731  hitchhiker  0.00494792 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2221  50S ribosomal protein L2  38.02 
 
 		 278 aa  100  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3804  50S ribosomal protein L2  36.53 
 
 		 273 aa  99.8  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00899018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23051  50S ribosomal protein L2  38.18 
 
 		 287 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3633  50S ribosomal protein L2  36.53 
 
 		 273 aa  99.8  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0350833  normal  0.361481 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2126  50S ribosomal protein L2  40.12 
 
 		 278 aa  100  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.647868 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3706  50S ribosomal protein L2  36.53 
 
 		 273 aa  99.8  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00279259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3633  50S ribosomal protein L2  36.53 
 
 		 273 aa  99.8  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000993877  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3741  50S ribosomal protein L2  36.53 
 
 		 273 aa  99.8  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.69026  normal  0.0152471 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0326  50S ribosomal protein L2  36.53 
 
 		 273 aa  100  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000291678  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3819  50S ribosomal protein L2  36.53 
 
 		 273 aa  100  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000104624  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3998  50S ribosomal protein L2  36.53 
 
 		 273 aa  100  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000302361  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0609  50S ribosomal protein L2  38.89 
 
 		 276 aa  99.4  4e-20  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0286  50S ribosomal protein L2  36.53 
 
 		 274 aa  99.4  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000315964  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0587  50S ribosomal protein L2  36.53 
 
 		 274 aa  99.4  4e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000050829  normal  0.227169 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3912  50S ribosomal protein L2  36.53 
 
 		 274 aa  99.4  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.5044e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0331  50S ribosomal protein L2  36.97 
 
 		 272 aa  99.8  4e-20  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0301  50S ribosomal protein L2  35.19 
 
 		 278 aa  99.4  5e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.302391  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2904  ribosomal protein L2  35.76 
 
 		 275 aa  99.4  5e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03168  50S ribosomal protein L2  36.53 
 
 		 273 aa  99  6e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00146365  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0396  ribosomal protein L2  36.53 
 
 		 273 aa  99  6e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000401214  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3612  50S ribosomal protein L2  36.53 
 
 		 273 aa  99  6e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000120655  hitchhiker  0.00428222 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4541  50S ribosomal protein L2  36.53 
 
 		 274 aa  99  6e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000106039  hitchhiker  0.00201461 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03119  hypothetical protein  36.53 
 
 		 273 aa  99  6e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00128631  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0194  50S ribosomal protein L2  37.89 
 
 		 274 aa  99  6e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.352427 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4640  50S ribosomal protein L2  36.53 
 
 		 273 aa  99  6e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0685659  normal  0.0584567 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0396  50S ribosomal protein L2  36.53 
 
 		 273 aa  99  6e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000072222  hitchhiker  0.000353424 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3511  50S ribosomal protein L2  36.53 
 
 		 273 aa  99  6e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112597  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3800  50S ribosomal protein L2  36.53 
 
 		 273 aa  99  6e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000757775  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3702  50S ribosomal protein L2  36.53 
 
 		 273 aa  99  6e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237187  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0669  50S ribosomal protein L2  38.27 
 
 		 277 aa  98.6  7e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000171407  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0701  50S ribosomal protein L2  38.27 
 
 		 277 aa  98.6  7e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000626221  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0408  50S ribosomal protein L2  36.53 
 
 		 273 aa  98.6  8e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00399178  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0694  50S ribosomal protein L2  38.18 
 
 		 287 aa  98.2  9e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00211234  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0565  50S ribosomal protein L2  36.42 
 
 		 277 aa  98.6  9e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3009  50S ribosomal protein L2  38.46 
 
 		 287 aa  98.2  9e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.141186  hitchhiker  0.00819024 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0762  50S ribosomal protein L2  37.65 
 
 		 279 aa  98.2  9e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.052515  normal  0.51938 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0870  50S ribosomal protein L2  36.42 
 
 		 274 aa  98.2  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0492  50S ribosomal protein L2  34.85 
 
 		 275 aa  97.8  1e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000323805  hitchhiker  0.00406555 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1682  50S ribosomal protein L2  36.65 
 
 		 277 aa  97.8  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0463749  hitchhiker  0.0000149038 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2229  50S ribosomal protein L2  35.98 
 
 		 287 aa  98.2  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.425308 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0487  50S ribosomal protein L2  34.85 
 
 		 275 aa  97.8  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000349566  normal  0.0292595 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0082  50S ribosomal protein L2  34.78 
 
 		 276 aa  97.8  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.173583 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00448  50S ribosomal protein L2  34.94 
 
 		 274 aa  98.2  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0129739  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2685  50S ribosomal protein L2  36.02 
 
 		 279 aa  97.4  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00277969  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0472  50S ribosomal protein L2  33.33 
 
 		 274 aa  97.4  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000311263  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1911  50S ribosomal protein L2  37.42 
 
 		 278 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00546363  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0199  50S ribosomal protein L2  36.9 
 
 		 277 aa  97.4  2e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0675116  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1828  50S ribosomal protein L2  37.28 
 
 		 277 aa  96.3  4e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.256739  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0350  50S ribosomal protein L2  37.42 
 
 		 278 aa  95.9  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.170348  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2562  50S ribosomal protein L2  36.97 
 
 		 287 aa  95.9  4e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.244819  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2315  50S ribosomal protein L2  38.69 
 
 		 277 aa  95.5  6e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000290927  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2274  50S ribosomal protein L2  38.69 
 
 		 277 aa  95.5  6e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000299614  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3521  50S ribosomal protein L2  34.94 
 
 		 275 aa  95.9  6e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000287143  hitchhiker  0.00000119311 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10718  50S ribosomal protein L2  37.04 
 
 		 280 aa  95.5  7e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0762488  normal  0.210258 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0577  50S ribosomal protein L2  35.8 
 
 		 279 aa  95.5  7e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>