More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2221 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_2221  ribosomal protein L2  100 
 
 		 240 aa  480  1e-134  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0213  ribosomal protein L2  93.75 
 
 		 240 aa  454  1e-127  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1831  50S ribosomal protein L2P  86.34 
 
 		 240 aa  404  1.0000000000000001e-112  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.548496 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2446  50S ribosomal protein L2P  82.67 
 
 		 240 aa  387  1e-106  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2295  50S ribosomal protein L2P  80.35 
 
 		 242 aa  380  1e-105  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0004  50S ribosomal protein L2P  61.86 
 
 		 237 aa  326  2.0000000000000001e-88  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000454303  n/a   
 
 
 
NC_008553  Mthe_1725  50S ribosomal protein L2P  64.83 
 
 		 236 aa  320  9.999999999999999e-87  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0310662  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0860  50S ribosomal protein L2P  60.67 
 
 		 240 aa  302  3.0000000000000004e-81  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.480475  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0107  50S ribosomal protein L2P  57.45 
 
 		 238 aa  301  7.000000000000001e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1124  50S ribosomal protein L2P  60.67 
 
 		 240 aa  297  8e-80  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0030  50S ribosomal protein L2P  60.25 
 
 		 240 aa  296  2e-79  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.291148  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0794  50S ribosomal protein L2P  60.25 
 
 		 240 aa  296  2e-79  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.097706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0804  50S ribosomal protein L2P  57.32 
 
 		 240 aa  295  3e-79  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.712432  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2250  50S ribosomal protein L2P  56.78 
 
 		 236 aa  273  1.0000000000000001e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000000353713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0535  50S ribosomal protein L2P  53.81 
 
 		 238 aa  272  4.0000000000000004e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.393685  normal  0.694231 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0084  50S ribosomal protein L2P  53.78 
 
 		 240 aa  263  1e-69  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.33391 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0445  50S ribosomal protein L2P  56.54 
 
 		 239 aa  255  4e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0154826  normal  0.478034 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0567  50S ribosomal protein L2P  52.74 
 
 		 239 aa  254  9e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0425344  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1518  ribosomal protein L2  55.22 
 
 		 234 aa  249  4e-65  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  6.90355e-16  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1775  ribosomal protein L2  45.76 
 
 		 238 aa  212  4.9999999999999996e-54  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0049  50S ribosomal protein L2P  49.37 
 
 		 245 aa  208  6e-53  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0336538 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0227  50S ribosomal protein L2P  47.08 
 
 		 248 aa  207  1e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1094  50S ribosomal protein L2P  49.37 
 
 		 246 aa  206  2e-52  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28234  predicted protein  45.97 
 
 		 257 aa  204  7e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.638688  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0018  50S ribosomal protein L2P  49.79 
 
 		 244 aa  204  8e-52  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31116  Ribosomal protein L8, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  44.31 
 
 		 255 aa  204  1e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.155376  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL03960  conserved hypothetical protein  45.9 
 
 		 255 aa  203  2e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.139278  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0052  50S ribosomal protein L2P  47.7 
 
 		 246 aa  203  2e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.946037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0094  50S ribosomal protein L2P  44.07 
 
 		 238 aa  203  2e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000127555  unclonable  0.000000429528 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1278  50S ribosomal protein L2P  45.83 
 
 		 255 aa  202  4e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000789854 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0102  50S ribosomal protein L2P  42.62 
 
 		 244 aa  196  3e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00140338 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02275  hypothetical protein similar to 60S ribosomal protein L2 (Broad)  43.32 
 
 		 254 aa  179  4.999999999999999e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28309  60S large subunit ribosomal protein L2A  43.32 
 
 		 254 aa  159  5e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.24055 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86991  60S large subunit ribosomal protein L2B  43.32 
 
 		 254 aa  159  5e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.32837 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2457  50S ribosomal protein L2  42.33 
 
 		 276 aa  146  3e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0871736 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2293  50S ribosomal protein L2  38.36 
 
 		 279 aa  144  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0106582  normal  0.012024 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0787  50S ribosomal protein L2  41.71 
 
 		 274 aa  144  1e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.469967  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1571  ribosomal protein L2  40.97 
 
 		 277 aa  144  2e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000641133  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1295  50S ribosomal protein L2  40.7 
 
 		 276 aa  142  3e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000122183  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1391  50S ribosomal protein L2  40.7 
 
 		 276 aa  142  3e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000232502  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10718  50S ribosomal protein L2  37.02 
 
 		 280 aa  142  5e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0762488  normal  0.210258 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2906  50S ribosomal protein L2  38.99 
 
 		 275 aa  142  5e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0172805  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01200  50S ribosomal protein L2  42.79 
 
 		 277 aa  142  5e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0770167  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2152  50S ribosomal protein L2  42.16 
 
 		 279 aa  141  9e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0924201  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03168  50S ribosomal protein L2  44.09 
 
 		 273 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00146365  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0396  ribosomal protein L2  44.09 
 
 		 273 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000401214  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4640  50S ribosomal protein L2  44.09 
 
 		 273 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0685659  normal  0.0584567 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3819  50S ribosomal protein L2  41.83 
 
 		 273 aa  140  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000104624  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03119  hypothetical protein  44.09 
 
 		 273 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00128631  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2061  50S ribosomal protein L2  39.81 
 
 		 279 aa  140  9.999999999999999e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000364134  normal  0.142265 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3511  50S ribosomal protein L2  44.09 
 
 		 273 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112597  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3800  50S ribosomal protein L2  44.09 
 
 		 273 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000757775  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3702  50S ribosomal protein L2  44.09 
 
 		 273 aa  141  9.999999999999999e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237187  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1521  ribosomal protein L2  40.62 
 
 		 275 aa  141  9.999999999999999e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0984  50S ribosomal protein L2  40.5 
 
 		 280 aa  141  9.999999999999999e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.619761  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3612  50S ribosomal protein L2  44.09 
 
 		 273 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000120655  hitchhiker  0.00428222 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0396  50S ribosomal protein L2  44.09 
 
 		 273 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000072222  hitchhiker  0.000353424 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3748  50S ribosomal protein L2  44.09 
 
 		 273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000108731  hitchhiker  0.00494792 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1710  50S ribosomal protein L2  38.46 
 
 		 276 aa  139  3e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0258  ribosomal protein L2  38.03 
 
 		 276 aa  140  3e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0461  50S ribosomal protein L2  43.75 
 
 		 274 aa  139  3e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0956  50S ribosomal protein L2  41.5 
 
 		 274 aa  139  3e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00125176  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0761  50S ribosomal protein L2  42.56 
 
 		 277 aa  139  3e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000295488  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1343  ribosomal protein L2  42.16 
 
 		 279 aa  139  3.9999999999999997e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0408  50S ribosomal protein L2  40.76 
 
 		 273 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00399178  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0292  50S ribosomal protein L2  40.61 
 
 		 264 aa  139  4.999999999999999e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3633  50S ribosomal protein L2  43.55 
 
 		 273 aa  138  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0350833  normal  0.361481 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0718  ribosomal protein L2  40.38 
 
 		 273 aa  138  6e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3706  50S ribosomal protein L2  43.55 
 
 		 273 aa  138  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00279259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3633  50S ribosomal protein L2  43.55 
 
 		 273 aa  138  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000993877  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3804  50S ribosomal protein L2  43.55 
 
 		 273 aa  138  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00899018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3741  50S ribosomal protein L2  43.55 
 
 		 273 aa  138  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.69026  normal  0.0152471 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3920  50S ribosomal protein L2  40.84 
 
 		 279 aa  138  7e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3998  50S ribosomal protein L2  43.72 
 
 		 273 aa  138  7e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000302361  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0197  50S ribosomal protein L2  39.17 
 
 		 283 aa  138  7e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00345154  normal  0.0626583 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2562  50S ribosomal protein L2  42 
 
 		 287 aa  138  7e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.244819  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3755  ribosomal protein L2  39.27 
 
 		 278 aa  138  7.999999999999999e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.168054  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2420  50S ribosomal protein L2  40 
 
 		 264 aa  138  7.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00126121  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2226  50S ribosomal protein L2  39.35 
 
 		 264 aa  138  8.999999999999999e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000549007  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0331  50S ribosomal protein L2  41.21 
 
 		 272 aa  138  8.999999999999999e-32  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0587  50S ribosomal protein L2  41.23 
 
 		 274 aa  137  1e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000050829  normal  0.227169 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3912  50S ribosomal protein L2  41.23 
 
 		 274 aa  137  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.5044e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0286  50S ribosomal protein L2  41.23 
 
 		 274 aa  137  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000315964  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0228  50S ribosomal protein L2  43.81 
 
 		 275 aa  137  1e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1848  50S ribosomal protein L2  38.14 
 
 		 279 aa  138  1e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.492965  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2711  50S ribosomal protein L2  41.15 
 
 		 277 aa  137  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2396  50S ribosomal protein L2  41.15 
 
 		 277 aa  137  1e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.445207  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0199  50S ribosomal protein L2  40.18 
 
 		 277 aa  138  1e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0675116  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1943  50S ribosomal protein L2  40.1 
 
 		 277 aa  137  2e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23780  50S ribosomal protein L2  40.31 
 
 		 278 aa  137  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf440  50S ribosomal protein L2  38.91 
 
 		 281 aa  137  2e-31  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4023  50S ribosomal protein L2  39.57 
 
 		 275 aa  136  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.796821  hitchhiker  0.00000688583 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2175  ribosomal protein L2  42.5 
 
 		 276 aa  136  3.0000000000000003e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2969  50S ribosomal protein L2  41.03 
 
 		 276 aa  136  3.0000000000000003e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0870  50S ribosomal protein L2  38.14 
 
 		 275 aa  135  4e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000015035  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1558  50S ribosomal protein L2  39.09 
 
 		 273 aa  135  4e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.49018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0082  50S ribosomal protein L2  42.26 
 
 		 276 aa  136  4e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.173583 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3140  50S ribosomal protein L2  40.84 
 
 		 278 aa  135  6.0000000000000005e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.524365  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0326  50S ribosomal protein L2  40.28 
 
 		 273 aa  135  6.0000000000000005e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000291678  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0762  50S ribosomal protein L2  41.95 
 
 		 279 aa  135  6.0000000000000005e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.052515  normal  0.51938 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>