More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2428 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2428  peptidase C26  100 
 
 		 248 aa  505  9.999999999999999e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3050  peptidase C26  89.8 
 
 		 250 aa  457  9.999999999999999e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3249  peptidase C26  65.68 
 
 		 250 aa  322  4e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3248  peptidase C26  53.39 
 
 		 251 aa  249  2e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1822  peptidase C26  50.42 
 
 		 245 aa  231  9e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4215  peptidase C26  46.75 
 
 		 253 aa  230  2e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2523  peptidase C26  49.37 
 
 		 252 aa  230  2e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0438  peptidase C26  49.17 
 
 		 255 aa  228  5e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4207  peptidase C26  48.77 
 
 		 298 aa  228  6e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.914824 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0053  peptidase C26  47.03 
 
 		 256 aa  204  8e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2164  peptidase C26  46.44 
 
 		 233 aa  182  3e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000115799  hitchhiker  0.0000699279 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2893  peptidase C26  41.05 
 
 		 233 aa  178  5.999999999999999e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.220365  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0444  glutamine amidotransferase class I  38.46 
 
 		 241 aa  177  1e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000517  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0730  peptidase C26  34.71 
 
 		 238 aa  176  3e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0361  peptidase C26  41.8 
 
 		 253 aa  176  4e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2021  peptidase C26  41.42 
 
 		 250 aa  172  5e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21880  peptidase C26  41.03 
 
 		 231 aa  171  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2162  peptidase C26  38.49 
 
 		 238 aa  170  2e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000124945  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0075  peptidase C26  42.49 
 
 		 244 aa  167  2e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.70164  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3742  peptidase C26  39.41 
 
 		 237 aa  165  5.9999999999999996e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011892  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0319  peptidase C26  43.64 
 
 		 233 aa  164  1.0000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.783639 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1878  hypothetical protein  40.45 
 
 		 230 aa  163  3e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2718  peptidase C26  37.38 
 
 		 242 aa  160  2e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0577548  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3356  peptidase C26  35.83 
 
 		 238 aa  157  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.95955  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1701  glutamine amidotransferase, class II/dipeptidase  40.47 
 
 		 602 aa  154  1e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1789  glutamine amidotransferase  38.01 
 
 		 241 aa  153  2e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000030649  hitchhiker  5.3956e-25 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0799  peptidase C26  38.82 
 
 		 235 aa  152  5e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1349  peptidase C26  39.53 
 
 		 240 aa  151  7e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000385212  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2536  peptidase C26  38.03 
 
 		 237 aa  151  8.999999999999999e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1017  putative glutamine amidotransferase  38.02 
 
 		 238 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0143  peptidase C26  41.91 
 
 		 238 aa  145  9e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0416  peptidase C26  44.91 
 
 		 264 aa  144  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0393355  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1031  glutamine amidotransferase  35.56 
 
 		 245 aa  143  3e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000341197  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04810  predicted glutamine amidotransferase  36.67 
 
 		 279 aa  142  4e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00756632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1757  peptidase C26  40.81 
 
 		 231 aa  142  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.721348  normal  0.077261 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1963  peptidase C26  44.6 
 
 		 254 aa  142  5e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.153313  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2261  peptidase C26  33.33 
 
 		 312 aa  142  7e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2528  glutamine amidotransferase, class I  41.71 
 
 		 250 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2155  peptidase C26  41.71 
 
 		 250 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159832 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0108  peptidase C26  37.26 
 
 		 258 aa  139  4.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3033  peptidase C26  37.77 
 
 		 254 aa  138  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.008786  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1964  peptidase C26  41.67 
 
 		 239 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.918763 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1141  putative transferase  41.62 
 
 		 266 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0928367 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0847  peptidase C26  44.09 
 
 		 246 aa  135  5e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1636  peptidase C26  42.35 
 
 		 252 aa  135  6.0000000000000005e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.370641  normal  0.14821 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1378  peptidase C26  37.16 
 
 		 253 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.735257  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1797  glutamine amidotransferase  39.25 
 
 		 238 aa  135  6.0000000000000005e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.239238  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03870  putative glutamine amidotransferase  40.91 
 
 		 250 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1106  peptidase C26  40.54 
 
 		 268 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.442866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2645  glutamine amidotransferase  38.64 
 
 		 254 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1477  peptidase C26  35.77 
 
 		 237 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0063  peptidase C26  37.91 
 
 		 242 aa  134  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.542911  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1786  peptidase C26  39.72 
 
 		 257 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3012  peptidase C26  36.91 
 
 		 254 aa  132  5e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0175  peptidase C26  39.73 
 
 		 249 aa  131  9e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000212098 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1164  peptidase C26  37.34 
 
 		 253 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.399023  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1072  peptidase C26  36.6 
 
 		 259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1197  peptidase C26  37.34 
 
 		 253 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0734619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4408  peptidase C26  36.32 
 
 		 262 aa  130  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0388  putative glutamine amidotransferase  40.18 
 
 		 250 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.55028  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3194  peptidase C26  37.34 
 
 		 253 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0388042 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3558  peptidase C26  41.15 
 
 		 257 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0982  glutamine amidotransferase, class I  37.44 
 
 		 278 aa  130  3e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1106  peptidase C26  36.91 
 
 		 253 aa  129  3e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00657887  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0651  glutamine amidotransferase class-I  36.63 
 
 		 242 aa  129  3e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.64648  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3195  peptidase C26  40.65 
 
 		 241 aa  129  3e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0921  glutamine amidotransferase, class I  37.44 
 
 		 278 aa  130  3e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.216457  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2179  peptidase C26  41.43 
 
 		 257 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2465  peptidase C26  40.21 
 
 		 247 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000302907  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2010  peptidase C26  38.6 
 
 		 243 aa  129  4.0000000000000003e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0361829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1945  glutamine amidotransferase, class I  38.46 
 
 		 313 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0746135  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3002  peptidase C26  35.34 
 
 		 253 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00604755  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48870  glutamine amidotransferase  40.36 
 
 		 250 aa  129  5.0000000000000004e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0954  peptidase C26  36.98 
 
 		 264 aa  129  6e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000028221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2920  peptidase C26  35.34 
 
 		 253 aa  128  9.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.129807  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0570  peptidase C26  34.6 
 
 		 240 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0083889  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6342  peptidase C26  37.61 
 
 		 262 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0076  peptidase C26  38.89 
 
 		 236 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.0652283 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1775  glutamine amidotransferase  35.62 
 
 		 227 aa  127  1.0000000000000001e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000113696 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3099  peptidase C26  35.34 
 
 		 253 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.015015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19230  predicted glutamine amidotransferase  34.4 
 
 		 273 aa  128  1.0000000000000001e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0453236 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2902  peptidase C26  37.16 
 
 		 261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0813  peptidase C26  34.53 
 
 		 264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.540694  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1267  glutamine amidotransferase  35.34 
 
 		 253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2182  peptidase C26  39.64 
 
 		 279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.418745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0094  peptidase C26  37.96 
 
 		 236 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000432288  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0082  peptidase C26  37.96 
 
 		 236 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.831872  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3226  peptidase C26  39.59 
 
 		 285 aa  126  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0076  peptidase C26  37.96 
 
 		 236 aa  126  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5913  peptidase C26  39.64 
 
 		 279 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2164  peptidase C26  39.64 
 
 		 279 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1643  glutamine amidotransferase, class I  36.84 
 
 		 229 aa  125  5e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0420698  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5346  peptidase C26  39.27 
 
 		 255 aa  125  5e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.176756 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5207  peptidase C26  39.45 
 
 		 255 aa  125  6e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.381902 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0710  peptidase C26  36.89 
 
 		 263 aa  125  6e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.391948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2080  peptidase C26  36.99 
 
 		 268 aa  125  9e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.285654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2532  peptidase C26  35.39 
 
 		 267 aa  124  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2987  peptidase C26  37.61 
 
 		 274 aa  124  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0244  glutamine amidotransferase  35.27 
 
 		 281 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.682625  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1092  peptidase C26  34.22 
 
 		 253 aa  123  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.337501  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>