262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1229 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1229  peptidase C26  100 
 
 		 259 aa  529  1e-149  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.121618 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2669  peptidase C26  71.43 
 
 		 288 aa  397  1e-109  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0275908  normal  0.209518 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1536  peptidase C26  72.44 
 
 		 276 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0710  peptidase C26  68.87 
 
 		 263 aa  382  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.391948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0244  glutamine amidotransferase  71.26 
 
 		 281 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.682625  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1887  peptidase C26  70.87 
 
 		 281 aa  377  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.192004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1649  peptidase C26  51.7 
 
 		 267 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4584  putative gamma-glutamyl hydrolase family protein  52.38 
 
 		 256 aa  268  5.9999999999999995e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4065  peptidase C26  50.57 
 
 		 267 aa  266  4e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.641789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3803  peptidase C26  52.19 
 
 		 267 aa  265  5e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1831  peptidase C26  50.81 
 
 		 261 aa  256  2e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0150811 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4023  peptidase C26  50.2 
 
 		 256 aa  252  3e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3677  Gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  41.09 
 
 		 259 aa  198  6e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.272698 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3790  hypothetical protein  42.75 
 
 		 254 aa  198  9e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3375  peptidase C26  41.09 
 
 		 259 aa  196  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.290232 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1298  peptidase C26  42.64 
 
 		 297 aa  196  4.0000000000000005e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.561811 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1378  peptidase C26  40.33 
 
 		 253 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.735257  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0982  glutamine amidotransferase, class I  40.33 
 
 		 278 aa  192  4e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0921  glutamine amidotransferase, class I  40.33 
 
 		 278 aa  192  4e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.216457  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2816  peptidase C26  43.17 
 
 		 255 aa  189  4e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2987  peptidase C26  38.67 
 
 		 274 aa  182  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2762  peptidase C26  41.2 
 
 		 251 aa  182  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.126803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0175  peptidase C26  42.68 
 
 		 249 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000212098 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1740  peptidase C26  40 
 
 		 256 aa  181  1e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000655544 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5207  peptidase C26  41 
 
 		 255 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.381902 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2902  peptidase C26  39 
 
 		 261 aa  180  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6342  peptidase C26  39 
 
 		 262 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5346  peptidase C26  41.42 
 
 		 255 aa  178  7e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.176756 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5298  peptidase C26  40.59 
 
 		 255 aa  178  9e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.880812  normal  0.49084 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1945  glutamine amidotransferase, class I  40.16 
 
 		 313 aa  177  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0746135  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1106  peptidase C26  38.78 
 
 		 268 aa  177  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.442866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0943  putative glutamine amidotransferase  37.7 
 
 		 264 aa  176  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.889039 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5913  peptidase C26  38.78 
 
 		 279 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2164  peptidase C26  38.78 
 
 		 279 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2182  peptidase C26  38.78 
 
 		 279 aa  174  9e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.418745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0847  peptidase C26  39.43 
 
 		 246 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1082  peptidase C26  41.23 
 
 		 259 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.3752 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4667  peptidase C26  36.89 
 
 		 264 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3040  peptidase C26  37.5 
 
 		 279 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3012  peptidase C26  37.92 
 
 		 261 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03870  putative glutamine amidotransferase  39.53 
 
 		 250 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0388  putative glutamine amidotransferase  39.92 
 
 		 250 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.55028  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2379  peptidase C26  37.92 
 
 		 261 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.732768  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2993  peptidase C26  37.92 
 
 		 261 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5474  peptidase C26  38.37 
 
 		 268 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48870  glutamine amidotransferase  40.96 
 
 		 250 aa  171  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2202  peptidase C26  37.96 
 
 		 268 aa  170  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0416  peptidase C26  41.96 
 
 		 264 aa  170  2e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0393355  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2920  peptidase C26  36.44 
 
 		 253 aa  169  3e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.129807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3002  peptidase C26  36.44 
 
 		 253 aa  168  8e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00604755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2080  peptidase C26  37.96 
 
 		 268 aa  168  9e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.285654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2865  peptidase C26  40.71 
 
 		 256 aa  168  9e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.136742  normal  0.196965 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2381  Gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  39.36 
 
 		 255 aa  168  9e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00995781  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1092  peptidase C26  36.03 
 
 		 253 aa  167  1e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.337501  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2318  peptidase C26  39.42 
 
 		 269 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3099  peptidase C26  36.03 
 
 		 253 aa  168  1e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.015015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1197  peptidase C26  36.03 
 
 		 253 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0734619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2813  peptidase C26  39.52 
 
 		 269 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1106  peptidase C26  36.03 
 
 		 253 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00657887  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1164  peptidase C26  36.03 
 
 		 253 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.399023  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3194  peptidase C26  36.03 
 
 		 253 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0388042 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1900  glutamine amidotransferase-like protein  41.28 
 
 		 267 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.720243  normal  0.134841 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3598  peptidase C26  38.21 
 
 		 269 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.420407  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2902  glutamine amidotransferase, putative  38.46 
 
 		 254 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00530511  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2706  glutamine amidotransferase  38.43 
 
 		 249 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.078896  normal  0.0560665 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1267  glutamine amidotransferase  36.03 
 
 		 253 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0349  peptidase C26  40 
 
 		 273 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.232683  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3097  peptidase C26  37.74 
 
 		 269 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.925767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3571  peptidase C26  37.44 
 
 		 247 aa  161  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2532  peptidase C26  38.97 
 
 		 267 aa  160  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3947  peptidase C26  35.12 
 
 		 261 aa  156  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0505393  normal  0.911745 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1827  glutamine amidotransferase, class I  40.6 
 
 		 263 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.259893  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2121  peptidase C26  39.26 
 
 		 253 aa  154  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0384981  normal  0.197243 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2179  peptidase C26  36.63 
 
 		 257 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2023  glutamine amidotransferase, class I  36.48 
 
 		 266 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3558  peptidase C26  36.63 
 
 		 257 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0794  hypothetical protein  36.15 
 
 		 267 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0637  glutamine amidotransferase  36.48 
 
 		 266 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3033  peptidase C26  32.66 
 
 		 254 aa  152  7e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.008786  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0729  glutamine amidotransferase  36.48 
 
 		 266 aa  152  7e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.30779  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0655  glutamine amidotransferase, class I  40.85 
 
 		 263 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2929  glutamine amidotransferase, class I  40.85 
 
 		 264 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3012  peptidase C26  33.88 
 
 		 254 aa  150  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2356  glutamine amidotransferase, class I  40.85 
 
 		 264 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1670  glutamine amidotransferase, class I  40.85 
 
 		 264 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.661584  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1786  peptidase C26  36.63 
 
 		 257 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2655  glutamine amidotransferase, class I  40.85 
 
 		 263 aa  149  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2712  glutamine amidotransferase, class I  40.85 
 
 		 264 aa  149  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.840188  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2789  glutamine amidotransferase, class I  40.85 
 
 		 349 aa  149  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6978  peptidase C26  35.25 
 
 		 275 aa  149  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.788826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2645  glutamine amidotransferase  37.85 
 
 		 254 aa  149  5e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5760  peptidase C26  37.55 
 
 		 267 aa  148  7e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4678  hypothetical protein  34.82 
 
 		 255 aa  148  1.0000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0944  peptidase C26  33.62 
 
 		 253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1129  peptidase C26  32.76 
 
 		 253 aa  146  3e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1111  peptidase C26  36.21 
 
 		 246 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.517876 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2067  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  37.5 
 
 		 253 aa  145  8.000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1059  peptidase C26  32.76 
 
 		 253 aa  142  6e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.22875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0971  peptidase C26  35.18 
 
 		 253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.174488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1940  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  33.2 
 
 		 250 aa  139  6e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.343934 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>