37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4788 on replicon NC_008697
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008697  Noca_4788  putative Rossmann-fold nucleotide-binding protein  100 
 
 		 94 aa  185  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.428705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2268  DNA protecting protein DprA  58.44 
 
 		 349 aa  91.3  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3246  DNA protecting protein DprA  53.06 
 
 		 378 aa  53.9  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.261915  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10090  DNA protecting protein DprA  44.59 
 
 		 428 aa  53.1  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2204  transcriptional regulator, TrmB  50.94 
 
 		 379 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.382652 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2191  DNA protecting protein DprA  51.67 
 
 		 384 aa  51.6  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0946717  normal  0.901386 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1524  DNA protecting protein DprA  56.86 
 
 		 600 aa  50.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0174562  hitchhiker  0.00583447 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4138  DNA protecting protein DprA  43.1 
 
 		 388 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.963935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2097  DNA protecting protein DprA  40.48 
 
 		 374 aa  50.4  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1480  DNA protecting protein DprA  54.17 
 
 		 402 aa  50.4  0.000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.173906  normal  0.04573 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1177  DNA protecting protein DprA  54.35 
 
 		 402 aa  49.3  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0990  DNA protecting protein DprA  49.06 
 
 		 475 aa  49.3  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.638055  normal  0.0748697 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1858  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  50.94 
 
 		 396 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306084  hitchhiker  0.00651172 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11160  DNA protecting protein DprA  47.06 
 
 		 371 aa  48.5  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0892181  normal  0.950847 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1967  DNA protecting protein DprA  57.78 
 
 		 376 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.41905 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2033  DNA protecting protein DprA  57.78 
 
 		 376 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.677839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1987  DNA processing protein DprA, putative  57.78 
 
 		 376 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23650  DNA protecting protein DprA  46.94 
 
 		 399 aa  47.8  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0566962  normal  0.0721644 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0671  SMF protein  47.06 
 
 		 394 aa  47.8  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2472  DNA protecting protein DprA  55.32 
 
 		 394 aa  47  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.156193  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2511  DNA protecting protein DprA  42.31 
 
 		 386 aa  46.6  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.488528 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1548  DNA protecting protein DprA  38.36 
 
 		 391 aa  46.6  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.20886 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1409  DNA protecting protein DprA  50.94 
 
 		 395 aa  45.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.79779  normal  0.0660954 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2211  DNA protecting protein DprA  51.06 
 
 		 402 aa  45.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000321708 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1158  DNA protecting protein DprA  45.28 
 
 		 408 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134749  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3584  DNA processing protein DprA, putative  41.54 
 
 		 446 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6741  putative DNA processing smf-family protein  55.56 
 
 		 283 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000806567  normal  0.0643644 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0233  DNA protecting protein DprA  45.83 
 
 		 400 aa  43.9  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5401  SMF family protein  50 
 
 		 310 aa  43.5  0.0009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.219936  normal  0.277255 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09260  DNA protecting protein DprA  39.19 
 
 		 424 aa  43.1  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.180441  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0180  DNA protecting protein DprA  38.57 
 
 		 382 aa  43.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1643  DNA protecting protein DprA  47.17 
 
 		 388 aa  43.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0293529  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1000  DNA protecting protein DprA  51.22 
 
 		 395 aa  42.4  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.390395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09850  DNA protecting protein DprA  40 
 
 		 383 aa  42.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3121  DNA protecting protein DprA  36.99 
 
 		 423 aa  41.2  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0011897  normal  0.148234 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1209  DNA protecting protein DprA  42.59 
 
 		 452 aa  41.2  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3415  DNA protecting protein DprA  42.62 
 
 		 387 aa  40.8  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>