261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3963 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_3313  peptidase C26  100 
 
 
305 aa  627  1e-179  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3963  peptidase C26  100 
 
 
305 aa  627  1e-179  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0830128  normal  0.322468 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4597  peptidase C26  84.45 
 
 
307 aa  500  1e-140  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5208  peptidase C26  76.71 
 
 
295 aa  460  9.999999999999999e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0917  peptidase C26  78.68 
 
 
293 aa  440  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.119037  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4701  peptidase C26  70.82 
 
 
272 aa  384  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3960  peptidase C26  66.42 
 
 
313 aa  373  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0591478 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0108  peptidase C26  57.36 
 
 
258 aa  303  3.0000000000000004e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1141  putative transferase  51.16 
 
 
266 aa  238  6.999999999999999e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0928367 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2112  glutamine amidotransferase class-I:peptidase C26  47.29 
 
 
260 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0486861  normal  0.283308 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1549  peptidase C26  48.83 
 
 
258 aa  231  9e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3033  peptidase C26  47.35 
 
 
493 aa  228  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.998523  decreased coverage  0.0021965 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3226  peptidase C26  46.69 
 
 
285 aa  226  4e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0717  peptidase C26  46.59 
 
 
479 aa  223  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.777258  normal  0.355316 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1617  glutamine amidotransferase, class I  46.04 
 
 
444 aa  224  2e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0954  putative amidotransferase  48.05 
 
 
251 aa  223  3e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.716357 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0983  peptidase C26  45.66 
 
 
396 aa  221  8e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.290196  normal  0.093467 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0545  peptidase C26  45.66 
 
 
396 aa  221  8e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.839837  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1024  peptidase C26  45.66 
 
 
396 aa  221  8e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2371  peptidase C26  45.66 
 
 
405 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.167921  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0888  peptidase C26  45.66 
 
 
427 aa  220  3e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0900  peptidase C26  45.66 
 
 
399 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.332784  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0455  glutamine amidotransferase, class I  45.28 
 
 
356 aa  219  5e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2970  peptidase C26  45.28 
 
 
442 aa  219  5e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.397336  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0173  peptidase C26  45.28 
 
 
444 aa  219  5e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0973  glutamine amidotransferase, class I  45.28 
 
 
444 aa  219  5e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2602  peptidase C26  45.28 
 
 
444 aa  219  5e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.160668  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3017  glutamine amidotransferase, class I  45.28 
 
 
442 aa  219  6e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2910  peptidase C26  45.28 
 
 
442 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.486072  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4137  peptidase C26  45.53 
 
 
251 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0361  peptidase C26  36.09 
 
 
253 aa  132  6.999999999999999e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0444  glutamine amidotransferase class I  32.1 
 
 
241 aa  130  2.0000000000000002e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000517  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0730  peptidase C26  31.37 
 
 
238 aa  130  3e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2164  peptidase C26  37.93 
 
 
233 aa  130  4.0000000000000003e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000115799  hitchhiker  0.0000699279 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1017  putative glutamine amidotransferase  40.4 
 
 
238 aa  126  5e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0053  peptidase C26  37.37 
 
 
256 aa  125  7e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21880  peptidase C26  34.4 
 
 
231 aa  123  3e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3050  peptidase C26  35.27 
 
 
250 aa  122  5e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3248  peptidase C26  35.56 
 
 
251 aa  122  6e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2428  peptidase C26  34.67 
 
 
248 aa  122  6e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1072  peptidase C26  40.11 
 
 
259 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1789  glutamine amidotransferase  34.62 
 
 
241 aa  117  1.9999999999999998e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000030649  hitchhiker  5.3956e-25 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2021  peptidase C26  31.72 
 
 
250 aa  116  3.9999999999999997e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1797  glutamine amidotransferase  35.9 
 
 
238 aa  116  5e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.239238  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0319  peptidase C26  38.27 
 
 
233 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.783639 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0063  peptidase C26  32.55 
 
 
242 aa  113  3e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.542911  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1082  peptidase C26  38.74 
 
 
259 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.3752 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0616  peptidase C26  35.4 
 
 
245 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.206585  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2532  peptidase C26  35.45 
 
 
267 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0799  peptidase C26  35.71 
 
 
235 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0143  peptidase C26  38.41 
 
 
238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1963  peptidase C26  43.4 
 
 
254 aa  109  5e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.153313  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04810  predicted glutamine amidotransferase  38.76 
 
 
279 aa  109  7.000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00756632  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0570  peptidase C26  36 
 
 
240 aa  108  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0083889  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1367  peptidase C26  37.67 
 
 
239 aa  108  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1349  peptidase C26  31.79 
 
 
240 aa  108  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000385212  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1429  glutamine amidotransferase (class I), putative  34.34 
 
 
231 aa  107  2e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1643  glutamine amidotransferase, class I  33.33 
 
 
229 aa  107  3e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0420698  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1775  glutamine amidotransferase  34.12 
 
 
227 aa  107  3e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000113696 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1636  peptidase C26  35.75 
 
 
252 aa  106  4e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.370641  normal  0.14821 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1031  glutamine amidotransferase  31.13 
 
 
245 aa  106  4e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000341197  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1945  glutamine amidotransferase, class I  36.49 
 
 
313 aa  106  6e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0746135  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0349  peptidase C26  34.56 
 
 
273 aa  106  6e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.232683  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0729  glutamine amidotransferase  35.25 
 
 
266 aa  105  9e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.30779  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4207  peptidase C26  33.33 
 
 
298 aa  105  9e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.914824 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0075  peptidase C26  31.78 
 
 
244 aa  105  9e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.70164  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3571  peptidase C26  34.17 
 
 
247 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3947  peptidase C26  38.2 
 
 
261 aa  105  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0505393  normal  0.911745 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2010  peptidase C26  40.93 
 
 
243 aa  104  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0361829  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1701  glutamine amidotransferase, class II/dipeptidase  31.3 
 
 
602 aa  104  2e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2813  peptidase C26  38.05 
 
 
269 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0637  glutamine amidotransferase  36.97 
 
 
266 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1887  peptidase C26  31.8 
 
 
281 aa  103  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.192004  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1852  peptidase C26  35.52 
 
 
238 aa  103  5e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.197074  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1111  peptidase C26  40.57 
 
 
246 aa  102  6e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.517876 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1378  peptidase C26  33.49 
 
 
253 aa  102  7e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.735257  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1477  peptidase C26  38.46 
 
 
237 aa  102  7e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2816  peptidase C26  34.91 
 
 
255 aa  102  8e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2155  peptidase C26  36.95 
 
 
250 aa  102  9e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000159832 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2528  glutamine amidotransferase, class I  36.95 
 
 
250 aa  102  9e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2023  glutamine amidotransferase, class I  36.49 
 
 
266 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2318  peptidase C26  39.19 
 
 
269 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167061  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3598  peptidase C26  38.01 
 
 
269 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.420407  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4215  peptidase C26  31.69 
 
 
253 aa  101  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0244  glutamine amidotransferase  31.42 
 
 
281 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.682625  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2279  peptidase C26  35.94 
 
 
280 aa  101  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.249131 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3097  peptidase C26  38.01 
 
 
269 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.925767  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0175  peptidase C26  38.37 
 
 
249 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000212098 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2381  Gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  36.82 
 
 
255 aa  100  4e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00995781  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4415  peptidase C26  34.87 
 
 
255 aa  100  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2523  peptidase C26  33.51 
 
 
252 aa  100  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0710  peptidase C26  36.14 
 
 
263 aa  100  4e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.391948  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1822  peptidase C26  36.84 
 
 
245 aa  100  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2887  peptidase C26  29.92 
 
 
268 aa  100  4e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3356  peptidase C26  27.9 
 
 
238 aa  100  4e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.95955  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0837  peptidase C26  31.15 
 
 
277 aa  99.8  5e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.347165  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2104  peptidase C26  33.48 
 
 
240 aa  99.8  5e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.297238  normal  0.0236912 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2041  peptidase C26  33.48 
 
 
240 aa  99.8  5e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.755428  normal  0.5084 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5913  peptidase C26  32.06 
 
 
279 aa  99.4  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2058  peptidase C26  33.48 
 
 
251 aa  99.8  6e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>