More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0107 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0107  50S ribosomal protein L2P  100 
 
 		 238 aa  484  1e-136  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0004  50S ribosomal protein L2P  72.15 
 
 		 237 aa  363  1e-99  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000454303  n/a   
 
 
 
NC_013922  Nmag_0213  ribosomal protein L2  59.15 
 
 		 240 aa  311  7.999999999999999e-84  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1725  50S ribosomal protein L2P  57.81 
 
 		 236 aa  295  3e-79  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0310662  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2446  50S ribosomal protein L2P  57.92 
 
 		 240 aa  290  1e-77  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0860  50S ribosomal protein L2P  57.92 
 
 		 240 aa  288  4e-77  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.480475  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0804  50S ribosomal protein L2P  56.67 
 
 		 240 aa  288  7e-77  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.712432  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0535  50S ribosomal protein L2P  57.98 
 
 		 238 aa  287  1e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.393685  normal  0.694231 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2295  50S ribosomal protein L2P  57.59 
 
 		 242 aa  286  2e-76  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0030  50S ribosomal protein L2P  57.08 
 
 		 240 aa  285  5.999999999999999e-76  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.291148  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1124  50S ribosomal protein L2P  57.5 
 
 		 240 aa  283  1.0000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2221  ribosomal protein L2  56.76 
 
 		 240 aa  284  1.0000000000000001e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0794  50S ribosomal protein L2P  57.08 
 
 		 240 aa  282  3.0000000000000004e-75  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.097706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1831  50S ribosomal protein L2P  56.31 
 
 		 240 aa  278  7e-74  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.548496 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2250  50S ribosomal protein L2P  57.14 
 
 		 236 aa  276  2e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000000353713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0084  50S ribosomal protein L2P  55.19 
 
 		 240 aa  268  4e-71  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.33391 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0567  50S ribosomal protein L2P  54.24 
 
 		 239 aa  263  1e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0425344  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0445  50S ribosomal protein L2P  56.07 
 
 		 239 aa  257  1e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0154826  normal  0.478034 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1518  ribosomal protein L2  54.78 
 
 		 234 aa  256  2e-67  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  6.90355e-16  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1775  ribosomal protein L2  47.68 
 
 		 238 aa  217  1e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL03960  conserved hypothetical protein  46.53 
 
 		 255 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.139278  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0052  50S ribosomal protein L2P  48.1 
 
 		 246 aa  214  9.999999999999999e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.946037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1094  50S ribosomal protein L2P  47.68 
 
 		 246 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0049  50S ribosomal protein L2P  47.26 
 
 		 245 aa  210  1e-53  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0336538 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0018  50S ribosomal protein L2P  46.84 
 
 		 244 aa  209  3e-53  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1278  50S ribosomal protein L2P  47.48 
 
 		 255 aa  207  1e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000789854 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0227  50S ribosomal protein L2P  45.87 
 
 		 248 aa  202  5e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28234  predicted protein  43.55 
 
 		 257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.638688  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0102  50S ribosomal protein L2P  43.1 
 
 		 244 aa  191  6e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00140338 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0094  50S ribosomal protein L2P  42.55 
 
 		 238 aa  191  8e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000127555  unclonable  0.000000429528 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31116  Ribosomal protein L8, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  41.13 
 
 		 255 aa  187  1e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.155376  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02275  hypothetical protein similar to 60S ribosomal protein L2 (Broad)  42.34 
 
 		 254 aa  176  2e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86991  60S large subunit ribosomal protein L2B  43.72 
 
 		 254 aa  170  2e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.32837 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28309  60S large subunit ribosomal protein L2A  43.72 
 
 		 254 aa  170  2e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.24055 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2906  50S ribosomal protein L2  40.86 
 
 		 275 aa  135  6.0000000000000005e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0172805  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1391  50S ribosomal protein L2  37.11 
 
 		 276 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000232502  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1295  50S ribosomal protein L2  37.11 
 
 		 276 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000122183  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1742  50S ribosomal protein L2  38.54 
 
 		 276 aa  133  3e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000110614  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10718  50S ribosomal protein L2  33.9 
 
 		 280 aa  132  5e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0762488  normal  0.210258 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01200  50S ribosomal protein L2  36.92 
 
 		 277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0770167  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2399  50S ribosomal protein L2  37.91 
 
 		 276 aa  130  3e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00287166  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0761  50S ribosomal protein L2  39.25 
 
 		 277 aa  129  3e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000295488  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0870  50S ribosomal protein L2  39.11 
 
 		 275 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000015035  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2711  50S ribosomal protein L2  41.11 
 
 		 277 aa  129  5.0000000000000004e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2396  50S ribosomal protein L2  41.11 
 
 		 277 aa  129  5.0000000000000004e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.445207  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1521  ribosomal protein L2  37.26 
 
 		 275 aa  128  6e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0787  50S ribosomal protein L2  36.14 
 
 		 274 aa  128  8.000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.469967  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0565  50S ribosomal protein L2  35.56 
 
 		 277 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1308  50S ribosomal protein L2  32.91 
 
 		 278 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186589  normal  0.118426 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1571  ribosomal protein L2  35.65 
 
 		 277 aa  126  3e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000641133  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4318  ribosomal protein L2  35.38 
 
 		 277 aa  126  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0197  50S ribosomal protein L2  38 
 
 		 283 aa  125  4.0000000000000003e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00345154  normal  0.0626583 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3902  50S ribosomal protein L2  36.27 
 
 		 278 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0845  ribosomal protein L2  35.9 
 
 		 276 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2562  50S ribosomal protein L2  38.92 
 
 		 287 aa  125  5e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.244819  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1043  50S ribosomal protein L2  33.76 
 
 		 278 aa  125  5e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1016  50S ribosomal protein L2  33.76 
 
 		 278 aa  125  5e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1033  50S ribosomal protein L2  33.76 
 
 		 278 aa  125  5e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.483426 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2457  50S ribosomal protein L2  37.13 
 
 		 276 aa  125  6e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0871736 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0408  50S ribosomal protein L2  36.36 
 
 		 273 aa  125  8.000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00399178  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1135  50S ribosomal protein L2  36.08 
 
 		 275 aa  124  1e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000903374  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5046  50S ribosomal protein L2  32.91 
 
 		 279 aa  124  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.126955 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1182  50S ribosomal protein L2  36.77 
 
 		 275 aa  123  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0984  50S ribosomal protein L2  35.07 
 
 		 280 aa  123  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.619761  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3021  50S ribosomal protein L2  36.65 
 
 		 274 aa  123  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0478203  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0199  50S ribosomal protein L2  35.55 
 
 		 277 aa  124  2e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0675116  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20840  50S ribosomal protein L2  34.18 
 
 		 278 aa  123  3e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1089  50S ribosomal protein L2  35.6 
 
 		 278 aa  122  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.062286 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29710  LSU ribosomal protein L2P  36.98 
 
 		 279 aa  123  3e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.560922 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0630  ribosomal protein L2  32.92 
 
 		 278 aa  123  3e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4918  50S ribosomal protein L2  38.16 
 
 		 275 aa  122  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.113284  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23780  50S ribosomal protein L2  34.17 
 
 		 278 aa  122  4e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3706  50S ribosomal protein L2  36.67 
 
 		 277 aa  122  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03168  50S ribosomal protein L2  35.89 
 
 		 273 aa  122  6e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00146365  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0396  ribosomal protein L2  35.89 
 
 		 273 aa  122  6e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000401214  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3612  50S ribosomal protein L2  35.89 
 
 		 273 aa  122  6e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000120655  hitchhiker  0.00428222 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03119  hypothetical protein  35.89 
 
 		 273 aa  122  6e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00128631  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3511  50S ribosomal protein L2  35.89 
 
 		 273 aa  122  6e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112597  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4640  50S ribosomal protein L2  35.89 
 
 		 273 aa  122  6e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0685659  normal  0.0584567 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3702  50S ribosomal protein L2  35.89 
 
 		 273 aa  122  6e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237187  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1181  ribosomal protein L2  38.21 
 
 		 274 aa  122  6e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000178958  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3800  50S ribosomal protein L2  35.89 
 
 		 273 aa  122  6e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000757775  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3819  50S ribosomal protein L2  35.89 
 
 		 273 aa  122  6e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000104624  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0396  50S ribosomal protein L2  35.89 
 
 		 273 aa  122  6e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000072222  hitchhiker  0.000353424 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0461  50S ribosomal protein L2  37.82 
 
 		 274 aa  122  7e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3432  ribosomal protein L2  34.9 
 
 		 278 aa  121  8e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3755  ribosomal protein L2  35.42 
 
 		 278 aa  121  8e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.168054  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0683  50S ribosomal protein L2  38.66 
 
 		 274 aa  121  8e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.660032  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3920  50S ribosomal protein L2  36.46 
 
 		 279 aa  120  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0326  50S ribosomal protein L2  35.89 
 
 		 273 aa  121  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000291678  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0694  50S ribosomal protein L2  36.28 
 
 		 287 aa  121  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00211234  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0114  50S ribosomal protein L2  37.25 
 
 		 276 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000290971  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2708  ribosomal protein L2  34.71 
 
 		 276 aa  121  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000275562  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1282  ribosomal protein L2  36.07 
 
 		 275 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1828  50S ribosomal protein L2  34.26 
 
 		 277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.256739  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0590  50S ribosomal protein L2  32.64 
 
 		 278 aa  120  1.9999999999999998e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.274558  normal  0.886345 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0587  50S ribosomal protein L2  36.1 
 
 		 274 aa  120  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000050829  normal  0.227169 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0934  50S ribosomal protein L2  36.46 
 
 		 278 aa  120  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0813346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0340  50S ribosomal protein L2  37.74 
 
 		 275 aa  120  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000079593  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0286  50S ribosomal protein L2  36.1 
 
 		 274 aa  120  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000315964  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>