More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1229 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1229  50S ribosomal protein L2  100 
 
 
275 aa  559  1e-158  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.624705  unclonable  0.0000121783 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2457  50S ribosomal protein L2  65.94 
 
 
276 aa  369  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0871736 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0218  50S ribosomal protein L2  65.45 
 
 
275 aa  363  2e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127498  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2708  ribosomal protein L2  65.22 
 
 
276 aa  362  3e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000275562  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01200  50S ribosomal protein L2  63.64 
 
 
277 aa  362  3e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0770167  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0289  50S ribosomal protein L2  61.82 
 
 
275 aa  362  4e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0283371  normal  0.0481443 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0425  50S ribosomal protein L2  63.77 
 
 
276 aa  361  6e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000111287  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1521  ribosomal protein L2  63.74 
 
 
275 aa  361  7.0000000000000005e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1070  50S ribosomal protein L2  67.15 
 
 
274 aa  359  2e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000147453  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1349  50S ribosomal protein L2  66.79 
 
 
274 aa  359  3e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2906  50S ribosomal protein L2  65.69 
 
 
275 aa  357  9e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0172805  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2854  50S ribosomal protein L2  67.15 
 
 
274 aa  355  5e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.16125  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23440  LSU ribosomal protein L2P  61.96 
 
 
276 aa  354  6.999999999999999e-97  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000561637  decreased coverage  0.0000000103379 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0228  50S ribosomal protein L2  62.91 
 
 
275 aa  353  2e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1742  50S ribosomal protein L2  64.73 
 
 
276 aa  353  2e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000110614  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0870  50S ribosomal protein L2  63.14 
 
 
275 aa  352  2.9999999999999997e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000015035  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3325  50S ribosomal protein L2  66.06 
 
 
274 aa  351  5.9999999999999994e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000129312 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0114  50S ribosomal protein L2  62.32 
 
 
276 aa  351  8e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000290971  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0936  50S ribosomal protein L2  66.06 
 
 
274 aa  350  1e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000014248  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0110  50S ribosomal protein L2  61.96 
 
 
276 aa  349  2e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0629  50S ribosomal protein L2  66.06 
 
 
274 aa  349  3e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000833663  hitchhiker  0.00000000000856838 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2175  ribosomal protein L2  61.23 
 
 
276 aa  349  3e-95  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0683  50S ribosomal protein L2  65.69 
 
 
274 aa  349  3e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.660032  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0761  50S ribosomal protein L2  62.82 
 
 
277 aa  348  7e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000295488  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1182  50S ribosomal protein L2  62.64 
 
 
275 aa  347  2e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09970  LSU ribosomal protein L2P  60.51 
 
 
276 aa  346  3e-94  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.7223  hitchhiker  0.00000165173 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0107  50S ribosomal protein L2  62.68 
 
 
276 aa  345  4e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000204251  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1181  ribosomal protein L2  59.85 
 
 
274 aa  345  6e-94  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000178958  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0718  ribosomal protein L2  62.5 
 
 
273 aa  342  2.9999999999999997e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5192  50S ribosomal protein L2  62.32 
 
 
276 aa  342  4e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000180933  unclonable  2.65522e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0134  50S ribosomal protein L2  62.32 
 
 
276 aa  342  4e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000249417  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0108  50S ribosomal protein L2  61.96 
 
 
276 aa  340  1e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000187869  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0113  50S ribosomal protein L2  61.59 
 
 
276 aa  339  2e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000200839  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0113  50S ribosomal protein L2  61.59 
 
 
276 aa  339  2e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000138046  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0109  50S ribosomal protein L2  61.59 
 
 
276 aa  339  2e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.27306e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0107  50S ribosomal protein L2  61.59 
 
 
276 aa  339  2e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000901221  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0113  50S ribosomal protein L2  61.59 
 
 
276 aa  339  2e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000512601  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0125  50S ribosomal protein L2  61.59 
 
 
276 aa  339  2e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.14187e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0144  50S ribosomal protein L2  61.59 
 
 
276 aa  339  2e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000100516  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0840  50S ribosomal protein L2  60.66 
 
 
273 aa  339  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2711  50S ribosomal protein L2  63.5 
 
 
277 aa  339  2.9999999999999998e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2396  50S ribosomal protein L2  63.5 
 
 
277 aa  339  2.9999999999999998e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.445207  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08880  50S ribosomal protein L2  60.66 
 
 
273 aa  339  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0116261 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0787  50S ribosomal protein L2  61.45 
 
 
274 aa  338  5e-92  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.469967  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4023  50S ribosomal protein L2  61.54 
 
 
275 aa  338  8e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.796821  hitchhiker  0.00000688583 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2837  50S ribosomal protein L2  59.27 
 
 
275 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000326026  normal  0.198819 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4918  50S ribosomal protein L2  59.64 
 
 
275 aa  337  1.9999999999999998e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.113284  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0288  50S ribosomal protein L2  59.64 
 
 
274 aa  336  1.9999999999999998e-91  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.101113  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0704  50S ribosomal protein L2  64.34 
 
 
273 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000350454  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0282  50S ribosomal protein L2  59.93 
 
 
277 aa  336  2.9999999999999997e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000161647  hitchhiker  0.00000193986 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1558  50S ribosomal protein L2  61.4 
 
 
273 aa  334  9e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.49018  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4541  50S ribosomal protein L2  60.73 
 
 
274 aa  334  1e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000106039  hitchhiker  0.00201461 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3641  50S ribosomal protein L2  58.91 
 
 
275 aa  333  1e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000585895  hitchhiker  0.0000000000261127 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0317  50S ribosomal protein L2  58.91 
 
 
275 aa  332  3e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000380441  decreased coverage  0.00287275 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1936  50S ribosomal protein L2  61.9 
 
 
282 aa  331  7.000000000000001e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2021  50S ribosomal protein L2  61.9 
 
 
282 aa  331  7.000000000000001e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1943  50S ribosomal protein L2  61.9 
 
 
282 aa  331  8e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2152  50S ribosomal protein L2  60 
 
 
279 aa  331  8e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0924201  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3450  50S ribosomal protein L2  58.55 
 
 
275 aa  330  1e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000764843  decreased coverage  0.00435128 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2315  50S ribosomal protein L2  61.37 
 
 
277 aa  330  1e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000290927  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0279  50S ribosomal protein L2  58.55 
 
 
275 aa  330  1e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000000000585498  normal  0.0839884 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2274  50S ribosomal protein L2  61.37 
 
 
277 aa  330  1e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000299614  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2756  50S ribosomal protein L2  58.55 
 
 
275 aa  330  1e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000162377  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0270  50S ribosomal protein L2  58.55 
 
 
275 aa  330  1e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00297501  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0330  50S ribosomal protein L2  58.55 
 
 
275 aa  330  1e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000414315  normal  0.021485 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3912  50S ribosomal protein L2  58.91 
 
 
274 aa  330  2e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.5044e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0286  50S ribosomal protein L2  58.91 
 
 
274 aa  330  2e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000315964  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0587  50S ribosomal protein L2  58.91 
 
 
274 aa  330  2e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000050829  normal  0.227169 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0351  50S ribosomal protein L2  58.18 
 
 
275 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000123883  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0216  50S ribosomal protein L2  63.87 
 
 
274 aa  330  2e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000116204  unclonable  0.00000865154 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0408  50S ribosomal protein L2  59.49 
 
 
273 aa  329  3e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00399178  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2293  50S ribosomal protein L2  59.85 
 
 
279 aa  329  3e-89  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0106582  normal  0.012024 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1904  50S ribosomal protein L2  60.65 
 
 
277 aa  329  3e-89  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1828  50S ribosomal protein L2  60.65 
 
 
277 aa  329  4e-89  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.256739  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3335  50S ribosomal protein L2  57.82 
 
 
275 aa  328  4e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000000645842  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2904  ribosomal protein L2  59.49 
 
 
275 aa  328  4e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0061  50S ribosomal protein L2  60.65 
 
 
277 aa  328  5.0000000000000004e-89  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.41006  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1343  ribosomal protein L2  61.48 
 
 
279 aa  328  6e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0870  50S ribosomal protein L2  62.77 
 
 
274 aa  328  6e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0326  50S ribosomal protein L2  59.12 
 
 
273 aa  328  6e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000291678  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0770  50S ribosomal protein L2  58.09 
 
 
277 aa  328  8e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.281311  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0187  50S ribosomal protein L2  61.82 
 
 
275 aa  327  9e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000586995  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0062  50S ribosomal protein L2  59.49 
 
 
273 aa  327  9e-89  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000394369  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2321  50S ribosomal protein L2  58.91 
 
 
274 aa  327  1.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000099496  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3748  50S ribosomal protein L2  58.39 
 
 
273 aa  327  1.0000000000000001e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000108731  hitchhiker  0.00494792 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3016  50S ribosomal protein L2  58.33 
 
 
276 aa  326  2.0000000000000001e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.000000236322  decreased coverage  0.00250234 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3294  50S ribosomal protein L2  58.33 
 
 
276 aa  326  2.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000000105073  hitchhiker  0.00000920299 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3009  50S ribosomal protein L2  59.06 
 
 
287 aa  327  2.0000000000000001e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.141186  hitchhiker  0.00819024 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3819  50S ribosomal protein L2  58.76 
 
 
273 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000104624  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3633  50S ribosomal protein L2  58.39 
 
 
273 aa  326  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0350833  normal  0.361481 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3741  50S ribosomal protein L2  58.39 
 
 
273 aa  326  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.69026  normal  0.0152471 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3633  50S ribosomal protein L2  58.39 
 
 
273 aa  326  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000993877  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3804  50S ribosomal protein L2  58.39 
 
 
273 aa  326  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00899018  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3706  50S ribosomal protein L2  58.39 
 
 
273 aa  326  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00279259  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2947  50S ribosomal protein L2  58.33 
 
 
276 aa  325  4.0000000000000003e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0126826  decreased coverage  0.00000017325 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2330  50S ribosomal protein L2  58.24 
 
 
275 aa  325  4.0000000000000003e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000156043  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0037  50S ribosomal protein L2  57.88 
 
 
276 aa  325  4.0000000000000003e-88  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00257974  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0492  50S ribosomal protein L2  62.09 
 
 
277 aa  325  5e-88  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.966251  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0461  50S ribosomal protein L2  62.5 
 
 
274 aa  325  5e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2254  50S ribosomal protein L2  61.23 
 
 
276 aa  325  6e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000201463  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>