More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2293 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2293  50S ribosomal protein L2  100 
 
 		 279 aa  560  1e-158  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0106582  normal  0.012024 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2061  50S ribosomal protein L2  88.17 
 
 		 279 aa  482  1e-135  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000364134  normal  0.142265 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1848  50S ribosomal protein L2  83.15 
 
 		 279 aa  450  1e-125  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.492965  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2226  50S ribosomal protein L2  82.95 
 
 		 264 aa  431  1e-120  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000549007  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0292  50S ribosomal protein L2  84.09 
 
 		 264 aa  432  1e-120  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2420  50S ribosomal protein L2  82.2 
 
 		 264 aa  430  1e-119  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00126121  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0787  50S ribosomal protein L2  66.67 
 
 		 274 aa  375  1e-103  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.469967  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01200  50S ribosomal protein L2  64.52 
 
 		 277 aa  375  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0770167  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2906  50S ribosomal protein L2  64.26 
 
 		 275 aa  373  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0172805  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2708  ribosomal protein L2  66.3 
 
 		 276 aa  374  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000275562  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2457  50S ribosomal protein L2  64.86 
 
 		 276 aa  366  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0871736 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0218  50S ribosomal protein L2  64.52 
 
 		 275 aa  364  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127498  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1521  ribosomal protein L2  63.77 
 
 		 275 aa  365  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2330  50S ribosomal protein L2  63.54 
 
 		 275 aa  363  2e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000156043  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0289  50S ribosomal protein L2  64.52 
 
 		 275 aa  362  3e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0283371  normal  0.0481443 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0870  50S ribosomal protein L2  63.54 
 
 		 275 aa  361  7.0000000000000005e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000015035  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0228  50S ribosomal protein L2  63.04 
 
 		 275 aa  360  2e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2175  ribosomal protein L2  62.09 
 
 		 276 aa  357  9.999999999999999e-98  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0425  50S ribosomal protein L2  62.32 
 
 		 276 aa  355  2.9999999999999997e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000111287  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23440  LSU ribosomal protein L2P  61.37 
 
 		 276 aa  354  7.999999999999999e-97  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000561637  decreased coverage  0.0000000103379 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1182  50S ribosomal protein L2  63.14 
 
 		 275 aa  353  2e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0984  50S ribosomal protein L2  62.04 
 
 		 280 aa  352  4e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.619761  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4023  50S ribosomal protein L2  63.5 
 
 		 275 aa  352  5e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.796821  hitchhiker  0.00000688583 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1762  50S ribosomal protein L2  61.29 
 
 		 276 aa  350  1e-95  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00807764  normal  0.409688 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2254  50S ribosomal protein L2  62.01 
 
 		 276 aa  350  2e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000201463  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0845  ribosomal protein L2  63.31 
 
 		 276 aa  348  5e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09970  LSU ribosomal protein L2P  60.65 
 
 		 276 aa  347  9e-95  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.7223  hitchhiker  0.00000165173 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2711  50S ribosomal protein L2  62.37 
 
 		 277 aa  347  1e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2396  50S ribosomal protein L2  62.37 
 
 		 277 aa  347  1e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.445207  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4918  50S ribosomal protein L2  60.93 
 
 		 275 aa  346  3e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.113284  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0288  50S ribosomal protein L2  62.68 
 
 		 274 aa  345  5e-94  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.101113  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0718  ribosomal protein L2  62.09 
 
 		 273 aa  345  7e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0629  50S ribosomal protein L2  62.68 
 
 		 274 aa  344  7e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000833663  hitchhiker  0.00000000000856838 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0107  50S ribosomal protein L2  62.09 
 
 		 276 aa  344  8.999999999999999e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000204251  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1181  ribosomal protein L2  61.59 
 
 		 274 aa  344  1e-93  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000178958  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0711  50S ribosomal protein L2  62.91 
 
 		 275 aa  343  1e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.876488  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1343  ribosomal protein L2  62.27 
 
 		 279 aa  342  5e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2062  50S ribosomal protein L2  62.32 
 
 		 275 aa  342  5e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000331539  normal  0.228916 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0144  50S ribosomal protein L2  61.73 
 
 		 276 aa  341  8e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000100516  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0113  50S ribosomal protein L2  61.73 
 
 		 276 aa  341  8e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000200839  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0113  50S ribosomal protein L2  61.73 
 
 		 276 aa  341  8e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000138046  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0109  50S ribosomal protein L2  61.73 
 
 		 276 aa  341  8e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.27306e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0107  50S ribosomal protein L2  61.73 
 
 		 276 aa  341  8e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000901221  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2274  50S ribosomal protein L2  62.01 
 
 		 277 aa  341  8e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000299614  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0113  50S ribosomal protein L2  61.73 
 
 		 276 aa  341  8e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000512601  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0125  50S ribosomal protein L2  61.73 
 
 		 276 aa  341  8e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.14187e-61 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2315  50S ribosomal protein L2  62.01 
 
 		 277 aa  341  8e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000290927  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1571  ribosomal protein L2  60.93 
 
 		 277 aa  340  1e-92  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000641133  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0246  50S ribosomal protein L2  63.41 
 
 		 276 aa  340  2e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0134  50S ribosomal protein L2  61.73 
 
 		 276 aa  340  2e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000249417  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5192  50S ribosomal protein L2  61.73 
 
 		 276 aa  340  2e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000180933  unclonable  2.65522e-25 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0249  50S ribosomal protein L2  63.41 
 
 		 276 aa  340  2e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0082  50S ribosomal protein L2  60.57 
 
 		 276 aa  340  2e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.173583 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1558  50S ribosomal protein L2  62.09 
 
 		 273 aa  340  2e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.49018  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0114  50S ribosomal protein L2  60.29 
 
 		 276 aa  339  2e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000290971  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1349  50S ribosomal protein L2  61.59 
 
 		 274 aa  339  2.9999999999999998e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3706  50S ribosomal protein L2  62.68 
 
 		 277 aa  338  4e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0108  50S ribosomal protein L2  61.73 
 
 		 276 aa  339  4e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000187869  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2854  50S ribosomal protein L2  61.59 
 
 		 274 aa  338  5e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.16125  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1828  50S ribosomal protein L2  60.93 
 
 		 277 aa  338  5.9999999999999996e-92  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.256739  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0197  50S ribosomal protein L2  59.06 
 
 		 283 aa  337  9.999999999999999e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00345154  normal  0.0626583 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0761  50S ribosomal protein L2  60.93 
 
 		 277 aa  337  9.999999999999999e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000295488  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0110  50S ribosomal protein L2  59.57 
 
 		 276 aa  335  2.9999999999999997e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0683  50S ribosomal protein L2  61.96 
 
 		 274 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.660032  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1391  50S ribosomal protein L2  63.18 
 
 		 276 aa  334  7.999999999999999e-91  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000232502  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1295  50S ribosomal protein L2  63.18 
 
 		 276 aa  334  7.999999999999999e-91  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000122183  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3325  50S ribosomal protein L2  60.51 
 
 		 274 aa  333  1e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000129312 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3021  50S ribosomal protein L2  62.36 
 
 		 274 aa  334  1e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0478203  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0936  50S ribosomal protein L2  60.51 
 
 		 274 aa  334  1e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000014248  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2152  50S ribosomal protein L2  59.93 
 
 		 279 aa  333  2e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0924201  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1742  50S ribosomal protein L2  61.15 
 
 		 276 aa  333  2e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000110614  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1158  ribosomal protein L2  58.93 
 
 		 278 aa  333  2e-90  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000162145  hitchhiker  0.000000663071 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0956  50S ribosomal protein L2  63.04 
 
 		 274 aa  332  3e-90  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00125176  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3009  50S ribosomal protein L2  60.65 
 
 		 287 aa  331  7.000000000000001e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.141186  hitchhiker  0.00819024 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0663  50S ribosomal protein L2  59.65 
 
 		 282 aa  331  8e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000112808  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0694  50S ribosomal protein L2  60.81 
 
 		 287 aa  329  3e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00211234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1070  50S ribosomal protein L2  59.78 
 
 		 274 aa  329  3e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000147453  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0704  50S ribosomal protein L2  59.57 
 
 		 273 aa  328  5.0000000000000004e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000350454  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1710  50S ribosomal protein L2  62.09 
 
 		 276 aa  328  7e-89  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0301  50S ribosomal protein L2  60.57 
 
 		 278 aa  327  1.0000000000000001e-88  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.302391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0258  ribosomal protein L2  62.09 
 
 		 276 aa  327  2.0000000000000001e-88  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1943  50S ribosomal protein L2  58.33 
 
 		 282 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2021  50S ribosomal protein L2  58.33 
 
 		 282 aa  326  3e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1936  50S ribosomal protein L2  58.33 
 
 		 282 aa  326  3e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0605  ribosomal protein L2  59.21 
 
 		 274 aa  325  7e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.397352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1480  50S ribosomal protein L2  60.65 
 
 		 281 aa  323  1e-87  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000349234  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2771  50S ribosomal protein L2  59.5 
 
 		 276 aa  324  1e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00347741  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1864  50S ribosomal protein L2  58.93 
 
 		 277 aa  323  2e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0213539  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2904  ribosomal protein L2  57.55 
 
 		 275 aa  323  2e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2399  50S ribosomal protein L2  59.85 
 
 		 276 aa  323  2e-87  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00287166  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2229  50S ribosomal protein L2  58.46 
 
 		 287 aa  322  4e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.425308 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2562  50S ribosomal protein L2  58.24 
 
 		 287 aa  322  5e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.244819  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1914  50S ribosomal protein L2  59.93 
 
 		 282 aa  321  6e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.253672 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0294  50S ribosomal protein L2  57.76 
 
 		 278 aa  320  9.999999999999999e-87  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  3.4720999999999997e-28 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1135  50S ribosomal protein L2  60.65 
 
 		 275 aa  320  9.999999999999999e-87  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000903374  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1904  50S ribosomal protein L2  57.35 
 
 		 277 aa  318  3.9999999999999996e-86  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17371  50S ribosomal protein L2  58.61 
 
 		 287 aa  318  7.999999999999999e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3664  50S ribosomal protein L2  59.14 
 
 		 281 aa  318  7.999999999999999e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272816  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0590  50S ribosomal protein L2  59.86 
 
 		 278 aa  317  9e-86  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.274558  normal  0.886345 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0037  50S ribosomal protein L2  57.86 
 
 		 276 aa  317  1e-85  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00257974  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>