More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0629 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0629  50S ribosomal protein L2  100 
 
 		 274 aa  558  1e-158  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000833663  hitchhiker  0.00000000000856838 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2854  50S ribosomal protein L2  91.24 
 
 		 274 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.16125  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1070  50S ribosomal protein L2  86.5 
 
 		 274 aa  476  1e-133  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000147453  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1349  50S ribosomal protein L2  85.04 
 
 		 274 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0683  50S ribosomal protein L2  82.85 
 
 		 274 aa  461  1e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.660032  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0936  50S ribosomal protein L2  82.12 
 
 		 274 aa  448  1e-125  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000014248  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3325  50S ribosomal protein L2  82.12 
 
 		 274 aa  449  1e-125  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000129312 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0704  50S ribosomal protein L2  76.67 
 
 		 273 aa  419  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000350454  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01200  50S ribosomal protein L2  72.79 
 
 		 277 aa  417  9.999999999999999e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0770167  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2906  50S ribosomal protein L2  71.9 
 
 		 275 aa  395  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0172805  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2708  ribosomal protein L2  69.93 
 
 		 276 aa  392  1e-108  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000275562  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0289  50S ribosomal protein L2  68.25 
 
 		 275 aa  387  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0283371  normal  0.0481443 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4918  50S ribosomal protein L2  67.88 
 
 		 275 aa  382  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.113284  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2254  50S ribosomal protein L2  70.33 
 
 		 276 aa  381  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000201463  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09970  LSU ribosomal protein L2P  66.67 
 
 		 276 aa  381  1e-105  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.7223  hitchhiker  0.00000165173 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0218  50S ribosomal protein L2  68.98 
 
 		 275 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127498  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0870  50S ribosomal protein L2  67.15 
 
 		 275 aa  380  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000015035  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4023  50S ribosomal protein L2  65.45 
 
 		 275 aa  378  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.796821  hitchhiker  0.00000688583 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1181  ribosomal protein L2  64.23 
 
 		 274 aa  375  1e-103  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000178958  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2771  50S ribosomal protein L2  72.53 
 
 		 276 aa  374  1e-103  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00347741  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1762  50S ribosomal protein L2  68.86 
 
 		 276 aa  375  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00807764  normal  0.409688 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2457  50S ribosomal protein L2  68.12 
 
 		 276 aa  375  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0871736 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0425  50S ribosomal protein L2  66.91 
 
 		 276 aa  377  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000111287  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1182  50S ribosomal protein L2  64.73 
 
 		 275 aa  376  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0850  50S ribosomal protein L2  67.39 
 
 		 277 aa  376  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00104266  decreased coverage  0.0000130499 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1521  ribosomal protein L2  65.57 
 
 		 275 aa  372  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2175  ribosomal protein L2  65.58 
 
 		 276 aa  372  1e-102  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23440  LSU ribosomal protein L2P  65.58 
 
 		 276 aa  373  1e-102  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000561637  decreased coverage  0.0000000103379 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0787  50S ribosomal protein L2  65.82 
 
 		 274 aa  373  1e-102  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.469967  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0082  50S ribosomal protein L2  68.5 
 
 		 276 aa  371  1e-102  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.173583 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0107  50S ribosomal protein L2  66.67 
 
 		 276 aa  367  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000204251  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0663  50S ribosomal protein L2  68.82 
 
 		 282 aa  367  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000112808  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0228  50S ribosomal protein L2  65.45 
 
 		 275 aa  364  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0718  ribosomal protein L2  64.71 
 
 		 273 aa  364  1e-100  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2062  50S ribosomal protein L2  68.36 
 
 		 275 aa  365  1e-100  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000331539  normal  0.228916 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2711  50S ribosomal protein L2  65.69 
 
 		 277 aa  365  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2396  50S ribosomal protein L2  65.69 
 
 		 277 aa  365  1e-100  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.445207  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3021  50S ribosomal protein L2  67.18 
 
 		 274 aa  364  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0478203  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0711  50S ribosomal protein L2  65.82 
 
 		 275 aa  365  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.876488  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1558  50S ribosomal protein L2  68.38 
 
 		 273 aa  366  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.49018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0984  50S ribosomal protein L2  65.07 
 
 		 280 aa  367  1e-100  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.619761  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0113  50S ribosomal protein L2  65.58 
 
 		 276 aa  363  1e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000200839  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0113  50S ribosomal protein L2  65.58 
 
 		 276 aa  363  1e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000138046  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0109  50S ribosomal protein L2  65.58 
 
 		 276 aa  363  1e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.27306e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0107  50S ribosomal protein L2  65.58 
 
 		 276 aa  363  1e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000901221  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0125  50S ribosomal protein L2  65.58 
 
 		 276 aa  363  1e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.14187e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0113  50S ribosomal protein L2  65.58 
 
 		 276 aa  363  1e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000512601  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0144  50S ribosomal protein L2  65.58 
 
 		 276 aa  363  1e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000100516  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0197  50S ribosomal protein L2  63.41 
 
 		 283 aa  362  3e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00345154  normal  0.0626583 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2330  50S ribosomal protein L2  64.47 
 
 		 275 aa  362  3e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000156043  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0114  50S ribosomal protein L2  65.58 
 
 		 276 aa  362  5.0000000000000005e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000290971  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2293  50S ribosomal protein L2  64.49 
 
 		 279 aa  362  5.0000000000000005e-99  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0106582  normal  0.012024 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0110  50S ribosomal protein L2  65.58 
 
 		 276 aa  362  5.0000000000000005e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1742  50S ribosomal protein L2  67.27 
 
 		 276 aa  361  6e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000110614  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5192  50S ribosomal protein L2  64.86 
 
 		 276 aa  359  2e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000180933  unclonable  2.65522e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0134  50S ribosomal protein L2  64.86 
 
 		 276 aa  359  2e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000249417  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0288  50S ribosomal protein L2  63.64 
 
 		 274 aa  358  6e-98  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.101113  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0108  50S ribosomal protein L2  64.49 
 
 		 276 aa  358  7e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000187869  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1936  50S ribosomal protein L2  63.37 
 
 		 282 aa  357  9.999999999999999e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2021  50S ribosomal protein L2  63.37 
 
 		 282 aa  357  9.999999999999999e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0761  50S ribosomal protein L2  63.41 
 
 		 277 aa  356  2.9999999999999997e-97  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000295488  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1943  50S ribosomal protein L2  62.64 
 
 		 282 aa  354  6.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1914  50S ribosomal protein L2  63 
 
 		 282 aa  353  1e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.253672 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1343  ribosomal protein L2  65.56 
 
 		 279 aa  353  1e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1229  50S ribosomal protein L2  66.06 
 
 		 275 aa  348  4e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.624705  unclonable  0.0000121783 
 
 
-
 
NC_002936  DET0477  50S ribosomal protein L2  62.64 
 
 		 274 aa  348  7e-95  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0481332  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1158  ribosomal protein L2  62.55 
 
 		 278 aa  347  1e-94  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000162145  hitchhiker  0.000000663071 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_420  ribosomal protein L2  62.27 
 
 		 274 aa  345  4e-94  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00663414  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2061  50S ribosomal protein L2  64.13 
 
 		 279 aa  344  7e-94  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000364134  normal  0.142265 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0454  50S ribosomal protein L2  62.27 
 
 		 274 aa  344  1e-93  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000232989  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2274  50S ribosomal protein L2  62.68 
 
 		 277 aa  343  2e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000299614  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2315  50S ribosomal protein L2  62.68 
 
 		 277 aa  343  2e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000290927  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1828  50S ribosomal protein L2  63.04 
 
 		 277 aa  342  2.9999999999999997e-93  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.256739  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0565  50S ribosomal protein L2  65.82 
 
 		 277 aa  342  2.9999999999999997e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4002  ribosomal protein L2  64.6 
 
 		 275 aa  342  2.9999999999999997e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101165  normal  0.712064 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0258  ribosomal protein L2  62.55 
 
 		 276 aa  342  5e-93  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1710  50S ribosomal protein L2  61.82 
 
 		 276 aa  340  1e-92  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0037  50S ribosomal protein L2  61.54 
 
 		 276 aa  340  2e-92  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00257974  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1571  ribosomal protein L2  60.51 
 
 		 277 aa  337  9e-92  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000641133  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1295  50S ribosomal protein L2  61.96 
 
 		 276 aa  337  9.999999999999999e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000122183  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0630  ribosomal protein L2  64.47 
 
 		 278 aa  337  9.999999999999999e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1391  50S ribosomal protein L2  61.96 
 
 		 276 aa  337  9.999999999999999e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000232502  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0294  50S ribosomal protein L2  61.68 
 
 		 278 aa  337  9.999999999999999e-92  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  3.4720999999999997e-28 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2643  50S ribosomal protein L2  65.09 
 
 		 277 aa  335  2.9999999999999997e-91  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.331406  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0956  50S ribosomal protein L2  63.14 
 
 		 274 aa  336  2.9999999999999997e-91  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00125176  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0845  ribosomal protein L2  61.31 
 
 		 276 aa  335  3.9999999999999995e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2656  ribosomal protein L2  64.84 
 
 		 278 aa  335  3.9999999999999995e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0199  50S ribosomal protein L2  63.14 
 
 		 277 aa  335  3.9999999999999995e-91  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0675116  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2904  ribosomal protein L2  61.68 
 
 		 275 aa  335  5e-91  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0408  50S ribosomal protein L2  60.22 
 
 		 273 aa  335  5e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00399178  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0590  50S ribosomal protein L2  64.47 
 
 		 278 aa  335  7e-91  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.274558  normal  0.886345 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0352  50S ribosomal protein L2  59.85 
 
 		 277 aa  334  7.999999999999999e-91  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000147687  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0691  50S ribosomal protein L2  63.37 
 
 		 278 aa  334  7.999999999999999e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0694  50S ribosomal protein L2  61.25 
 
 		 287 aa  333  1e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00211234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0062  50S ribosomal protein L2  59.85 
 
 		 273 aa  334  1e-90  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000394369  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29710  LSU ribosomal protein L2P  63.74 
 
 		 279 aa  333  2e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.560922 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2152  50S ribosomal protein L2  60.22 
 
 		 279 aa  333  2e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0924201  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0587  50S ribosomal protein L2  60.22 
 
 		 274 aa  333  3e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000050829  normal  0.227169 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0286  50S ribosomal protein L2  60.22 
 
 		 274 aa  333  3e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000315964  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3912  50S ribosomal protein L2  60.22 
 
 		 274 aa  333  3e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.5044e-16  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>