More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1789 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1789  glutamine amidotransferase  100 
 
 		 241 aa  494  1e-139  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000030649  hitchhiker  5.3956e-25 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0075  peptidase C26  62.08 
 
 		 244 aa  285  5e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.70164  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2718  peptidase C26  48.15 
 
 		 242 aa  224  1e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0577548  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0444  glutamine amidotransferase class I  45.42 
 
 		 241 aa  215  5.9999999999999996e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000517  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0730  peptidase C26  42.98 
 
 		 238 aa  204  7e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0361  peptidase C26  39.5 
 
 		 253 aa  182  4.0000000000000006e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21880  peptidase C26  42.56 
 
 		 231 aa  172  5.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2162  peptidase C26  38.59 
 
 		 238 aa  166  4e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000124945  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2893  peptidase C26  38.59 
 
 		 233 aa  162  3e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.220365  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0063  peptidase C26  36.51 
 
 		 242 aa  158  6e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.542911  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2164  peptidase C26  37.39 
 
 		 233 aa  157  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000115799  hitchhiker  0.0000699279 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2428  peptidase C26  37.08 
 
 		 248 aa  154  9e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04810  predicted glutamine amidotransferase  36.99 
 
 		 279 aa  152  4e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00756632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3356  peptidase C26  36.36 
 
 		 238 aa  150  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.95955  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4207  peptidase C26  37.89 
 
 		 298 aa  150  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.914824 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2021  peptidase C26  37.38 
 
 		 250 aa  150  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3050  peptidase C26  34.84 
 
 		 250 aa  149  4e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1031  glutamine amidotransferase  36.95 
 
 		 245 aa  149  5e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000341197  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0799  peptidase C26  35.05 
 
 		 235 aa  148  7e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0438  peptidase C26  37.44 
 
 		 255 aa  148  8e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1878  hypothetical protein  37.91 
 
 		 230 aa  148  9e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1701  glutamine amidotransferase, class II/dipeptidase  33.74 
 
 		 602 aa  147  2.0000000000000003e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3248  peptidase C26  37.33 
 
 		 251 aa  146  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0319  peptidase C26  36.15 
 
 		 233 aa  146  4.0000000000000006e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.783639 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3742  peptidase C26  36.48 
 
 		 237 aa  145  6e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1822  peptidase C26  35.15 
 
 		 245 aa  144  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1963  peptidase C26  34.87 
 
 		 254 aa  142  7e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.153313  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4215  peptidase C26  36.41 
 
 		 253 aa  141  9e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0570  peptidase C26  36.2 
 
 		 240 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0083889  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2523  peptidase C26  36.61 
 
 		 252 aa  139  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1349  peptidase C26  33.62 
 
 		 240 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000385212  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3249  peptidase C26  34.84 
 
 		 250 aa  138  6e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0053  peptidase C26  33.06 
 
 		 256 aa  137  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0143  peptidase C26  41.58 
 
 		 238 aa  137  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0076  peptidase C26  36.2 
 
 		 236 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.0652283 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1636  peptidase C26  39.9 
 
 		 252 aa  136  3.0000000000000003e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.370641  normal  0.14821 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19230  predicted glutamine amidotransferase  35.56 
 
 		 273 aa  136  4e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0453236 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3960  peptidase C26  38.25 
 
 		 313 aa  136  4e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0591478 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2536  peptidase C26  34.2 
 
 		 237 aa  135  6.0000000000000005e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2279  peptidase C26  37.89 
 
 		 280 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249131 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4701  peptidase C26  36.52 
 
 		 272 aa  134  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4064  peptidase C26  36.73 
 
 		 256 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.529097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1852  peptidase C26  32.88 
 
 		 238 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.197074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2261  peptidase C26  31.93 
 
 		 312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12875  amidotransferase  34.98 
 
 		 272 aa  133  3e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.853598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1797  glutamine amidotransferase  36.24 
 
 		 238 aa  130  1.0000000000000001e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.239238  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1429  glutamine amidotransferase (class I), putative  35.68 
 
 		 231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1757  peptidase C26  38.34 
 
 		 231 aa  127  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.721348  normal  0.077261 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0813  peptidase C26  34.7 
 
 		 264 aa  127  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.540694  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0076  peptidase C26  35.91 
 
 		 236 aa  126  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0108  peptidase C26  34.78 
 
 		 258 aa  125  4.0000000000000003e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0094  peptidase C26  35.91 
 
 		 236 aa  125  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000432288  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2058  peptidase C26  36.61 
 
 		 251 aa  125  6e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0082  peptidase C26  35.91 
 
 		 236 aa  125  7e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.831872  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2155  peptidase C26  34.43 
 
 		 250 aa  125  8.000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159832 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1775  glutamine amidotransferase  33.49 
 
 		 227 aa  125  8.000000000000001e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000113696 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2528  glutamine amidotransferase, class I  34.43 
 
 		 250 aa  125  8.000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2041  peptidase C26  39.5 
 
 		 240 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.755428  normal  0.5084 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1072  peptidase C26  36.26 
 
 		 259 aa  124  1e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2104  peptidase C26  39.5 
 
 		 240 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.297238  normal  0.0236912 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1017  putative glutamine amidotransferase  30.19 
 
 		 238 aa  124  2e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3195  peptidase C26  35.43 
 
 		 241 aa  122  4e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2584  peptidase C26  37 
 
 		 237 aa  122  4e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0482191  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0954  peptidase C26  37.89 
 
 		 264 aa  122  5e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000028221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4408  peptidase C26  35.71 
 
 		 262 aa  122  6e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0616  peptidase C26  33.02 
 
 		 245 aa  121  9e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.206585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1141  putative transferase  34.32 
 
 		 266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0928367 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3313  peptidase C26  33.91 
 
 		 305 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3963  peptidase C26  33.91 
 
 		 305 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0830128  normal  0.322468 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12430  predicted glutamine amidotransferase  35.14 
 
 		 247 aa  119  4.9999999999999996e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124059  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0837  peptidase C26  30.17 
 
 		 277 aa  118  7e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.347165  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0651  glutamine amidotransferase class-I  30.42 
 
 		 242 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.64648  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2465  peptidase C26  34.18 
 
 		 247 aa  116  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000302907  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1964  peptidase C26  32.78 
 
 		 239 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.918763 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4597  peptidase C26  33.19 
 
 		 307 aa  115  5e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1740  peptidase C26  28.75 
 
 		 241 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.227165  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5208  peptidase C26  32.62 
 
 		 295 aa  113  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3033  peptidase C26  31.7 
 
 		 254 aa  112  5e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.008786  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0608  peptidase C26  34.74 
 
 		 237 aa  112  6e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.982002  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1367  peptidase C26  31.34 
 
 		 239 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0917  peptidase C26  33.03 
 
 		 293 aa  111  8.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.119037  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1643  glutamine amidotransferase, class I  34.73 
 
 		 229 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0420698  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3226  peptidase C26  32.86 
 
 		 285 aa  110  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2887  peptidase C26  29.32 
 
 		 268 aa  109  5e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1477  peptidase C26  30.77 
 
 		 237 aa  108  5e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0710  peptidase C26  34.35 
 
 		 263 aa  108  6e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.391948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4921  peptidase C26  36.65 
 
 		 299 aa  107  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3677  Gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  31.45 
 
 		 259 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.272698 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0455  glutamine amidotransferase, class I  32.35 
 
 		 356 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1229  peptidase C26  32.74 
 
 		 259 aa  107  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.121618 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1297  peptidase C26  27.78 
 
 		 259 aa  107  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.266099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3033  peptidase C26  32.05 
 
 		 493 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.998523  decreased coverage  0.0021965 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1617  glutamine amidotransferase, class I  32.35 
 
 		 444 aa  106  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4415  peptidase C26  32.43 
 
 		 255 aa  106  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2970  peptidase C26  32.35 
 
 		 442 aa  105  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.397336  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2602  peptidase C26  32.35 
 
 		 444 aa  105  5e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.160668  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3017  glutamine amidotransferase, class I  32.35 
 
 		 442 aa  105  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0973  glutamine amidotransferase, class I  32.35 
 
 		 444 aa  105  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2910  peptidase C26  32.35 
 
 		 442 aa  105  5e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.486072  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2009  peptidase C26  38.25 
 
 		 245 aa  105  5e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>