More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_0545 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010084  Bmul_2371  peptidase C26  89.88 
 
 		 405 aa  683    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.167921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0983  peptidase C26  100 
 
 		 396 aa  800    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.290196  normal  0.093467 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0545  peptidase C26  100 
 
 		 396 aa  800    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.839837  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0888  peptidase C26  84.22 
 
 		 427 aa  665    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0900  peptidase C26  89.3 
 
 		 399 aa  664    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.332784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1024  peptidase C26  100 
 
 		 396 aa  800    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2910  peptidase C26  72.91 
 
 		 442 aa  598  1e-170  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.486072  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0173  peptidase C26  72.81 
 
 		 444 aa  599  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3017  glutamine amidotransferase, class I  72.91 
 
 		 442 aa  598  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0973  glutamine amidotransferase, class I  72.81 
 
 		 444 aa  599  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2602  peptidase C26  72.81 
 
 		 444 aa  599  1e-170  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.160668  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2970  peptidase C26  72.91 
 
 		 442 aa  599  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.397336  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1617  glutamine amidotransferase, class I  92.14 
 
 		 444 aa  591  1e-168  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0455  glutamine amidotransferase, class I  91.51 
 
 		 356 aa  587  1e-167  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0717  peptidase C26  82.46 
 
 		 479 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.777258  normal  0.355316 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3033  peptidase C26  78.37 
 
 		 493 aa  560  1e-158  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.998523  decreased coverage  0.0021965 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4137  peptidase C26  99.6 
 
 		 251 aa  520  1e-146  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0954  putative amidotransferase  86.45 
 
 		 251 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.716357 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2112  glutamine amidotransferase class-I:peptidase C26  59.46 
 
 		 260 aa  331  1e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0486861  normal  0.283308 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1549  peptidase C26  56.42 
 
 		 258 aa  292  7e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1141  putative transferase  56.13 
 
 		 266 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0928367 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3226  peptidase C26  51.54 
 
 		 285 aa  265  1e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4701  peptidase C26  46.46 
 
 		 272 aa  228  2e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3960  peptidase C26  46.15 
 
 		 313 aa  223  3e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0591478 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3313  peptidase C26  45.66 
 
 		 305 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3963  peptidase C26  45.66 
 
 		 305 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0830128  normal  0.322468 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4597  peptidase C26  44.09 
 
 		 307 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0917  peptidase C26  44.53 
 
 		 293 aa  219  5e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.119037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0108  peptidase C26  45.59 
 
 		 258 aa  218  1e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5208  peptidase C26  44.92 
 
 		 295 aa  216  4e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4136  hypothetical protein  87.3 
 
 		 129 aa  147  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2164  peptidase C26  43.86 
 
 		 233 aa  123  6e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000115799  hitchhiker  0.0000699279 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0730  peptidase C26  34.65 
 
 		 238 aa  123  7e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4207  peptidase C26  38.97 
 
 		 298 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.914824 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2671  peptidase C26  38.32 
 
 		 229 aa  118  9.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0625878 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1031  glutamine amidotransferase  40.94 
 
 		 245 aa  118  1.9999999999999998e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000341197  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0075  peptidase C26  41.38 
 
 		 244 aa  117  3.9999999999999997e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.70164  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4215  peptidase C26  34.72 
 
 		 253 aa  116  6.9999999999999995e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2261  peptidase C26  38.83 
 
 		 312 aa  116  8.999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0438  peptidase C26  42.86 
 
 		 255 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1822  peptidase C26  39.23 
 
 		 245 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0444  glutamine amidotransferase class I  39.66 
 
 		 241 aa  115  2.0000000000000002e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000517  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2428  peptidase C26  37.57 
 
 		 248 aa  114  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0053  peptidase C26  37.24 
 
 		 256 aa  114  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3050  peptidase C26  35.57 
 
 		 250 aa  114  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1017  putative glutamine amidotransferase  39.77 
 
 		 238 aa  113  5e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3356  peptidase C26  36.47 
 
 		 238 aa  113  6e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.95955  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1082  peptidase C26  37.69 
 
 		 259 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.3752 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2528  glutamine amidotransferase, class I  41.82 
 
 		 250 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2155  peptidase C26  41.82 
 
 		 250 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159832 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3571  peptidase C26  34.71 
 
 		 247 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2523  peptidase C26  38.69 
 
 		 252 aa  110  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1945  glutamine amidotransferase, class I  34.98 
 
 		 313 aa  110  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0746135  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21880  peptidase C26  39.05 
 
 		 231 aa  109  7.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2718  peptidase C26  38.98 
 
 		 242 aa  108  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0577548  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5474  peptidase C26  32.38 
 
 		 268 aa  108  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2887  peptidase C26  35.75 
 
 		 268 aa  108  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0954  peptidase C26  35.15 
 
 		 264 aa  107  3e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000028221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2941  glutamine amidotransferase related enzyme  37.13 
 
 		 237 aa  107  5e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0319  peptidase C26  34.73 
 
 		 233 aa  106  6e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.783639 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3947  peptidase C26  36.11 
 
 		 261 aa  105  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0505393  normal  0.911745 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0799  peptidase C26  38.86 
 
 		 235 aa  105  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0570  peptidase C26  38.46 
 
 		 240 aa  105  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0083889  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2023  glutamine amidotransferase, class I  34.57 
 
 		 266 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2182  peptidase C26  33.18 
 
 		 279 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.418745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0637  glutamine amidotransferase  34.57 
 
 		 266 aa  104  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5913  peptidase C26  33.18 
 
 		 279 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2164  peptidase C26  33.18 
 
 		 279 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0349  peptidase C26  33.93 
 
 		 273 aa  103  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.232683  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4408  peptidase C26  37.5 
 
 		 262 aa  103  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1349  peptidase C26  39.26 
 
 		 240 aa  103  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000385212  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1797  glutamine amidotransferase  35.08 
 
 		 238 aa  102  9e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.239238  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0729  glutamine amidotransferase  34.16 
 
 		 266 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.30779  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0943  putative glutamine amidotransferase  34.33 
 
 		 264 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.889039 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2021  peptidase C26  37.2 
 
 		 250 aa  101  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2381  Gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  38.58 
 
 		 255 aa  101  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00995781  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1789  glutamine amidotransferase  32.24 
 
 		 241 aa  101  2e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000030649  hitchhiker  5.3956e-25 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1429  glutamine amidotransferase (class I), putative  35.09 
 
 		 231 aa  101  2e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0794  hypothetical protein  33.33 
 
 		 267 aa  101  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2536  peptidase C26  37.72 
 
 		 237 aa  101  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2532  peptidase C26  31.88 
 
 		 267 aa  101  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1878  hypothetical protein  36 
 
 		 230 aa  101  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1072  peptidase C26  36.25 
 
 		 259 aa  100  6e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1160  peptidase C26  39.88 
 
 		 222 aa  100  6e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4921  peptidase C26  38.15 
 
 		 299 aa  99.8  7e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2162  peptidase C26  36.63 
 
 		 238 aa  99.8  8e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000124945  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2318  peptidase C26  34.83 
 
 		 269 aa  99.4  9e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2202  peptidase C26  33.18 
 
 		 268 aa  99.4  9e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19230  predicted glutamine amidotransferase  33.18 
 
 		 273 aa  99.4  9e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0453236 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3097  peptidase C26  34.83 
 
 		 269 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.925767  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3598  peptidase C26  34.83 
 
 		 269 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.420407  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1643  glutamine amidotransferase, class I  31.74 
 
 		 229 aa  99.4  1e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0420698  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2813  peptidase C26  34.83 
 
 		 269 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0982  glutamine amidotransferase, class I  35.38 
 
 		 278 aa  98.2  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2184  peptidase C26  32.41 
 
 		 275 aa  98.6  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.297323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1106  peptidase C26  34.44 
 
 		 268 aa  98.2  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.442866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2080  peptidase C26  33.18 
 
 		 268 aa  98.2  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.285654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0921  glutamine amidotransferase, class I  35.38 
 
 		 278 aa  98.2  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.216457  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1378  peptidase C26  37.28 
 
 		 253 aa  98.2  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.735257  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08940  predicted glutamine amidotransferase  34.8 
 
 		 244 aa  97.8  3e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0342497  normal  0.666279 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>