More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0663 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0663  50S ribosomal protein L2  100 
 
 		 282 aa  568  1e-161  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000112808  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1762  50S ribosomal protein L2  84.4 
 
 		 276 aa  458  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00807764  normal  0.409688 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0082  50S ribosomal protein L2  83.33 
 
 		 276 aa  456  1e-127  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.173583 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2254  50S ribosomal protein L2  80.14 
 
 		 276 aa  445  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000201463  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2062  50S ribosomal protein L2  75.8 
 
 		 275 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000331539  normal  0.228916 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2771  50S ribosomal protein L2  73.4 
 
 		 276 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00347741  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2175  ribosomal protein L2  66.43 
 
 		 276 aa  379  1e-104  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09970  LSU ribosomal protein L2P  66.79 
 
 		 276 aa  380  1e-104  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.7223  hitchhiker  0.00000165173 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2906  50S ribosomal protein L2  67.86 
 
 		 275 aa  375  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0172805  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23440  LSU ribosomal protein L2P  65.71 
 
 		 276 aa  377  1e-103  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000561637  decreased coverage  0.0000000103379 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0629  50S ribosomal protein L2  68.82 
 
 		 274 aa  371  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000833663  hitchhiker  0.00000000000856838 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01200  50S ribosomal protein L2  66.31 
 
 		 277 aa  373  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0770167  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2708  ribosomal protein L2  67.86 
 
 		 276 aa  372  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000275562  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2854  50S ribosomal protein L2  67.26 
 
 		 274 aa  369  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.16125  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0289  50S ribosomal protein L2  67.38 
 
 		 275 aa  369  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0283371  normal  0.0481443 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1349  50S ribosomal protein L2  68.46 
 
 		 274 aa  369  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1070  50S ribosomal protein L2  68.1 
 
 		 274 aa  365  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000147453  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0228  50S ribosomal protein L2  66.31 
 
 		 275 aa  361  9e-99  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0683  50S ribosomal protein L2  67.38 
 
 		 274 aa  360  1e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.660032  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2457  50S ribosomal protein L2  66.31 
 
 		 276 aa  358  7e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0871736 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0870  50S ribosomal protein L2  64.29 
 
 		 275 aa  357  9e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000015035  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0288  50S ribosomal protein L2  64.41 
 
 		 274 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.101113  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0704  50S ribosomal protein L2  67.03 
 
 		 273 aa  355  5e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000350454  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1181  ribosomal protein L2  62.72 
 
 		 274 aa  355  5e-97  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000178958  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1158  ribosomal protein L2  62.54 
 
 		 278 aa  355  5e-97  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000162145  hitchhiker  0.000000663071 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0107  50S ribosomal protein L2  65.36 
 
 		 276 aa  355  5.999999999999999e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000204251  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0425  50S ribosomal protein L2  63.83 
 
 		 276 aa  354  7.999999999999999e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000111287  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1521  ribosomal protein L2  65.71 
 
 		 275 aa  354  1e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0197  50S ribosomal protein L2  63.12 
 
 		 283 aa  353  2e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00345154  normal  0.0626583 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3325  50S ribosomal protein L2  67.03 
 
 		 274 aa  352  2.9999999999999997e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000129312 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0144  50S ribosomal protein L2  64.64 
 
 		 276 aa  352  4e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000100516  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0113  50S ribosomal protein L2  64.64 
 
 		 276 aa  352  4e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000200839  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0113  50S ribosomal protein L2  64.64 
 
 		 276 aa  352  4e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000138046  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0109  50S ribosomal protein L2  64.64 
 
 		 276 aa  352  4e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.27306e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0107  50S ribosomal protein L2  64.64 
 
 		 276 aa  352  4e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000901221  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0125  50S ribosomal protein L2  64.64 
 
 		 276 aa  352  4e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.14187e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0113  50S ribosomal protein L2  64.64 
 
 		 276 aa  352  4e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000512601  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0936  50S ribosomal protein L2  66.67 
 
 		 274 aa  351  8e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000014248  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0984  50S ribosomal protein L2  61.84 
 
 		 280 aa  350  1e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.619761  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0218  50S ribosomal protein L2  64.54 
 
 		 275 aa  350  1e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127498  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5192  50S ribosomal protein L2  64.29 
 
 		 276 aa  350  1e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000180933  unclonable  2.65522e-25 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2293  50S ribosomal protein L2  61.75 
 
 		 279 aa  350  1e-95  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0106582  normal  0.012024 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0134  50S ribosomal protein L2  64.29 
 
 		 276 aa  350  1e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000249417  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0787  50S ribosomal protein L2  61.29 
 
 		 274 aa  349  3e-95  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.469967  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4918  50S ribosomal protein L2  63.12 
 
 		 275 aa  349  3e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.113284  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0108  50S ribosomal protein L2  63.93 
 
 		 276 aa  349  4e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000187869  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0114  50S ribosomal protein L2  63.21 
 
 		 276 aa  348  5e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000290971  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1343  ribosomal protein L2  63.41 
 
 		 279 aa  348  7e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4023  50S ribosomal protein L2  64.29 
 
 		 275 aa  347  1e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.796821  hitchhiker  0.00000688583 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0110  50S ribosomal protein L2  63.21 
 
 		 276 aa  346  3e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1182  50S ribosomal protein L2  63.57 
 
 		 275 aa  345  4e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0761  50S ribosomal protein L2  63.25 
 
 		 277 aa  345  6e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000295488  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1742  50S ribosomal protein L2  63.35 
 
 		 276 aa  344  8e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000110614  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0711  50S ribosomal protein L2  64.89 
 
 		 275 aa  343  2e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.876488  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1571  ribosomal protein L2  63.6 
 
 		 277 aa  342  4e-93  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000641133  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1558  50S ribosomal protein L2  64.52 
 
 		 273 aa  341  9e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.49018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3021  50S ribosomal protein L2  67.29 
 
 		 274 aa  341  1e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0478203  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2643  50S ribosomal protein L2  67.84 
 
 		 277 aa  340  2e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.331406  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2711  50S ribosomal protein L2  62.54 
 
 		 277 aa  340  2e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2396  50S ribosomal protein L2  62.54 
 
 		 277 aa  340  2e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.445207  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0565  50S ribosomal protein L2  65.37 
 
 		 277 aa  339  2e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0718  ribosomal protein L2  63.44 
 
 		 273 aa  340  2e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1295  50S ribosomal protein L2  63.48 
 
 		 276 aa  339  4e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000122183  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1391  50S ribosomal protein L2  63.48 
 
 		 276 aa  339  4e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000232502  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0249  50S ribosomal protein L2  63.57 
 
 		 276 aa  336  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0246  50S ribosomal protein L2  63.57 
 
 		 276 aa  336  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2061  50S ribosomal protein L2  62.11 
 
 		 279 aa  337  1.9999999999999998e-91  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000364134  normal  0.142265 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2315  50S ribosomal protein L2  61.48 
 
 		 277 aa  335  3.9999999999999995e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000290927  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2274  50S ribosomal protein L2  61.48 
 
 		 277 aa  335  3.9999999999999995e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000299614  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0956  50S ribosomal protein L2  64.52 
 
 		 274 aa  334  7.999999999999999e-91  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00125176  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1828  50S ribosomal protein L2  61.84 
 
 		 277 aa  334  1e-90  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.256739  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3009  50S ribosomal protein L2  59.29 
 
 		 287 aa  334  1e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.141186  hitchhiker  0.00819024 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0845  ribosomal protein L2  62.01 
 
 		 276 aa  333  2e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2562  50S ribosomal protein L2  61.37 
 
 		 287 aa  333  2e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.244819  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0258  ribosomal protein L2  62.28 
 
 		 276 aa  333  2e-90  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1848  50S ribosomal protein L2  62.81 
 
 		 279 aa  332  4e-90  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.492965  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0309  50S ribosomal protein L2  66.07 
 
 		 278 aa  332  6e-90  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237082 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0061  50S ribosomal protein L2  61.48 
 
 		 277 aa  330  1e-89  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.41006  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1904  50S ribosomal protein L2  61.48 
 
 		 277 aa  330  1e-89  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5127  ribosomal protein L2  64.98 
 
 		 279 aa  330  2e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.840283 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4318  ribosomal protein L2  66.08 
 
 		 277 aa  330  2e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3706  50S ribosomal protein L2  61.35 
 
 		 277 aa  330  2e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0590  50S ribosomal protein L2  64.64 
 
 		 278 aa  330  2e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.274558  normal  0.886345 
 
 
-
 
NC_002936  DET0477  50S ribosomal protein L2  61.57 
 
 		 274 aa  329  3e-89  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0481332  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0294  50S ribosomal protein L2  60.71 
 
 		 278 aa  329  3e-89  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  3.4720999999999997e-28 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2330  50S ribosomal protein L2  61.79 
 
 		 275 aa  328  4e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000156043  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3140  50S ribosomal protein L2  63.21 
 
 		 278 aa  328  5.0000000000000004e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.524365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10718  50S ribosomal protein L2  63.21 
 
 		 280 aa  328  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0762488  normal  0.210258 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2904  ribosomal protein L2  60 
 
 		 275 aa  328  7e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1710  50S ribosomal protein L2  61.21 
 
 		 276 aa  328  7e-89  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1016  50S ribosomal protein L2  63.93 
 
 		 278 aa  327  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1033  50S ribosomal protein L2  63.93 
 
 		 278 aa  327  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.483426 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1043  50S ribosomal protein L2  63.93 
 
 		 278 aa  327  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0630  ribosomal protein L2  63.57 
 
 		 278 aa  327  2.0000000000000001e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5046  50S ribosomal protein L2  63.57 
 
 		 279 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.126955 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1308  50S ribosomal protein L2  63.21 
 
 		 278 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186589  normal  0.118426 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1914  50S ribosomal protein L2  59.64 
 
 		 282 aa  325  4.0000000000000003e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.253672 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0454  50S ribosomal protein L2  60.85 
 
 		 274 aa  325  5e-88  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000232989  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1135  50S ribosomal protein L2  61.07 
 
 		 275 aa  325  5e-88  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000903374  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0850  50S ribosomal protein L2  59.86 
 
 		 277 aa  325  5e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00104266  decreased coverage  0.0000130499 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>