More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_2348 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01275  gamma-Glu-GABA hydrolase  99.61 
 
 
254 aa  514  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2348  peptidase C26  100 
 
 
254 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.388942  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1508  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  99.61 
 
 
254 aa  515  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2327  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  99.61 
 
 
254 aa  515  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1413  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  100 
 
 
254 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01286  hypothetical protein  99.61 
 
 
254 aa  514  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1824  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  99.6 
 
 
250 aa  507  1e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0824878 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1940  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  99.2 
 
 
250 aa  503  9.999999999999999e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.343934 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2067  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  74.21 
 
 
253 aa  374  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0175  peptidase C26  47.39 
 
 
249 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000212098 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0388  putative glutamine amidotransferase  45.42 
 
 
250 aa  199  5e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.55028  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5207  peptidase C26  46.59 
 
 
255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.381902 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5474  peptidase C26  44.18 
 
 
268 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5298  peptidase C26  46.59 
 
 
255 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.880812  normal  0.49084 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2202  peptidase C26  43.43 
 
 
268 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3558  peptidase C26  44.88 
 
 
257 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1267  glutamine amidotransferase  44.4 
 
 
253 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5913  peptidase C26  44.18 
 
 
279 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3012  peptidase C26  44.4 
 
 
254 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2164  peptidase C26  44.18 
 
 
279 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5346  peptidase C26  46.59 
 
 
255 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.176756 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2080  peptidase C26  43.03 
 
 
268 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.285654  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2920  peptidase C26  44.8 
 
 
253 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.129807  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3099  peptidase C26  44.8 
 
 
253 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.015015  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2182  peptidase C26  44.18 
 
 
279 aa  195  6e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.418745  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03870  putative glutamine amidotransferase  44.18 
 
 
250 aa  195  6e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6342  peptidase C26  41.98 
 
 
262 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3033  peptidase C26  42 
 
 
254 aa  192  3e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.008786  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1106  peptidase C26  44.18 
 
 
268 aa  192  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.442866  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3002  peptidase C26  44.4 
 
 
253 aa  192  4e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00604755  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2987  peptidase C26  40.16 
 
 
274 aa  191  7e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2179  peptidase C26  44.09 
 
 
257 aa  191  9e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1059  peptidase C26  45.78 
 
 
253 aa  191  1e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.22875  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3194  peptidase C26  43.6 
 
 
253 aa  190  2e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0388042 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1740  peptidase C26  44.49 
 
 
256 aa  190  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000655544 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1197  peptidase C26  43.6 
 
 
253 aa  190  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0734619  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1106  peptidase C26  43.6 
 
 
253 aa  190  2e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00657887  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1164  peptidase C26  43.6 
 
 
253 aa  190  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.399023  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2902  peptidase C26  41.22 
 
 
261 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3012  peptidase C26  42.26 
 
 
261 aa  188  7e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90022  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1129  peptidase C26  44.58 
 
 
253 aa  188  8e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0943  putative glutamine amidotransferase  40.48 
 
 
264 aa  188  8e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.889039 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1092  peptidase C26  44.21 
 
 
253 aa  188  9e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.337501  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4678  hypothetical protein  39.34 
 
 
255 aa  187  1e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4667  peptidase C26  40.48 
 
 
264 aa  187  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1945  glutamine amidotransferase, class I  38.78 
 
 
313 aa  186  4e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0746135  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0971  peptidase C26  43.37 
 
 
253 aa  185  6e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.174488  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3571  peptidase C26  43.86 
 
 
247 aa  185  7e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2379  peptidase C26  41.84 
 
 
261 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.732768  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2993  peptidase C26  41.84 
 
 
261 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2645  glutamine amidotransferase  42.8 
 
 
254 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3040  peptidase C26  40.16 
 
 
279 aa  182  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0944  peptidase C26  44.58 
 
 
253 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1786  peptidase C26  43.7 
 
 
257 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2706  glutamine amidotransferase  45.56 
 
 
249 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.078896  normal  0.0560665 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1900  glutamine amidotransferase-like protein  46.06 
 
 
267 aa  178  8e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.720243  normal  0.134841 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2902  glutamine amidotransferase, putative  45.34 
 
 
254 aa  178  9e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00530511  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2023  glutamine amidotransferase, class I  39.53 
 
 
266 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0637  glutamine amidotransferase  39.53 
 
 
266 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1082  peptidase C26  38.98 
 
 
259 aa  176  3e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.3752 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0729  glutamine amidotransferase  39.53 
 
 
266 aa  176  4e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.30779  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2121  peptidase C26  45.68 
 
 
253 aa  175  6e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0384981  normal  0.197243 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2532  peptidase C26  37.5 
 
 
267 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48870  glutamine amidotransferase  45.04 
 
 
250 aa  174  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0794  hypothetical protein  39.92 
 
 
267 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3790  hypothetical protein  37.8 
 
 
254 aa  174  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3598  peptidase C26  37.7 
 
 
269 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.420407  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3097  peptidase C26  37.3 
 
 
269 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.925767  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2813  peptidase C26  37.7 
 
 
269 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2318  peptidase C26  37.3 
 
 
269 aa  171  9e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167061  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0349  peptidase C26  38.31 
 
 
273 aa  171  1e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.232683  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3677  Gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  39.04 
 
 
259 aa  167  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.272698 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3375  peptidase C26  39.2 
 
 
259 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.290232 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2762  peptidase C26  39.13 
 
 
251 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.126803  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6978  peptidase C26  37.15 
 
 
275 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.788826  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1339  peptidase C26  39.92 
 
 
253 aa  159  3e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1827  glutamine amidotransferase, class I  44.02 
 
 
263 aa  157  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.259893  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0655  glutamine amidotransferase, class I  44.02 
 
 
263 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2356  glutamine amidotransferase, class I  44.02 
 
 
264 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2929  glutamine amidotransferase, class I  44.02 
 
 
264 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1670  glutamine amidotransferase, class I  44.02 
 
 
264 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.661584  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2712  glutamine amidotransferase, class I  43.59 
 
 
264 aa  156  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.840188  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2789  glutamine amidotransferase, class I  43.4 
 
 
349 aa  155  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2655  glutamine amidotransferase, class I  43.59 
 
 
263 aa  155  4e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2381  Gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  38.25 
 
 
255 aa  153  2e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00995781  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1298  peptidase C26  39.38 
 
 
297 aa  153  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.561811 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5047  peptidase C26  38.4 
 
 
301 aa  152  4e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0416  peptidase C26  37.85 
 
 
264 aa  152  5e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0393355  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5760  peptidase C26  38.84 
 
 
267 aa  150  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7781  peptidase C26  34.46 
 
 
274 aa  149  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0847  peptidase C26  41.98 
 
 
246 aa  150  3e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2865  peptidase C26  38.79 
 
 
256 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.136742  normal  0.196965 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2816  peptidase C26  37.4 
 
 
255 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0710  peptidase C26  35.29 
 
 
263 aa  144  1e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.391948  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1111  peptidase C26  36.32 
 
 
246 aa  143  3e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.517876 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1378  peptidase C26  35.83 
 
 
253 aa  142  4e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.735257  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0982  glutamine amidotransferase, class I  36.65 
 
 
278 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0921  glutamine amidotransferase, class I  36.65 
 
 
278 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.216457  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3947  peptidase C26  34.87 
 
 
261 aa  139  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0505393  normal  0.911745 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4584  putative gamma-glutamyl hydrolase family protein  36.43 
 
 
256 aa  138  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>