276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1822 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1822  peptidase C26  100 
 
 
245 aa  494  1e-139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2523  peptidase C26  77.55 
 
 
252 aa  393  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4207  peptidase C26  56.1 
 
 
298 aa  259  3e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.914824 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0438  peptidase C26  56.1 
 
 
255 aa  256  3e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35287  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2428  peptidase C26  50.42 
 
 
248 aa  231  8.000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3248  peptidase C26  48.76 
 
 
251 aa  229  3e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3050  peptidase C26  48.96 
 
 
250 aa  227  1e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0053  peptidase C26  51.38 
 
 
256 aa  220  9.999999999999999e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4215  peptidase C26  46.81 
 
 
253 aa  211  9e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3249  peptidase C26  51.91 
 
 
250 aa  210  2e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21880  peptidase C26  41.01 
 
 
231 aa  176  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0361  peptidase C26  42.61 
 
 
253 aa  171  1e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2162  peptidase C26  38.33 
 
 
238 aa  168  9e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000124945  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3356  peptidase C26  34.75 
 
 
238 aa  164  9e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.95955  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0444  glutamine amidotransferase class I  34.71 
 
 
241 aa  156  3e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000517  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0954  peptidase C26  37.55 
 
 
264 aa  153  2e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000028221  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2164  peptidase C26  44.08 
 
 
233 aa  153  2.9999999999999998e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000115799  hitchhiker  0.0000699279 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2893  peptidase C26  35.04 
 
 
233 aa  150  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.220365  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1878  hypothetical protein  36.91 
 
 
230 aa  151  1e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0730  peptidase C26  32.05 
 
 
238 aa  151  1e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0799  peptidase C26  44.44 
 
 
235 aa  150  3e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3742  peptidase C26  36.02 
 
 
237 aa  149  4e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011892  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0319  peptidase C26  43.32 
 
 
233 aa  148  1.0000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.783639 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0075  peptidase C26  40.09 
 
 
244 aa  146  2.0000000000000003e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.70164  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2021  peptidase C26  40.82 
 
 
250 aa  145  5e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1701  glutamine amidotransferase, class II/dipeptidase  37.45 
 
 
602 aa  145  8.000000000000001e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1789  glutamine amidotransferase  37.13 
 
 
241 aa  141  9e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000030649  hitchhiker  5.3956e-25 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2718  peptidase C26  34.22 
 
 
242 aa  141  9e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0577548  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0416  peptidase C26  43.18 
 
 
264 aa  140  3e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0393355  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04810  predicted glutamine amidotransferase  37.84 
 
 
279 aa  135  4e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00756632  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1378  peptidase C26  37.9 
 
 
253 aa  135  4e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.735257  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0063  peptidase C26  38.79 
 
 
242 aa  134  9.999999999999999e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.542911  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0982  glutamine amidotransferase, class I  40 
 
 
278 aa  132  3e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2536  peptidase C26  35.02 
 
 
237 aa  133  3e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0570  peptidase C26  38.5 
 
 
240 aa  133  3e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0083889  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0921  glutamine amidotransferase, class I  40 
 
 
278 aa  132  3e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.216457  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2816  peptidase C26  39.44 
 
 
255 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1017  putative glutamine amidotransferase  38.79 
 
 
238 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0813  peptidase C26  32.77 
 
 
264 aa  129  4.0000000000000003e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.540694  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0143  peptidase C26  37.56 
 
 
238 aa  129  6e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1031  glutamine amidotransferase  35.61 
 
 
245 aa  128  7.000000000000001e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000341197  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3195  peptidase C26  37.4 
 
 
241 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1797  glutamine amidotransferase  32.75 
 
 
238 aa  125  4.0000000000000003e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.239238  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1349  peptidase C26  33.05 
 
 
240 aa  125  5e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000385212  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1072  peptidase C26  34.59 
 
 
259 aa  125  5e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2528  glutamine amidotransferase, class I  37.32 
 
 
250 aa  125  6e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2155  peptidase C26  37.32 
 
 
250 aa  125  6e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000159832 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1963  peptidase C26  38.11 
 
 
254 aa  124  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.153313  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19230  predicted glutamine amidotransferase  32.78 
 
 
273 aa  124  2e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0453236 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2465  peptidase C26  41.54 
 
 
247 aa  123  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000302907  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1141  putative transferase  39.89 
 
 
266 aa  122  4e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0928367 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1964  peptidase C26  36.55 
 
 
239 aa  122  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.918763 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3790  hypothetical protein  42.65 
 
 
254 aa  122  6e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2261  peptidase C26  34.36 
 
 
312 aa  120  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3033  peptidase C26  36.95 
 
 
254 aa  119  3e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.008786  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5047  peptidase C26  42.01 
 
 
301 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0076  peptidase C26  36.29 
 
 
236 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.0652283 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0847  peptidase C26  43.26 
 
 
246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4137  peptidase C26  40.35 
 
 
251 aa  116  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1636  peptidase C26  37.39 
 
 
252 aa  116  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.370641  normal  0.14821 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0888  peptidase C26  40.35 
 
 
427 aa  116  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1852  peptidase C26  36.73 
 
 
238 aa  116  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.197074  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2371  peptidase C26  40.35 
 
 
405 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.167921  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4415  peptidase C26  38.1 
 
 
255 aa  116  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0455  glutamine amidotransferase, class I  40.35 
 
 
356 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0900  peptidase C26  40.35 
 
 
399 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.332784  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2910  peptidase C26  40.35 
 
 
442 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.486072  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5207  peptidase C26  38.06 
 
 
255 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.381902 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0983  peptidase C26  40.35 
 
 
396 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.290196  normal  0.093467 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0175  peptidase C26  38.04 
 
 
249 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000212098 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0545  peptidase C26  40.35 
 
 
396 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.839837  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1429  glutamine amidotransferase (class I), putative  36.32 
 
 
231 aa  116  3.9999999999999997e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1024  peptidase C26  40.35 
 
 
396 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2602  peptidase C26  40.35 
 
 
444 aa  115  5e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.160668  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3017  glutamine amidotransferase, class I  40.35 
 
 
442 aa  115  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0173  peptidase C26  40.35 
 
 
444 aa  115  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2970  peptidase C26  40.35 
 
 
442 aa  115  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.397336  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0973  glutamine amidotransferase, class I  40.35 
 
 
444 aa  115  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5298  peptidase C26  38.06 
 
 
255 aa  115  6e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.880812  normal  0.49084 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0108  peptidase C26  38.46 
 
 
258 aa  115  6e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1887  peptidase C26  32.93 
 
 
281 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.192004  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1536  peptidase C26  33.61 
 
 
276 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0244  glutamine amidotransferase  32.93 
 
 
281 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.682625  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3677  Gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  39.9 
 
 
259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.272698 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1549  peptidase C26  37.82 
 
 
258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1617  glutamine amidotransferase, class I  39.77 
 
 
444 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1775  glutamine amidotransferase  36.26 
 
 
227 aa  114  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000113696 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3033  peptidase C26  40.35 
 
 
493 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.998523  decreased coverage  0.0021965 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0954  putative amidotransferase  39.77 
 
 
251 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.716357 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1229  peptidase C26  33.33 
 
 
259 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.121618 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5346  peptidase C26  38.96 
 
 
255 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.176756 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1082  peptidase C26  34.16 
 
 
259 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.3752 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4678  hypothetical protein  34.96 
 
 
255 aa  112  6e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2010  peptidase C26  36.14 
 
 
243 aa  112  6e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0361829  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0076  peptidase C26  35.98 
 
 
236 aa  112  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4921  peptidase C26  38.12 
 
 
299 aa  112  8.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12875  amidotransferase  37.89 
 
 
272 aa  111  9e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.853598  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1092  peptidase C26  33.33 
 
 
253 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.337501  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3375  peptidase C26  39.41 
 
 
259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.290232 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6978  peptidase C26  35.98 
 
 
275 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.788826  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>