More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1725 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_1725  50S ribosomal protein L2P  100 
 
 		 236 aa  479  1e-134  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0310662  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0213  ribosomal protein L2  64.83 
 
 		 240 aa  327  1.0000000000000001e-88  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0004  50S ribosomal protein L2P  61.6 
 
 		 237 aa  321  5e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000454303  n/a   
 
 
 
NC_013743  Htur_2221  ribosomal protein L2  65.02 
 
 		 240 aa  305  4.0000000000000004e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2295  50S ribosomal protein L2P  63.56 
 
 		 242 aa  303  1.0000000000000001e-81  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0107  50S ribosomal protein L2P  57.81 
 
 		 238 aa  295  3e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0084  50S ribosomal protein L2P  57.74 
 
 		 240 aa  295  4e-79  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.33391 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1831  50S ribosomal protein L2P  62.33 
 
 		 240 aa  293  1e-78  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.548496 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0445  50S ribosomal protein L2P  63.71 
 
 		 239 aa  293  1e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0154826  normal  0.478034 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0860  50S ribosomal protein L2P  60 
 
 		 240 aa  293  2e-78  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.480475  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0804  50S ribosomal protein L2P  58.75 
 
 		 240 aa  293  2e-78  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.712432  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2446  50S ribosomal protein L2P  62.61 
 
 		 240 aa  292  3e-78  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0535  50S ribosomal protein L2P  59.15 
 
 		 238 aa  290  2e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.393685  normal  0.694231 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2250  50S ribosomal protein L2P  60.17 
 
 		 236 aa  288  4e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000000353713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0030  50S ribosomal protein L2P  58.33 
 
 		 240 aa  288  4e-77  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.291148  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1124  50S ribosomal protein L2P  58.75 
 
 		 240 aa  288  6e-77  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0567  50S ribosomal protein L2P  59.32 
 
 		 239 aa  287  8e-77  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0425344  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0794  50S ribosomal protein L2P  58.33 
 
 		 240 aa  287  1e-76  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.097706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1518  ribosomal protein L2  58.52 
 
 		 234 aa  256  2e-67  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  6.90355e-16  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1775  ribosomal protein L2  47.46 
 
 		 238 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0094  50S ribosomal protein L2P  45.34 
 
 		 238 aa  211  5.999999999999999e-54  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000127555  unclonable  0.000000429528 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28234  predicted protein  45.53 
 
 		 257 aa  208  5e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.638688  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1278  50S ribosomal protein L2P  46.44 
 
 		 255 aa  206  3e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000789854 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31116  Ribosomal protein L8, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  45.12 
 
 		 255 aa  202  4e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.155376  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0049  50S ribosomal protein L2P  47.68 
 
 		 245 aa  199  3e-50  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0336538 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0227  50S ribosomal protein L2P  43.57 
 
 		 248 aa  198  5e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL03960  conserved hypothetical protein  42.15 
 
 		 255 aa  194  1e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.139278  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0018  50S ribosomal protein L2P  46.22 
 
 		 244 aa  194  1e-48  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1094  50S ribosomal protein L2P  43.04 
 
 		 246 aa  187  9e-47  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0052  50S ribosomal protein L2P  42.62 
 
 		 246 aa  187  1e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.946037  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02275  hypothetical protein similar to 60S ribosomal protein L2 (Broad)  44.13 
 
 		 254 aa  180  1e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86991  60S large subunit ribosomal protein L2B  45.08 
 
 		 254 aa  175  6e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.32837 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28309  60S large subunit ribosomal protein L2A  45.08 
 
 		 254 aa  175  6e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.24055 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0102  50S ribosomal protein L2P  40.34 
 
 		 244 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00140338 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03168  50S ribosomal protein L2  38.08 
 
 		 273 aa  141  9e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00146365  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0396  ribosomal protein L2  38.08 
 
 		 273 aa  141  9e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000401214  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03119  hypothetical protein  38.08 
 
 		 273 aa  141  9e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00128631  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3612  50S ribosomal protein L2  38.08 
 
 		 273 aa  141  9e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000120655  hitchhiker  0.00428222 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4640  50S ribosomal protein L2  38.08 
 
 		 273 aa  141  9e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0685659  normal  0.0584567 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0396  50S ribosomal protein L2  38.08 
 
 		 273 aa  141  9e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000072222  hitchhiker  0.000353424 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3511  50S ribosomal protein L2  38.08 
 
 		 273 aa  141  9e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112597  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3702  50S ribosomal protein L2  38.08 
 
 		 273 aa  141  9e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237187  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3800  50S ribosomal protein L2  38.08 
 
 		 273 aa  141  9e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000757775  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0588  50S ribosomal protein L2  40.91 
 
 		 280 aa  141  9.999999999999999e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1571  ribosomal protein L2  40.34 
 
 		 277 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000641133  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2685  50S ribosomal protein L2  39.38 
 
 		 279 aa  139  3e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00277969  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2457  50S ribosomal protein L2  39.07 
 
 		 276 aa  139  3e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0871736 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0408  50S ribosomal protein L2  37.66 
 
 		 273 aa  139  3e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00399178  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0587  50S ribosomal protein L2  37.71 
 
 		 274 aa  139  3.9999999999999997e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000050829  normal  0.227169 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3912  50S ribosomal protein L2  37.71 
 
 		 274 aa  139  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.5044e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0286  50S ribosomal protein L2  37.71 
 
 		 274 aa  139  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000315964  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0762  50S ribosomal protein L2  40.45 
 
 		 279 aa  139  3.9999999999999997e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.052515  normal  0.51938 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0701  50S ribosomal protein L2  39.8 
 
 		 277 aa  139  4.999999999999999e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000626221  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0294  50S ribosomal protein L2  38.6 
 
 		 278 aa  139  4.999999999999999e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  3.4720999999999997e-28 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0669  50S ribosomal protein L2  39.8 
 
 		 277 aa  139  4.999999999999999e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000171407  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3819  50S ribosomal protein L2  37.24 
 
 		 273 aa  138  6e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000104624  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0197  50S ribosomal protein L2  39.57 
 
 		 283 aa  138  6e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00345154  normal  0.0626583 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3741  50S ribosomal protein L2  37.66 
 
 		 273 aa  138  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.69026  normal  0.0152471 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3706  50S ribosomal protein L2  37.66 
 
 		 273 aa  138  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00279259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3633  50S ribosomal protein L2  37.66 
 
 		 273 aa  138  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0350833  normal  0.361481 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3633  50S ribosomal protein L2  37.66 
 
 		 273 aa  138  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000993877  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3804  50S ribosomal protein L2  37.66 
 
 		 273 aa  138  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00899018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3998  50S ribosomal protein L2  37.66 
 
 		 273 aa  138  7e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000302361  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0285  50S ribosomal protein L2  42.13 
 
 		 280 aa  137  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0326  50S ribosomal protein L2  37.24 
 
 		 273 aa  137  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000291678  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01200  50S ribosomal protein L2  42.08 
 
 		 277 aa  136  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0770167  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0718  ribosomal protein L2  42.25 
 
 		 273 aa  137  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0252  50S ribosomal protein L2  40.4 
 
 		 280 aa  137  2e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2531  50S ribosomal protein L2  42.13 
 
 		 279 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.445887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3748  50S ribosomal protein L2  37.66 
 
 		 273 aa  137  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000108731  hitchhiker  0.00494792 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0364  50S ribosomal protein L2  42.13 
 
 		 279 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.838149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1719  50S ribosomal protein L2  42.13 
 
 		 279 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.238282  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1742  50S ribosomal protein L2  40.59 
 
 		 276 aa  135  4e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000110614  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2399  50S ribosomal protein L2  40.57 
 
 		 276 aa  135  4e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00287166  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0199  50S ribosomal protein L2  41.01 
 
 		 277 aa  135  4e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0675116  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1959  50S ribosomal protein L2  40.31 
 
 		 277 aa  135  5e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0386068  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0984  50S ribosomal protein L2  40.1 
 
 		 280 aa  135  6.0000000000000005e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.619761  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1230  50S ribosomal protein L2  39.8 
 
 		 277 aa  135  7.000000000000001e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.424988  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0228  50S ribosomal protein L2  40.74 
 
 		 275 aa  135  8e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1943  50S ribosomal protein L2  39.09 
 
 		 277 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4918  50S ribosomal protein L2  42.5 
 
 		 275 aa  134  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.113284  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0787  50S ribosomal protein L2  36.67 
 
 		 274 aa  134  9.999999999999999e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.469967  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2226  50S ribosomal protein L2  37.44 
 
 		 264 aa  134  9.999999999999999e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000549007  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1193  50S ribosomal protein L2  39.8 
 
 		 277 aa  134  9.999999999999999e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0331  50S ribosomal protein L2  38.76 
 
 		 272 aa  133  1.9999999999999998e-30  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0761  50S ribosomal protein L2  42.86 
 
 		 277 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000295488  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4541  50S ribosomal protein L2  36.67 
 
 		 274 aa  134  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000106039  hitchhiker  0.00201461 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1828  50S ribosomal protein L2  39.53 
 
 		 277 aa  132  3e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.256739  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2061  50S ribosomal protein L2  38.91 
 
 		 279 aa  132  3e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000364134  normal  0.142265 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2969  50S ribosomal protein L2  42.22 
 
 		 276 aa  133  3e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1904  50S ribosomal protein L2  39.34 
 
 		 277 aa  133  3e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0061  50S ribosomal protein L2  39.81 
 
 		 277 aa  132  3.9999999999999996e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.41006  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1848  50S ribosomal protein L2  37.38 
 
 		 279 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.492965  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0107  50S ribosomal protein L2  39.15 
 
 		 276 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000204251  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0989  50S ribosomal protein L2  41.62 
 
 		 278 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227684  normal  0.0318056 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0492  50S ribosomal protein L2  38.14 
 
 		 275 aa  132  5e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000323805  hitchhiker  0.00406555 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5192  50S ribosomal protein L2  38.99 
 
 		 276 aa  132  5e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000180933  unclonable  2.65522e-25 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2708  ribosomal protein L2  40.76 
 
 		 276 aa  132  5e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000275562  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0134  50S ribosomal protein L2  38.99 
 
 		 276 aa  132  5e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000249417  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0292  50S ribosomal protein L2  38.46 
 
 		 264 aa  132  5e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>