More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_3195 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_3195  peptidase C26  100 
 
 
241 aa  474  1e-133  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4227  peptidase C26  53.19 
 
 
260 aa  232  3e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135339  normal  0.255877 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12875  amidotransferase  48.28 
 
 
272 aa  203  2e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.853598  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2465  peptidase C26  47.19 
 
 
247 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000302907  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1757  peptidase C26  48.07 
 
 
231 aa  194  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.721348  normal  0.077261 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1848  peptidase C26  44.58 
 
 
251 aa  180  2e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.845506 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1798  peptidase C26  45.15 
 
 
247 aa  179  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.720671 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1636  peptidase C26  48.02 
 
 
252 aa  177  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.370641  normal  0.14821 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2584  peptidase C26  48.29 
 
 
237 aa  176  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0482191  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2058  peptidase C26  43.64 
 
 
251 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4064  peptidase C26  43.7 
 
 
256 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.529097  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2041  peptidase C26  43.91 
 
 
240 aa  170  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.755428  normal  0.5084 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2104  peptidase C26  43.91 
 
 
240 aa  170  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.297238  normal  0.0236912 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4415  peptidase C26  47.32 
 
 
255 aa  169  4e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2279  peptidase C26  42.68 
 
 
280 aa  163  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.249131 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2077  peptidase C26  44.59 
 
 
233 aa  160  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0651  glutamine amidotransferase class-I  42.27 
 
 
242 aa  156  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.64648  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2184  peptidase C26  42.49 
 
 
275 aa  155  5.0000000000000005e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.297323  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2010  peptidase C26  44.23 
 
 
243 aa  150  2e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0361829  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1878  hypothetical protein  41.23 
 
 
230 aa  150  2e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1349  peptidase C26  41.2 
 
 
240 aa  148  8e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000385212  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3991  hypothetical protein  42.42 
 
 
229 aa  146  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0400316  normal  0.343275 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2718  peptidase C26  38.57 
 
 
242 aa  145  4.0000000000000006e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0577548  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2893  peptidase C26  36.82 
 
 
233 aa  145  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.220365  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0361  peptidase C26  41.7 
 
 
253 aa  145  8.000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1477  peptidase C26  38.98 
 
 
237 aa  142  5e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21880  peptidase C26  38.89 
 
 
231 aa  141  8e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3742  peptidase C26  36.44 
 
 
237 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011892  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2021  peptidase C26  42.06 
 
 
250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2164  peptidase C26  42.45 
 
 
233 aa  138  7.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000115799  hitchhiker  0.0000699279 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3356  peptidase C26  33.33 
 
 
238 aa  137  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.95955  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2162  peptidase C26  35.87 
 
 
238 aa  135  5e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000124945  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19230  predicted glutamine amidotransferase  40.7 
 
 
273 aa  135  6.0000000000000005e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0453236 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0143  peptidase C26  43.23 
 
 
238 aa  134  9e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0444  glutamine amidotransferase class I  37.33 
 
 
241 aa  134  9.999999999999999e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000517  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0082  peptidase C26  39.51 
 
 
236 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.831872  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0063  peptidase C26  36.16 
 
 
242 aa  134  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.542911  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0094  peptidase C26  39.51 
 
 
236 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000432288  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0076  peptidase C26  39.51 
 
 
236 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0053  peptidase C26  37.16 
 
 
256 aa  133  3e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0813  peptidase C26  37.2 
 
 
264 aa  132  3.9999999999999996e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.540694  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2155  peptidase C26  43.16 
 
 
250 aa  132  6.999999999999999e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000159832 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2523  peptidase C26  37.6 
 
 
252 aa  132  6.999999999999999e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2528  glutamine amidotransferase, class I  43.16 
 
 
250 aa  132  6.999999999999999e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0076  peptidase C26  40.25 
 
 
236 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.0652283 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0319  peptidase C26  38.73 
 
 
233 aa  130  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.783639 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1964  peptidase C26  39.83 
 
 
239 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.918763 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2428  peptidase C26  40.65 
 
 
248 aa  129  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_002950  PG1701  glutamine amidotransferase, class II/dipeptidase  36.69 
 
 
602 aa  129  6e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3803  peptidase C26  39.41 
 
 
267 aa  129  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4065  peptidase C26  40.69 
 
 
267 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.641789  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1822  peptidase C26  37.4 
 
 
245 aa  127  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0075  peptidase C26  40.21 
 
 
244 aa  127  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.70164  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3248  peptidase C26  38.77 
 
 
251 aa  126  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5474  peptidase C26  40.97 
 
 
268 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3050  peptidase C26  39.72 
 
 
250 aa  125  9e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5913  peptidase C26  41.41 
 
 
279 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2164  peptidase C26  41.41 
 
 
279 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0799  peptidase C26  40.41 
 
 
235 aa  122  4e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2261  peptidase C26  32.75 
 
 
312 aa  122  4e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0244  glutamine amidotransferase  40.72 
 
 
281 aa  122  5e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.682625  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1963  peptidase C26  37.92 
 
 
254 aa  122  5e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.153313  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1378  peptidase C26  35.11 
 
 
253 aa  122  6e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.735257  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4215  peptidase C26  36.62 
 
 
253 aa  122  7e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3249  peptidase C26  36.48 
 
 
250 aa  121  8e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1945  glutamine amidotransferase, class I  39.13 
 
 
313 aa  121  8e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0746135  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2182  peptidase C26  40.97 
 
 
279 aa  121  9e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.418745  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4207  peptidase C26  38.36 
 
 
298 aa  121  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.914824 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0349  peptidase C26  36.32 
 
 
273 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.232683  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1887  peptidase C26  40.21 
 
 
281 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.192004  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3677  Gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  35.56 
 
 
259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.272698 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0416  peptidase C26  37.17 
 
 
264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0393355  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1031  glutamine amidotransferase  32.29 
 
 
245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000341197  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2813  peptidase C26  36.73 
 
 
269 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04810  predicted glutamine amidotransferase  37.05 
 
 
279 aa  120  3e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00756632  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3375  peptidase C26  35.11 
 
 
259 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.290232 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0921  glutamine amidotransferase, class I  35.11 
 
 
278 aa  119  4.9999999999999996e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.216457  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1082  peptidase C26  37.76 
 
 
259 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.3752 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0982  glutamine amidotransferase, class I  35.11 
 
 
278 aa  119  4.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0438  peptidase C26  37.5 
 
 
255 aa  119  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35287  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1789  glutamine amidotransferase  37.82 
 
 
241 aa  119  4.9999999999999996e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000030649  hitchhiker  5.3956e-25 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2902  peptidase C26  37.17 
 
 
261 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4023  peptidase C26  36.59 
 
 
256 aa  118  7.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2887  peptidase C26  38.33 
 
 
268 aa  118  7.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0730  peptidase C26  33.85 
 
 
238 aa  118  9e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2536  peptidase C26  35.35 
 
 
237 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2381  Gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  39.88 
 
 
255 aa  118  9.999999999999999e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00995781  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1297  peptidase C26  33.2 
 
 
259 aa  117  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.266099  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1649  peptidase C26  38.05 
 
 
267 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2080  peptidase C26  40.09 
 
 
268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.285654  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2987  peptidase C26  35.84 
 
 
274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12430  predicted glutamine amidotransferase  38.12 
 
 
247 aa  116  3e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124059  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2318  peptidase C26  36.73 
 
 
269 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167061  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3040  peptidase C26  36.28 
 
 
279 aa  116  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3598  peptidase C26  36.73 
 
 
269 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.420407  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2532  peptidase C26  35.2 
 
 
267 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2023  glutamine amidotransferase, class I  37.44 
 
 
266 aa  115  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0943  putative glutamine amidotransferase  36.04 
 
 
264 aa  115  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.889039 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2202  peptidase C26  40.09 
 
 
268 aa  115  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1429  glutamine amidotransferase (class I), putative  35.87 
 
 
231 aa  115  6e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>