More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2906 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2906  50S ribosomal protein L2  100 
 
 		 275 aa  556  1e-157  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0172805  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0870  50S ribosomal protein L2  79.27 
 
 		 275 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000015035  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0761  50S ribosomal protein L2  79.93 
 
 		 277 aa  442  1e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000295488  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01200  50S ribosomal protein L2  77.09 
 
 		 277 aa  439  9.999999999999999e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0770167  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2708  ribosomal protein L2  75.91 
 
 		 276 aa  436  1e-121  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000275562  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2711  50S ribosomal protein L2  75.55 
 
 		 277 aa  425  1e-118  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2396  50S ribosomal protein L2  75.55 
 
 		 277 aa  425  1e-118  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.445207  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0289  50S ribosomal protein L2  75.18 
 
 		 275 aa  421  1e-117  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0283371  normal  0.0481443 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1742  50S ribosomal protein L2  76.81 
 
 		 276 aa  421  1e-117  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000110614  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1521  ribosomal protein L2  74.82 
 
 		 275 aa  417  9.999999999999999e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0425  50S ribosomal protein L2  72.99 
 
 		 276 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000111287  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0984  50S ribosomal protein L2  71.79 
 
 		 280 aa  410  1e-114  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.619761  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0110  50S ribosomal protein L2  73.82 
 
 		 276 aa  411  1e-114  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2457  50S ribosomal protein L2  72.99 
 
 		 276 aa  411  1e-114  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0871736 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0114  50S ribosomal protein L2  73.45 
 
 		 276 aa  410  1e-114  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000290971  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0113  50S ribosomal protein L2  71.64 
 
 		 276 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000200839  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0125  50S ribosomal protein L2  71.64 
 
 		 276 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.14187e-61 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0113  50S ribosomal protein L2  71.64 
 
 		 276 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000138046  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0109  50S ribosomal protein L2  71.64 
 
 		 276 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.27306e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0144  50S ribosomal protein L2  71.64 
 
 		 276 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000100516  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0107  50S ribosomal protein L2  71.64 
 
 		 276 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000901221  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1182  50S ribosomal protein L2  71.9 
 
 		 275 aa  404  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0113  50S ribosomal protein L2  71.64 
 
 		 276 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000512601  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5192  50S ribosomal protein L2  72 
 
 		 276 aa  404  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000180933  unclonable  2.65522e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0134  50S ribosomal protein L2  72 
 
 		 276 aa  404  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000249417  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2330  50S ribosomal protein L2  69.82 
 
 		 275 aa  405  1.0000000000000001e-112  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000156043  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0107  50S ribosomal protein L2  72 
 
 		 276 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000204251  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0218  50S ribosomal protein L2  73.36 
 
 		 275 aa  404  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127498  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0108  50S ribosomal protein L2  71.64 
 
 		 276 aa  402  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000187869  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4023  50S ribosomal protein L2  72.26 
 
 		 275 aa  400  1e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.796821  hitchhiker  0.00000688583 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0228  50S ribosomal protein L2  71.9 
 
 		 275 aa  404  1e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0197  50S ribosomal protein L2  67.88 
 
 		 283 aa  399  9.999999999999999e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00345154  normal  0.0626583 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1828  50S ribosomal protein L2  70.18 
 
 		 277 aa  396  1e-109  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.256739  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2274  50S ribosomal protein L2  70.18 
 
 		 277 aa  396  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000299614  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23440  LSU ribosomal protein L2P  70.18 
 
 		 276 aa  394  1e-109  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000561637  decreased coverage  0.0000000103379 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2315  50S ribosomal protein L2  70.18 
 
 		 277 aa  396  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000290927  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0718  ribosomal protein L2  71.27 
 
 		 273 aa  395  1e-109  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09970  LSU ribosomal protein L2P  68.73 
 
 		 276 aa  389  1e-107  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.7223  hitchhiker  0.00000165173 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4918  50S ribosomal protein L2  69.45 
 
 		 275 aa  390  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.113284  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2175  ribosomal protein L2  68 
 
 		 276 aa  384  1e-106  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2854  50S ribosomal protein L2  72.26 
 
 		 274 aa  382  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.16125  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1571  ribosomal protein L2  66.79 
 
 		 277 aa  382  1e-105  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000641133  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1349  50S ribosomal protein L2  71.53 
 
 		 274 aa  381  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1070  50S ribosomal protein L2  72.26 
 
 		 274 aa  378  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000147453  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0629  50S ribosomal protein L2  71.9 
 
 		 274 aa  380  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000833663  hitchhiker  0.00000000000856838 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0288  50S ribosomal protein L2  69.71 
 
 		 274 aa  377  1e-104  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.101113  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3664  50S ribosomal protein L2  70.8 
 
 		 281 aa  379  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272816  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0294  50S ribosomal protein L2  67.64 
 
 		 278 aa  376  1e-103  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  3.4720999999999997e-28 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1181  ribosomal protein L2  67.88 
 
 		 274 aa  375  1e-103  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000178958  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0683  50S ribosomal protein L2  71.53 
 
 		 274 aa  377  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.660032  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3325  50S ribosomal protein L2  71.53 
 
 		 274 aa  374  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000129312 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3021  50S ribosomal protein L2  70.77 
 
 		 274 aa  372  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0478203  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2293  50S ribosomal protein L2  64.26 
 
 		 279 aa  373  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0106582  normal  0.012024 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0936  50S ribosomal protein L2  71.53 
 
 		 274 aa  372  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000014248  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1343  ribosomal protein L2  66.79 
 
 		 279 aa  371  1e-102  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2152  50S ribosomal protein L2  66.91 
 
 		 279 aa  369  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0924201  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1762  50S ribosomal protein L2  68.61 
 
 		 276 aa  365  1e-100  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00807764  normal  0.409688 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0199  50S ribosomal protein L2  66.91 
 
 		 277 aa  365  1e-100  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0675116  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1904  50S ribosomal protein L2  65.33 
 
 		 277 aa  363  1e-99  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2021  50S ribosomal protein L2  65.09 
 
 		 282 aa  363  2e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1943  50S ribosomal protein L2  65.09 
 
 		 282 aa  363  2e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1936  50S ribosomal protein L2  65.09 
 
 		 282 aa  363  2e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0787  50S ribosomal protein L2  64.96 
 
 		 274 aa  363  2e-99  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.469967  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1558  50S ribosomal protein L2  68 
 
 		 273 aa  363  2e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.49018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2399  50S ribosomal protein L2  66.3 
 
 		 276 aa  362  4e-99  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00287166  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0061  50S ribosomal protein L2  64.96 
 
 		 277 aa  362  5.0000000000000005e-99  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.41006  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1480  50S ribosomal protein L2  67.64 
 
 		 281 aa  361  6e-99  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000349234  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2254  50S ribosomal protein L2  67.52 
 
 		 276 aa  360  1e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000201463  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0082  50S ribosomal protein L2  67.52 
 
 		 276 aa  360  1e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.173583 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3009  50S ribosomal protein L2  62.55 
 
 		 287 aa  360  2e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.141186  hitchhiker  0.00819024 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1295  50S ribosomal protein L2  66.91 
 
 		 276 aa  359  3e-98  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000122183  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1391  50S ribosomal protein L2  66.91 
 
 		 276 aa  359  3e-98  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000232502  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0845  ribosomal protein L2  64.23 
 
 		 276 aa  359  3e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0249  50S ribosomal protein L2  64.96 
 
 		 276 aa  358  5e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0246  50S ribosomal protein L2  64.96 
 
 		 276 aa  358  5e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0956  50S ribosomal protein L2  68.98 
 
 		 274 aa  358  6e-98  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00125176  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1914  50S ribosomal protein L2  65.45 
 
 		 282 aa  357  9.999999999999999e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.253672 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0694  50S ribosomal protein L2  65.31 
 
 		 287 aa  356  1.9999999999999998e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00211234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0704  50S ribosomal protein L2  67.64 
 
 		 273 aa  356  1.9999999999999998e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000350454  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0565  50S ribosomal protein L2  67.64 
 
 		 277 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1848  50S ribosomal protein L2  64.13 
 
 		 279 aa  356  1.9999999999999998e-97  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.492965  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1158  ribosomal protein L2  63.9 
 
 		 278 aa  356  1.9999999999999998e-97  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000162145  hitchhiker  0.000000663071 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2061  50S ribosomal protein L2  64.26 
 
 		 279 aa  356  1.9999999999999998e-97  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000364134  normal  0.142265 
 
 
-
 
NC_002936  DET0477  50S ribosomal protein L2  63.87 
 
 		 274 aa  355  2.9999999999999997e-97  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0481332  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5046  50S ribosomal protein L2  66.67 
 
 		 279 aa  355  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.126955 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0663  50S ribosomal protein L2  66.07 
 
 		 282 aa  355  3.9999999999999996e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000112808  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_420  ribosomal protein L2  63.87 
 
 		 274 aa  355  5e-97  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00663414  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3706  50S ribosomal protein L2  64.96 
 
 		 277 aa  355  5e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0850  50S ribosomal protein L2  64.75 
 
 		 277 aa  355  5.999999999999999e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00104266  decreased coverage  0.0000130499 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10718  50S ribosomal protein L2  65.22 
 
 		 280 aa  354  8.999999999999999e-97  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0762488  normal  0.210258 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1033  50S ribosomal protein L2  66.67 
 
 		 278 aa  353  1e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.483426 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1043  50S ribosomal protein L2  66.67 
 
 		 278 aa  353  1e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1016  50S ribosomal protein L2  66.67 
 
 		 278 aa  353  1e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2562  50S ribosomal protein L2  63.1 
 
 		 287 aa  353  2e-96  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.244819  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0454  50S ribosomal protein L2  63.5 
 
 		 274 aa  353  2e-96  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000232989  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0590  50S ribosomal protein L2  65.22 
 
 		 278 aa  353  2e-96  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.274558  normal  0.886345 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2904  ribosomal protein L2  64.49 
 
 		 275 aa  352  2.9999999999999997e-96  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1308  50S ribosomal protein L2  65.94 
 
 		 278 aa  352  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186589  normal  0.118426 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1282  ribosomal protein L2  64.73 
 
 		 275 aa  352  2.9999999999999997e-96  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29710  LSU ribosomal protein L2P  65.58 
 
 		 279 aa  350  1e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.560922 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>