More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_2970 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008785  BMASAVP1_A2602  peptidase C26  97.07 
 
 
444 aa  754    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.160668  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2970  peptidase C26  100 
 
 
442 aa  882    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.397336  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3017  glutamine amidotransferase, class I  99.77 
 
 
442 aa  879    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1617  glutamine amidotransferase, class I  88.29 
 
 
444 aa  668    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0973  glutamine amidotransferase, class I  97.07 
 
 
444 aa  754    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0173  peptidase C26  97.07 
 
 
444 aa  754    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2910  peptidase C26  99.77 
 
 
442 aa  880    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.486072  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0455  glutamine amidotransferase, class I  100 
 
 
356 aa  629  1e-179  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2371  peptidase C26  92.26 
 
 
405 aa  619  1e-176  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.167921  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0900  peptidase C26  91.61 
 
 
399 aa  609  1e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.332784  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0717  peptidase C26  83.19 
 
 
479 aa  598  1e-170  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.777258  normal  0.355316 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0888  peptidase C26  74.05 
 
 
427 aa  595  1e-169  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0545  peptidase C26  74.21 
 
 
396 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.839837  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0983  peptidase C26  74.21 
 
 
396 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.290196  normal  0.093467 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1024  peptidase C26  74.21 
 
 
396 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3033  peptidase C26  85.67 
 
 
493 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.998523  decreased coverage  0.0021965 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4137  peptidase C26  93.63 
 
 
251 aa  494  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0954  putative amidotransferase  88.05 
 
 
251 aa  475  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.716357 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2112  glutamine amidotransferase class-I:peptidase C26  59.07 
 
 
260 aa  329  6e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0486861  normal  0.283308 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1141  putative transferase  55.29 
 
 
266 aa  290  4e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0928367 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1549  peptidase C26  55.6 
 
 
258 aa  285  9e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3226  peptidase C26  50.77 
 
 
285 aa  259  9e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3313  peptidase C26  45.28 
 
 
305 aa  219  7e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3963  peptidase C26  45.28 
 
 
305 aa  219  7e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0830128  normal  0.322468 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0917  peptidase C26  44.74 
 
 
293 aa  219  8.999999999999998e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.119037  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4701  peptidase C26  45.28 
 
 
272 aa  218  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3960  peptidase C26  46 
 
 
313 aa  218  2e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0591478 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5208  peptidase C26  45.14 
 
 
295 aa  214  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0108  peptidase C26  46.33 
 
 
258 aa  214  2.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4597  peptidase C26  43.14 
 
 
307 aa  212  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0730  peptidase C26  34.16 
 
 
238 aa  123  5e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2164  peptidase C26  43.86 
 
 
233 aa  122  9e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000115799  hitchhiker  0.0000699279 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4207  peptidase C26  40.88 
 
 
298 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.914824 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2671  peptidase C26  38.32 
 
 
229 aa  121  3e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0625878 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0053  peptidase C26  38.78 
 
 
256 aa  119  9e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0444  glutamine amidotransferase class I  40.22 
 
 
241 aa  117  3.9999999999999997e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000517  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0438  peptidase C26  42.86 
 
 
255 aa  117  5e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35287  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0075  peptidase C26  42.77 
 
 
244 aa  116  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.70164  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2428  peptidase C26  38.1 
 
 
248 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1822  peptidase C26  40.35 
 
 
245 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1031  glutamine amidotransferase  39.77 
 
 
245 aa  115  2.0000000000000002e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000341197  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2528  glutamine amidotransferase, class I  41.92 
 
 
250 aa  114  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2155  peptidase C26  41.92 
 
 
250 aa  114  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000159832 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4215  peptidase C26  34.72 
 
 
253 aa  114  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3050  peptidase C26  37.11 
 
 
250 aa  114  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2261  peptidase C26  38.83 
 
 
312 aa  113  6e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1017  putative glutamine amidotransferase  37.19 
 
 
238 aa  113  6e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1082  peptidase C26  37.19 
 
 
259 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.3752 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1945  glutamine amidotransferase, class I  34.71 
 
 
313 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0746135  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2718  peptidase C26  38.1 
 
 
242 aa  111  3e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0577548  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2523  peptidase C26  39.29 
 
 
252 aa  111  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3947  peptidase C26  35.29 
 
 
261 aa  110  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0505393  normal  0.911745 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5474  peptidase C26  33.64 
 
 
268 aa  110  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0349  peptidase C26  35.75 
 
 
273 aa  110  6e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.232683  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0319  peptidase C26  38.8 
 
 
233 aa  109  8.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.783639 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2887  peptidase C26  35.29 
 
 
268 aa  108  1e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21880  peptidase C26  39.05 
 
 
231 aa  109  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3356  peptidase C26  35.29 
 
 
238 aa  108  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.95955  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2182  peptidase C26  32.38 
 
 
279 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.418745  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5913  peptidase C26  32.38 
 
 
279 aa  108  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0799  peptidase C26  39.08 
 
 
235 aa  108  3e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2164  peptidase C26  32.38 
 
 
279 aa  108  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0794  hypothetical protein  33.49 
 
 
267 aa  107  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3571  peptidase C26  34.23 
 
 
247 aa  107  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0570  peptidase C26  38.73 
 
 
240 aa  107  5e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0083889  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2536  peptidase C26  37.95 
 
 
237 aa  107  5e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1797  glutamine amidotransferase  35.23 
 
 
238 aa  105  2e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.239238  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4408  peptidase C26  38.46 
 
 
262 aa  104  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1789  glutamine amidotransferase  36.31 
 
 
241 aa  104  3e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000030649  hitchhiker  5.3956e-25 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2184  peptidase C26  33.33 
 
 
275 aa  103  4e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.297323  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2202  peptidase C26  35.29 
 
 
268 aa  104  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0954  peptidase C26  33.66 
 
 
264 aa  103  4e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000028221  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1349  peptidase C26  39.88 
 
 
240 aa  103  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000385212  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0943  putative glutamine amidotransferase  33.64 
 
 
264 aa  103  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.889039 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2532  peptidase C26  32.46 
 
 
267 aa  103  7e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1429  glutamine amidotransferase (class I), putative  35.09 
 
 
231 aa  103  7e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19230  predicted glutamine amidotransferase  34.54 
 
 
273 aa  103  8e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0453236 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2080  peptidase C26  35.29 
 
 
268 aa  103  9e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.285654  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2162  peptidase C26  37.79 
 
 
238 aa  102  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000124945  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2381  Gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  38.42 
 
 
255 aa  102  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00995781  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2318  peptidase C26  34.33 
 
 
269 aa  101  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167061  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2021  peptidase C26  35.8 
 
 
250 aa  101  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3598  peptidase C26  34.33 
 
 
269 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.420407  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2813  peptidase C26  34.33 
 
 
269 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3097  peptidase C26  34.33 
 
 
269 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.925767  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1378  peptidase C26  37.87 
 
 
253 aa  100  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.735257  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0710  peptidase C26  33.79 
 
 
263 aa  100  5e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.391948  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0982  glutamine amidotransferase, class I  37.87 
 
 
278 aa  100  6e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0921  glutamine amidotransferase, class I  37.87 
 
 
278 aa  100  6e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.216457  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6342  peptidase C26  37.91 
 
 
262 aa  100  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3012  peptidase C26  38.33 
 
 
261 aa  100  8e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90022  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1072  peptidase C26  36.25 
 
 
259 aa  99.8  8e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2379  peptidase C26  38.33 
 
 
261 aa  99.8  8e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.732768  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1106  peptidase C26  35.52 
 
 
268 aa  99.8  8e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.442866  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2993  peptidase C26  38.33 
 
 
261 aa  99.8  8e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2669  peptidase C26  34.95 
 
 
288 aa  99.8  9e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0275908  normal  0.209518 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0637  glutamine amidotransferase  33.88 
 
 
266 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1643  glutamine amidotransferase, class I  32.12 
 
 
229 aa  99.8  1e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0420698  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2023  glutamine amidotransferase, class I  33.88 
 
 
266 aa  99.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1536  peptidase C26  33.64 
 
 
276 aa  99  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>