More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0102 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0102  50S ribosomal protein L2P  100 
 
 		 244 aa  491  9.999999999999999e-139  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00140338 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1775  ribosomal protein L2  46.41 
 
 		 238 aa  205  4e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0213  ribosomal protein L2  43.88 
 
 		 240 aa  201  9.999999999999999e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2446  50S ribosomal protein L2P  48.47 
 
 		 240 aa  196  2.0000000000000003e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0860  50S ribosomal protein L2P  46.67 
 
 		 240 aa  196  3e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.480475  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0030  50S ribosomal protein L2P  45.61 
 
 		 240 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.291148  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1124  50S ribosomal protein L2P  46.03 
 
 		 240 aa  194  1e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0794  50S ribosomal protein L2P  45.61 
 
 		 240 aa  193  2e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.097706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0018  50S ribosomal protein L2P  45.31 
 
 		 244 aa  192  4e-48  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0107  50S ribosomal protein L2P  43.1 
 
 		 238 aa  191  6e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0094  50S ribosomal protein L2P  42.62 
 
 		 238 aa  191  1e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000127555  unclonable  0.000000429528 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0804  50S ribosomal protein L2P  43.33 
 
 		 240 aa  189  5e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.712432  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2295  50S ribosomal protein L2P  45.92 
 
 		 242 aa  186  3e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0004  50S ribosomal protein L2P  41.77 
 
 		 237 aa  185  5e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000454303  n/a   
 
 
 
NC_013743  Htur_2221  ribosomal protein L2  45.41 
 
 		 240 aa  185  6e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0049  50S ribosomal protein L2P  44.08 
 
 		 245 aa  185  6e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0336538 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0227  50S ribosomal protein L2P  43.62 
 
 		 248 aa  184  9e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1278  50S ribosomal protein L2P  43.9 
 
 		 255 aa  183  2.0000000000000003e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000789854 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0052  50S ribosomal protein L2P  42.45 
 
 		 246 aa  181  1e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.946037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1831  50S ribosomal protein L2P  45.41 
 
 		 240 aa  180  2e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.548496 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0535  50S ribosomal protein L2P  39.68 
 
 		 238 aa  177  1e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.393685  normal  0.694231 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1094  50S ribosomal protein L2P  41.63 
 
 		 246 aa  177  2e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1518  ribosomal protein L2  40.69 
 
 		 234 aa  175  8e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  6.90355e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2250  50S ribosomal protein L2P  40.82 
 
 		 236 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000000353713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1725  50S ribosomal protein L2P  40.34 
 
 		 236 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0310662  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL03960  conserved hypothetical protein  43.9 
 
 		 255 aa  169  5e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.139278  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31116  Ribosomal protein L8, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  39 
 
 		 255 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.155376  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0567  50S ribosomal protein L2P  37.1 
 
 		 239 aa  160  1e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0425344  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28234  predicted protein  40.28 
 
 		 257 aa  160  2e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.638688  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0445  50S ribosomal protein L2P  39.92 
 
 		 239 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0154826  normal  0.478034 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0084  50S ribosomal protein L2P  37.04 
 
 		 240 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.33391 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02275  hypothetical protein similar to 60S ribosomal protein L2 (Broad)  37.2 
 
 		 254 aa  144  1e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28309  60S large subunit ribosomal protein L2A  39.17 
 
 		 254 aa  126  4.0000000000000003e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.24055 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86991  60S large subunit ribosomal protein L2B  39.17 
 
 		 254 aa  126  4.0000000000000003e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.32837 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0331  50S ribosomal protein L2  34.34 
 
 		 272 aa  92.8  4e-18  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0694  50S ribosomal protein L2  38.65 
 
 		 287 aa  92  7e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00211234  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0812  50S ribosomal protein L2  31.4 
 
 		 284 aa  90.9  2e-17  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.237121  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3819  50S ribosomal protein L2  32.74 
 
 		 273 aa  90.5  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000104624  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3998  50S ribosomal protein L2  32.74 
 
 		 273 aa  90.5  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000302361  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3009  50S ribosomal protein L2  35.23 
 
 		 287 aa  90.9  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.141186  hitchhiker  0.00819024 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3741  50S ribosomal protein L2  32.74 
 
 		 273 aa  89.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.69026  normal  0.0152471 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3706  50S ribosomal protein L2  32.74 
 
 		 273 aa  89.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00279259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3633  50S ribosomal protein L2  32.74 
 
 		 273 aa  89.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0350833  normal  0.361481 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3748  50S ribosomal protein L2  32.74 
 
 		 273 aa  90.1  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000108731  hitchhiker  0.00494792 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3633  50S ribosomal protein L2  32.74 
 
 		 273 aa  89.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000993877  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3804  50S ribosomal protein L2  32.74 
 
 		 273 aa  89.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00899018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0199  50S ribosomal protein L2  34.18 
 
 		 277 aa  90.1  3e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0675116  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03168  50S ribosomal protein L2  32.74 
 
 		 273 aa  89.7  4e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00146365  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0396  ribosomal protein L2  32.74 
 
 		 273 aa  89.7  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000401214  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3612  50S ribosomal protein L2  32.74 
 
 		 273 aa  89.7  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000120655  hitchhiker  0.00428222 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0870  50S ribosomal protein L2  33.13 
 
 		 275 aa  89.7  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000015035  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3511  50S ribosomal protein L2  32.74 
 
 		 273 aa  89.7  4e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112597  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf440  50S ribosomal protein L2  33.68 
 
 		 281 aa  89.7  4e-17  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0396  50S ribosomal protein L2  32.74 
 
 		 273 aa  89.7  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000072222  hitchhiker  0.000353424 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03119  hypothetical protein  32.74 
 
 		 273 aa  89.7  4e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00128631  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3702  50S ribosomal protein L2  32.74 
 
 		 273 aa  89.7  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237187  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3800  50S ribosomal protein L2  32.74 
 
 		 273 aa  89.7  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000757775  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4640  50S ribosomal protein L2  32.74 
 
 		 273 aa  89.7  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0685659  normal  0.0584567 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0587  50S ribosomal protein L2  32.14 
 
 		 274 aa  89  7e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000050829  normal  0.227169 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0286  50S ribosomal protein L2  32.14 
 
 		 274 aa  89  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000315964  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3912  50S ribosomal protein L2  32.14 
 
 		 274 aa  89  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.5044e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4918  50S ribosomal protein L2  34.76 
 
 		 275 aa  88.6  8e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.113284  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2562  50S ribosomal protein L2  36.81 
 
 		 287 aa  88.6  8e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.244819  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1521  ribosomal protein L2  32.37 
 
 		 275 aa  88.6  9e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0598  50S ribosomal protein L2  34.64 
 
 		 279 aa  88.6  9e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000263643  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0984  50S ribosomal protein L2  32.73 
 
 		 280 aa  88.2  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.619761  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1480  50S ribosomal protein L2  36.26 
 
 		 281 aa  87.4  2e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000349234  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0408  50S ribosomal protein L2  32.14 
 
 		 273 aa  87.8  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00399178  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4541  50S ribosomal protein L2  32.74 
 
 		 274 aa  87.4  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000106039  hitchhiker  0.00201461 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29034  Putative mitochondrial ribosomal protein L2  36.75 
 
 		 283 aa  87.4  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0175318  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0326  50S ribosomal protein L2  32.14 
 
 		 273 aa  87.8  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000291678  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0424  50S ribosomal protein L2  34.18 
 
 		 275 aa  87.4  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0891588  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0197  50S ribosomal protein L2  35.37 
 
 		 283 aa  87.8  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00345154  normal  0.0626583 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2711  50S ribosomal protein L2  32.04 
 
 		 277 aa  87  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2396  50S ribosomal protein L2  32.04 
 
 		 277 aa  87  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.445207  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2837  50S ribosomal protein L2  35.4 
 
 		 275 aa  86.7  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000326026  normal  0.198819 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2321  50S ribosomal protein L2  31.98 
 
 		 274 aa  86.7  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000099496  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0288  50S ribosomal protein L2  31.95 
 
 		 274 aa  86.3  4e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.101113  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0289  50S ribosomal protein L2  31.55 
 
 		 275 aa  86.3  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0283371  normal  0.0481443 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1927  50S ribosomal protein L2  32.5 
 
 		 275 aa  86.3  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000132135  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3481  50S ribosomal protein L2  32.5 
 
 		 275 aa  86.3  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000122656  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0228  50S ribosomal protein L2  32.73 
 
 		 275 aa  86.3  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3801  50S ribosomal protein L2  35.4 
 
 		 275 aa  86.3  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0211596  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3743  50S ribosomal protein L2  35.4 
 
 		 275 aa  86.3  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000272978  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3641  50S ribosomal protein L2  35.4 
 
 		 275 aa  85.9  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000585895  hitchhiker  0.0000000000261127 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0330  50S ribosomal protein L2  35.4 
 
 		 275 aa  85.9  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000414315  normal  0.021485 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0279  50S ribosomal protein L2  35.4 
 
 		 275 aa  85.9  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000000000585498  normal  0.0839884 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2629  50S ribosomal protein L2  35.4 
 
 		 275 aa  86.3  5e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00000217343  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3773  50S ribosomal protein L2  35.4 
 
 		 275 aa  86.3  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000105761  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3450  50S ribosomal protein L2  35.4 
 
 		 275 aa  85.9  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000764843  decreased coverage  0.00435128 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3065  50S ribosomal protein L2  35.4 
 
 		 275 aa  85.9  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000040785  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3166  50S ribosomal protein L2  35.4 
 
 		 275 aa  86.3  5e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000940413  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0429  50S ribosomal protein L2  30.74 
 
 		 276 aa  85.9  5e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000081496  decreased coverage  0.00000678891 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0317  50S ribosomal protein L2  35.4 
 
 		 275 aa  85.9  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000380441  decreased coverage  0.00287275 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0252  50S ribosomal protein L2  35.4 
 
 		 275 aa  85.9  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000167103  normal  0.0370671 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2756  50S ribosomal protein L2  35.4 
 
 		 275 aa  85.9  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000162377  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0270  50S ribosomal protein L2  35.4 
 
 		 275 aa  85.9  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00297501  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01200  50S ribosomal protein L2  33.53 
 
 		 277 aa  85.1  8e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0770167  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0351  50S ribosomal protein L2  34.78 
 
 		 275 aa  85.1  8e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000123883  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1571  ribosomal protein L2  32.11 
 
 		 277 aa  84.7  0.000000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000641133  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>