More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_17638 on replicon NC_009366
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009366  OSTLU_17638  predicted protein  100 
 
 
254 aa  529  1e-149  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.265479  normal  0.729989 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2685  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  51.07 
 
 
346 aa  218  7.999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000061721  normal  0.591184 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2558  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  50.88 
 
 
351 aa  217  1e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  8.150479999999999e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1655  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  50.21 
 
 
351 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0167472  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4057  radical SAM domain-containing protein  44.98 
 
 
342 aa  214  8e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.291969  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1111  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  50.21 
 
 
360 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000337587  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3610  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  46.89 
 
 
351 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1640  radical SAM protein  46.28 
 
 
425 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.100638  normal  0.136917 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0427  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  50.43 
 
 
347 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.273579  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1592  radical SAM enzyme, Cfr family  45.87 
 
 
425 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.368814  normal  0.725987 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2505  radical SAM protein  47.28 
 
 
391 aa  211  5.999999999999999e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.282858  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1922  radical SAM enzyme, Cfr family  45.87 
 
 
425 aa  211  7e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0056484 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1122  radical SAM protein  46.12 
 
 
430 aa  211  9e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4488  radical SAM enzyme, Cfr family  46.12 
 
 
431 aa  209  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2022  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  46.05 
 
 
371 aa  209  3e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1581  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  48.51 
 
 
343 aa  209  3e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000011547  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1397  radical SAM protein  43.91 
 
 
370 aa  207  1e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.724249  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1336  radical SAM family enzyme  43.91 
 
 
370 aa  207  1e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4556  radical SAM protein  45.71 
 
 
431 aa  207  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.15006  decreased coverage  0.00152892 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3311  radical SAM enzyme  43.32 
 
 
406 aa  205  5e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.853243  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1479  hypothetical protein  43.83 
 
 
382 aa  204  8e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2993  radical SAM protein  45.04 
 
 
356 aa  204  8e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00523882  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0185  radical SAM protein  45.11 
 
 
404 aa  204  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.582725 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1504  hypothetical protein  41.31 
 
 
382 aa  203  2e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3393  radical SAM enzyme, Cfr family  44.58 
 
 
382 aa  203  2e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1616  hypothetical protein  42.98 
 
 
339 aa  202  6e-51  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.787812 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3329  hypothetical protein  45.76 
 
 
428 aa  201  7e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2180  radical SAM protein  43.82 
 
 
377 aa  201  7e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2700  radical SAM protein  44.73 
 
 
390 aa  201  9e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.83245  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3017  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.98 
 
 
419 aa  201  9.999999999999999e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1255  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.98 
 
 
400 aa  201  9.999999999999999e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.450874  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2051  radical SAM protein  44.31 
 
 
376 aa  201  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0429585  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01368  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.31 
 
 
372 aa  200  1.9999999999999998e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000522962  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3612  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.13 
 
 
398 aa  200  1.9999999999999998e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.172682 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0041  radical SAM protein  42.68 
 
 
392 aa  199  3e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1382  radical SAM superfamily protein  42.68 
 
 
392 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0050  radical SAM protein  42.68 
 
 
392 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.890909  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3014  hypothetical protein  43.15 
 
 
397 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.327469 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0759  radical SAM protein  43.27 
 
 
391 aa  199  5e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2740  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.13 
 
 
393 aa  199  5e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1115  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.13 
 
 
392 aa  198  6e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2677  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.55 
 
 
388 aa  198  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3011  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.13 
 
 
388 aa  198  7.999999999999999e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2783  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.55 
 
 
388 aa  197  9e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.355164  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2720  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.55 
 
 
388 aa  197  9e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.564025  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2895  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.55 
 
 
388 aa  197  9e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2764  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.55 
 
 
388 aa  197  9e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02409  predicted enzyme  42.55 
 
 
384 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1151  radical SAM enzyme, Cfr family  42.55 
 
 
384 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.390398  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2668  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.55 
 
 
384 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02371  hypothetical protein  42.55 
 
 
384 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2801  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.55 
 
 
384 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2892  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.55 
 
 
384 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0093  hypothetical protein  44.96 
 
 
399 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.82991  normal  0.435247 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1160  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.55 
 
 
384 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0206768 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0269  hypothetical protein  42.91 
 
 
410 aa  197  1.0000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.169274 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2669  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.55 
 
 
384 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.253648 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2317  radical SAM enzyme, Cfr family  46.09 
 
 
372 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.144753  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2229  radical SAM enzyme, Cfr family  46.09 
 
 
372 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1631  hypothetical protein  46.09 
 
 
372 aa  196  3e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.212269  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0401  radical SAM enzyme, Cfr family  43.7 
 
 
399 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.213699  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1056  radical SAM enzyme, Cfr family  44.17 
 
 
383 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0486076  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1148  radical SAM enzyme, Cfr family  44.17 
 
 
383 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187802  normal  0.550837 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3742  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.13 
 
 
384 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0028  radical SAM protein  44.26 
 
 
396 aa  196  4.0000000000000005e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0709  hypothetical protein  43.7 
 
 
398 aa  194  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0679  hypothetical protein  41.98 
 
 
409 aa  194  9e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2966  radical SAM enzyme, Cfr family  40.98 
 
 
399 aa  194  1e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.80573 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0241  putative pyruvate formate lyase activating enzyme 2 (yfgB)  43.7 
 
 
403 aa  194  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.283575  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2887  hypothetical protein  43.46 
 
 
366 aa  193  2e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2988  hypothetical protein  42.74 
 
 
364 aa  194  2e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.45923  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0421  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.85 
 
 
398 aa  194  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.662236  hitchhiker  0.00298691 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1905  radical SAM protein  42.37 
 
 
403 aa  193  2e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1183  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.85 
 
 
398 aa  194  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1290  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.85 
 
 
398 aa  194  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1602  radical SAM enzyme, Cfr family  44.54 
 
 
363 aa  193  2e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.113295 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1930  radical SAM enzyme, Cfr family  44.54 
 
 
362 aa  193  2e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0648  hypothetical protein  41.98 
 
 
413 aa  192  3e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2109  hypothetical protein  44.17 
 
 
384 aa  192  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.207444 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1212  hypothetical protein  44.17 
 
 
383 aa  192  4e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5856  radical SAM enzyme, Cfr family  41.88 
 
 
378 aa  192  4e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1623  hypothetical protein  42.92 
 
 
362 aa  192  5e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00271207 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0085  radical SAM enzyme, Cfr family  43.04 
 
 
404 aa  192  6e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.176991  normal  0.136088 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0732  radical SAM enzyme, Cfr family  43.8 
 
 
377 aa  192  6e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1380  radical SAM protein  43.7 
 
 
399 aa  191  1e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0398  radical SAM protein  42.04 
 
 
414 aa  191  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0578367  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0035  hypothetical protein  44.12 
 
 
399 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09940  radical SAM enzyme, Cfr family  45.3 
 
 
349 aa  191  1e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0591  hypothetical protein  42.74 
 
 
372 aa  189  2e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.196855  normal  0.247417 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2379  hypothetical protein  41.37 
 
 
365 aa  190  2e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.444977  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2962  radical SAM protein  42.19 
 
 
402 aa  190  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.161045 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1791  radical SAM protein  42.98 
 
 
359 aa  189  2.9999999999999997e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0620  hypothetical protein  40.59 
 
 
370 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.180215  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2089  hypothetical protein  42.92 
 
 
384 aa  189  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2311  radical SAM protein  44.98 
 
 
371 aa  189  4e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1287  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.49 
 
 
373 aa  188  5.999999999999999e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.900175 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1541  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.49 
 
 
373 aa  188  5.999999999999999e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.865101  normal  0.656047 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3626  hypothetical protein  42.02 
 
 
397 aa  188  7e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.674584  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3129  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.17 
 
 
380 aa  187  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0286  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.45 
 
 
373 aa  187  1e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0016411  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>