More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0075 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0075  peptidase C26  100 
 
 		 244 aa  502  1e-141  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.70164  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1789  glutamine amidotransferase  62.08 
 
 		 241 aa  285  5e-76  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000030649  hitchhiker  5.3956e-25 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0444  glutamine amidotransferase class I  43.39 
 
 		 241 aa  209  2e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000517  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2718  peptidase C26  46.28 
 
 		 242 aa  207  1e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0577548  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0361  peptidase C26  39.75 
 
 		 253 aa  186  4e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0730  peptidase C26  39.57 
 
 		 238 aa  184  8e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3356  peptidase C26  41.67 
 
 		 238 aa  176  4e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.95955  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2893  peptidase C26  41 
 
 		 233 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.220365  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2428  peptidase C26  41.53 
 
 		 248 aa  171  7.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3742  peptidase C26  41.91 
 
 		 237 aa  171  9e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3050  peptidase C26  40.73 
 
 		 250 aa  169  5e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21880  peptidase C26  40.09 
 
 		 231 aa  165  5e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1701  glutamine amidotransferase, class II/dipeptidase  38.68 
 
 		 602 aa  164  1.0000000000000001e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2164  peptidase C26  40.51 
 
 		 233 aa  164  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000115799  hitchhiker  0.0000699279 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2162  peptidase C26  35.95 
 
 		 238 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000124945  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4215  peptidase C26  38.68 
 
 		 253 aa  163  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1031  glutamine amidotransferase  39.68 
 
 		 245 aa  163  2.0000000000000002e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000341197  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2523  peptidase C26  38.52 
 
 		 252 aa  156  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3248  peptidase C26  39.73 
 
 		 251 aa  155  6e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2021  peptidase C26  39.53 
 
 		 250 aa  154  8e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1429  glutamine amidotransferase (class I), putative  38.17 
 
 		 231 aa  154  1e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1797  glutamine amidotransferase  35.74 
 
 		 238 aa  153  2e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.239238  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2536  peptidase C26  34.84 
 
 		 237 aa  154  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1822  peptidase C26  38.75 
 
 		 245 aa  152  5e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04810  predicted glutamine amidotransferase  36.59 
 
 		 279 aa  151  8e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00756632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1349  peptidase C26  36.82 
 
 		 240 aa  151  8.999999999999999e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000385212  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1878  hypothetical protein  40.48 
 
 		 230 aa  150  2e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4207  peptidase C26  36.18 
 
 		 298 aa  146  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.914824 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0438  peptidase C26  36.29 
 
 		 255 aa  145  5e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0076  peptidase C26  36.51 
 
 		 236 aa  145  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.0652283 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0954  peptidase C26  39.81 
 
 		 264 aa  142  4e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000028221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0063  peptidase C26  34.58 
 
 		 242 aa  141  9.999999999999999e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.542911  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0799  peptidase C26  40.93 
 
 		 235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2261  peptidase C26  32.41 
 
 		 312 aa  140  3e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1775  glutamine amidotransferase  37.5 
 
 		 227 aa  139  3.9999999999999997e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000113696 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1852  peptidase C26  32.66 
 
 		 238 aa  138  7.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.197074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0053  peptidase C26  35.91 
 
 		 256 aa  137  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0319  peptidase C26  38.97 
 
 		 233 aa  137  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.783639 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0143  peptidase C26  41.94 
 
 		 238 aa  136  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3249  peptidase C26  39.92 
 
 		 250 aa  137  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1963  peptidase C26  37.08 
 
 		 254 aa  137  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.153313  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1643  glutamine amidotransferase, class I  35.66 
 
 		 229 aa  134  9.999999999999999e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0420698  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0076  peptidase C26  37.45 
 
 		 236 aa  132  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12875  amidotransferase  41.29 
 
 		 272 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.853598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2155  peptidase C26  36.45 
 
 		 250 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159832 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2528  glutamine amidotransferase, class I  36.45 
 
 		 250 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0094  peptidase C26  37.45 
 
 		 236 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000432288  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12430  predicted glutamine amidotransferase  36.44 
 
 		 247 aa  129  3e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124059  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0082  peptidase C26  37.45 
 
 		 236 aa  129  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.831872  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19230  predicted glutamine amidotransferase  32.92 
 
 		 273 aa  128  9.000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0453236 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1636  peptidase C26  38.35 
 
 		 252 aa  128  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.370641  normal  0.14821 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3195  peptidase C26  40.21 
 
 		 241 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0651  glutamine amidotransferase class-I  35.32 
 
 		 242 aa  126  3e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.64648  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1367  peptidase C26  36.7 
 
 		 239 aa  126  3e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1072  peptidase C26  38.22 
 
 		 259 aa  126  4.0000000000000003e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1477  peptidase C26  34.45 
 
 		 237 aa  124  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1549  peptidase C26  36.86 
 
 		 258 aa  124  1e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4408  peptidase C26  36.54 
 
 		 262 aa  124  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2279  peptidase C26  33.86 
 
 		 280 aa  123  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249131 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4064  peptidase C26  37.39 
 
 		 256 aa  122  4e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.529097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2465  peptidase C26  33.73 
 
 		 247 aa  122  4e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000302907  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2584  peptidase C26  37.78 
 
 		 237 aa  122  4e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0482191  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1017  putative glutamine amidotransferase  31.73 
 
 		 238 aa  122  5e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2010  peptidase C26  34.43 
 
 		 243 aa  121  9.999999999999999e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0361829  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3677  Gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  35.39 
 
 		 259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.272698 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3925  peptidase C26  39.67 
 
 		 240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.792522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1297  peptidase C26  31.56 
 
 		 259 aa  120  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.266099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2532  peptidase C26  35.95 
 
 		 267 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3033  peptidase C26  43.03 
 
 		 493 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.998523  decreased coverage  0.0021965 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0954  putative amidotransferase  43.03 
 
 		 251 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.716357 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1757  peptidase C26  33.47 
 
 		 231 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.721348  normal  0.077261 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3375  peptidase C26  35.54 
 
 		 259 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.290232 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2058  peptidase C26  39 
 
 		 251 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3960  peptidase C26  35.51 
 
 		 313 aa  118  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0591478 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1141  putative transferase  36.59 
 
 		 266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0928367 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0983  peptidase C26  43.37 
 
 		 396 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.290196  normal  0.093467 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0545  peptidase C26  43.37 
 
 		 396 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.839837  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1024  peptidase C26  43.37 
 
 		 396 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2041  peptidase C26  39 
 
 		 240 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.755428  normal  0.5084 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2104  peptidase C26  39 
 
 		 240 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.297238  normal  0.0236912 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0455  glutamine amidotransferase, class I  36.64 
 
 		 356 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2371  peptidase C26  43.37 
 
 		 405 aa  116  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.167921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2009  peptidase C26  40.11 
 
 		 245 aa  116  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0570  peptidase C26  33.03 
 
 		 240 aa  116  3e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0083889  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2910  peptidase C26  42.77 
 
 		 442 aa  115  5e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.486072  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3017  glutamine amidotransferase, class I  42.77 
 
 		 442 aa  115  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0973  glutamine amidotransferase, class I  42.77 
 
 		 444 aa  115  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4137  peptidase C26  43.37 
 
 		 251 aa  115  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0173  peptidase C26  42.77 
 
 		 444 aa  115  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2602  peptidase C26  42.77 
 
 		 444 aa  115  5e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.160668  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2970  peptidase C26  42.77 
 
 		 442 aa  115  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.397336  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1617  glutamine amidotransferase, class I  36.64 
 
 		 444 aa  115  6e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1740  peptidase C26  31.47 
 
 		 241 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.227165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0888  peptidase C26  42.77 
 
 		 427 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2112  glutamine amidotransferase class-I:peptidase C26  46.3 
 
 		 260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0486861  normal  0.283308 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0900  peptidase C26  42.77 
 
 		 399 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.332784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1964  peptidase C26  36.03 
 
 		 239 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.918763 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3226  peptidase C26  35.94 
 
 		 285 aa  114  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2669  peptidase C26  34.16 
 
 		 288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0275908  normal  0.209518 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0349  peptidase C26  32.43 
 
 		 273 aa  113  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.232683  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>