More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1775 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_1775  glutamine amidotransferase  100 
 
 
227 aa  464  9.999999999999999e-131  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000113696 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1031  glutamine amidotransferase  38.97 
 
 
245 aa  154  2e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000341197  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0063  peptidase C26  38.68 
 
 
242 aa  149  3e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.542911  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0444  glutamine amidotransferase class I  41.67 
 
 
241 aa  146  2.0000000000000003e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000517  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2893  peptidase C26  37.97 
 
 
233 aa  145  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.220365  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21880  peptidase C26  36.8 
 
 
231 aa  145  6e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1797  glutamine amidotransferase  34.74 
 
 
238 aa  143  2e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.239238  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1701  glutamine amidotransferase, class II/dipeptidase  35.09 
 
 
602 aa  142  5e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2021  peptidase C26  36.36 
 
 
250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0730  peptidase C26  36.02 
 
 
238 aa  139  3e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0075  peptidase C26  37.5 
 
 
244 aa  139  3.9999999999999997e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.70164  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0319  peptidase C26  38.86 
 
 
233 aa  137  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.783639 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2164  peptidase C26  36.67 
 
 
233 aa  130  1.0000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000115799  hitchhiker  0.0000699279 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1349  peptidase C26  36.44 
 
 
240 aa  128  7.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000385212  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2428  peptidase C26  35.62 
 
 
248 aa  127  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3050  peptidase C26  35.35 
 
 
250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0361  peptidase C26  35.14 
 
 
253 aa  126  3e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2523  peptidase C26  33.33 
 
 
252 aa  126  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0143  peptidase C26  35.96 
 
 
238 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1878  hypothetical protein  36.92 
 
 
230 aa  125  4.0000000000000003e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0053  peptidase C26  33.99 
 
 
256 aa  125  6e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1963  peptidase C26  36.29 
 
 
254 aa  125  6e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.153313  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1789  glutamine amidotransferase  34.5 
 
 
241 aa  124  8.000000000000001e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000030649  hitchhiker  5.3956e-25 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3248  peptidase C26  38.25 
 
 
251 aa  124  9e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3742  peptidase C26  37.39 
 
 
237 aa  124  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011892  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2162  peptidase C26  35.96 
 
 
238 aa  124  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000124945  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0799  peptidase C26  36.7 
 
 
235 aa  122  3e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0570  peptidase C26  34.25 
 
 
240 aa  121  7e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0083889  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0076  peptidase C26  33.48 
 
 
236 aa  121  8e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0094  peptidase C26  33.48 
 
 
236 aa  121  8e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000432288  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0082  peptidase C26  33.48 
 
 
236 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.831872  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2536  peptidase C26  30.53 
 
 
237 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4207  peptidase C26  37.78 
 
 
298 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.914824 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0438  peptidase C26  36.41 
 
 
255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35287  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3356  peptidase C26  31.3 
 
 
238 aa  119  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.95955  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1852  peptidase C26  32.86 
 
 
238 aa  118  9e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.197074  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2261  peptidase C26  36.22 
 
 
312 aa  116  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1141  putative transferase  35.96 
 
 
266 aa  116  3e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0928367 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04810  predicted glutamine amidotransferase  35.15 
 
 
279 aa  115  3.9999999999999997e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00756632  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0608  peptidase C26  37.06 
 
 
237 aa  115  6.9999999999999995e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.982002  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1822  peptidase C26  36.26 
 
 
245 aa  114  8.999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4215  peptidase C26  33.15 
 
 
253 aa  114  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1160  peptidase C26  32.3 
 
 
222 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3249  peptidase C26  35.78 
 
 
250 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0076  peptidase C26  32.47 
 
 
236 aa  111  9e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.0652283 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1643  glutamine amidotransferase, class I  34.43 
 
 
229 aa  110  1.0000000000000001e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0420698  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4415  peptidase C26  32.42 
 
 
255 aa  108  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3963  peptidase C26  34.12 
 
 
305 aa  106  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0830128  normal  0.322468 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1636  peptidase C26  31.37 
 
 
252 aa  107  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.370641  normal  0.14821 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1740  peptidase C26  31.14 
 
 
241 aa  107  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.227165  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3313  peptidase C26  34.12 
 
 
305 aa  106  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1429  glutamine amidotransferase (class I), putative  34.04 
 
 
231 aa  106  3e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1017  putative glutamine amidotransferase  34.24 
 
 
238 aa  106  3e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5760  peptidase C26  35.33 
 
 
267 aa  105  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4408  peptidase C26  33.33 
 
 
262 aa  105  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2671  peptidase C26  37.43 
 
 
229 aa  105  5e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0625878 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1367  peptidase C26  32.39 
 
 
239 aa  105  6e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2465  peptidase C26  31.05 
 
 
247 aa  104  9e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000302907  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0954  putative amidotransferase  38.65 
 
 
251 aa  104  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.716357 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2718  peptidase C26  34.76 
 
 
242 aa  104  1e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0577548  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2112  glutamine amidotransferase class-I:peptidase C26  38.18 
 
 
260 aa  103  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0486861  normal  0.283308 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0813  peptidase C26  31.75 
 
 
264 aa  103  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.540694  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19230  predicted glutamine amidotransferase  32.3 
 
 
273 aa  103  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0453236 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2041  peptidase C26  34.91 
 
 
240 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.755428  normal  0.5084 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2058  peptidase C26  34.91 
 
 
251 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1072  peptidase C26  36.93 
 
 
259 aa  103  3e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2104  peptidase C26  34.91 
 
 
240 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.297238  normal  0.0236912 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3925  peptidase C26  34.44 
 
 
240 aa  102  4e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.792522  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2532  peptidase C26  35.64 
 
 
267 aa  102  4e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3960  peptidase C26  34.63 
 
 
313 aa  102  4e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0591478 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3033  peptidase C26  31.28 
 
 
254 aa  102  5e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.008786  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3226  peptidase C26  37.04 
 
 
285 aa  102  5e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12875  amidotransferase  35.93 
 
 
272 aa  102  6e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.853598  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3033  peptidase C26  38.04 
 
 
493 aa  101  7e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.998523  decreased coverage  0.0021965 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0108  peptidase C26  35.37 
 
 
258 aa  102  7e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4597  peptidase C26  33.18 
 
 
307 aa  101  7e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2887  peptidase C26  29.41 
 
 
268 aa  100  3e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0794  hypothetical protein  35.48 
 
 
267 aa  99.8  3e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0954  peptidase C26  35.4 
 
 
264 aa  99.4  4e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000028221  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3947  peptidase C26  28.33 
 
 
261 aa  99  5e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0505393  normal  0.911745 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3195  peptidase C26  29.68 
 
 
241 aa  99.4  5e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1848  peptidase C26  29.49 
 
 
251 aa  99  6e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.845506 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1945  glutamine amidotransferase, class I  31.56 
 
 
313 aa  98.2  8e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0746135  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0616  peptidase C26  32.1 
 
 
245 aa  98.2  8e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.206585  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4064  peptidase C26  33.72 
 
 
256 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.529097  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1964  peptidase C26  33.71 
 
 
239 aa  97.1  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.918763 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2155  peptidase C26  33.5 
 
 
250 aa  97.4  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000159832 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1549  peptidase C26  36.81 
 
 
258 aa  97.1  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12430  predicted glutamine amidotransferase  26.07 
 
 
247 aa  96.7  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124059  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2528  glutamine amidotransferase, class I  33.5 
 
 
250 aa  97.4  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1267  glutamine amidotransferase  33.16 
 
 
253 aa  96.7  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3002  peptidase C26  33.16 
 
 
253 aa  96.7  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00604755  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2184  peptidase C26  33.68 
 
 
275 aa  95.9  5e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.297323  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1477  peptidase C26  36.11 
 
 
237 aa  95.9  5e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3099  peptidase C26  32.63 
 
 
253 aa  95.5  5e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.015015  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3991  hypothetical protein  30.91 
 
 
229 aa  95.5  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0400316  normal  0.343275 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0717  peptidase C26  36.81 
 
 
479 aa  95.5  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.777258  normal  0.355316 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0388  putative glutamine amidotransferase  30.96 
 
 
250 aa  95.1  8e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.55028  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2920  peptidase C26  32.63 
 
 
253 aa  95.1  8e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.129807  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5208  peptidase C26  34.73 
 
 
295 aa  94.4  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>