265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5208 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_5208  peptidase C26  100 
 
 		 295 aa  611  9.999999999999999e-175  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4597  peptidase C26  79.36 
 
 		 307 aa  454  1e-127  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3313  peptidase C26  76.7 
 
 		 305 aa  441  1e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3963  peptidase C26  76.7 
 
 		 305 aa  441  1e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0830128  normal  0.322468 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0917  peptidase C26  72.83 
 
 		 293 aa  404  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.119037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4701  peptidase C26  70.88 
 
 		 272 aa  388  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3960  peptidase C26  69.2 
 
 		 313 aa  379  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0591478 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0108  peptidase C26  56.27 
 
 		 258 aa  296  2e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2112  glutamine amidotransferase class-I:peptidase C26  48.44 
 
 		 260 aa  245  8e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0486861  normal  0.283308 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1141  putative transferase  48.48 
 
 		 266 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0928367 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1549  peptidase C26  47.19 
 
 		 258 aa  229  3e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3226  peptidase C26  45.9 
 
 		 285 aa  228  1e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3033  peptidase C26  47.64 
 
 		 493 aa  224  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.998523  decreased coverage  0.0021965 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0717  peptidase C26  47.24 
 
 		 479 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.777258  normal  0.355316 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0888  peptidase C26  44.32 
 
 		 427 aa  219  3e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0900  peptidase C26  44.32 
 
 		 399 aa  219  5e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.332784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1617  glutamine amidotransferase, class I  44.66 
 
 		 444 aa  217  1e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0545  peptidase C26  44.06 
 
 		 396 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.839837  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1024  peptidase C26  44.06 
 
 		 396 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0983  peptidase C26  44.06 
 
 		 396 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.290196  normal  0.093467 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0954  putative amidotransferase  47.2 
 
 		 251 aa  216  4e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.716357 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2371  peptidase C26  46.06 
 
 		 405 aa  216  4e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.167921  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0455  glutamine amidotransferase, class I  44.27 
 
 		 356 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3017  glutamine amidotransferase, class I  44.27 
 
 		 442 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2970  peptidase C26  44.27 
 
 		 442 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.397336  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0973  glutamine amidotransferase, class I  44.27 
 
 		 444 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0173  peptidase C26  44.27 
 
 		 444 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2602  peptidase C26  44.27 
 
 		 444 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.160668  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2910  peptidase C26  44.27 
 
 		 442 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.486072  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4137  peptidase C26  43.58 
 
 		 251 aa  210  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0730  peptidase C26  32.1 
 
 		 238 aa  124  1e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1797  glutamine amidotransferase  36.82 
 
 		 238 aa  122  5e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.239238  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0444  glutamine amidotransferase class I  31.56 
 
 		 241 aa  122  6e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000517  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0053  peptidase C26  37.5 
 
 		 256 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2164  peptidase C26  35.47 
 
 		 233 aa  120  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000115799  hitchhiker  0.0000699279 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0361  peptidase C26  36.6 
 
 		 253 aa  116  3.9999999999999997e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3248  peptidase C26  37.19 
 
 		 251 aa  113  5e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1789  glutamine amidotransferase  33.81 
 
 		 241 aa  113  5e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000030649  hitchhiker  5.3956e-25 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3050  peptidase C26  33.92 
 
 		 250 aa  112  9e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2021  peptidase C26  30.57 
 
 		 250 aa  112  9e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0799  peptidase C26  36.36 
 
 		 235 aa  111  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1643  glutamine amidotransferase, class I  33.01 
 
 		 229 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0420698  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1072  peptidase C26  33.74 
 
 		 259 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1031  glutamine amidotransferase  31.46 
 
 		 245 aa  111  2.0000000000000002e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000341197  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21880  peptidase C26  31.28 
 
 		 231 aa  110  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0063  peptidase C26  30.73 
 
 		 242 aa  109  6e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.542911  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1017  putative glutamine amidotransferase  38 
 
 		 238 aa  109  7.000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2428  peptidase C26  32.61 
 
 		 248 aa  108  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1963  peptidase C26  40.99 
 
 		 254 aa  106  4e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.153313  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1701  glutamine amidotransferase, class II/dipeptidase  31.25 
 
 		 602 aa  105  6e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0570  peptidase C26  32.55 
 
 		 240 aa  104  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0083889  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04810  predicted glutamine amidotransferase  35.8 
 
 		 279 aa  104  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00756632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1082  peptidase C26  36 
 
 		 259 aa  103  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.3752 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0319  peptidase C26  34.67 
 
 		 233 aa  103  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.783639 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3947  peptidase C26  39.44 
 
 		 261 aa  103  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0505393  normal  0.911745 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1429  glutamine amidotransferase (class I), putative  32.54 
 
 		 231 aa  103  4e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0794  hypothetical protein  36.19 
 
 		 267 aa  102  7e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1636  peptidase C26  34.85 
 
 		 252 aa  102  7e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.370641  normal  0.14821 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2162  peptidase C26  30.7 
 
 		 238 aa  101  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000124945  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1111  peptidase C26  38.67 
 
 		 246 aa  101  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.517876 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0143  peptidase C26  34.86 
 
 		 238 aa  102  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01275  gamma-Glu-GABA hydrolase  30.62 
 
 		 254 aa  101  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0729  glutamine amidotransferase  34.04 
 
 		 266 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.30779  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01286  hypothetical protein  30.62 
 
 		 254 aa  101  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1824  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  31.01 
 
 		 250 aa  100  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0824878 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1508  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  31.01 
 
 		 254 aa  100  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1940  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  31.01 
 
 		 250 aa  101  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.343934 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2327  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  31.01 
 
 		 254 aa  100  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3356  peptidase C26  27.39 
 
 		 238 aa  101  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.95955  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2532  peptidase C26  33.94 
 
 		 267 aa  100  4e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4215  peptidase C26  34.01 
 
 		 253 aa  100  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4415  peptidase C26  34.69 
 
 		 255 aa  100  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.663907 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2348  peptidase C26  30.62 
 
 		 254 aa  99.8  5e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.388942  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4227  peptidase C26  35.05 
 
 		 260 aa  99.8  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135339  normal  0.255877 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1413  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  30.62 
 
 		 254 aa  99.8  5e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2465  peptidase C26  35.06 
 
 		 247 aa  99.8  5e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000302907  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1945  glutamine amidotransferase, class I  33.19 
 
 		 313 aa  99  8e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0746135  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0637  glutamine amidotransferase  33.62 
 
 		 266 aa  99  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2813  peptidase C26  34.84 
 
 		 269 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4207  peptidase C26  35.36 
 
 		 298 aa  98.6  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.914824 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2023  glutamine amidotransferase, class I  33.19 
 
 		 266 aa  97.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1822  peptidase C26  34.17 
 
 		 245 aa  97.8  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3571  peptidase C26  31.6 
 
 		 247 aa  98.2  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0847  peptidase C26  32.45 
 
 		 246 aa  97.8  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3790  hypothetical protein  31.6 
 
 		 254 aa  98.2  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0616  peptidase C26  35.32 
 
 		 245 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.206585  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3598  peptidase C26  35.19 
 
 		 269 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.420407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3097  peptidase C26  35.19 
 
 		 269 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.925767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1878  hypothetical protein  33.52 
 
 		 230 aa  97.4  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0438  peptidase C26  36.26 
 
 		 255 aa  97.1  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1349  peptidase C26  35.12 
 
 		 240 aa  96.7  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000385212  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0943  putative glutamine amidotransferase  32.47 
 
 		 264 aa  96.7  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.889039 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2318  peptidase C26  35.19 
 
 		 269 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1852  peptidase C26  35.8 
 
 		 238 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.197074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5474  peptidase C26  32.33 
 
 		 268 aa  95.9  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1367  peptidase C26  34.19 
 
 		 239 aa  95.1  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1477  peptidase C26  38.24 
 
 		 237 aa  95.1  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2893  peptidase C26  30.1 
 
 		 233 aa  95.1  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.220365  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0349  peptidase C26  33.33 
 
 		 273 aa  94.4  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.232683  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5760  peptidase C26  36.45 
 
 		 267 aa  94.4  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>