More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_12430 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_12430  predicted glutamine amidotransferase  100 
 
 
247 aa  484  1e-136  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124059  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1636  peptidase C26  46.05 
 
 
252 aa  158  9e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.370641  normal  0.14821 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2465  peptidase C26  41.48 
 
 
247 aa  135  8e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000302907  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12875  amidotransferase  39.73 
 
 
272 aa  126  3e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.853598  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0319  peptidase C26  38.24 
 
 
233 aa  124  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.783639 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0075  peptidase C26  37.22 
 
 
244 aa  123  4e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.70164  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2164  peptidase C26  38.97 
 
 
233 aa  122  7e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000115799  hitchhiker  0.0000699279 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4415  peptidase C26  41.36 
 
 
255 aa  122  7e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2058  peptidase C26  38.33 
 
 
251 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0444  glutamine amidotransferase class I  31.98 
 
 
241 aa  119  3e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000517  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4207  peptidase C26  37.26 
 
 
298 aa  119  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.914824 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0361  peptidase C26  36.25 
 
 
253 aa  117  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1848  peptidase C26  37.82 
 
 
251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.845506 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3195  peptidase C26  38.12 
 
 
241 aa  116  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2041  peptidase C26  38.89 
 
 
240 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.755428  normal  0.5084 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4064  peptidase C26  37.28 
 
 
256 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.529097  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2104  peptidase C26  38.89 
 
 
240 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.297238  normal  0.0236912 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2077  peptidase C26  38.46 
 
 
233 aa  114  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4227  peptidase C26  37 
 
 
260 aa  113  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135339  normal  0.255877 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0799  peptidase C26  36.99 
 
 
235 aa  113  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1031  glutamine amidotransferase  30.49 
 
 
245 aa  114  2.0000000000000002e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000341197  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1789  glutamine amidotransferase  36.23 
 
 
241 aa  112  4.0000000000000004e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000030649  hitchhiker  5.3956e-25 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3925  peptidase C26  36.55 
 
 
240 aa  112  5e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.792522  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0438  peptidase C26  35.92 
 
 
255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35287  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0143  peptidase C26  41.14 
 
 
238 aa  108  8.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0651  glutamine amidotransferase class-I  34.32 
 
 
242 aa  107  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.64648  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2021  peptidase C26  38.14 
 
 
250 aa  107  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1757  peptidase C26  37.02 
 
 
231 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.721348  normal  0.077261 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2718  peptidase C26  30 
 
 
242 aa  107  2e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0577548  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2261  peptidase C26  30.74 
 
 
312 aa  106  4e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0730  peptidase C26  31.02 
 
 
238 aa  105  5e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2279  peptidase C26  35.81 
 
 
280 aa  105  6e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.249131 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3742  peptidase C26  30.99 
 
 
237 aa  105  6e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011892  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19230  predicted glutamine amidotransferase  32.61 
 
 
273 aa  105  7e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0453236 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1798  peptidase C26  37.08 
 
 
247 aa  105  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.720671 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2584  peptidase C26  36.45 
 
 
237 aa  105  8e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0482191  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3991  hypothetical protein  35.98 
 
 
229 aa  105  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0400316  normal  0.343275 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1878  hypothetical protein  33.04 
 
 
230 aa  105  9e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4408  peptidase C26  35.97 
 
 
262 aa  104  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21880  peptidase C26  32.52 
 
 
231 aa  102  5e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1940  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  33.33 
 
 
250 aa  102  6e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.343934 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3356  peptidase C26  31.11 
 
 
238 aa  102  6e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.95955  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01275  gamma-Glu-GABA hydrolase  32.81 
 
 
254 aa  101  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2893  peptidase C26  32.16 
 
 
233 aa  101  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.220365  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2155  peptidase C26  35.57 
 
 
250 aa  101  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000159832 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01286  hypothetical protein  32.81 
 
 
254 aa  101  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2536  peptidase C26  30.2 
 
 
237 aa  101  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2528  glutamine amidotransferase, class I  35.57 
 
 
250 aa  101  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1508  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  32.81 
 
 
254 aa  100  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3248  peptidase C26  35.5 
 
 
251 aa  100  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2327  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  32.81 
 
 
254 aa  100  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0063  peptidase C26  32.14 
 
 
242 aa  100  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.542911  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1429  glutamine amidotransferase (class I), putative  28.69 
 
 
231 aa  100  2e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1701  glutamine amidotransferase, class II/dipeptidase  33.48 
 
 
602 aa  100  3e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.176176 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2348  peptidase C26  32.41 
 
 
254 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.388942  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0954  peptidase C26  33.06 
 
 
264 aa  99.8  4e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000028221  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1413  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  32.41 
 
 
254 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1349  peptidase C26  29.67 
 
 
240 aa  99.4  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000385212  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1824  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  32.93 
 
 
250 aa  99.4  5e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0824878 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2184  peptidase C26  36.32 
 
 
275 aa  99.4  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.297323  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1964  peptidase C26  33.07 
 
 
239 aa  98.6  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.918763 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2941  glutamine amidotransferase related enzyme  31.13 
 
 
237 aa  97.1  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04810  predicted glutamine amidotransferase  31.06 
 
 
279 aa  97.4  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00756632  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2010  peptidase C26  34.68 
 
 
243 aa  97.8  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0361829  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0053  peptidase C26  34.69 
 
 
256 aa  96.7  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0388  putative glutamine amidotransferase  32.67 
 
 
250 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.55028  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4215  peptidase C26  32.27 
 
 
253 aa  96.7  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1775  glutamine amidotransferase  26.07 
 
 
227 aa  96.7  3e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000113696 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1297  peptidase C26  31.33 
 
 
259 aa  95.9  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.266099  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4678  hypothetical protein  30 
 
 
255 aa  95.9  6e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0616  peptidase C26  32.89 
 
 
245 aa  95.5  6e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.206585  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1797  glutamine amidotransferase  27.43 
 
 
238 aa  95.1  9e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.239238  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2112  glutamine amidotransferase class-I:peptidase C26  35.57 
 
 
260 aa  94.7  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0486861  normal  0.283308 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0954  putative amidotransferase  34.76 
 
 
251 aa  94.7  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.716357 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3159  peptidase C26  32.47 
 
 
261 aa  94  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2162  peptidase C26  28.96 
 
 
238 aa  94.4  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000124945  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3050  peptidase C26  31.23 
 
 
250 aa  93.6  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1141  putative transferase  37.85 
 
 
266 aa  93.6  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0928367 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0076  peptidase C26  35 
 
 
236 aa  93.2  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.0652283 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1072  peptidase C26  31.02 
 
 
259 aa  92.8  4e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1822  peptidase C26  33.48 
 
 
245 aa  92.4  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03870  putative glutamine amidotransferase  32.68 
 
 
250 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2887  peptidase C26  33.33 
 
 
268 aa  92.4  6e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48870  glutamine amidotransferase  35.46 
 
 
250 aa  92  8e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0900  peptidase C26  32.62 
 
 
399 aa  91.3  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.332784  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1477  peptidase C26  32.73 
 
 
237 aa  91.3  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1160  peptidase C26  37.33 
 
 
222 aa  91.7  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3558  peptidase C26  34.26 
 
 
257 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0888  peptidase C26  32.8 
 
 
427 aa  91.3  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0416  peptidase C26  34.13 
 
 
264 aa  90.1  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0393355  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3097  peptidase C26  30.53 
 
 
269 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.925767  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3033  peptidase C26  33.16 
 
 
493 aa  89.7  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.998523  decreased coverage  0.0021965 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2428  peptidase C26  32.13 
 
 
248 aa  89.4  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1549  peptidase C26  35.33 
 
 
258 aa  89.4  5e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3598  peptidase C26  30.09 
 
 
269 aa  89  7e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.420407  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4137  peptidase C26  33.72 
 
 
251 aa  88.6  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2179  peptidase C26  34.26 
 
 
257 aa  88.6  8e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3033  peptidase C26  31.37 
 
 
254 aa  88.6  8e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.008786  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2371  peptidase C26  32.26 
 
 
405 aa  88.6  9e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.167921  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0349  peptidase C26  30.08 
 
 
273 aa  88.6  9e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.232683  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>