More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_29034 on replicon NC_009355
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009355  OSTLU_29034  Putative mitochondrial ribosomal protein L2  100 
 
 		 283 aa  566  1e-160  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0175318  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2906  50S ribosomal protein L2  57.3 
 
 		 275 aa  303  2.0000000000000002e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0172805  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4541  50S ribosomal protein L2  56.67 
 
 		 274 aa  301  7.000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000106039  hitchhiker  0.00201461 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0870  50S ribosomal protein L2  56.57 
 
 		 275 aa  300  2e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000015035  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0289  50S ribosomal protein L2  55.88 
 
 		 275 aa  299  3e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0283371  normal  0.0481443 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3912  50S ribosomal protein L2  56.3 
 
 		 274 aa  298  6e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.5044e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0286  50S ribosomal protein L2  56.3 
 
 		 274 aa  298  6e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000315964  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0587  50S ribosomal protein L2  56.3 
 
 		 274 aa  298  6e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000050829  normal  0.227169 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3804  50S ribosomal protein L2  55.56 
 
 		 273 aa  293  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00899018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3633  50S ribosomal protein L2  55.56 
 
 		 273 aa  293  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0350833  normal  0.361481 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3633  50S ribosomal protein L2  55.56 
 
 		 273 aa  293  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000993877  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3706  50S ribosomal protein L2  55.56 
 
 		 273 aa  293  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00279259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3741  50S ribosomal protein L2  55.56 
 
 		 273 aa  293  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.69026  normal  0.0152471 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03168  50S ribosomal protein L2  55.56 
 
 		 273 aa  292  4e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00146365  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0396  ribosomal protein L2  55.56 
 
 		 273 aa  292  4e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000401214  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4640  50S ribosomal protein L2  55.56 
 
 		 273 aa  292  4e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0685659  normal  0.0584567 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3702  50S ribosomal protein L2  55.56 
 
 		 273 aa  292  4e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237187  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3511  50S ribosomal protein L2  55.56 
 
 		 273 aa  292  4e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112597  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3800  50S ribosomal protein L2  55.56 
 
 		 273 aa  292  4e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000757775  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3612  50S ribosomal protein L2  55.56 
 
 		 273 aa  292  4e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000120655  hitchhiker  0.00428222 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3748  50S ribosomal protein L2  55.56 
 
 		 273 aa  292  4e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000108731  hitchhiker  0.00494792 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0396  50S ribosomal protein L2  55.56 
 
 		 273 aa  292  4e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000072222  hitchhiker  0.000353424 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03119  hypothetical protein  55.56 
 
 		 273 aa  292  4e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00128631  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0062  50S ribosomal protein L2  56.72 
 
 		 273 aa  292  4e-78  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000394369  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3819  50S ribosomal protein L2  55.19 
 
 		 273 aa  292  5e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000104624  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3998  50S ribosomal protein L2  55.19 
 
 		 273 aa  292  5e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000302361  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0840  50S ribosomal protein L2  55.6 
 
 		 273 aa  291  7e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08880  50S ribosomal protein L2  55.6 
 
 		 273 aa  291  7e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0116261 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0326  50S ribosomal protein L2  55.19 
 
 		 273 aa  291  8e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000291678  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0408  50S ribosomal protein L2  55.97 
 
 		 273 aa  291  9e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00399178  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0762  50S ribosomal protein L2  57.04 
 
 		 279 aa  289  4e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.052515  normal  0.51938 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2457  50S ribosomal protein L2  54.32 
 
 		 276 aa  288  6e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0871736 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0218  50S ribosomal protein L2  54.78 
 
 		 275 aa  288  7e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127498  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2531  50S ribosomal protein L2  56.32 
 
 		 279 aa  287  1e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.445887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01200  50S ribosomal protein L2  54.15 
 
 		 277 aa  288  1e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0770167  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1719  50S ribosomal protein L2  55.96 
 
 		 279 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.238282  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0364  50S ribosomal protein L2  55.96 
 
 		 279 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.838149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0298  50S ribosomal protein L2  57.72 
 
 		 275 aa  286  4e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00025292  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1742  50S ribosomal protein L2  54.58 
 
 		 276 aa  285  8e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000110614  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0279  50S ribosomal protein L2  55.6 
 
 		 275 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000000000585498  normal  0.0839884 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0330  50S ribosomal protein L2  55.6 
 
 		 275 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000414315  normal  0.021485 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2739  50S ribosomal protein L2  57.04 
 
 		 278 aa  284  1.0000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.236416  normal  0.312063 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3450  50S ribosomal protein L2  55.6 
 
 		 275 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000764843  decreased coverage  0.00435128 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2756  50S ribosomal protein L2  55.6 
 
 		 275 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000162377  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0270  50S ribosomal protein L2  55.6 
 
 		 275 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00297501  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0351  50S ribosomal protein L2  55.22 
 
 		 275 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000123883  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0317  50S ribosomal protein L2  55.22 
 
 		 275 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000380441  decreased coverage  0.00287275 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2837  50S ribosomal protein L2  55.22 
 
 		 275 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000326026  normal  0.198819 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0228  50S ribosomal protein L2  55.51 
 
 		 275 aa  282  4.0000000000000003e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0397  50S ribosomal protein L2  58.39 
 
 		 275 aa  281  6.000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0282  50S ribosomal protein L2  53.11 
 
 		 277 aa  281  7.000000000000001e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000161647  hitchhiker  0.00000193986 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0372  50S ribosomal protein L2  58.39 
 
 		 275 aa  281  8.000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3641  50S ribosomal protein L2  54.48 
 
 		 275 aa  281  1e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000585895  hitchhiker  0.0000000000261127 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1229  50S ribosomal protein L2  55.88 
 
 		 275 aa  281  1e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.624705  unclonable  0.0000121783 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2685  50S ribosomal protein L2  56.47 
 
 		 279 aa  280  2e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00277969  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2708  ribosomal protein L2  54.01 
 
 		 276 aa  280  3e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000275562  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0472  50S ribosomal protein L2  58.58 
 
 		 274 aa  280  3e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000311263  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0718  ribosomal protein L2  53.48 
 
 		 273 aa  279  4e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1521  ribosomal protein L2  53.48 
 
 		 275 aa  279  4e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1181  ribosomal protein L2  52.21 
 
 		 274 aa  278  7e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000178958  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1792  50S ribosomal protein L2  55.04 
 
 		 278 aa  278  7e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.109634  normal  0.0522844 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2321  50S ribosomal protein L2  56.34 
 
 		 274 aa  278  9e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000099496  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1682  50S ribosomal protein L2  54.51 
 
 		 277 aa  277  1e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0463749  hitchhiker  0.0000149038 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0216  50S ribosomal protein L2  57.78 
 
 		 274 aa  276  2e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000116204  unclonable  0.00000865154 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0234  50S ribosomal protein L2  57.84 
 
 		 274 aa  277  2e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0285  50S ribosomal protein L2  56.12 
 
 		 280 aa  276  2e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1349  50S ribosomal protein L2  55.84 
 
 		 274 aa  277  2e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1675  50S ribosomal protein L2  58.21 
 
 		 278 aa  276  2e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0350  50S ribosomal protein L2  56.99 
 
 		 278 aa  276  3e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.170348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3756  50S ribosomal protein L2  57.84 
 
 		 274 aa  276  3e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000243067  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0202  50S ribosomal protein L2  57.46 
 
 		 274 aa  276  3e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000118322  unclonable  0.0000000000286265 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0197  50S ribosomal protein L2  57.46 
 
 		 274 aa  276  3e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0317166  decreased coverage  0.000296247 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0110  50S ribosomal protein L2  52.17 
 
 		 276 aa  276  3e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0202  50S ribosomal protein L2  57.46 
 
 		 274 aa  276  3e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000998768  hitchhiker  0.00000000161676 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0683  50S ribosomal protein L2  55.88 
 
 		 274 aa  275  5e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.660032  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2711  50S ribosomal protein L2  54.38 
 
 		 277 aa  275  5e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2396  50S ribosomal protein L2  54.38 
 
 		 277 aa  275  5e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.445207  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0113  50S ribosomal protein L2  53.62 
 
 		 276 aa  275  6e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000200839  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0113  50S ribosomal protein L2  53.62 
 
 		 276 aa  275  6e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000138046  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0109  50S ribosomal protein L2  53.62 
 
 		 276 aa  275  6e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.27306e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0107  50S ribosomal protein L2  53.62 
 
 		 276 aa  275  6e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000901221  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0113  50S ribosomal protein L2  53.62 
 
 		 276 aa  275  6e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000512601  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0144  50S ribosomal protein L2  53.62 
 
 		 276 aa  275  6e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000100516  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0125  50S ribosomal protein L2  53.62 
 
 		 276 aa  275  6e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.14187e-61 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0436  50S ribosomal protein L2  54.31 
 
 		 275 aa  275  7e-73  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00110098  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0770  50S ribosomal protein L2  54.04 
 
 		 277 aa  275  8e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.281311  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1617  50S ribosomal protein L2  55.6 
 
 		 279 aa  275  9e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.134416 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1959  50S ribosomal protein L2  55.23 
 
 		 277 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0386068  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3335  50S ribosomal protein L2  54.1 
 
 		 275 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000000645842  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1182  50S ribosomal protein L2  54.18 
 
 		 275 aa  274  2.0000000000000002e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0497  50S ribosomal protein L2  53.93 
 
 		 275 aa  274  2.0000000000000002e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00000398645  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3294  50S ribosomal protein L2  54.65 
 
 		 276 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000000105073  hitchhiker  0.00000920299 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0288  50S ribosomal protein L2  52.75 
 
 		 274 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.101113  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4053  50S ribosomal protein L2  57.46 
 
 		 274 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000480154  unclonable  0.0000000000078999 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0252  50S ribosomal protein L2  55.04 
 
 		 280 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0199  50S ribosomal protein L2  57.46 
 
 		 274 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000102621  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0203  50S ribosomal protein L2  57.46 
 
 		 274 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000173146  unclonable  0.0000103945 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4167  50S ribosomal protein L2  57.46 
 
 		 274 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000617746  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3016  50S ribosomal protein L2  54.65 
 
 		 276 aa  273  3e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.000000236322  decreased coverage  0.00250234 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4023  50S ribosomal protein L2  54.55 
 
 		 275 aa  273  3e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.796821  hitchhiker  0.00000688583 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>