More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_2528 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_2528  glutamine amidotransferase, class I  100 
 
 
250 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2155  peptidase C26  100 
 
 
250 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000159832 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2164  peptidase C26  45.71 
 
 
233 aa  168  1e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000115799  hitchhiker  0.0000699279 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1964  peptidase C26  41.59 
 
 
239 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.918763 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2465  peptidase C26  40.82 
 
 
247 aa  148  8e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000302907  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3050  peptidase C26  42.47 
 
 
250 aa  148  8e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2021  peptidase C26  42.01 
 
 
250 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2536  peptidase C26  36.52 
 
 
237 aa  146  3e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0076  peptidase C26  40.35 
 
 
236 aa  145  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.0652283 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3248  peptidase C26  38.64 
 
 
251 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3356  peptidase C26  33.05 
 
 
238 aa  144  1e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.95955  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1082  peptidase C26  38.31 
 
 
259 aa  144  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.3752 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0361  peptidase C26  38.6 
 
 
253 aa  144  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1477  peptidase C26  38.72 
 
 
237 aa  142  7e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2428  peptidase C26  41.71 
 
 
248 aa  140  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1963  peptidase C26  42.72 
 
 
254 aa  141  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.153313  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1031  glutamine amidotransferase  36.36 
 
 
245 aa  141  9.999999999999999e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000341197  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1757  peptidase C26  41.31 
 
 
231 aa  139  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.721348  normal  0.077261 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1349  peptidase C26  37 
 
 
240 aa  137  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000385212  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1852  peptidase C26  42.59 
 
 
238 aa  137  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.197074  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0349  peptidase C26  38.31 
 
 
273 aa  137  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.232683  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2010  peptidase C26  38.91 
 
 
243 aa  135  5e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0361829  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1878  hypothetical protein  34.51 
 
 
230 aa  135  5e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1797  glutamine amidotransferase  36.62 
 
 
238 aa  135  5e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.239238  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0076  peptidase C26  39.46 
 
 
236 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2523  peptidase C26  36.29 
 
 
252 aa  134  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1072  peptidase C26  33.7 
 
 
259 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4064  peptidase C26  40.97 
 
 
256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.529097  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0651  glutamine amidotransferase class-I  37.96 
 
 
242 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.64648  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0730  peptidase C26  31.38 
 
 
238 aa  133  3e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1017  putative glutamine amidotransferase  37.89 
 
 
238 aa  133  3e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3249  peptidase C26  44.08 
 
 
250 aa  133  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2162  peptidase C26  30.57 
 
 
238 aa  132  6e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000124945  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0094  peptidase C26  39.01 
 
 
236 aa  132  6e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000432288  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0082  peptidase C26  39.01 
 
 
236 aa  132  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.831872  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3195  peptidase C26  43.16 
 
 
241 aa  132  7.999999999999999e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3742  peptidase C26  34.56 
 
 
237 aa  131  9e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011892  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1701  glutamine amidotransferase, class II/dipeptidase  36.51 
 
 
602 aa  130  1.0000000000000001e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21880  peptidase C26  34.38 
 
 
231 aa  130  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12875  amidotransferase  39.34 
 
 
272 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.853598  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0075  peptidase C26  36.45 
 
 
244 aa  131  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.70164  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0319  peptidase C26  36.52 
 
 
233 aa  130  3e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.783639 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0847  peptidase C26  39.66 
 
 
246 aa  130  3e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2058  peptidase C26  42.27 
 
 
251 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0608  peptidase C26  41.8 
 
 
237 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.982002  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2318  peptidase C26  34.78 
 
 
269 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167061  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1636  peptidase C26  41.1 
 
 
252 aa  129  6e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.370641  normal  0.14821 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0799  peptidase C26  36.67 
 
 
235 aa  128  7.000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2041  peptidase C26  45.6 
 
 
240 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.755428  normal  0.5084 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2104  peptidase C26  45.6 
 
 
240 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.297238  normal  0.0236912 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3598  peptidase C26  34.35 
 
 
269 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.420407  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3097  peptidase C26  34.35 
 
 
269 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.925767  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2813  peptidase C26  35.65 
 
 
269 aa  125  6e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1822  peptidase C26  37.32 
 
 
245 aa  125  6e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1789  glutamine amidotransferase  34.43 
 
 
241 aa  125  7e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000030649  hitchhiker  5.3956e-25 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2893  peptidase C26  32.62 
 
 
233 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.220365  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1141  putative transferase  41.26 
 
 
266 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0928367 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2279  peptidase C26  39.56 
 
 
280 aa  125  9e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.249131 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0063  peptidase C26  35.71 
 
 
242 aa  124  2e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.542911  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0438  peptidase C26  35.78 
 
 
255 aa  122  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35287  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1429  glutamine amidotransferase (class I), putative  34.6 
 
 
231 aa  122  7e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1848  peptidase C26  35.62 
 
 
251 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.845506 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1378  peptidase C26  36.45 
 
 
253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.735257  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1740  peptidase C26  38.79 
 
 
241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.227165  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0053  peptidase C26  32.74 
 
 
256 aa  119  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03870  putative glutamine amidotransferase  34.02 
 
 
250 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1099  peptidase C26  36.32 
 
 
243 aa  120  3e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0143  peptidase C26  38.96 
 
 
238 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4207  peptidase C26  37.56 
 
 
298 aa  119  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.914824 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2584  peptidase C26  38.56 
 
 
237 aa  119  6e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0482191  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0921  glutamine amidotransferase, class I  35.07 
 
 
278 aa  118  7.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.216457  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0982  glutamine amidotransferase, class I  35.07 
 
 
278 aa  118  7.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2816  peptidase C26  35.37 
 
 
255 aa  118  9e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4408  peptidase C26  35.47 
 
 
262 aa  117  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4227  peptidase C26  35.37 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135339  normal  0.255877 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2718  peptidase C26  31.17 
 
 
242 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0577548  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3033  peptidase C26  42.26 
 
 
493 aa  116  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.998523  decreased coverage  0.0021965 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2112  glutamine amidotransferase class-I:peptidase C26  43.12 
 
 
260 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0486861  normal  0.283308 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1617  glutamine amidotransferase, class I  42.86 
 
 
444 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0570  peptidase C26  27.56 
 
 
240 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0083889  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2887  peptidase C26  34.73 
 
 
268 aa  115  5e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0175  peptidase C26  37.29 
 
 
249 aa  115  6e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000212098 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0954  putative amidotransferase  43.64 
 
 
251 aa  115  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.716357 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0444  glutamine amidotransferase class I  32.54 
 
 
241 aa  115  8.999999999999998e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000517  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0455  glutamine amidotransferase, class I  41.67 
 
 
356 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2970  peptidase C26  41.92 
 
 
442 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.397336  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3017  glutamine amidotransferase, class I  41.92 
 
 
442 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2910  peptidase C26  41.92 
 
 
442 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.486072  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0717  peptidase C26  41.92 
 
 
479 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.777258  normal  0.355316 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0173  peptidase C26  41.92 
 
 
444 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0388  putative glutamine amidotransferase  33.61 
 
 
250 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.55028  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0973  glutamine amidotransferase, class I  41.92 
 
 
444 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2602  peptidase C26  41.92 
 
 
444 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.160668  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3790  hypothetical protein  36.49 
 
 
254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3677  Gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  35.74 
 
 
259 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.272698 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3558  peptidase C26  38.42 
 
 
257 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0416  peptidase C26  40.69 
 
 
264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0393355  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19230  predicted glutamine amidotransferase  33.33 
 
 
273 aa  113  3e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0453236 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2371  peptidase C26  41.82 
 
 
405 aa  113  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.167921  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3033  peptidase C26  34.74 
 
 
254 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.008786  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>