More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1636 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_1636  peptidase C26  100 
 
 
252 aa  493  9.999999999999999e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.370641  normal  0.14821 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2058  peptidase C26  57.38 
 
 
251 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2104  peptidase C26  57.51 
 
 
240 aa  245  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.297238  normal  0.0236912 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2041  peptidase C26  57.51 
 
 
240 aa  245  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.755428  normal  0.5084 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2279  peptidase C26  55.37 
 
 
280 aa  236  3e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.249131 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4064  peptidase C26  54.51 
 
 
256 aa  234  7e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.529097  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12875  amidotransferase  52.97 
 
 
272 aa  223  2e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.853598  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1757  peptidase C26  53.81 
 
 
231 aa  213  3.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.721348  normal  0.077261 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2077  peptidase C26  51.88 
 
 
233 aa  197  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2465  peptidase C26  50.85 
 
 
247 aa  195  5.000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000302907  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3195  peptidase C26  47.64 
 
 
241 aa  179  4e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2584  peptidase C26  49.79 
 
 
237 aa  179  4e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0482191  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1848  peptidase C26  49.37 
 
 
251 aa  175  5e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.845506 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2021  peptidase C26  47.72 
 
 
250 aa  170  2e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4415  peptidase C26  46.29 
 
 
255 aa  168  9e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4227  peptidase C26  44.77 
 
 
260 aa  160  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135339  normal  0.255877 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12430  predicted glutamine amidotransferase  44.67 
 
 
247 aa  160  3e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124059  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1798  peptidase C26  41.8 
 
 
247 aa  159  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.720671 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0444  glutamine amidotransferase class I  39.27 
 
 
241 aa  158  9e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000517  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0730  peptidase C26  39.7 
 
 
238 aa  156  3e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2164  peptidase C26  43.98 
 
 
233 aa  155  6e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000115799  hitchhiker  0.0000699279 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2184  peptidase C26  42.91 
 
 
275 aa  150  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.297323  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1349  peptidase C26  41.46 
 
 
240 aa  150  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000385212  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1878  hypothetical protein  43 
 
 
230 aa  149  5e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0361  peptidase C26  44.9 
 
 
253 aa  146  4.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1429  glutamine amidotransferase (class I), putative  34.87 
 
 
231 aa  145  4.0000000000000006e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0063  peptidase C26  36.94 
 
 
242 aa  142  7e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.542911  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0438  peptidase C26  39.62 
 
 
255 aa  139  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35287  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2718  peptidase C26  35.68 
 
 
242 aa  139  3.9999999999999997e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0577548  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4207  peptidase C26  38.82 
 
 
298 aa  138  7e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.914824 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4408  peptidase C26  45.55 
 
 
262 aa  138  7e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1378  peptidase C26  37.01 
 
 
253 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.735257  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1789  glutamine amidotransferase  37.38 
 
 
241 aa  136  3.0000000000000003e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000030649  hitchhiker  5.3956e-25 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0319  peptidase C26  41.51 
 
 
233 aa  136  3.0000000000000003e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.783639 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2887  peptidase C26  40.52 
 
 
268 aa  136  4e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2428  peptidase C26  42.35 
 
 
248 aa  135  5e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3050  peptidase C26  43 
 
 
250 aa  135  5e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0982  glutamine amidotransferase, class I  38.61 
 
 
278 aa  135  9e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0921  glutamine amidotransferase, class I  38.61 
 
 
278 aa  135  9e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.216457  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3742  peptidase C26  37.14 
 
 
237 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011892  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1963  peptidase C26  46.67 
 
 
254 aa  134  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.153313  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1964  peptidase C26  40.57 
 
 
239 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.918763 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0651  glutamine amidotransferase class-I  39.84 
 
 
242 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.64648  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2162  peptidase C26  33.61 
 
 
238 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000124945  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2893  peptidase C26  37.34 
 
 
233 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.220365  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1797  glutamine amidotransferase  36.79 
 
 
238 aa  132  5e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.239238  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1031  glutamine amidotransferase  32.44 
 
 
245 aa  131  9e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000341197  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2528  glutamine amidotransferase, class I  40.17 
 
 
250 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2155  peptidase C26  40.17 
 
 
250 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000159832 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0813  peptidase C26  39.91 
 
 
264 aa  130  1.0000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.540694  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0075  peptidase C26  37.09 
 
 
244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.70164  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21880  peptidase C26  37.67 
 
 
231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1477  peptidase C26  42.39 
 
 
237 aa  130  3e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3925  peptidase C26  42.45 
 
 
240 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.792522  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2532  peptidase C26  37.85 
 
 
267 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2941  glutamine amidotransferase related enzyme  35.1 
 
 
237 aa  129  5.0000000000000004e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3356  peptidase C26  31.05 
 
 
238 aa  128  7.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.95955  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1740  peptidase C26  42.92 
 
 
241 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.227165  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2010  peptidase C26  41.13 
 
 
243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0361829  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0416  peptidase C26  42.19 
 
 
264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0393355  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0847  peptidase C26  44.55 
 
 
246 aa  125  7e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0349  peptidase C26  38.18 
 
 
273 aa  124  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.232683  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5207  peptidase C26  38.93 
 
 
255 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.381902 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2706  glutamine amidotransferase  38.61 
 
 
249 aa  123  4e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.078896  normal  0.0560665 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19230  predicted glutamine amidotransferase  34.8 
 
 
273 aa  122  4e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0453236 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3991  hypothetical protein  41.03 
 
 
229 aa  122  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0400316  normal  0.343275 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1852  peptidase C26  40.57 
 
 
238 aa  122  5e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.197074  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3002  peptidase C26  39.25 
 
 
253 aa  122  5e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00604755  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0608  peptidase C26  47.16 
 
 
237 aa  122  6e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.982002  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0053  peptidase C26  35.06 
 
 
256 aa  122  6e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5298  peptidase C26  38.93 
 
 
255 aa  122  8e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.880812  normal  0.49084 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5346  peptidase C26  40.08 
 
 
255 aa  121  8e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.176756 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0954  peptidase C26  35.77 
 
 
264 aa  121  9.999999999999999e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000028221  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2536  peptidase C26  31.85 
 
 
237 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1297  peptidase C26  39.11 
 
 
259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.266099  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2523  peptidase C26  38.06 
 
 
252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2920  peptidase C26  38.79 
 
 
253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.129807  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0108  peptidase C26  40 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3099  peptidase C26  38.79 
 
 
253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.015015  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3226  peptidase C26  44.67 
 
 
285 aa  120  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1701  glutamine amidotransferase, class II/dipeptidase  35.18 
 
 
602 aa  119  3e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0076  peptidase C26  41.15 
 
 
236 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.0652283 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1267  glutamine amidotransferase  39.25 
 
 
253 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0175  peptidase C26  40.98 
 
 
249 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000212098 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1643  glutamine amidotransferase, class I  34.8 
 
 
229 aa  119  4.9999999999999996e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0420698  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1822  peptidase C26  36.69 
 
 
245 aa  119  6e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3033  peptidase C26  35.98 
 
 
254 aa  118  7.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.008786  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04810  predicted glutamine amidotransferase  37.95 
 
 
279 aa  117  9.999999999999999e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00756632  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0799  peptidase C26  40.28 
 
 
235 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08940  predicted glutamine amidotransferase  37.44 
 
 
244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0342497  normal  0.666279 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0837  peptidase C26  41.91 
 
 
277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.347165  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1092  peptidase C26  36.33 
 
 
253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.337501  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2902  peptidase C26  38.55 
 
 
261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3598  peptidase C26  37.85 
 
 
269 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.420407  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0143  peptidase C26  42.86 
 
 
238 aa  116  3e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3960  peptidase C26  37.5 
 
 
313 aa  117  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0591478 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2112  glutamine amidotransferase class-I:peptidase C26  43.83 
 
 
260 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0486861  normal  0.283308 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2318  peptidase C26  37.96 
 
 
269 aa  115  5e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167061  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3248  peptidase C26  39.77 
 
 
251 aa  115  6e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4701  peptidase C26  35 
 
 
272 aa  115  6e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>