293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_04810 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_04810  predicted glutamine amidotransferase  100 
 
 
279 aa  572  1.0000000000000001e-162  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00756632  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19230  predicted glutamine amidotransferase  44.07 
 
 
273 aa  213  3.9999999999999995e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0453236 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2162  peptidase C26  39.09 
 
 
238 aa  162  6e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000124945  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3248  peptidase C26  39.11 
 
 
251 aa  155  5.0000000000000005e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0438  peptidase C26  38.39 
 
 
255 aa  154  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35287  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21880  peptidase C26  37.29 
 
 
231 aa  154  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3356  peptidase C26  36.53 
 
 
238 aa  154  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.95955  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0361  peptidase C26  38.77 
 
 
253 aa  151  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0075  peptidase C26  37.95 
 
 
244 aa  150  2e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.70164  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1789  glutamine amidotransferase  37.95 
 
 
241 aa  150  2e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000030649  hitchhiker  5.3956e-25 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0954  peptidase C26  35.77 
 
 
264 aa  149  5e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000028221  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0730  peptidase C26  36.36 
 
 
238 aa  148  7e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1878  hypothetical protein  36.2 
 
 
230 aa  144  1e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2536  peptidase C26  31.78 
 
 
237 aa  144  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3050  peptidase C26  36.16 
 
 
250 aa  144  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4215  peptidase C26  35.91 
 
 
253 aa  143  4e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2428  peptidase C26  36.67 
 
 
248 aa  142  4e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2164  peptidase C26  36.78 
 
 
233 aa  142  6e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000115799  hitchhiker  0.0000699279 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0799  peptidase C26  36.03 
 
 
235 aa  139  3.9999999999999997e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2893  peptidase C26  36.24 
 
 
233 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.220365  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1701  glutamine amidotransferase, class II/dipeptidase  35.32 
 
 
602 aa  139  6e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4207  peptidase C26  36.77 
 
 
298 aa  139  6e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.914824 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0319  peptidase C26  37.66 
 
 
233 aa  137  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.783639 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2261  peptidase C26  32.62 
 
 
312 aa  137  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1017  putative glutamine amidotransferase  35.43 
 
 
238 aa  137  2e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0444  glutamine amidotransferase class I  35.32 
 
 
241 aa  136  4e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000517  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3742  peptidase C26  33.47 
 
 
237 aa  136  4e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011892  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1822  peptidase C26  37.84 
 
 
245 aa  135  5e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2523  peptidase C26  37.84 
 
 
252 aa  134  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0082  peptidase C26  37.92 
 
 
236 aa  133  3e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.831872  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0076  peptidase C26  37.92 
 
 
236 aa  132  5e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0094  peptidase C26  37.92 
 
 
236 aa  132  5e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000432288  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2021  peptidase C26  34.52 
 
 
250 aa  131  1.0000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1963  peptidase C26  37.18 
 
 
254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.153313  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0076  peptidase C26  36.67 
 
 
236 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.0652283 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2010  peptidase C26  37.39 
 
 
243 aa  129  5.0000000000000004e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0361829  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3249  peptidase C26  36.65 
 
 
250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1349  peptidase C26  34.04 
 
 
240 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000385212  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0616  peptidase C26  41.67 
 
 
245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.206585  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0143  peptidase C26  37.82 
 
 
238 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1072  peptidase C26  38.55 
 
 
259 aa  125  5e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2718  peptidase C26  33.86 
 
 
242 aa  125  7e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0577548  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0063  peptidase C26  35.19 
 
 
242 aa  124  2e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.542911  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01275  gamma-Glu-GABA hydrolase  31.58 
 
 
254 aa  122  5e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01286  hypothetical protein  31.58 
 
 
254 aa  122  5e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0053  peptidase C26  33.19 
 
 
256 aa  122  5e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2348  peptidase C26  31.58 
 
 
254 aa  122  8e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.388942  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1413  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  31.58 
 
 
254 aa  122  8e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2327  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  31.58 
 
 
254 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1508  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  31.58 
 
 
254 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1940  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  31.82 
 
 
250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.343934 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2887  peptidase C26  34.19 
 
 
268 aa  120  3e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3677  Gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  33.2 
 
 
259 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.272698 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3195  peptidase C26  37.05 
 
 
241 aa  120  3e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6978  peptidase C26  33.91 
 
 
275 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.788826  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1824  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  31.82 
 
 
250 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0824878 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0651  glutamine amidotransferase class-I  34.16 
 
 
242 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.64648  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2465  peptidase C26  35.66 
 
 
247 aa  119  7e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000302907  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4408  peptidase C26  34.15 
 
 
262 aa  119  7.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2671  peptidase C26  37.95 
 
 
229 aa  118  9e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0625878 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1477  peptidase C26  33.33 
 
 
237 aa  116  3e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1031  glutamine amidotransferase  33.59 
 
 
245 aa  116  3e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000341197  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3375  peptidase C26  32.41 
 
 
259 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.290232 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1797  glutamine amidotransferase  36.76 
 
 
238 aa  116  3.9999999999999997e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.239238  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4227  peptidase C26  34.85 
 
 
260 aa  116  5e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135339  normal  0.255877 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1775  glutamine amidotransferase  35.15 
 
 
227 aa  115  5e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000113696 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1636  peptidase C26  38.03 
 
 
252 aa  115  6e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.370641  normal  0.14821 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2532  peptidase C26  37.38 
 
 
267 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1964  peptidase C26  30.95 
 
 
239 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.918763 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1848  peptidase C26  35.19 
 
 
251 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.845506 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1757  peptidase C26  34.55 
 
 
231 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.721348  normal  0.077261 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1160  peptidase C26  34.44 
 
 
222 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0570  peptidase C26  30.52 
 
 
240 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0083889  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08940  predicted glutamine amidotransferase  36.19 
 
 
244 aa  114  3e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0342497  normal  0.666279 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2067  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  32.09 
 
 
253 aa  113  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3790  hypothetical protein  35.68 
 
 
254 aa  112  7.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3012  peptidase C26  34.63 
 
 
254 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3571  peptidase C26  37.32 
 
 
247 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5913  peptidase C26  35.81 
 
 
279 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2164  peptidase C26  35.81 
 
 
279 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0388  putative glutamine amidotransferase  36.36 
 
 
250 aa  109  5e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.55028  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48870  glutamine amidotransferase  35.27 
 
 
250 aa  109  5e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0943  putative glutamine amidotransferase  34.91 
 
 
264 aa  109  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.889039 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5474  peptidase C26  35.81 
 
 
268 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3313  peptidase C26  38.76 
 
 
305 aa  108  8.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3963  peptidase C26  38.76 
 
 
305 aa  108  8.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0830128  normal  0.322468 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4597  peptidase C26  34.78 
 
 
307 aa  108  9.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0982  glutamine amidotransferase, class I  34.45 
 
 
278 aa  108  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2182  peptidase C26  35.37 
 
 
279 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.418745  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0921  glutamine amidotransferase, class I  34.45 
 
 
278 aa  108  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.216457  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1852  peptidase C26  33.94 
 
 
238 aa  107  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.197074  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4701  peptidase C26  36.67 
 
 
272 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2816  peptidase C26  35.1 
 
 
255 aa  107  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2865  peptidase C26  34.13 
 
 
256 aa  107  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.136742  normal  0.196965 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2077  peptidase C26  36.89 
 
 
233 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3960  peptidase C26  36.11 
 
 
313 aa  107  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0591478 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4415  peptidase C26  34.36 
 
 
255 aa  107  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2381  Gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  34.55 
 
 
255 aa  107  3e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00995781  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4667  peptidase C26  34.91 
 
 
264 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03870  putative glutamine amidotransferase  35.89 
 
 
250 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>