More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1518 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_1518  ribosomal protein L2  100 
 
 		 234 aa  469  1.0000000000000001e-131  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  6.90355e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0860  50S ribosomal protein L2P  55.83 
 
 		 240 aa  260  1e-68  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.480475  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0107  50S ribosomal protein L2P  53.78 
 
 		 238 aa  259  3e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1725  50S ribosomal protein L2P  57.2 
 
 		 236 aa  259  3e-68  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0310662  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0030  50S ribosomal protein L2P  54.58 
 
 		 240 aa  258  6e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.291148  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1124  50S ribosomal protein L2P  55 
 
 		 240 aa  257  1e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0794  50S ribosomal protein L2P  54.58 
 
 		 240 aa  256  2e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.097706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0213  ribosomal protein L2  54.94 
 
 		 240 aa  254  7e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0804  50S ribosomal protein L2P  53.33 
 
 		 240 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.712432  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0004  50S ribosomal protein L2P  51.9 
 
 		 237 aa  250  1e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000454303  n/a   
 
 
 
NC_013743  Htur_2221  ribosomal protein L2  53.18 
 
 		 240 aa  233  2.0000000000000002e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1831  50S ribosomal protein L2P  53.64 
 
 		 240 aa  228  9e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.548496 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2295  50S ribosomal protein L2P  51.8 
 
 		 242 aa  224  1e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2446  50S ribosomal protein L2P  51.38 
 
 		 240 aa  223  1e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0535  50S ribosomal protein L2P  48.1 
 
 		 238 aa  213  1.9999999999999998e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.393685  normal  0.694231 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0049  50S ribosomal protein L2P  51.74 
 
 		 245 aa  207  1e-52  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0336538 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0018  50S ribosomal protein L2P  50 
 
 		 244 aa  206  3e-52  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0052  50S ribosomal protein L2P  49.13 
 
 		 246 aa  204  1e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.946037  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1775  ribosomal protein L2  47.03 
 
 		 238 aa  203  2e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2250  50S ribosomal protein L2P  47.03 
 
 		 236 aa  203  2e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000000353713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1094  50S ribosomal protein L2P  50 
 
 		 246 aa  202  4e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0084  50S ribosomal protein L2P  46.67 
 
 		 240 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.33391 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0567  50S ribosomal protein L2P  44.96 
 
 		 239 aa  198  7e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0425344  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0227  50S ribosomal protein L2P  46.69 
 
 		 248 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0094  50S ribosomal protein L2P  45.15 
 
 		 238 aa  192  4e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000127555  unclonable  0.000000429528 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0445  50S ribosomal protein L2P  48.12 
 
 		 239 aa  190  2e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0154826  normal  0.478034 
 
 
-
 
NC_006681  CNL03960  conserved hypothetical protein  44.21 
 
 		 255 aa  187  9e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.139278  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1278  50S ribosomal protein L2P  50.43 
 
 		 255 aa  187  2e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000789854 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28234  predicted protein  43.15 
 
 		 257 aa  184  8e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.638688  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02275  hypothetical protein similar to 60S ribosomal protein L2 (Broad)  44.49 
 
 		 254 aa  180  2e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31116  Ribosomal protein L8, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  41.13 
 
 		 255 aa  179  4e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.155376  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0102  50S ribosomal protein L2P  40.17 
 
 		 244 aa  177  9e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00140338 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86991  60S large subunit ribosomal protein L2B  45.27 
 
 		 254 aa  168  7e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.32837 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28309  60S large subunit ribosomal protein L2A  45.27 
 
 		 254 aa  168  7e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.24055 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0199  50S ribosomal protein L2  42.29 
 
 		 277 aa  131  1.0000000000000001e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0675116  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03168  50S ribosomal protein L2  37.81 
 
 		 273 aa  123  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00146365  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0396  ribosomal protein L2  37.81 
 
 		 273 aa  123  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000401214  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03119  hypothetical protein  37.81 
 
 		 273 aa  123  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00128631  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0396  50S ribosomal protein L2  37.81 
 
 		 273 aa  123  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000072222  hitchhiker  0.000353424 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3612  50S ribosomal protein L2  37.81 
 
 		 273 aa  123  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000120655  hitchhiker  0.00428222 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3511  50S ribosomal protein L2  37.81 
 
 		 273 aa  123  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112597  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3702  50S ribosomal protein L2  37.81 
 
 		 273 aa  123  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237187  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3800  50S ribosomal protein L2  37.81 
 
 		 273 aa  123  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000757775  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4640  50S ribosomal protein L2  37.81 
 
 		 273 aa  123  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0685659  normal  0.0584567 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2906  50S ribosomal protein L2  41.67 
 
 		 275 aa  123  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0172805  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0197  50S ribosomal protein L2  40.31 
 
 		 283 aa  123  3e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00345154  normal  0.0626583 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0984  50S ribosomal protein L2  38.5 
 
 		 280 aa  123  3e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.619761  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3902  50S ribosomal protein L2  39.38 
 
 		 278 aa  123  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0228  50S ribosomal protein L2  42.65 
 
 		 275 aa  122  5e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2399  50S ribosomal protein L2  41.33 
 
 		 276 aa  122  5e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00287166  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0598  50S ribosomal protein L2  41.71 
 
 		 279 aa  122  6e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000263643  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0565  50S ribosomal protein L2  39.06 
 
 		 277 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0408  50S ribosomal protein L2  39.77 
 
 		 273 aa  121  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00399178  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23780  50S ribosomal protein L2  42.71 
 
 		 278 aa  121  9.999999999999999e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4318  ribosomal protein L2  39.06 
 
 		 277 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3741  50S ribosomal protein L2  37.31 
 
 		 273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.69026  normal  0.0152471 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0761  50S ribosomal protein L2  39.13 
 
 		 277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000295488  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3633  50S ribosomal protein L2  37.31 
 
 		 273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000993877  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3998  50S ribosomal protein L2  37.31 
 
 		 273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000302361  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3804  50S ribosomal protein L2  37.31 
 
 		 273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00899018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3706  50S ribosomal protein L2  37.31 
 
 		 273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00279259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3633  50S ribosomal protein L2  37.31 
 
 		 273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0350833  normal  0.361481 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0294  50S ribosomal protein L2  39.91 
 
 		 278 aa  119  3e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  3.4720999999999997e-28 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3748  50S ribosomal protein L2  36.82 
 
 		 273 aa  119  3.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000108731  hitchhiker  0.00494792 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3819  50S ribosomal protein L2  37.31 
 
 		 273 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000104624  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0326  50S ribosomal protein L2  39.18 
 
 		 273 aa  119  6e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000291678  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3755  ribosomal protein L2  38.02 
 
 		 278 aa  117  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.168054  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1710  50S ribosomal protein L2  40.72 
 
 		 276 aa  118  9.999999999999999e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1571  ribosomal protein L2  38.27 
 
 		 277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000641133  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3432  ribosomal protein L2  38.54 
 
 		 278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0286  50S ribosomal protein L2  39.18 
 
 		 274 aa  116  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000315964  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5046  50S ribosomal protein L2  38.54 
 
 		 279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.126955 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3912  50S ribosomal protein L2  39.18 
 
 		 274 aa  116  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.5044e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0587  50S ribosomal protein L2  39.18 
 
 		 274 aa  116  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000050829  normal  0.227169 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10718  50S ribosomal protein L2  38.02 
 
 		 280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0762488  normal  0.210258 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01200  50S ribosomal protein L2  41.46 
 
 		 277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0770167  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1126  50S ribosomal protein L2  39.58 
 
 		 278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.881325  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3140  50S ribosomal protein L2  40.62 
 
 		 278 aa  116  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.524365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2711  50S ribosomal protein L2  38.98 
 
 		 277 aa  116  3e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2396  50S ribosomal protein L2  38.98 
 
 		 277 aa  116  3e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.445207  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1308  50S ribosomal protein L2  38.02 
 
 		 278 aa  115  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186589  normal  0.118426 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1480  50S ribosomal protein L2  41.4 
 
 		 281 aa  115  5e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000349234  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3664  50S ribosomal protein L2  41.36 
 
 		 281 aa  115  5e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272816  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29710  LSU ribosomal protein L2P  39.58 
 
 		 279 aa  115  5e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.560922 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3920  50S ribosomal protein L2  39.06 
 
 		 279 aa  115  5e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2562  50S ribosomal protein L2  40.31 
 
 		 287 aa  115  6e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.244819  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1043  50S ribosomal protein L2  38.54 
 
 		 278 aa  115  6e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1016  50S ribosomal protein L2  38.54 
 
 		 278 aa  115  6e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1033  50S ribosomal protein L2  38.54 
 
 		 278 aa  115  6e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.483426 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0870  50S ribosomal protein L2  41.03 
 
 		 275 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000015035  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5127  ribosomal protein L2  37.95 
 
 		 279 aa  115  7.999999999999999e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.840283 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1089  50S ribosomal protein L2  38.54 
 
 		 278 aa  115  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.062286 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0258  ribosomal protein L2  39.18 
 
 		 276 aa  115  7.999999999999999e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0113  50S ribosomal protein L2  40.4 
 
 		 276 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000200839  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0061  50S ribosomal protein L2  39.57 
 
 		 277 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.41006  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1521  ribosomal protein L2  39.8 
 
 		 275 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0113  50S ribosomal protein L2  40.4 
 
 		 276 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000512601  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1914  50S ribosomal protein L2  40.62 
 
 		 282 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.253672 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0144  50S ribosomal protein L2  40.4 
 
 		 276 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000100516  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0309  50S ribosomal protein L2  39.27 
 
 		 278 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237082 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>