276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0944 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_0944  peptidase C26  100 
 
 
253 aa  522  1e-147  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1059  peptidase C26  83.79 
 
 
253 aa  456  1e-127  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.22875  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1129  peptidase C26  84.19 
 
 
253 aa  454  1e-127  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0971  peptidase C26  81.82 
 
 
253 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.174488  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3012  peptidase C26  71.65 
 
 
254 aa  393  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1197  peptidase C26  71.89 
 
 
253 aa  384  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0734619  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1164  peptidase C26  71.89 
 
 
253 aa  384  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.399023  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3194  peptidase C26  71.89 
 
 
253 aa  384  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0388042 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2920  peptidase C26  71.31 
 
 
253 aa  384  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.129807  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1106  peptidase C26  71.89 
 
 
253 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00657887  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3002  peptidase C26  70.52 
 
 
253 aa  382  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00604755  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3099  peptidase C26  70.92 
 
 
253 aa  383  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.015015  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1092  peptidase C26  70.68 
 
 
253 aa  380  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.337501  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1267  glutamine amidotransferase  71.49 
 
 
253 aa  380  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2645  glutamine amidotransferase  69.69 
 
 
254 aa  380  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3033  peptidase C26  66.54 
 
 
254 aa  370  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.008786  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03870  putative glutamine amidotransferase  59.92 
 
 
250 aa  311  5.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0388  putative glutamine amidotransferase  59.92 
 
 
250 aa  310  2e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.55028  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48870  glutamine amidotransferase  57.89 
 
 
250 aa  290  2e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3558  peptidase C26  55.87 
 
 
257 aa  284  8e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0943  putative glutamine amidotransferase  56.1 
 
 
264 aa  280  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.889039 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2179  peptidase C26  55.06 
 
 
257 aa  278  4e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4667  peptidase C26  56.1 
 
 
264 aa  278  7e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2121  peptidase C26  59.66 
 
 
253 aa  277  1e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0384981  normal  0.197243 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2080  peptidase C26  54.84 
 
 
268 aa  276  3e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.285654  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2202  peptidase C26  54.84 
 
 
268 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5913  peptidase C26  55.06 
 
 
279 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2164  peptidase C26  55.06 
 
 
279 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1786  peptidase C26  55.47 
 
 
257 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2182  peptidase C26  54.66 
 
 
279 aa  269  4e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.418745  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1945  glutamine amidotransferase, class I  53.63 
 
 
313 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0746135  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6342  peptidase C26  56.49 
 
 
262 aa  267  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5474  peptidase C26  54.25 
 
 
268 aa  266  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2987  peptidase C26  54.07 
 
 
274 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0175  peptidase C26  53.6 
 
 
249 aa  264  1e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000212098 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2902  peptidase C26  55.65 
 
 
261 aa  260  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3012  peptidase C26  56.36 
 
 
261 aa  259  3e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90022  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1106  peptidase C26  53.04 
 
 
268 aa  259  3e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.442866  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3571  peptidase C26  55.27 
 
 
247 aa  259  4e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2706  glutamine amidotransferase  54.88 
 
 
249 aa  256  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.078896  normal  0.0560665 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5346  peptidase C26  52.8 
 
 
255 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.176756 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5298  peptidase C26  52.4 
 
 
255 aa  255  4e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.880812  normal  0.49084 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3040  peptidase C26  56.17 
 
 
279 aa  255  4e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2379  peptidase C26  55.51 
 
 
261 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.732768  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5207  peptidase C26  52 
 
 
255 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.381902 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2993  peptidase C26  55.51 
 
 
261 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2023  glutamine amidotransferase, class I  52.21 
 
 
266 aa  251  6e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0637  glutamine amidotransferase  52.21 
 
 
266 aa  251  6e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0729  glutamine amidotransferase  52.21 
 
 
266 aa  250  1e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.30779  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1827  glutamine amidotransferase, class I  55.84 
 
 
263 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.259893  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2789  glutamine amidotransferase, class I  55.91 
 
 
349 aa  238  5e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0655  glutamine amidotransferase, class I  55.91 
 
 
263 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1670  glutamine amidotransferase, class I  55.91 
 
 
264 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.661584  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2929  glutamine amidotransferase, class I  55.91 
 
 
264 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2356  glutamine amidotransferase, class I  55.91 
 
 
264 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2655  glutamine amidotransferase, class I  55.91 
 
 
263 aa  238  8e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2712  glutamine amidotransferase, class I  55.91 
 
 
264 aa  238  9e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.840188  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4678  hypothetical protein  47.92 
 
 
255 aa  237  1e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2902  glutamine amidotransferase, putative  51.61 
 
 
254 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00530511  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2381  Gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  51.43 
 
 
255 aa  231  6e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00995781  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1900  glutamine amidotransferase-like protein  49.79 
 
 
267 aa  227  2e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.720243  normal  0.134841 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1339  peptidase C26  48.79 
 
 
253 aa  226  2e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1740  peptidase C26  49.38 
 
 
256 aa  224  7e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000655544 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2865  peptidase C26  46.98 
 
 
256 aa  220  1.9999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.136742  normal  0.196965 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1298  peptidase C26  44.09 
 
 
297 aa  208  8e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.561811 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5760  peptidase C26  46.06 
 
 
267 aa  199  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0847  peptidase C26  45.42 
 
 
246 aa  199  3e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0794  hypothetical protein  42.42 
 
 
267 aa  192  4e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2813  peptidase C26  40.17 
 
 
269 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2816  peptidase C26  41.6 
 
 
255 aa  185  6e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3598  peptidase C26  39.33 
 
 
269 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.420407  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1940  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  44.98 
 
 
250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.343934 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1824  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  44.98 
 
 
250 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0824878 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2327  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  44.98 
 
 
254 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0982  glutamine amidotransferase, class I  42.92 
 
 
278 aa  183  2.0000000000000003e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1508  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  44.98 
 
 
254 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3097  peptidase C26  38.91 
 
 
269 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.925767  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0921  glutamine amidotransferase, class I  42.92 
 
 
278 aa  183  2.0000000000000003e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.216457  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1378  peptidase C26  42.86 
 
 
253 aa  182  3e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.735257  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2348  peptidase C26  44.58 
 
 
254 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.388942  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1413  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  44.58 
 
 
254 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2318  peptidase C26  38.91 
 
 
269 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167061  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01275  gamma-Glu-GABA hydrolase  44.18 
 
 
254 aa  181  1e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01286  hypothetical protein  44.18 
 
 
254 aa  181  1e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0349  peptidase C26  38.36 
 
 
273 aa  175  8e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.232683  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3790  hypothetical protein  41.03 
 
 
254 aa  174  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3947  peptidase C26  38.91 
 
 
261 aa  173  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0505393  normal  0.911745 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2067  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  43.57 
 
 
253 aa  172  5.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1082  peptidase C26  38.7 
 
 
259 aa  169  3e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.3752 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2532  peptidase C26  36.82 
 
 
267 aa  168  9e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3375  peptidase C26  39.66 
 
 
259 aa  167  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.290232 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3803  peptidase C26  38.71 
 
 
267 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3677  Gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  39.13 
 
 
259 aa  165  8e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.272698 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0416  peptidase C26  38.27 
 
 
264 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0393355  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4065  peptidase C26  38.65 
 
 
267 aa  162  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.641789  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6978  peptidase C26  39.17 
 
 
275 aa  163  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.788826  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1111  peptidase C26  41.1 
 
 
246 aa  159  4e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.517876 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1831  peptidase C26  39.3 
 
 
261 aa  159  6e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0150811 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2762  peptidase C26  37.77 
 
 
251 aa  157  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.126803  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4584  putative gamma-glutamyl hydrolase family protein  37.07 
 
 
256 aa  156  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>