More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2250 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2250  50S ribosomal protein L2P  100 
 
 		 236 aa  483  1e-136  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000000353713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0535  50S ribosomal protein L2P  75.32 
 
 		 238 aa  380  1e-105  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.393685  normal  0.694231 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0567  50S ribosomal protein L2P  69.49 
 
 		 239 aa  345  3e-94  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0425344  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0084  50S ribosomal protein L2P  69.04 
 
 		 240 aa  343  2e-93  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.33391 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0445  50S ribosomal protein L2P  73 
 
 		 239 aa  341  8e-93  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0154826  normal  0.478034 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0004  50S ribosomal protein L2P  60.08 
 
 		 237 aa  298  7e-80  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000454303  n/a   
 
 
 
NC_008553  Mthe_1725  50S ribosomal protein L2P  60.17 
 
 		 236 aa  288  4e-77  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0310662  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0213  ribosomal protein L2  58.47 
 
 		 240 aa  283  2.0000000000000002e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0107  50S ribosomal protein L2P  57.14 
 
 		 238 aa  276  2e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2295  50S ribosomal protein L2P  57.59 
 
 		 242 aa  271  9e-72  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2446  50S ribosomal protein L2P  58.11 
 
 		 240 aa  263  1e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1831  50S ribosomal protein L2P  57.47 
 
 		 240 aa  262  3e-69  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.548496 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2221  ribosomal protein L2  57.01 
 
 		 240 aa  261  6.999999999999999e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0860  50S ribosomal protein L2P  53.53 
 
 		 240 aa  258  8e-68  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.480475  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0804  50S ribosomal protein L2P  54.58 
 
 		 240 aa  256  3e-67  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.712432  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0030  50S ribosomal protein L2P  52.7 
 
 		 240 aa  254  5e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.291148  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1124  50S ribosomal protein L2P  52.7 
 
 		 240 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0794  50S ribosomal protein L2P  52.28 
 
 		 240 aa  252  3e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.097706  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1775  ribosomal protein L2  44.92 
 
 		 238 aa  202  3e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1518  ribosomal protein L2  48.47 
 
 		 234 aa  202  4e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  6.90355e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0094  50S ribosomal protein L2P  41.53 
 
 		 238 aa  182  4.0000000000000006e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000127555  unclonable  0.000000429528 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0052  50S ribosomal protein L2P  40.51 
 
 		 246 aa  176  4e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.946037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28234  predicted protein  42.68 
 
 		 257 aa  175  5e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.638688  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0018  50S ribosomal protein L2P  42.68 
 
 		 244 aa  174  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0049  50S ribosomal protein L2P  42.68 
 
 		 245 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0336538 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0102  50S ribosomal protein L2P  40.82 
 
 		 244 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00140338 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0227  50S ribosomal protein L2P  39.83 
 
 		 248 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL03960  conserved hypothetical protein  41.8 
 
 		 255 aa  172  5e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.139278  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1278  50S ribosomal protein L2P  41.42 
 
 		 255 aa  163  2.0000000000000002e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000789854 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1094  50S ribosomal protein L2P  39.66 
 
 		 246 aa  162  6e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31116  Ribosomal protein L8, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  38.27 
 
 		 255 aa  156  3e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.155376  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02275  hypothetical protein similar to 60S ribosomal protein L2 (Broad)  41.29 
 
 		 254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86991  60S large subunit ribosomal protein L2B  42.29 
 
 		 254 aa  135  4e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.32837 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28309  60S large subunit ribosomal protein L2A  42.29 
 
 		 254 aa  135  4e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.24055 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0984  50S ribosomal protein L2  39.2 
 
 		 280 aa  134  9e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.619761  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0870  50S ribosomal protein L2  38.54 
 
 		 275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000015035  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0761  50S ribosomal protein L2  38.99 
 
 		 277 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000295488  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0288  50S ribosomal protein L2  39.02 
 
 		 274 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.101113  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1742  50S ribosomal protein L2  37.86 
 
 		 276 aa  126  3e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000110614  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0787  50S ribosomal protein L2  37.86 
 
 		 274 aa  125  4.0000000000000003e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.469967  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1521  ribosomal protein L2  38.05 
 
 		 275 aa  124  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4918  50S ribosomal protein L2  38.24 
 
 		 275 aa  124  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.113284  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2906  50S ribosomal protein L2  36.7 
 
 		 275 aa  124  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0172805  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01200  50S ribosomal protein L2  37.62 
 
 		 277 aa  124  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0770167  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1571  ribosomal protein L2  38.25 
 
 		 277 aa  123  3e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000641133  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0218  50S ribosomal protein L2  37.62 
 
 		 275 aa  122  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127498  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2708  ribosomal protein L2  38.05 
 
 		 276 aa  123  3e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000275562  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2562  50S ribosomal protein L2  36.82 
 
 		 287 aa  123  3e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.244819  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2293  50S ribosomal protein L2  35.12 
 
 		 279 aa  123  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0106582  normal  0.012024 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2330  50S ribosomal protein L2  36.7 
 
 		 275 aa  122  4e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000156043  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2274  50S ribosomal protein L2  37.74 
 
 		 277 aa  122  5e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000299614  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1391  50S ribosomal protein L2  37.62 
 
 		 276 aa  122  5e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000232502  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1295  50S ribosomal protein L2  37.62 
 
 		 276 aa  122  5e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000122183  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2399  50S ribosomal protein L2  38.28 
 
 		 276 aa  122  5e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00287166  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2315  50S ribosomal protein L2  37.74 
 
 		 277 aa  122  5e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000290927  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0331  50S ribosomal protein L2  36.08 
 
 		 272 aa  122  7e-27  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0812  50S ribosomal protein L2  38.76 
 
 		 284 aa  121  8e-27  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.237121  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1295  50S ribosomal protein L2  39.88 
 
 		 287 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000231184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2152  50S ribosomal protein L2  34.83 
 
 		 279 aa  120  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0924201  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1343  ribosomal protein L2  37.21 
 
 		 279 aa  121  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3912  50S ribosomal protein L2  35.85 
 
 		 274 aa  120  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.5044e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0587  50S ribosomal protein L2  35.85 
 
 		 274 aa  120  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000050829  normal  0.227169 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0286  50S ribosomal protein L2  35.85 
 
 		 274 aa  120  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000315964  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0110  50S ribosomal protein L2  37.43 
 
 		 276 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3819  50S ribosomal protein L2  35.38 
 
 		 273 aa  119  3e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000104624  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0326  50S ribosomal protein L2  34.91 
 
 		 273 aa  120  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000291678  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0694  50S ribosomal protein L2  36.32 
 
 		 287 aa  119  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00211234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2457  50S ribosomal protein L2  35.12 
 
 		 276 aa  119  3e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0871736 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2711  50S ribosomal protein L2  36.36 
 
 		 277 aa  119  3e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2396  50S ribosomal protein L2  36.36 
 
 		 277 aa  119  3e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.445207  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0228  50S ribosomal protein L2  36.92 
 
 		 275 aa  119  3e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0114  50S ribosomal protein L2  37.97 
 
 		 276 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000290971  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0956  50S ribosomal protein L2  36.87 
 
 		 274 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00125176  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3748  50S ribosomal protein L2  35.82 
 
 		 273 aa  119  4.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000108731  hitchhiker  0.00494792 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3804  50S ribosomal protein L2  35.82 
 
 		 273 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00899018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3706  50S ribosomal protein L2  39.46 
 
 		 277 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3633  50S ribosomal protein L2  35.82 
 
 		 273 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000993877  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3741  50S ribosomal protein L2  35.82 
 
 		 273 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.69026  normal  0.0152471 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0289  50S ribosomal protein L2  38.83 
 
 		 275 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0283371  normal  0.0481443 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3998  50S ribosomal protein L2  35.82 
 
 		 273 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000302361  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3633  50S ribosomal protein L2  35.82 
 
 		 273 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0350833  normal  0.361481 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3706  50S ribosomal protein L2  35.82 
 
 		 273 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00279259  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0408  50S ribosomal protein L2  34.91 
 
 		 273 aa  118  6e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00399178  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1480  50S ribosomal protein L2  35.45 
 
 		 281 aa  119  6e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000349234  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3450  50S ribosomal protein L2  36.15 
 
 		 275 aa  118  7e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000764843  decreased coverage  0.00435128 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0330  50S ribosomal protein L2  36.15 
 
 		 275 aa  118  7e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000414315  normal  0.021485 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2756  50S ribosomal protein L2  36.15 
 
 		 275 aa  118  7e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000162377  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0270  50S ribosomal protein L2  36.15 
 
 		 275 aa  118  7e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00297501  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0279  50S ribosomal protein L2  36.15 
 
 		 275 aa  118  7e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000000000585498  normal  0.0839884 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03168  50S ribosomal protein L2  35.82 
 
 		 273 aa  118  7.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00146365  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0396  ribosomal protein L2  35.82 
 
 		 273 aa  118  7.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000401214  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3612  50S ribosomal protein L2  35.82 
 
 		 273 aa  118  7.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000120655  hitchhiker  0.00428222 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0252  50S ribosomal protein L2  36.62 
 
 		 275 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000167103  normal  0.0370671 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3065  50S ribosomal protein L2  36.62 
 
 		 275 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000040785  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3511  50S ribosomal protein L2  35.82 
 
 		 273 aa  118  7.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112597  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3800  50S ribosomal protein L2  35.82 
 
 		 273 aa  118  7.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000757775  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0396  50S ribosomal protein L2  35.82 
 
 		 273 aa  118  7.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000072222  hitchhiker  0.000353424 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03119  hypothetical protein  35.82 
 
 		 273 aa  118  7.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00128631  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0301  50S ribosomal protein L2  36.32 
 
 		 278 aa  118  7.999999999999999e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.302391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4640  50S ribosomal protein L2  35.82 
 
 		 273 aa  118  7.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0685659  normal  0.0584567 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>