More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1864 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1864  50S ribosomal protein L2  100 
 
 		 277 aa  558  1e-158  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0213539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2616  50S ribosomal protein L2  77.01 
 
 		 275 aa  410  1e-114  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0160883  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2904  ribosomal protein L2  73.72 
 
 		 275 aa  410  1e-114  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0425  50S ribosomal protein L2  63.18 
 
 		 276 aa  359  3e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000111287  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01200  50S ribosomal protein L2  65.69 
 
 		 277 aa  359  3e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0770167  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0787  50S ribosomal protein L2  64.23 
 
 		 274 aa  359  3e-98  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.469967  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0288  50S ribosomal protein L2  66.18 
 
 		 274 aa  357  8e-98  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.101113  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0134  50S ribosomal protein L2  64.73 
 
 		 276 aa  355  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000249417  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5192  50S ribosomal protein L2  64.73 
 
 		 276 aa  355  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000180933  unclonable  2.65522e-25 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0107  50S ribosomal protein L2  64.73 
 
 		 276 aa  355  3.9999999999999996e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000204251  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23440  LSU ribosomal protein L2P  65.09 
 
 		 276 aa  355  5e-97  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000561637  decreased coverage  0.0000000103379 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0984  50S ribosomal protein L2  62.59 
 
 		 280 aa  354  6.999999999999999e-97  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.619761  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1521  ribosomal protein L2  64.73 
 
 		 275 aa  354  7.999999999999999e-97  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0108  50S ribosomal protein L2  64.36 
 
 		 276 aa  353  1e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000187869  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1135  50S ribosomal protein L2  63.41 
 
 		 275 aa  353  2e-96  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000903374  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2708  ribosomal protein L2  63.64 
 
 		 276 aa  353  2e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000275562  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2175  ribosomal protein L2  65.09 
 
 		 276 aa  352  4e-96  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0113  50S ribosomal protein L2  64 
 
 		 276 aa  352  5e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000200839  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0113  50S ribosomal protein L2  64 
 
 		 276 aa  352  5e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000138046  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0109  50S ribosomal protein L2  64 
 
 		 276 aa  352  5e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.27306e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0107  50S ribosomal protein L2  64 
 
 		 276 aa  352  5e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000901221  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0113  50S ribosomal protein L2  64 
 
 		 276 aa  352  5e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000512601  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0125  50S ribosomal protein L2  64 
 
 		 276 aa  352  5e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.14187e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0144  50S ribosomal protein L2  64 
 
 		 276 aa  352  5e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000100516  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0870  50S ribosomal protein L2  62.55 
 
 		 275 aa  351  5.9999999999999994e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000015035  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1391  50S ribosomal protein L2  64.6 
 
 		 276 aa  351  7e-96  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000232502  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1295  50S ribosomal protein L2  64.6 
 
 		 276 aa  351  7e-96  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000122183  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2457  50S ribosomal protein L2  62.91 
 
 		 276 aa  349  3e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0871736 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0956  50S ribosomal protein L2  65.22 
 
 		 274 aa  348  5e-95  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00125176  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4918  50S ribosomal protein L2  61.31 
 
 		 275 aa  347  1e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.113284  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09970  LSU ribosomal protein L2P  64 
 
 		 276 aa  347  1e-94  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.7223  hitchhiker  0.00000165173 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0289  50S ribosomal protein L2  62.09 
 
 		 275 aa  347  1e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0283371  normal  0.0481443 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0218  50S ribosomal protein L2  62.82 
 
 		 275 aa  345  3e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127498  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0114  50S ribosomal protein L2  61.82 
 
 		 276 aa  343  1e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000290971  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0249  50S ribosomal protein L2  63.64 
 
 		 276 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0246  50S ribosomal protein L2  63.64 
 
 		 276 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0110  50S ribosomal protein L2  61.45 
 
 		 276 aa  342  5e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2152  50S ribosomal protein L2  63.5 
 
 		 279 aa  341  7e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0924201  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2293  50S ribosomal protein L2  60.71 
 
 		 279 aa  340  1e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0106582  normal  0.012024 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3706  50S ribosomal protein L2  62.91 
 
 		 277 aa  340  2e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2906  50S ribosomal protein L2  62.55 
 
 		 275 aa  339  2.9999999999999998e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0172805  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1182  50S ribosomal protein L2  63.64 
 
 		 275 aa  339  2.9999999999999998e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1828  50S ribosomal protein L2  63.24 
 
 		 277 aa  338  5e-92  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.256739  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0228  50S ribosomal protein L2  60.95 
 
 		 275 aa  338  7e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3009  50S ribosomal protein L2  60.73 
 
 		 287 aa  337  9.999999999999999e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.141186  hitchhiker  0.00819024 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1158  ribosomal protein L2  61.29 
 
 		 278 aa  336  1.9999999999999998e-91  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000162145  hitchhiker  0.000000663071 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2711  50S ribosomal protein L2  62.59 
 
 		 277 aa  336  2.9999999999999997e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2396  50S ribosomal protein L2  62.59 
 
 		 277 aa  336  2.9999999999999997e-91  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.445207  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0718  ribosomal protein L2  62.04 
 
 		 273 aa  335  7e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2315  50S ribosomal protein L2  62.13 
 
 		 277 aa  335  7e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000290927  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2274  50S ribosomal protein L2  62.13 
 
 		 277 aa  335  7e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000299614  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0373  50S ribosomal protein L2  60 
 
 		 287 aa  334  7.999999999999999e-91  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0694  50S ribosomal protein L2  62.87 
 
 		 287 aa  334  1e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00211234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16751  50S ribosomal protein L2  61.03 
 
 		 287 aa  334  1e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1343  ribosomal protein L2  61.62 
 
 		 279 aa  333  1e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2562  50S ribosomal protein L2  61.4 
 
 		 287 aa  333  2e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.244819  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2330  50S ribosomal protein L2  62.55 
 
 		 275 aa  333  2e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000156043  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1349  50S ribosomal protein L2  63.5 
 
 		 274 aa  333  2e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0352  50S ribosomal protein L2  60.93 
 
 		 277 aa  332  6e-90  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000147687  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1181  ribosomal protein L2  61.31 
 
 		 274 aa  331  9e-90  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000178958  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1958  50S ribosomal protein L2  60.36 
 
 		 287 aa  331  9e-90  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4023  50S ribosomal protein L2  61.45 
 
 		 275 aa  330  1e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.796821  hitchhiker  0.00000688583 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20001  50S ribosomal protein L2  59.27 
 
 		 287 aa  330  2e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.738026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1126  50S ribosomal protein L2  59.27 
 
 		 287 aa  330  2e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23051  50S ribosomal protein L2  59.56 
 
 		 287 aa  329  3e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1571  ribosomal protein L2  58.99 
 
 		 277 aa  328  5.0000000000000004e-89  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000641133  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2229  50S ribosomal protein L2  60.89 
 
 		 287 aa  328  5.0000000000000004e-89  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.425308 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0683  50S ribosomal protein L2  63.14 
 
 		 274 aa  328  6e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.660032  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1070  50S ribosomal protein L2  62.04 
 
 		 274 aa  327  9e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000147453  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17461  50S ribosomal protein L2  59.19 
 
 		 287 aa  327  2.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1647  50S ribosomal protein L2  59.19 
 
 		 287 aa  326  2.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0845  ribosomal protein L2  61.96 
 
 		 276 aa  326  3e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1029  50S ribosomal protein L2  58.78 
 
 		 277 aa  325  4.0000000000000003e-88  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000494173  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4318  ribosomal protein L2  62.77 
 
 		 277 aa  325  6e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0590  50S ribosomal protein L2  61.68 
 
 		 278 aa  325  7e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.274558  normal  0.886345 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2854  50S ribosomal protein L2  62.41 
 
 		 274 aa  324  9e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.16125  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3021  50S ribosomal protein L2  62.45 
 
 		 274 aa  324  1e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0478203  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2061  50S ribosomal protein L2  61.07 
 
 		 279 aa  324  1e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000364134  normal  0.142265 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1943  50S ribosomal protein L2  61.09 
 
 		 282 aa  323  1e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17371  50S ribosomal protein L2  58.82 
 
 		 287 aa  323  1e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17621  50S ribosomal protein L2  59.63 
 
 		 287 aa  324  1e-87  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10718  50S ribosomal protein L2  61.68 
 
 		 280 aa  323  1e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0762488  normal  0.210258 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2021  50S ribosomal protein L2  61.09 
 
 		 282 aa  323  2e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0565  50S ribosomal protein L2  61.37 
 
 		 277 aa  323  2e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0691  50S ribosomal protein L2  61.68 
 
 		 278 aa  323  2e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1742  50S ribosomal protein L2  57.97 
 
 		 276 aa  323  2e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000110614  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1936  50S ribosomal protein L2  61.09 
 
 		 282 aa  323  2e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0037  50S ribosomal protein L2  58.27 
 
 		 276 aa  323  2e-87  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00257974  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0061  50S ribosomal protein L2  58.99 
 
 		 277 aa  322  3e-87  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.41006  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3920  50S ribosomal protein L2  62.77 
 
 		 279 aa  322  3e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3902  50S ribosomal protein L2  63.5 
 
 		 278 aa  323  3e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0704  50S ribosomal protein L2  60.58 
 
 		 273 aa  322  4e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000350454  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0629  50S ribosomal protein L2  61.68 
 
 		 274 aa  322  4e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000833663  hitchhiker  0.00000000000856838 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0258  ribosomal protein L2  58.03 
 
 		 276 aa  322  4e-87  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1904  50S ribosomal protein L2  58.99 
 
 		 277 aa  322  5e-87  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1762  50S ribosomal protein L2  61.01 
 
 		 276 aa  322  6e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00807764  normal  0.409688 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4312  50S ribosomal protein L2  62.41 
 
 		 279 aa  321  9.000000000000001e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00376489 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20840  50S ribosomal protein L2  62.04 
 
 		 278 aa  320  9.999999999999999e-87  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0197  50S ribosomal protein L2  58.18 
 
 		 283 aa  320  9.999999999999999e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00345154  normal  0.0626583 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0936  50S ribosomal protein L2  61.68 
 
 		 274 aa  320  9.999999999999999e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000014248  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>