More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2904 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_2904  ribosomal protein L2  100 
 
 		 275 aa  554  1e-157  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2616  50S ribosomal protein L2  81.45 
 
 		 275 aa  437  9.999999999999999e-123  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0160883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1864  50S ribosomal protein L2  73.72 
 
 		 277 aa  394  1e-109  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0213539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23440  LSU ribosomal protein L2P  67.03 
 
 		 276 aa  372  1e-102  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000561637  decreased coverage  0.0000000103379 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09970  LSU ribosomal protein L2P  66.67 
 
 		 276 aa  365  1e-100  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.7223  hitchhiker  0.00000165173 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01200  50S ribosomal protein L2  64.36 
 
 		 277 aa  365  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0770167  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2175  ribosomal protein L2  65.22 
 
 		 276 aa  363  2e-99  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0425  50S ribosomal protein L2  64.6 
 
 		 276 aa  360  1e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000111287  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1521  ribosomal protein L2  64.73 
 
 		 275 aa  360  1e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1391  50S ribosomal protein L2  67.15 
 
 		 276 aa  358  6e-98  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000232502  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1295  50S ribosomal protein L2  67.15 
 
 		 276 aa  358  6e-98  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000122183  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2708  ribosomal protein L2  64.73 
 
 		 276 aa  357  9.999999999999999e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000275562  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0218  50S ribosomal protein L2  65.33 
 
 		 275 aa  355  2.9999999999999997e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127498  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0107  50S ribosomal protein L2  64.49 
 
 		 276 aa  353  1e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000204251  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2906  50S ribosomal protein L2  64.49 
 
 		 275 aa  352  2.9999999999999997e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0172805  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0289  50S ribosomal protein L2  64.6 
 
 		 275 aa  352  2.9999999999999997e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0283371  normal  0.0481443 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0984  50S ribosomal protein L2  63.87 
 
 		 280 aa  352  4e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.619761  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1828  50S ribosomal protein L2  64.49 
 
 		 277 aa  348  4e-95  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.256739  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1135  50S ribosomal protein L2  65.69 
 
 		 275 aa  348  4e-95  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000903374  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0718  ribosomal protein L2  65.45 
 
 		 273 aa  348  5e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0110  50S ribosomal protein L2  61.96 
 
 		 276 aa  348  6e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0114  50S ribosomal protein L2  61.96 
 
 		 276 aa  347  1e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000290971  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5192  50S ribosomal protein L2  63.41 
 
 		 276 aa  347  1e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000180933  unclonable  2.65522e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0134  50S ribosomal protein L2  63.41 
 
 		 276 aa  347  1e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000249417  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2457  50S ribosomal protein L2  64 
 
 		 276 aa  346  2e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0871736 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2315  50S ribosomal protein L2  63.41 
 
 		 277 aa  346  3e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000290927  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2274  50S ribosomal protein L2  63.41 
 
 		 277 aa  346  3e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000299614  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0288  50S ribosomal protein L2  63.87 
 
 		 274 aa  345  3e-94  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.101113  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0787  50S ribosomal protein L2  61.31 
 
 		 274 aa  345  3e-94  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.469967  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0144  50S ribosomal protein L2  62.68 
 
 		 276 aa  345  4e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000100516  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0113  50S ribosomal protein L2  62.68 
 
 		 276 aa  345  4e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000200839  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0113  50S ribosomal protein L2  62.68 
 
 		 276 aa  345  4e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000138046  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0109  50S ribosomal protein L2  62.68 
 
 		 276 aa  345  4e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.27306e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0107  50S ribosomal protein L2  62.68 
 
 		 276 aa  345  4e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000901221  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0108  50S ribosomal protein L2  63.04 
 
 		 276 aa  345  4e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000187869  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0113  50S ribosomal protein L2  62.68 
 
 		 276 aa  345  4e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000512601  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0228  50S ribosomal protein L2  62.04 
 
 		 275 aa  345  4e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0956  50S ribosomal protein L2  66.79 
 
 		 274 aa  345  4e-94  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00125176  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0125  50S ribosomal protein L2  62.68 
 
 		 276 aa  345  4e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.14187e-61 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0870  50S ribosomal protein L2  62.32 
 
 		 275 aa  343  2e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000015035  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2152  50S ribosomal protein L2  62.91 
 
 		 279 aa  342  4e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0924201  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1182  50S ribosomal protein L2  63.27 
 
 		 275 aa  340  1e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4918  50S ribosomal protein L2  61.82 
 
 		 275 aa  340  2e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.113284  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0249  50S ribosomal protein L2  62.91 
 
 		 276 aa  339  2.9999999999999998e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0246  50S ribosomal protein L2  62.91 
 
 		 276 aa  339  2.9999999999999998e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3706  50S ribosomal protein L2  62.18 
 
 		 277 aa  339  4e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1742  50S ribosomal protein L2  61.73 
 
 		 276 aa  338  5e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000110614  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0694  50S ribosomal protein L2  61.76 
 
 		 287 aa  337  9.999999999999999e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00211234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1571  ribosomal protein L2  60 
 
 		 277 aa  337  9.999999999999999e-92  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000641133  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1158  ribosomal protein L2  61.73 
 
 		 278 aa  337  9.999999999999999e-92  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000162145  hitchhiker  0.000000663071 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0199  50S ribosomal protein L2  60.87 
 
 		 277 aa  335  5.999999999999999e-91  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0675116  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1181  ribosomal protein L2  60.22 
 
 		 274 aa  335  7e-91  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000178958  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0373  50S ribosomal protein L2  58.7 
 
 		 287 aa  333  2e-90  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4023  50S ribosomal protein L2  61.82 
 
 		 275 aa  333  2e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.796821  hitchhiker  0.00000688583 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2711  50S ribosomal protein L2  60.36 
 
 		 277 aa  333  2e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2396  50S ribosomal protein L2  60.36 
 
 		 277 aa  333  2e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.445207  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2562  50S ribosomal protein L2  59.56 
 
 		 287 aa  332  3e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.244819  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0845  ribosomal protein L2  62.41 
 
 		 276 aa  331  6e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23051  50S ribosomal protein L2  59.56 
 
 		 287 aa  331  8e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1126  50S ribosomal protein L2  57.61 
 
 		 287 aa  330  1e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1070  50S ribosomal protein L2  63.87 
 
 		 274 aa  330  1e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000147453  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20001  50S ribosomal protein L2  57.61 
 
 		 287 aa  330  1e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.738026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1349  50S ribosomal protein L2  63.5 
 
 		 274 aa  330  1e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17371  50S ribosomal protein L2  59.93 
 
 		 287 aa  330  2e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17461  50S ribosomal protein L2  59.93 
 
 		 287 aa  329  3e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1958  50S ribosomal protein L2  57.97 
 
 		 287 aa  328  4e-89  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1647  50S ribosomal protein L2  59.93 
 
 		 287 aa  328  6e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0590  50S ribosomal protein L2  63.27 
 
 		 278 aa  328  8e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.274558  normal  0.886345 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2330  50S ribosomal protein L2  60.14 
 
 		 275 aa  328  8e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000156043  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10718  50S ribosomal protein L2  62.55 
 
 		 280 aa  327  9e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0762488  normal  0.210258 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3140  50S ribosomal protein L2  62.91 
 
 		 278 aa  326  2.0000000000000001e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.524365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0598  50S ribosomal protein L2  61.15 
 
 		 279 aa  326  2.0000000000000001e-88  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000263643  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1343  ribosomal protein L2  61.99 
 
 		 279 aa  326  3e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16751  50S ribosomal protein L2  58.46 
 
 		 287 aa  326  3e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0197  50S ribosomal protein L2  56.73 
 
 		 283 aa  326  3e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00345154  normal  0.0626583 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1480  50S ribosomal protein L2  60.87 
 
 		 281 aa  325  4.0000000000000003e-88  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000349234  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17621  50S ribosomal protein L2  60 
 
 		 287 aa  325  4.0000000000000003e-88  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3902  50S ribosomal protein L2  64.73 
 
 		 278 aa  325  5e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3021  50S ribosomal protein L2  62.45 
 
 		 274 aa  324  7e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0478203  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1762  50S ribosomal protein L2  61.31 
 
 		 276 aa  324  8.000000000000001e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00807764  normal  0.409688 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2229  50S ribosomal protein L2  59.04 
 
 		 287 aa  323  1e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.425308 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2293  50S ribosomal protein L2  57.55 
 
 		 279 aa  323  2e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0106582  normal  0.012024 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20840  50S ribosomal protein L2  63.64 
 
 		 278 aa  323  2e-87  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3009  50S ribosomal protein L2  58.33 
 
 		 287 aa  323  2e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.141186  hitchhiker  0.00819024 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0691  50S ribosomal protein L2  62.55 
 
 		 278 aa  323  3e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0683  50S ribosomal protein L2  62.04 
 
 		 274 aa  322  3e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.660032  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0258  ribosomal protein L2  59.27 
 
 		 276 aa  322  4e-87  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0936  50S ribosomal protein L2  62.04 
 
 		 274 aa  322  4e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000014248  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4312  50S ribosomal protein L2  63.14 
 
 		 279 aa  321  7e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00376489 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0565  50S ribosomal protein L2  61.68 
 
 		 277 aa  321  8e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2643  50S ribosomal protein L2  60.95 
 
 		 277 aa  320  9.999999999999999e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.331406  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5127  ribosomal protein L2  60.52 
 
 		 279 aa  320  9.999999999999999e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.840283 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5046  50S ribosomal protein L2  61.45 
 
 		 279 aa  320  9.999999999999999e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.126955 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3325  50S ribosomal protein L2  61.68 
 
 		 274 aa  320  9.999999999999999e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000129312 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0061  50S ribosomal protein L2  58.91 
 
 		 277 aa  320  1.9999999999999998e-86  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.41006  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1016  50S ribosomal protein L2  62.18 
 
 		 278 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29710  LSU ribosomal protein L2P  60.73 
 
 		 279 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.560922 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1033  50S ribosomal protein L2  62.18 
 
 		 278 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.483426 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1308  50S ribosomal protein L2  61.09 
 
 		 278 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186589  normal  0.118426 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1043  50S ribosomal protein L2  62.18 
 
 		 278 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>