266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3960 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3960  peptidase C26  100 
 
 		 313 aa  649    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0591478 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4701  peptidase C26  86.92 
 
 		 272 aa  481  1e-135  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4597  peptidase C26  68.98 
 
 		 307 aa  389  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5208  peptidase C26  69.2 
 
 		 295 aa  379  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0917  peptidase C26  67.79 
 
 		 293 aa  379  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.119037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3313  peptidase C26  66.42 
 
 		 305 aa  373  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3963  peptidase C26  66.42 
 
 		 305 aa  373  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0830128  normal  0.322468 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0108  peptidase C26  57.75 
 
 		 258 aa  314  9.999999999999999e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1141  putative transferase  51.55 
 
 		 266 aa  250  3e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0928367 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1549  peptidase C26  48.64 
 
 		 258 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2112  glutamine amidotransferase class-I:peptidase C26  48.05 
 
 		 260 aa  238  6.999999999999999e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0486861  normal  0.283308 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3226  peptidase C26  46.24 
 
 		 285 aa  236  3e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0717  peptidase C26  48.05 
 
 		 479 aa  229  5e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.777258  normal  0.355316 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3033  peptidase C26  47.27 
 
 		 493 aa  228  9e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.998523  decreased coverage  0.0021965 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0888  peptidase C26  46.54 
 
 		 427 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2371  peptidase C26  47.43 
 
 		 405 aa  223  3e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.167921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0900  peptidase C26  46.54 
 
 		 399 aa  223  3e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.332784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1617  glutamine amidotransferase, class I  46.15 
 
 		 444 aa  223  3e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0983  peptidase C26  46.15 
 
 		 396 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.290196  normal  0.093467 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0545  peptidase C26  46.15 
 
 		 396 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.839837  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1024  peptidase C26  46.15 
 
 		 396 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0954  putative amidotransferase  46.8 
 
 		 251 aa  218  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.716357 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0973  glutamine amidotransferase, class I  45 
 
 		 444 aa  217  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0173  peptidase C26  45 
 
 		 444 aa  217  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3017  glutamine amidotransferase, class I  45 
 
 		 442 aa  217  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2970  peptidase C26  45 
 
 		 442 aa  217  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.397336  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2910  peptidase C26  45 
 
 		 442 aa  217  2e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.486072  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2602  peptidase C26  45 
 
 		 444 aa  217  2e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.160668  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0455  glutamine amidotransferase, class I  45 
 
 		 356 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4137  peptidase C26  45.67 
 
 		 251 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1789  glutamine amidotransferase  38.25 
 
 		 241 aa  136  5e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000030649  hitchhiker  5.3956e-25 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0361  peptidase C26  43.56 
 
 		 253 aa  133  3.9999999999999996e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1072  peptidase C26  39.06 
 
 		 259 aa  129  9.000000000000001e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0730  peptidase C26  39.52 
 
 		 238 aa  125  9e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4215  peptidase C26  37.63 
 
 		 253 aa  121  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1963  peptidase C26  42.86 
 
 		 254 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.153313  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1017  putative glutamine amidotransferase  37.38 
 
 		 238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0075  peptidase C26  35.51 
 
 		 244 aa  118  9.999999999999999e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.70164  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0444  glutamine amidotransferase class I  34.09 
 
 		 241 aa  117  1.9999999999999998e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000517  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3248  peptidase C26  42.42 
 
 		 251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0053  peptidase C26  41.67 
 
 		 256 aa  117  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1636  peptidase C26  37.5 
 
 		 252 aa  116  3.9999999999999997e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.370641  normal  0.14821 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0438  peptidase C26  33.62 
 
 		 255 aa  115  7.999999999999999e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2164  peptidase C26  34.05 
 
 		 233 aa  115  7.999999999999999e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000115799  hitchhiker  0.0000699279 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3050  peptidase C26  38.15 
 
 		 250 aa  115  7.999999999999999e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0570  peptidase C26  33.78 
 
 		 240 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0083889  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0799  peptidase C26  37.76 
 
 		 235 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21880  peptidase C26  34.59 
 
 		 231 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0319  peptidase C26  35.37 
 
 		 233 aa  114  3e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.783639 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2428  peptidase C26  36.46 
 
 		 248 aa  113  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0143  peptidase C26  35.76 
 
 		 238 aa  112  6e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4207  peptidase C26  36.9 
 
 		 298 aa  112  8.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.914824 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2155  peptidase C26  39.51 
 
 		 250 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159832 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2528  glutamine amidotransferase, class I  39.51 
 
 		 250 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1852  peptidase C26  36.61 
 
 		 238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.197074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1031  glutamine amidotransferase  32.06 
 
 		 245 aa  110  4.0000000000000004e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000341197  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1477  peptidase C26  39.39 
 
 		 237 aa  109  8.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2523  peptidase C26  34.76 
 
 		 252 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3356  peptidase C26  27.51 
 
 		 238 aa  108  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.95955  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2021  peptidase C26  31.42 
 
 		 250 aa  107  3e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1797  glutamine amidotransferase  33.6 
 
 		 238 aa  107  3e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.239238  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04810  predicted glutamine amidotransferase  36.11 
 
 		 279 aa  107  3e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00756632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4415  peptidase C26  34.31 
 
 		 255 aa  107  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2162  peptidase C26  33.33 
 
 		 238 aa  106  7e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000124945  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2887  peptidase C26  31.42 
 
 		 268 aa  105  7e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1082  peptidase C26  36.5 
 
 		 259 aa  105  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.3752 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0954  peptidase C26  34.21 
 
 		 264 aa  105  1e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000028221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3947  peptidase C26  38.64 
 
 		 261 aa  105  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0505393  normal  0.911745 
 
 
-
 
NC_002950  PG1701  glutamine amidotransferase, class II/dipeptidase  33.05 
 
 		 602 aa  103  3e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1848  peptidase C26  36.64 
 
 		 251 aa  103  4e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.845506 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0616  peptidase C26  35.89 
 
 		 245 aa  103  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.206585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19230  predicted glutamine amidotransferase  36.14 
 
 		 273 aa  102  7e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0453236 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1775  glutamine amidotransferase  34.63 
 
 		 227 aa  102  7e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000113696 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2987  peptidase C26  36.68 
 
 		 274 aa  102  7e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0063  peptidase C26  29.25 
 
 		 242 aa  102  1e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.542911  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2041  peptidase C26  34.23 
 
 		 240 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.755428  normal  0.5084 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0943  putative glutamine amidotransferase  34.25 
 
 		 264 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.889039 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1378  peptidase C26  37.65 
 
 		 253 aa  101  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.735257  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2058  peptidase C26  34.23 
 
 		 251 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1822  peptidase C26  35.67 
 
 		 245 aa  101  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2104  peptidase C26  34.23 
 
 		 240 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.297238  normal  0.0236912 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0982  glutamine amidotransferase, class I  39.41 
 
 		 278 aa  100  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0921  glutamine amidotransferase, class I  39.41 
 
 		 278 aa  100  3e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.216457  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1349  peptidase C26  31.33 
 
 		 240 aa  100  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000385212  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3790  hypothetical protein  33.01 
 
 		 254 aa  99.8  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1429  glutamine amidotransferase (class I), putative  32.49 
 
 		 231 aa  99.8  5e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0349  peptidase C26  33.64 
 
 		 273 aa  99.4  6e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.232683  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2532  peptidase C26  32.91 
 
 		 267 aa  99.4  6e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2536  peptidase C26  30 
 
 		 237 aa  99.4  7e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2279  peptidase C26  38.97 
 
 		 280 aa  99  8e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249131 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3097  peptidase C26  36 
 
 		 269 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.925767  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2718  peptidase C26  32.46 
 
 		 242 aa  98.6  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0577548  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2381  Gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  37.1 
 
 		 255 aa  98.6  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00995781  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4667  peptidase C26  34.62 
 
 		 264 aa  98.6  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1643  glutamine amidotransferase, class I  29.56 
 
 		 229 aa  98.2  2e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0420698  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2813  peptidase C26  35.9 
 
 		 269 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2893  peptidase C26  30.93 
 
 		 233 aa  97.4  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.220365  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1757  peptidase C26  38.89 
 
 		 231 aa  97.1  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.721348  normal  0.077261 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1367  peptidase C26  33.61 
 
 		 239 aa  97.4  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2902  peptidase C26  38.24 
 
 		 261 aa  97.1  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>