More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12875 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12875  amidotransferase  100 
 
 
272 aa  541  1e-153  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.853598  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2058  peptidase C26  64.71 
 
 
251 aa  309  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2041  peptidase C26  64.53 
 
 
240 aa  303  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.755428  normal  0.5084 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2104  peptidase C26  64.53 
 
 
240 aa  303  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.297238  normal  0.0236912 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4064  peptidase C26  59.68 
 
 
256 aa  302  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.529097  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2279  peptidase C26  60.91 
 
 
280 aa  294  1e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.249131 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1636  peptidase C26  52.84 
 
 
252 aa  217  1e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.370641  normal  0.14821 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2465  peptidase C26  50.21 
 
 
247 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000302907  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1757  peptidase C26  51.3 
 
 
231 aa  215  5e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.721348  normal  0.077261 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3195  peptidase C26  48.28 
 
 
241 aa  203  2e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2584  peptidase C26  49.15 
 
 
237 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0482191  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2077  peptidase C26  48.94 
 
 
233 aa  188  9e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4227  peptidase C26  45 
 
 
260 aa  187  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135339  normal  0.255877 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1848  peptidase C26  46.81 
 
 
251 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.845506 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1798  peptidase C26  44.86 
 
 
247 aa  178  7e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.720671 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4415  peptidase C26  41.74 
 
 
255 aa  149  4e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1477  peptidase C26  44.44 
 
 
237 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2184  peptidase C26  41.3 
 
 
275 aa  144  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.297323  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2893  peptidase C26  37.45 
 
 
233 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.220365  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2021  peptidase C26  40 
 
 
250 aa  144  2e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2164  peptidase C26  41.22 
 
 
233 aa  143  4e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000115799  hitchhiker  0.0000699279 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1429  glutamine amidotransferase (class I), putative  35.17 
 
 
231 aa  142  7e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1963  peptidase C26  43.56 
 
 
254 aa  138  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.153313  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1964  peptidase C26  40.83 
 
 
239 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.918763 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3991  hypothetical protein  36.32 
 
 
229 aa  136  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0400316  normal  0.343275 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1031  glutamine amidotransferase  33.06 
 
 
245 aa  135  5e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000341197  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0730  peptidase C26  33.78 
 
 
238 aa  134  9.999999999999999e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0651  glutamine amidotransferase class-I  37.19 
 
 
242 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.64648  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3356  peptidase C26  33.06 
 
 
238 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.95955  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1789  glutamine amidotransferase  37.44 
 
 
241 aa  133  3e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000030649  hitchhiker  5.3956e-25 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3742  peptidase C26  35.86 
 
 
237 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011892  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0075  peptidase C26  41.29 
 
 
244 aa  132  7.999999999999999e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.70164  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2155  peptidase C26  39.34 
 
 
250 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000159832 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2528  glutamine amidotransferase, class I  39.34 
 
 
250 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0319  peptidase C26  35.81 
 
 
233 aa  131  1.0000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.783639 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0444  glutamine amidotransferase class I  32.51 
 
 
241 aa  130  2.0000000000000002e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000517  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21880  peptidase C26  37.04 
 
 
231 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4207  peptidase C26  37.5 
 
 
298 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.914824 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0361  peptidase C26  39.42 
 
 
253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0063  peptidase C26  37.91 
 
 
242 aa  130  3e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.542911  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2718  peptidase C26  34.23 
 
 
242 aa  129  4.0000000000000003e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0577548  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0053  peptidase C26  35.63 
 
 
256 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0954  peptidase C26  38.01 
 
 
264 aa  129  7.000000000000001e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000028221  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2010  peptidase C26  38.8 
 
 
243 aa  128  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0361829  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2532  peptidase C26  36.86 
 
 
267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0847  peptidase C26  40.97 
 
 
246 aa  126  3e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12430  predicted glutamine amidotransferase  39.73 
 
 
247 aa  126  3e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124059  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0076  peptidase C26  42.15 
 
 
236 aa  125  7e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0143  peptidase C26  41.63 
 
 
238 aa  125  9e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0094  peptidase C26  44.19 
 
 
236 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000432288  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0982  glutamine amidotransferase, class I  35.51 
 
 
278 aa  124  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0082  peptidase C26  44.19 
 
 
236 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.831872  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1349  peptidase C26  34.8 
 
 
240 aa  124  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000385212  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0921  glutamine amidotransferase, class I  35.51 
 
 
278 aa  124  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.216457  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1378  peptidase C26  34.51 
 
 
253 aa  124  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.735257  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3925  peptidase C26  42.55 
 
 
240 aa  124  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.792522  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1852  peptidase C26  41.15 
 
 
238 aa  124  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.197074  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0799  peptidase C26  35.98 
 
 
235 aa  123  4e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2887  peptidase C26  35.58 
 
 
268 aa  122  4e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1297  peptidase C26  33.72 
 
 
259 aa  123  4e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.266099  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4215  peptidase C26  39.21 
 
 
253 aa  122  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3040  peptidase C26  39.21 
 
 
279 aa  122  6e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1878  hypothetical protein  39.02 
 
 
230 aa  121  9e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0813  peptidase C26  35.42 
 
 
264 aa  122  9e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.540694  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2902  peptidase C26  38.62 
 
 
261 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1643  glutamine amidotransferase, class I  32.07 
 
 
229 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0420698  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2987  peptidase C26  36.29 
 
 
274 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3248  peptidase C26  37.12 
 
 
251 aa  121  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2162  peptidase C26  31.17 
 
 
238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000124945  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0076  peptidase C26  41.63 
 
 
236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.0652283 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1797  glutamine amidotransferase  35.21 
 
 
238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.239238  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0416  peptidase C26  35.41 
 
 
264 aa  120  3e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0393355  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0438  peptidase C26  35.89 
 
 
255 aa  120  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35287  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5871  putative RNA polymerase, sigma 70 family subunit  41.75 
 
 
386 aa  118  9e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.41765  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2261  peptidase C26  30.9 
 
 
312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1701  glutamine amidotransferase, class II/dipeptidase  34 
 
 
602 aa  116  3.9999999999999997e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19230  predicted glutamine amidotransferase  33.06 
 
 
273 aa  116  5e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0453236 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1740  peptidase C26  42.63 
 
 
241 aa  115  6e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.227165  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3226  peptidase C26  37.25 
 
 
285 aa  115  6e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5760  peptidase C26  36.57 
 
 
267 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3012  peptidase C26  38.33 
 
 
261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90022  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6342  peptidase C26  37.8 
 
 
262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1072  peptidase C26  33.33 
 
 
259 aa  113  3e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2379  peptidase C26  38.94 
 
 
261 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.732768  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2993  peptidase C26  38.94 
 
 
261 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2523  peptidase C26  36.9 
 
 
252 aa  112  7.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5207  peptidase C26  34.66 
 
 
255 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.381902 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0570  peptidase C26  30.62 
 
 
240 aa  112  9e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0083889  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5298  peptidase C26  34.12 
 
 
255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.880812  normal  0.49084 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1082  peptidase C26  35.85 
 
 
259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.3752 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1822  peptidase C26  37.89 
 
 
245 aa  111  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2671  peptidase C26  35.2 
 
 
229 aa  111  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0625878 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3050  peptidase C26  36 
 
 
250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5346  peptidase C26  34.12 
 
 
255 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.176756 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1160  peptidase C26  36.71 
 
 
222 aa  110  3e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3002  peptidase C26  32.35 
 
 
253 aa  110  3e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00604755  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1945  glutamine amidotransferase, class I  36 
 
 
313 aa  109  5e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0746135  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3159  peptidase C26  34.32 
 
 
261 aa  109  5e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4408  peptidase C26  36.64 
 
 
262 aa  109  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1017  putative glutamine amidotransferase  34.41 
 
 
238 aa  108  1e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>