285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0717 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_0717  peptidase C26  100 
 
 
479 aa  968    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.777258  normal  0.355316 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3033  peptidase C26  69.92 
 
 
493 aa  622  1e-177  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.998523  decreased coverage  0.0021965 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2371  peptidase C26  85.94 
 
 
405 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.167921  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0900  peptidase C26  85.94 
 
 
399 aa  578  1e-164  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.332784  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1617  glutamine amidotransferase, class I  88.68 
 
 
444 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0173  peptidase C26  87.11 
 
 
444 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3017  glutamine amidotransferase, class I  87.11 
 
 
442 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0973  glutamine amidotransferase, class I  87.11 
 
 
444 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0888  peptidase C26  85.99 
 
 
427 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2602  peptidase C26  87.11 
 
 
444 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.160668  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2970  peptidase C26  87.11 
 
 
442 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.397336  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2910  peptidase C26  87.11 
 
 
442 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.486072  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0455  glutamine amidotransferase, class I  87.11 
 
 
356 aa  569  1e-161  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0545  peptidase C26  85.44 
 
 
396 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.839837  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0983  peptidase C26  85.44 
 
 
396 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.290196  normal  0.093467 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1024  peptidase C26  85.44 
 
 
396 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0954  putative amidotransferase  93.63 
 
 
251 aa  501  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.716357 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4137  peptidase C26  86.85 
 
 
251 aa  473  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2112  glutamine amidotransferase class-I:peptidase C26  60 
 
 
260 aa  340  2.9999999999999998e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0486861  normal  0.283308 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1549  peptidase C26  56.76 
 
 
258 aa  296  6e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1141  putative transferase  57.31 
 
 
266 aa  294  2e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0928367 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3226  peptidase C26  51.15 
 
 
285 aa  264  2e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3960  peptidase C26  48.05 
 
 
313 aa  231  3e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0591478 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4701  peptidase C26  47.41 
 
 
272 aa  228  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3313  peptidase C26  46.59 
 
 
305 aa  224  3e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3963  peptidase C26  46.59 
 
 
305 aa  224  3e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0830128  normal  0.322468 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0917  peptidase C26  45.66 
 
 
293 aa  222  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.119037  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4597  peptidase C26  45.63 
 
 
307 aa  222  9.999999999999999e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5208  peptidase C26  47.24 
 
 
295 aa  221  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0108  peptidase C26  45.56 
 
 
258 aa  220  5e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0730  peptidase C26  35.71 
 
 
238 aa  131  2.0000000000000002e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2164  peptidase C26  43.86 
 
 
233 aa  125  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000115799  hitchhiker  0.0000699279 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5474  peptidase C26  36.36 
 
 
268 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2671  peptidase C26  38.92 
 
 
229 aa  119  9.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0625878 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2261  peptidase C26  38.05 
 
 
312 aa  118  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3571  peptidase C26  36.65 
 
 
247 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0053  peptidase C26  39.29 
 
 
256 aa  117  6e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0444  glutamine amidotransferase class I  40.57 
 
 
241 aa  116  1.0000000000000001e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000517  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3947  peptidase C26  38.62 
 
 
261 aa  115  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0505393  normal  0.911745 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4207  peptidase C26  39.78 
 
 
298 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.914824 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1945  glutamine amidotransferase, class I  35.54 
 
 
313 aa  114  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0746135  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2182  peptidase C26  35.43 
 
 
279 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.418745  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2528  glutamine amidotransferase, class I  41.92 
 
 
250 aa  114  4.0000000000000004e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5913  peptidase C26  35.43 
 
 
279 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2155  peptidase C26  41.92 
 
 
250 aa  114  4.0000000000000004e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000159832 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2164  peptidase C26  35.43 
 
 
279 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1797  glutamine amidotransferase  37.57 
 
 
238 aa  113  8.000000000000001e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.239238  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2428  peptidase C26  35.98 
 
 
248 aa  111  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1031  glutamine amidotransferase  37.06 
 
 
245 aa  111  3e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000341197  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3050  peptidase C26  35.05 
 
 
250 aa  111  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2718  peptidase C26  36.27 
 
 
242 aa  110  5e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0577548  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2184  peptidase C26  34.27 
 
 
275 aa  109  8.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.297323  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0075  peptidase C26  40.96 
 
 
244 aa  110  8.000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.70164  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3356  peptidase C26  36.47 
 
 
238 aa  109  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.95955  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0319  peptidase C26  40.11 
 
 
233 aa  109  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.783639 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2202  peptidase C26  34.98 
 
 
268 aa  109  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1017  putative glutamine amidotransferase  40 
 
 
238 aa  108  2e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0943  putative glutamine amidotransferase  36.87 
 
 
264 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.889039 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0438  peptidase C26  41.67 
 
 
255 aa  108  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35287  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21880  peptidase C26  37.5 
 
 
231 aa  108  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2080  peptidase C26  34.98 
 
 
268 aa  108  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.285654  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1822  peptidase C26  38.6 
 
 
245 aa  107  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2887  peptidase C26  34.08 
 
 
268 aa  107  5e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4215  peptidase C26  34.72 
 
 
253 aa  106  9e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2021  peptidase C26  38.82 
 
 
250 aa  106  9e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2536  peptidase C26  37.43 
 
 
237 aa  105  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19230  predicted glutamine amidotransferase  36.6 
 
 
273 aa  105  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0453236 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2941  glutamine amidotransferase related enzyme  35.54 
 
 
237 aa  106  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2523  peptidase C26  38.69 
 
 
252 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0799  peptidase C26  39.08 
 
 
235 aa  105  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0570  peptidase C26  38.37 
 
 
240 aa  105  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0083889  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2381  Gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  37.62 
 
 
255 aa  105  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00995781  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2902  peptidase C26  39.89 
 
 
261 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0954  peptidase C26  35.06 
 
 
264 aa  104  3e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000028221  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1082  peptidase C26  36.61 
 
 
259 aa  105  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.3752 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0794  hypothetical protein  33.17 
 
 
267 aa  104  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1643  glutamine amidotransferase, class I  34.73 
 
 
229 aa  104  4e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0420698  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3040  peptidase C26  39.89 
 
 
279 aa  104  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2987  peptidase C26  35.68 
 
 
274 aa  103  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1349  peptidase C26  39.26 
 
 
240 aa  103  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000385212  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4408  peptidase C26  39.77 
 
 
262 aa  103  6e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1160  peptidase C26  41.07 
 
 
222 aa  103  7e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2023  glutamine amidotransferase, class I  36.65 
 
 
266 aa  103  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0637  glutamine amidotransferase  36.65 
 
 
266 aa  103  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4667  peptidase C26  35.94 
 
 
264 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1106  peptidase C26  36.07 
 
 
268 aa  102  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.442866  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0349  peptidase C26  33.82 
 
 
273 aa  102  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.232683  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2058  peptidase C26  39.18 
 
 
251 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0063  peptidase C26  35.15 
 
 
242 aa  102  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.542911  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2104  peptidase C26  39.18 
 
 
240 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.297238  normal  0.0236912 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1852  peptidase C26  42.59 
 
 
238 aa  102  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.197074  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2041  peptidase C26  39.18 
 
 
240 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.755428  normal  0.5084 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3012  peptidase C26  39.78 
 
 
261 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90022  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6342  peptidase C26  39.34 
 
 
262 aa  101  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2379  peptidase C26  39.78 
 
 
261 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.732768  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2993  peptidase C26  39.78 
 
 
261 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4415  peptidase C26  37.22 
 
 
255 aa  100  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1878  hypothetical protein  36.42 
 
 
230 aa  100  4e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0729  glutamine amidotransferase  36.2 
 
 
266 aa  100  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.30779  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2532  peptidase C26  31.88 
 
 
267 aa  100  7e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>