286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_08940 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_08940  predicted glutamine amidotransferase  100 
 
 
244 aa  508  1e-143  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0342497  normal  0.666279 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2887  peptidase C26  41.03 
 
 
268 aa  167  1e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1878  hypothetical protein  33.06 
 
 
230 aa  135  6.0000000000000005e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0570  peptidase C26  34.93 
 
 
240 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0083889  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1349  peptidase C26  35.61 
 
 
240 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000385212  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0730  peptidase C26  32.89 
 
 
238 aa  125  6e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0319  peptidase C26  39.9 
 
 
233 aa  125  9e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.783639 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2428  peptidase C26  35.37 
 
 
248 aa  124  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0799  peptidase C26  34.14 
 
 
235 aa  123  3e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1017  putative glutamine amidotransferase  38.53 
 
 
238 aa  121  9e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3050  peptidase C26  34.93 
 
 
250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2021  peptidase C26  34.08 
 
 
250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2465  peptidase C26  37.96 
 
 
247 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000302907  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21880  peptidase C26  32.46 
 
 
231 aa  119  6e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3356  peptidase C26  30.77 
 
 
238 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.95955  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2162  peptidase C26  31.69 
 
 
238 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000124945  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1636  peptidase C26  38.57 
 
 
252 aa  116  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.370641  normal  0.14821 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2010  peptidase C26  39.42 
 
 
243 aa  115  5e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0361829  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0837  peptidase C26  35.78 
 
 
277 aa  115  6.9999999999999995e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.347165  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1477  peptidase C26  36.49 
 
 
237 aa  115  7.999999999999999e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2164  peptidase C26  36.36 
 
 
233 aa  114  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000115799  hitchhiker  0.0000699279 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04810  predicted glutamine amidotransferase  36.19 
 
 
279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00756632  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3742  peptidase C26  32.35 
 
 
237 aa  113  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011892  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3248  peptidase C26  32.81 
 
 
251 aa  112  5e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0954  peptidase C26  35.91 
 
 
264 aa  112  5e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000028221  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2816  peptidase C26  31.71 
 
 
255 aa  112  6e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1797  glutamine amidotransferase  35.43 
 
 
238 aa  112  8.000000000000001e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.239238  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0982  glutamine amidotransferase, class I  31.87 
 
 
278 aa  111  9e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2155  peptidase C26  39.06 
 
 
250 aa  111  9e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000159832 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0921  glutamine amidotransferase, class I  31.87 
 
 
278 aa  111  9e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.216457  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2528  glutamine amidotransferase, class I  39.06 
 
 
250 aa  111  9e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0361  peptidase C26  36.1 
 
 
253 aa  110  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0053  peptidase C26  35.58 
 
 
256 aa  109  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1964  peptidase C26  33.2 
 
 
239 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.918763 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3249  peptidase C26  37.99 
 
 
250 aa  108  6e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2523  peptidase C26  34.65 
 
 
252 aa  107  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2893  peptidase C26  31.08 
 
 
233 aa  107  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.220365  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0651  glutamine amidotransferase class-I  34.31 
 
 
242 aa  107  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.64648  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19230  predicted glutamine amidotransferase  32.73 
 
 
273 aa  107  2e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0453236 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1378  peptidase C26  31.1 
 
 
253 aa  107  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.735257  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1757  peptidase C26  36.41 
 
 
231 aa  106  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.721348  normal  0.077261 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2941  glutamine amidotransferase related enzyme  35.05 
 
 
237 aa  105  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2009  peptidase C26  35.63 
 
 
245 aa  106  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2077  peptidase C26  38.43 
 
 
233 aa  105  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1822  peptidase C26  33.62 
 
 
245 aa  105  6e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0076  peptidase C26  33.18 
 
 
236 aa  105  8e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.0652283 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1852  peptidase C26  38.14 
 
 
238 aa  105  8e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.197074  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2041  peptidase C26  37.56 
 
 
240 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.755428  normal  0.5084 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1082  peptidase C26  34.08 
 
 
259 aa  104  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.3752 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2058  peptidase C26  38.07 
 
 
251 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2104  peptidase C26  37.56 
 
 
240 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.297238  normal  0.0236912 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2718  peptidase C26  30.64 
 
 
242 aa  103  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0577548  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2261  peptidase C26  35 
 
 
312 aa  103  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0082  peptidase C26  32.79 
 
 
236 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.831872  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0094  peptidase C26  32.79 
 
 
236 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000432288  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3375  peptidase C26  36.84 
 
 
259 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.290232 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3790  hypothetical protein  34.51 
 
 
254 aa  102  7e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4408  peptidase C26  33.06 
 
 
262 aa  102  8e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12875  amidotransferase  38.66 
 
 
272 aa  102  8e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.853598  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4227  peptidase C26  35.29 
 
 
260 aa  102  8e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135339  normal  0.255877 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4207  peptidase C26  34.76 
 
 
298 aa  101  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.914824 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3677  Gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  36.36 
 
 
259 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.272698 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0076  peptidase C26  32.38 
 
 
236 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2536  peptidase C26  28.16 
 
 
237 aa  101  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2318  peptidase C26  32.58 
 
 
269 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167061  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3598  peptidase C26  31.67 
 
 
269 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.420407  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0075  peptidase C26  33.33 
 
 
244 aa  100  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.70164  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0710  peptidase C26  34.39 
 
 
263 aa  100  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.391948  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3097  peptidase C26  31.67 
 
 
269 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.925767  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1031  glutamine amidotransferase  27.42 
 
 
245 aa  100  2e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000341197  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03870  putative glutamine amidotransferase  31.25 
 
 
250 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0143  peptidase C26  37 
 
 
238 aa  100  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1701  glutamine amidotransferase, class II/dipeptidase  31.88 
 
 
602 aa  99.8  4e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4415  peptidase C26  34.47 
 
 
255 aa  99.8  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1963  peptidase C26  34.09 
 
 
254 aa  99.4  5e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.153313  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2584  peptidase C26  35.14 
 
 
237 aa  99.4  5e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0482191  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4137  peptidase C26  34.31 
 
 
251 aa  99  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0847  peptidase C26  34.65 
 
 
246 aa  98.6  7e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0388  putative glutamine amidotransferase  31.42 
 
 
250 aa  99  7e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.55028  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4064  peptidase C26  37.81 
 
 
256 aa  98.6  7e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.529097  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0983  peptidase C26  34.31 
 
 
396 aa  98.6  8e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.290196  normal  0.093467 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0545  peptidase C26  34.31 
 
 
396 aa  98.6  8e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.839837  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1024  peptidase C26  34.31 
 
 
396 aa  98.6  8e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2865  peptidase C26  31.6 
 
 
256 aa  98.6  8e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.136742  normal  0.196965 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1789  glutamine amidotransferase  31.11 
 
 
241 aa  98.6  9e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000030649  hitchhiker  5.3956e-25 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1267  glutamine amidotransferase  31.33 
 
 
253 aa  97.8  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1160  peptidase C26  32.79 
 
 
222 aa  98.2  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0063  peptidase C26  31.92 
 
 
242 aa  98.2  1e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.542911  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0900  peptidase C26  34.31 
 
 
399 aa  97.1  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.332784  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0888  peptidase C26  34.31 
 
 
427 aa  97.4  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2671  peptidase C26  30.59 
 
 
229 aa  97.1  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0625878 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0616  peptidase C26  32.21 
 
 
245 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.206585  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2279  peptidase C26  38.07 
 
 
280 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.249131 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3226  peptidase C26  37.36 
 
 
285 aa  97.1  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0444  glutamine amidotransferase class I  30.24 
 
 
241 aa  96.7  3e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000517  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2813  peptidase C26  31.36 
 
 
269 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3960  peptidase C26  34.09 
 
 
313 aa  96.7  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0591478 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3313  peptidase C26  35.68 
 
 
305 aa  96.3  4e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3963  peptidase C26  35.68 
 
 
305 aa  96.3  4e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0830128  normal  0.322468 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4597  peptidase C26  35.96 
 
 
307 aa  95.9  5e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>