More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1124 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1124  50S ribosomal protein L2P  100 
 
 
240 aa  479  1e-134  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0794  50S ribosomal protein L2P  99.58 
 
 
240 aa  478  1e-134  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.097706  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0030  50S ribosomal protein L2P  98.33 
 
 
240 aa  476  1e-133  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.291148  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0860  50S ribosomal protein L2P  93.33 
 
 
240 aa  457  9.999999999999999e-129  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.480475  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0804  50S ribosomal protein L2P  76.67 
 
 
240 aa  398  9.999999999999999e-111  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.712432  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0213  ribosomal protein L2  61.51 
 
 
240 aa  301  7.000000000000001e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0004  50S ribosomal protein L2P  57.5 
 
 
237 aa  297  1e-79  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000454303  n/a   
 
 
 
NC_008553  Mthe_1725  50S ribosomal protein L2P  58.75 
 
 
236 aa  288  6e-77  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0310662  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0107  50S ribosomal protein L2P  57.5 
 
 
238 aa  283  1.0000000000000001e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2221  ribosomal protein L2  60.62 
 
 
240 aa  281  5.000000000000001e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2295  50S ribosomal protein L2P  59.29 
 
 
242 aa  275  4e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1831  50S ribosomal protein L2P  58.15 
 
 
240 aa  270  2e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.548496 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2446  50S ribosomal protein L2P  57.33 
 
 
240 aa  269  2.9999999999999997e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1518  ribosomal protein L2  56.22 
 
 
234 aa  255  5e-67  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  6.90355e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2250  50S ribosomal protein L2P  52.7 
 
 
236 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000000353713  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0567  50S ribosomal protein L2P  52.92 
 
 
239 aa  250  2e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0425344  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0535  50S ribosomal protein L2P  51.88 
 
 
238 aa  247  2e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.393685  normal  0.694231 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0084  50S ribosomal protein L2P  50.62 
 
 
240 aa  237  1e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.33391 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0445  50S ribosomal protein L2P  52.28 
 
 
239 aa  231  8.000000000000001e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0154826  normal  0.478034 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28234  predicted protein  50 
 
 
257 aa  224  6e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.638688  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1775  ribosomal protein L2  48.75 
 
 
238 aa  218  6e-56  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0049  50S ribosomal protein L2P  53.11 
 
 
245 aa  218  7.999999999999999e-56  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0336538 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0227  50S ribosomal protein L2P  49.79 
 
 
248 aa  215  4e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL03960  conserved hypothetical protein  45.9 
 
 
255 aa  214  9.999999999999999e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.139278  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31116  Ribosomal protein L8, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  45.53 
 
 
255 aa  212  3.9999999999999995e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.155376  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0018  50S ribosomal protein L2P  52.28 
 
 
244 aa  211  7e-54  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1094  50S ribosomal protein L2P  50.62 
 
 
246 aa  207  8e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0094  50S ribosomal protein L2P  46.25 
 
 
238 aa  207  1e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000127555  unclonable  0.000000429528 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0052  50S ribosomal protein L2P  49.79 
 
 
246 aa  206  3e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.946037  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02275  hypothetical protein similar to 60S ribosomal protein L2 (Broad)  44.08 
 
 
254 aa  202  4e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0102  50S ribosomal protein L2P  46.03 
 
 
244 aa  194  1e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00140338 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28309  60S large subunit ribosomal protein L2A  48.16 
 
 
254 aa  193  2e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.24055 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86991  60S large subunit ribosomal protein L2B  48.16 
 
 
254 aa  193  2e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.32837 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1278  50S ribosomal protein L2P  46.86 
 
 
255 aa  187  2e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000789854 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2457  50S ribosomal protein L2  42.23 
 
 
276 aa  141  7e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0871736 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0197  50S ribosomal protein L2  38.46 
 
 
283 aa  135  5e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00345154  normal  0.0626583 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03168  50S ribosomal protein L2  38.21 
 
 
273 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00146365  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0396  ribosomal protein L2  38.21 
 
 
273 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000401214  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0396  50S ribosomal protein L2  38.21 
 
 
273 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000072222  hitchhiker  0.000353424 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3702  50S ribosomal protein L2  38.21 
 
 
273 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237187  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4640  50S ribosomal protein L2  38.21 
 
 
273 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0685659  normal  0.0584567 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3612  50S ribosomal protein L2  38.21 
 
 
273 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000120655  hitchhiker  0.00428222 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03119  hypothetical protein  38.21 
 
 
273 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00128631  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3511  50S ribosomal protein L2  38.21 
 
 
273 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112597  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3800  50S ribosomal protein L2  38.21 
 
 
273 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000757775  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0113  50S ribosomal protein L2  41.78 
 
 
276 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000200839  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0408  50S ribosomal protein L2  37.74 
 
 
273 aa  134  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00399178  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0113  50S ribosomal protein L2  41.78 
 
 
276 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000138046  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0109  50S ribosomal protein L2  41.78 
 
 
276 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.27306e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0107  50S ribosomal protein L2  41.78 
 
 
276 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000901221  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3748  50S ribosomal protein L2  39.44 
 
 
273 aa  134  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000108731  hitchhiker  0.00494792 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0113  50S ribosomal protein L2  41.78 
 
 
276 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000512601  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0787  50S ribosomal protein L2  41.09 
 
 
274 aa  134  9.999999999999999e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.469967  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0144  50S ribosomal protein L2  41.78 
 
 
276 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000100516  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0125  50S ribosomal protein L2  41.78 
 
 
276 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.14187e-61 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0114  50S ribosomal protein L2  43.2 
 
 
276 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000290971  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01200  50S ribosomal protein L2  40.39 
 
 
277 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0770167  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3819  50S ribosomal protein L2  38.97 
 
 
273 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000104624  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2906  50S ribosomal protein L2  40.4 
 
 
275 aa  133  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0172805  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1828  50S ribosomal protein L2  38.84 
 
 
277 aa  133  3e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.256739  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0288  50S ribosomal protein L2  39.62 
 
 
274 aa  132  3e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.101113  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0984  50S ribosomal protein L2  37.16 
 
 
280 aa  133  3e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.619761  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3633  50S ribosomal protein L2  37.74 
 
 
273 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000993877  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3804  50S ribosomal protein L2  37.74 
 
 
273 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00899018  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3706  50S ribosomal protein L2  37.74 
 
 
273 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00279259  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3741  50S ribosomal protein L2  37.74 
 
 
273 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.69026  normal  0.0152471 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3633  50S ribosomal protein L2  37.74 
 
 
273 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0350833  normal  0.361481 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3912  50S ribosomal protein L2  37.74 
 
 
274 aa  132  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.5044e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0587  50S ribosomal protein L2  37.74 
 
 
274 aa  132  5e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000050829  normal  0.227169 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0286  50S ribosomal protein L2  37.74 
 
 
274 aa  132  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000315964  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3998  50S ribosomal protein L2  37.74 
 
 
273 aa  132  5e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000302361  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0870  50S ribosomal protein L2  40.89 
 
 
275 aa  132  6e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000015035  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1521  ribosomal protein L2  39.91 
 
 
275 aa  132  6e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0326  50S ribosomal protein L2  37.26 
 
 
273 aa  131  7.999999999999999e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000291678  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0134  50S ribosomal protein L2  40.38 
 
 
276 aa  131  9e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000249417  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5192  50S ribosomal protein L2  40.38 
 
 
276 aa  131  9e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000180933  unclonable  2.65522e-25 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0107  50S ribosomal protein L2  41.75 
 
 
276 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000204251  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1230  50S ribosomal protein L2  36.63 
 
 
277 aa  131  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.424988  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1571  ribosomal protein L2  37.61 
 
 
277 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000641133  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1391  50S ribosomal protein L2  38.19 
 
 
276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000232502  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1295  50S ribosomal protein L2  38.19 
 
 
276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000122183  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0110  50S ribosomal protein L2  42.23 
 
 
276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2562  50S ribosomal protein L2  38.54 
 
 
287 aa  130  2.0000000000000002e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.244819  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2399  50S ribosomal protein L2  36.89 
 
 
276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00287166  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1742  50S ribosomal protein L2  40.29 
 
 
276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000110614  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3992  ribosomal protein L2  39.8 
 
 
275 aa  130  3e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1848  50S ribosomal protein L2  38.69 
 
 
279 aa  129  3e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.492965  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0761  50S ribosomal protein L2  39.39 
 
 
277 aa  129  3e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000295488  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2274  50S ribosomal protein L2  40.47 
 
 
277 aa  129  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000299614  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1943  50S ribosomal protein L2  37.81 
 
 
277 aa  129  3e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2315  50S ribosomal protein L2  40.47 
 
 
277 aa  129  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000290927  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0108  50S ribosomal protein L2  39.91 
 
 
276 aa  130  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000187869  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4541  50S ribosomal protein L2  36.79 
 
 
274 aa  129  4.0000000000000003e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000106039  hitchhiker  0.00201461 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1959  50S ribosomal protein L2  37.13 
 
 
277 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0386068  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0228  50S ribosomal protein L2  39.9 
 
 
275 aa  129  4.0000000000000003e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0082  50S ribosomal protein L2  37.81 
 
 
276 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.173583 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4918  50S ribosomal protein L2  38.54 
 
 
275 aa  129  4.0000000000000003e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.113284  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0718  ribosomal protein L2  38.05 
 
 
273 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1193  50S ribosomal protein L2  36.14 
 
 
277 aa  129  5.0000000000000004e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2152  50S ribosomal protein L2  39.7 
 
 
279 aa  129  6e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0924201  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>