More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0288 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0288  50S ribosomal protein L2  100 
 
 		 274 aa  552  1e-156  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.101113  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0110  50S ribosomal protein L2  70.29 
 
 		 276 aa  397  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1521  ribosomal protein L2  72.26 
 
 		 275 aa  396  1e-109  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0114  50S ribosomal protein L2  69.93 
 
 		 276 aa  396  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000290971  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0107  50S ribosomal protein L2  68.48 
 
 		 276 aa  389  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000204251  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0108  50S ribosomal protein L2  68.12 
 
 		 276 aa  388  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000187869  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0134  50S ribosomal protein L2  68.48 
 
 		 276 aa  389  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000249417  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5192  50S ribosomal protein L2  68.48 
 
 		 276 aa  389  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000180933  unclonable  2.65522e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0113  50S ribosomal protein L2  68.48 
 
 		 276 aa  387  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000200839  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0113  50S ribosomal protein L2  68.48 
 
 		 276 aa  387  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000138046  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0109  50S ribosomal protein L2  68.48 
 
 		 276 aa  387  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.27306e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0125  50S ribosomal protein L2  68.48 
 
 		 276 aa  387  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.14187e-61 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0107  50S ribosomal protein L2  68.48 
 
 		 276 aa  387  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000901221  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0113  50S ribosomal protein L2  68.48 
 
 		 276 aa  387  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000512601  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0144  50S ribosomal protein L2  68.48 
 
 		 276 aa  387  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000100516  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0870  50S ribosomal protein L2  68.61 
 
 		 275 aa  381  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000015035  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2708  ribosomal protein L2  68.48 
 
 		 276 aa  382  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000275562  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4918  50S ribosomal protein L2  67.4 
 
 		 275 aa  379  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.113284  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0984  50S ribosomal protein L2  68.86 
 
 		 280 aa  377  1e-104  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.619761  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2906  50S ribosomal protein L2  69.71 
 
 		 275 aa  377  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0172805  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1828  50S ribosomal protein L2  67.03 
 
 		 277 aa  377  1e-103  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.256739  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0425  50S ribosomal protein L2  65.45 
 
 		 276 aa  376  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000111287  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0289  50S ribosomal protein L2  66.55 
 
 		 275 aa  374  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0283371  normal  0.0481443 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0718  ribosomal protein L2  66.3 
 
 		 273 aa  375  1e-103  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2315  50S ribosomal protein L2  67.39 
 
 		 277 aa  377  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000290927  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2274  50S ribosomal protein L2  67.39 
 
 		 277 aa  377  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000299614  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23440  LSU ribosomal protein L2P  64.49 
 
 		 276 aa  372  1e-102  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000561637  decreased coverage  0.0000000103379 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2175  ribosomal protein L2  64.13 
 
 		 276 aa  371  1e-102  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2457  50S ribosomal protein L2  65.22 
 
 		 276 aa  371  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0871736 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1742  50S ribosomal protein L2  68.36 
 
 		 276 aa  374  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000110614  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1181  ribosomal protein L2  66.55 
 
 		 274 aa  371  1e-102  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000178958  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0228  50S ribosomal protein L2  66.18 
 
 		 275 aa  372  1e-102  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0218  50S ribosomal protein L2  66.55 
 
 		 275 aa  372  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127498  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09970  LSU ribosomal protein L2P  64.49 
 
 		 276 aa  368  1e-101  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.7223  hitchhiker  0.00000165173 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1295  50S ribosomal protein L2  69.82 
 
 		 276 aa  368  1e-101  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000122183  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1391  50S ribosomal protein L2  69.82 
 
 		 276 aa  368  1e-101  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000232502  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01200  50S ribosomal protein L2  67.4 
 
 		 277 aa  369  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0770167  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0787  50S ribosomal protein L2  65.33 
 
 		 274 aa  367  1e-101  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.469967  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1343  ribosomal protein L2  64.44 
 
 		 279 aa  360  2e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2330  50S ribosomal protein L2  65.69 
 
 		 275 aa  359  3e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000156043  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1182  50S ribosomal protein L2  64.96 
 
 		 275 aa  358  4e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3021  50S ribosomal protein L2  68.08 
 
 		 274 aa  358  4e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0478203  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0268  50S ribosomal protein L2  67.02 
 
 		 288 aa  358  5e-98  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000297487  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1904  50S ribosomal protein L2  64.6 
 
 		 277 aa  358  7e-98  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0845  ribosomal protein L2  66.3 
 
 		 276 aa  356  1.9999999999999998e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4023  50S ribosomal protein L2  65.33 
 
 		 275 aa  355  3.9999999999999996e-97  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.796821  hitchhiker  0.00000688583 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0061  50S ribosomal protein L2  62.32 
 
 		 277 aa  353  2e-96  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.41006  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1762  50S ribosomal protein L2  65.45 
 
 		 276 aa  351  8e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00807764  normal  0.409688 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0249  50S ribosomal protein L2  64.96 
 
 		 276 aa  351  8e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0246  50S ribosomal protein L2  64.96 
 
 		 276 aa  351  8e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1349  50S ribosomal protein L2  62.91 
 
 		 274 aa  349  2e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0956  50S ribosomal protein L2  66.91 
 
 		 274 aa  349  2e-95  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00125176  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1158  ribosomal protein L2  63.27 
 
 		 278 aa  349  3e-95  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000162145  hitchhiker  0.000000663071 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2711  50S ribosomal protein L2  62.41 
 
 		 277 aa  348  4e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2396  50S ribosomal protein L2  62.41 
 
 		 277 aa  348  4e-95  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.445207  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0683  50S ribosomal protein L2  62.55 
 
 		 274 aa  346  2e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.660032  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2904  ribosomal protein L2  63.87 
 
 		 275 aa  345  3e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2293  50S ribosomal protein L2  62.68 
 
 		 279 aa  345  5e-94  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0106582  normal  0.012024 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2399  50S ribosomal protein L2  62.27 
 
 		 276 aa  344  7e-94  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00287166  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0082  50S ribosomal protein L2  63.27 
 
 		 276 aa  344  8.999999999999999e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.173583 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2854  50S ribosomal protein L2  62.55 
 
 		 274 aa  343  2e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.16125  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3912  50S ribosomal protein L2  62.41 
 
 		 274 aa  343  2e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.5044e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2254  50S ribosomal protein L2  63.27 
 
 		 276 aa  343  2e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000201463  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2229  50S ribosomal protein L2  62.59 
 
 		 287 aa  343  2e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.425308 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1135  50S ribosomal protein L2  64.84 
 
 		 275 aa  343  2e-93  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000903374  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3748  50S ribosomal protein L2  62.77 
 
 		 273 aa  343  2e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000108731  hitchhiker  0.00494792 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0587  50S ribosomal protein L2  62.41 
 
 		 274 aa  343  2e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000050829  normal  0.227169 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0197  50S ribosomal protein L2  59.78 
 
 		 283 aa  343  2e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00345154  normal  0.0626583 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3998  50S ribosomal protein L2  63.14 
 
 		 273 aa  343  2e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000302361  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0286  50S ribosomal protein L2  62.41 
 
 		 274 aa  343  2e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000315964  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3706  50S ribosomal protein L2  63.04 
 
 		 277 aa  342  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0694  50S ribosomal protein L2  63.47 
 
 		 287 aa  342  2.9999999999999997e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00211234  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3819  50S ribosomal protein L2  62.77 
 
 		 273 aa  342  2.9999999999999997e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000104624  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1480  50S ribosomal protein L2  64.96 
 
 		 281 aa  342  2.9999999999999997e-93  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000349234  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0761  50S ribosomal protein L2  61.23 
 
 		 277 aa  342  5e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000295488  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3633  50S ribosomal protein L2  62.41 
 
 		 273 aa  342  5e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0350833  normal  0.361481 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3804  50S ribosomal protein L2  62.41 
 
 		 273 aa  342  5e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00899018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3633  50S ribosomal protein L2  62.41 
 
 		 273 aa  342  5e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000993877  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3706  50S ribosomal protein L2  62.41 
 
 		 273 aa  342  5e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00279259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3741  50S ribosomal protein L2  62.41 
 
 		 273 aa  342  5e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.69026  normal  0.0152471 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0326  50S ribosomal protein L2  62.41 
 
 		 273 aa  341  7e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000291678  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2562  50S ribosomal protein L2  61.99 
 
 		 287 aa  340  1e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.244819  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0408  50S ribosomal protein L2  62.41 
 
 		 273 aa  340  2e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00399178  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0629  50S ribosomal protein L2  61.82 
 
 		 274 aa  340  2e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000833663  hitchhiker  0.00000000000856838 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03168  50S ribosomal protein L2  62.04 
 
 		 273 aa  339  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00146365  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0396  ribosomal protein L2  62.04 
 
 		 273 aa  339  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000401214  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3511  50S ribosomal protein L2  62.04 
 
 		 273 aa  339  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112597  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3702  50S ribosomal protein L2  62.04 
 
 		 273 aa  339  2.9999999999999998e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237187  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3800  50S ribosomal protein L2  62.04 
 
 		 273 aa  339  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000757775  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1864  50S ribosomal protein L2  65.82 
 
 		 277 aa  339  2.9999999999999998e-92  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0213539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3612  50S ribosomal protein L2  62.04 
 
 		 273 aa  339  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000120655  hitchhiker  0.00428222 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4640  50S ribosomal protein L2  62.04 
 
 		 273 aa  339  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0685659  normal  0.0584567 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0396  50S ribosomal protein L2  62.04 
 
 		 273 aa  339  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000072222  hitchhiker  0.000353424 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03119  hypothetical protein  62.04 
 
 		 273 aa  339  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00128631  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0663  50S ribosomal protein L2  62.99 
 
 		 282 aa  338  4e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000112808  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0704  50S ribosomal protein L2  62.27 
 
 		 273 aa  338  4e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000350454  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4541  50S ribosomal protein L2  61.31 
 
 		 274 aa  339  4e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000106039  hitchhiker  0.00201461 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1282  ribosomal protein L2  61.23 
 
 		 275 aa  338  5.9999999999999996e-92  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2061  50S ribosomal protein L2  63.41 
 
 		 279 aa  338  5.9999999999999996e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000364134  normal  0.142265 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2152  50S ribosomal protein L2  61.82 
 
 		 279 aa  338  8e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0924201  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>