247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1392 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1392  hypothetical protein  100 
 
 		 215 aa  422  1e-117  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.115749  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2465  peptidase C26  46.09 
 
 		 247 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000302907  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3991  hypothetical protein  46.72 
 
 		 229 aa  161  8.000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0400316  normal  0.343275 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1757  peptidase C26  39.47 
 
 		 231 aa  110  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.721348  normal  0.077261 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2077  peptidase C26  40.89 
 
 		 233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1636  peptidase C26  37.44 
 
 		 252 aa  105  6e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.370641  normal  0.14821 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4227  peptidase C26  35.71 
 
 		 260 aa  104  8e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135339  normal  0.255877 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12875  amidotransferase  34.76 
 
 		 272 aa  102  3e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.853598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2164  peptidase C26  31.8 
 
 		 233 aa  99.4  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000115799  hitchhiker  0.0000699279 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2584  peptidase C26  35.78 
 
 		 237 aa  99.4  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0482191  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3195  peptidase C26  35.06 
 
 		 241 aa  99  5e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0509  peptidase C26  36.36 
 
 		 225 aa  98.6  7e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0498  peptidase C26  36.36 
 
 		 225 aa  98.6  7e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0520  peptidase C26  36.36 
 
 		 225 aa  98.6  7e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0063  peptidase C26  31.63 
 
 		 242 aa  97.4  1e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.542911  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2184  peptidase C26  33.33 
 
 		 275 aa  95.5  5e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.297323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4064  peptidase C26  33.62 
 
 		 256 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.529097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1848  peptidase C26  36.4 
 
 		 251 aa  94.4  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.845506 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1798  peptidase C26  30.71 
 
 		 247 aa  91.7  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.720671 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4415  peptidase C26  35.16 
 
 		 255 aa  89.4  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2279  peptidase C26  32.64 
 
 		 280 aa  87  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249131 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2941  glutamine amidotransferase related enzyme  31.88 
 
 		 237 aa  86.7  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2058  peptidase C26  32.03 
 
 		 251 aa  85.5  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2893  peptidase C26  29.77 
 
 		 233 aa  85.1  7e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.220365  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2021  peptidase C26  32.21 
 
 		 250 aa  85.1  8e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0361  peptidase C26  31.58 
 
 		 253 aa  84.7  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1878  hypothetical protein  29.69 
 
 		 230 aa  83.6  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3742  peptidase C26  30.97 
 
 		 237 aa  82.4  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0954  peptidase C26  31.7 
 
 		 264 aa  82.8  0.000000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000028221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12430  predicted glutamine amidotransferase  35.38 
 
 		 247 aa  82  0.000000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124059  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0319  peptidase C26  32.98 
 
 		 233 aa  81.6  0.000000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.783639 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2104  peptidase C26  31.72 
 
 		 240 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.297238  normal  0.0236912 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2041  peptidase C26  31.72 
 
 		 240 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.755428  normal  0.5084 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1775  glutamine amidotransferase  28.57 
 
 		 227 aa  79.7  0.00000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000113696 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1160  peptidase C26  33.91 
 
 		 222 aa  78.6  0.00000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4207  peptidase C26  31.3 
 
 		 298 aa  77.8  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.914824 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2987  peptidase C26  34.06 
 
 		 274 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0416  peptidase C26  30.67 
 
 		 264 aa  76.3  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0393355  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3033  peptidase C26  31.58 
 
 		 254 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.008786  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2902  peptidase C26  33.19 
 
 		 261 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0799  peptidase C26  30.32 
 
 		 235 aa  73.9  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2816  peptidase C26  34.15 
 
 		 255 aa  73.6  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1129  peptidase C26  30.24 
 
 		 253 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3159  peptidase C26  31.7 
 
 		 261 aa  73.9  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0053  peptidase C26  27.83 
 
 		 256 aa  73.2  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2379  peptidase C26  33.62 
 
 		 261 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.732768  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3012  peptidase C26  30 
 
 		 254 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2993  peptidase C26  33.62 
 
 		 261 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3012  peptidase C26  33.62 
 
 		 261 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1429  glutamine amidotransferase (class I), putative  26.96 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6342  peptidase C26  33.04 
 
 		 262 aa  72  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3040  peptidase C26  33.48 
 
 		 279 aa  72  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2718  peptidase C26  25.11 
 
 		 242 aa  71.6  0.000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0577548  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1940  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  28.89 
 
 		 250 aa  71.6  0.000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.343934 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2010  peptidase C26  32.63 
 
 		 243 aa  71.6  0.000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0361829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0944  peptidase C26  30.43 
 
 		 253 aa  71.6  0.000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2080  peptidase C26  32.02 
 
 		 268 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.285654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2327  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  28.89 
 
 		 254 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1508  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  28.89 
 
 		 254 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21880  peptidase C26  27.16 
 
 		 231 aa  70.5  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1852  peptidase C26  33.97 
 
 		 238 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.197074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1824  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  28.89 
 
 		 250 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0824878 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4215  peptidase C26  29.91 
 
 		 253 aa  70.1  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1092  peptidase C26  29.69 
 
 		 253 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.337501  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2202  peptidase C26  32.02 
 
 		 268 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2348  peptidase C26  28.44 
 
 		 254 aa  69.3  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.388942  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1413  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  28.44 
 
 		 254 aa  69.3  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2155  peptidase C26  31.22 
 
 		 250 aa  68.6  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159832 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3356  peptidase C26  25.23 
 
 		 238 aa  68.6  0.00000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.95955  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1945  glutamine amidotransferase, class I  30.84 
 
 		 313 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0746135  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0608  peptidase C26  31.36 
 
 		 237 aa  68.9  0.00000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.982002  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2528  glutamine amidotransferase, class I  31.22 
 
 		 250 aa  68.6  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0847  peptidase C26  32.75 
 
 		 246 aa  68.9  0.00000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01275  gamma-Glu-GABA hydrolase  28.44 
 
 		 254 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0444  glutamine amidotransferase class I  26.24 
 
 		 241 aa  67.8  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000517  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2887  peptidase C26  31.19 
 
 		 221 aa  67.8  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.550139  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3375  peptidase C26  29.37 
 
 		 259 aa  67.8  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.290232 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1059  peptidase C26  30.2 
 
 		 253 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.22875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0143  peptidase C26  31.58 
 
 		 238 aa  68.2  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2536  peptidase C26  27.84 
 
 		 237 aa  67.4  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0954  putative amidotransferase  32.18 
 
 		 251 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.716357 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01286  hypothetical protein  28.44 
 
 		 254 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3194  peptidase C26  29.48 
 
 		 253 aa  67  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0388042 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1164  peptidase C26  29.48 
 
 		 253 aa  67  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.399023  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1197  peptidase C26  29.48 
 
 		 253 aa  67  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0734619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1740  peptidase C26  31.37 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000655544 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3571  peptidase C26  32.12 
 
 		 247 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2182  peptidase C26  32.75 
 
 		 279 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.418745  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3677  Gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  27.87 
 
 		 259 aa  67  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.272698 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1141  putative transferase  30.23 
 
 		 266 aa  67  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0928367 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2532  peptidase C26  28.27 
 
 		 267 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1106  peptidase C26  34.36 
 
 		 268 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.442866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0438  peptidase C26  29.39 
 
 		 255 aa  66.2  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2920  peptidase C26  28.71 
 
 		 253 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.129807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0717  peptidase C26  30.68 
 
 		 479 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.777258  normal  0.355316 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1106  peptidase C26  29.17 
 
 		 253 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00657887  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2762  peptidase C26  30.84 
 
 		 251 aa  66.2  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.126803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1339  peptidase C26  34.07 
 
 		 253 aa  66.6  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4667  peptidase C26  28.95 
 
 		 264 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5913  peptidase C26  32.75 
 
 		 279 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>