More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2584 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_2584  peptidase C26  100 
 
 
237 aa  460  1e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0482191  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12875  amidotransferase  49.15 
 
 
272 aa  204  9e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.853598  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2058  peptidase C26  48.56 
 
 
251 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1757  peptidase C26  48.7 
 
 
231 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.721348  normal  0.077261 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2465  peptidase C26  45.85 
 
 
247 aa  193  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000302907  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2041  peptidase C26  48.52 
 
 
240 aa  193  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.755428  normal  0.5084 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2104  peptidase C26  48.52 
 
 
240 aa  193  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.297238  normal  0.0236912 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4064  peptidase C26  47.15 
 
 
256 aa  192  3e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.529097  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1848  peptidase C26  44.73 
 
 
251 aa  189  2e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.845506 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2279  peptidase C26  47.72 
 
 
280 aa  189  4e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.249131 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1636  peptidase C26  50.69 
 
 
252 aa  181  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.370641  normal  0.14821 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3195  peptidase C26  47.88 
 
 
241 aa  180  2e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2077  peptidase C26  50.66 
 
 
233 aa  174  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1798  peptidase C26  42.51 
 
 
247 aa  160  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.720671 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4227  peptidase C26  41.74 
 
 
260 aa  148  6e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135339  normal  0.255877 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1349  peptidase C26  39.59 
 
 
240 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000385212  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2021  peptidase C26  41.53 
 
 
250 aa  145  5e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4415  peptidase C26  42.73 
 
 
255 aa  137  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0651  glutamine amidotransferase class-I  39.17 
 
 
242 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.64648  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21880  peptidase C26  36.87 
 
 
231 aa  135  5e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2893  peptidase C26  35 
 
 
233 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.220365  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1477  peptidase C26  43.28 
 
 
237 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0361  peptidase C26  41.7 
 
 
253 aa  133  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2010  peptidase C26  41.08 
 
 
243 aa  133  3e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0361829  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2184  peptidase C26  45.54 
 
 
275 aa  133  3e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.297323  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2164  peptidase C26  42.53 
 
 
233 aa  132  3e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000115799  hitchhiker  0.0000699279 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1789  glutamine amidotransferase  37 
 
 
241 aa  130  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000030649  hitchhiker  5.3956e-25 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3991  hypothetical protein  40.69 
 
 
229 aa  127  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0400316  normal  0.343275 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1963  peptidase C26  42.79 
 
 
254 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.153313  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0075  peptidase C26  39.11 
 
 
244 aa  126  4.0000000000000003e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.70164  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0076  peptidase C26  44.77 
 
 
236 aa  125  6e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.0652283 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1964  peptidase C26  37.9 
 
 
239 aa  125  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.918763 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3742  peptidase C26  37.44 
 
 
237 aa  124  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011892  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2528  glutamine amidotransferase, class I  38.56 
 
 
250 aa  124  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2155  peptidase C26  38.56 
 
 
250 aa  124  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000159832 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0730  peptidase C26  33.33 
 
 
238 aa  122  4e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3356  peptidase C26  31.98 
 
 
238 aa  122  4e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.95955  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0444  glutamine amidotransferase class I  32.31 
 
 
241 aa  122  6e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000517  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0063  peptidase C26  35.89 
 
 
242 aa  121  8e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.542911  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0094  peptidase C26  45.79 
 
 
236 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000432288  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0076  peptidase C26  45.79 
 
 
236 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0082  peptidase C26  45.79 
 
 
236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.831872  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0438  peptidase C26  38.86 
 
 
255 aa  119  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35287  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2162  peptidase C26  34.55 
 
 
238 aa  119  4.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000124945  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4408  peptidase C26  40.71 
 
 
262 aa  118  6e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1878  hypothetical protein  37.44 
 
 
230 aa  119  6e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19230  predicted glutamine amidotransferase  34.4 
 
 
273 aa  118  7e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0453236 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0143  peptidase C26  40.09 
 
 
238 aa  118  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1031  glutamine amidotransferase  28.4 
 
 
245 aa  116  1.9999999999999998e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000341197  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1852  peptidase C26  40.09 
 
 
238 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.197074  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2718  peptidase C26  32.43 
 
 
242 aa  116  3.9999999999999997e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0577548  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0319  peptidase C26  38.22 
 
 
233 aa  116  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.783639 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4207  peptidase C26  35 
 
 
298 aa  115  5e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.914824 
 
 
-
 
NC_002950  PG1701  glutamine amidotransferase, class II/dipeptidase  33.73 
 
 
602 aa  114  1.0000000000000001e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2428  peptidase C26  38.02 
 
 
248 aa  113  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1429  glutamine amidotransferase (class I), putative  30.8 
 
 
231 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1297  peptidase C26  35.02 
 
 
259 aa  113  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.266099  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3248  peptidase C26  34.22 
 
 
251 aa  112  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12430  predicted glutamine amidotransferase  36.45 
 
 
247 aa  112  7.000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124059  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3050  peptidase C26  37.11 
 
 
250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0416  peptidase C26  37.05 
 
 
264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0393355  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0616  peptidase C26  38.33 
 
 
245 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.206585  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1643  glutamine amidotransferase, class I  31.8 
 
 
229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0420698  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0053  peptidase C26  33.18 
 
 
256 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0982  glutamine amidotransferase, class I  38.69 
 
 
278 aa  108  6e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0921  glutamine amidotransferase, class I  38.69 
 
 
278 aa  108  6e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.216457  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1378  peptidase C26  37.19 
 
 
253 aa  107  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.735257  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1141  putative transferase  36.65 
 
 
266 aa  107  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0928367 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0813  peptidase C26  34.6 
 
 
264 aa  107  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.540694  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2816  peptidase C26  37.88 
 
 
255 aa  105  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0799  peptidase C26  33.47 
 
 
235 aa  105  5e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3249  peptidase C26  40.1 
 
 
250 aa  105  6e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2523  peptidase C26  37.31 
 
 
252 aa  105  6e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2261  peptidase C26  30.3 
 
 
312 aa  105  7e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4701  peptidase C26  37.79 
 
 
272 aa  104  9e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1822  peptidase C26  37.44 
 
 
245 aa  105  9e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1392  hypothetical protein  35.78 
 
 
215 aa  104  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.115749  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04810  predicted glutamine amidotransferase  32.75 
 
 
279 aa  104  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00756632  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2532  peptidase C26  34.54 
 
 
267 aa  103  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3960  peptidase C26  38.78 
 
 
313 aa  102  4e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0591478 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0847  peptidase C26  38.58 
 
 
246 aa  102  4e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2887  peptidase C26  34.91 
 
 
268 aa  102  5e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08940  predicted glutamine amidotransferase  34.84 
 
 
244 aa  102  6e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0342497  normal  0.666279 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5760  peptidase C26  36.56 
 
 
267 aa  102  7e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2536  peptidase C26  31.39 
 
 
237 aa  101  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3963  peptidase C26  38.61 
 
 
305 aa  101  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0830128  normal  0.322468 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1017  putative glutamine amidotransferase  34.96 
 
 
238 aa  101  1e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3313  peptidase C26  38.61 
 
 
305 aa  101  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1072  peptidase C26  33.73 
 
 
259 aa  100  1e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4215  peptidase C26  36.46 
 
 
253 aa  100  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0954  peptidase C26  32.87 
 
 
264 aa  100  2e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000028221  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2987  peptidase C26  37.44 
 
 
274 aa  99.4  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2902  peptidase C26  37.95 
 
 
261 aa  99.8  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5208  peptidase C26  36.94 
 
 
295 aa  99.4  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0349  peptidase C26  35.94 
 
 
273 aa  99  6e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.232683  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5474  peptidase C26  38.69 
 
 
268 aa  98.6  8e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3040  peptidase C26  37.44 
 
 
279 aa  97.8  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2902  glutamine amidotransferase, putative  35.18 
 
 
254 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00530511  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1082  peptidase C26  35.57 
 
 
259 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.3752 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5913  peptidase C26  38.19 
 
 
279 aa  97.1  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>