More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4207 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4207  peptidase C26  100 
 
 		 298 aa  611  9.999999999999999e-175  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.914824 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0438  peptidase C26  84.8 
 
 		 255 aa  448  1e-125  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2523  peptidase C26  57.32 
 
 		 252 aa  264  1e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1822  peptidase C26  56.1 
 
 		 245 aa  259  4e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3050  peptidase C26  49.8 
 
 		 250 aa  233  4.0000000000000004e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4215  peptidase C26  49.4 
 
 		 253 aa  231  1e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2428  peptidase C26  48.77 
 
 		 248 aa  228  9e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3248  peptidase C26  44.58 
 
 		 251 aa  220  3e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3249  peptidase C26  51.03 
 
 		 250 aa  215  5.9999999999999996e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0053  peptidase C26  44.14 
 
 		 256 aa  192  4e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2164  peptidase C26  50.7 
 
 		 233 aa  184  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000115799  hitchhiker  0.0000699279 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21880  peptidase C26  43.33 
 
 		 231 aa  171  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2893  peptidase C26  40.65 
 
 		 233 aa  169  5e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.220365  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2162  peptidase C26  37.67 
 
 		 238 aa  157  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000124945  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2021  peptidase C26  38.43 
 
 		 250 aa  155  9e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2465  peptidase C26  41.94 
 
 		 247 aa  150  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000302907  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0361  peptidase C26  40.1 
 
 		 253 aa  150  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1878  hypothetical protein  39.15 
 
 		 230 aa  150  2e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1031  glutamine amidotransferase  37.16 
 
 		 245 aa  150  2e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000341197  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0319  peptidase C26  39.37 
 
 		 233 aa  147  1.0000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.783639 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1789  glutamine amidotransferase  39.49 
 
 		 241 aa  147  1.0000000000000001e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000030649  hitchhiker  5.3956e-25 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0954  peptidase C26  39.82 
 
 		 264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000028221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0075  peptidase C26  38.79 
 
 		 244 aa  147  3e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.70164  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0730  peptidase C26  32.16 
 
 		 238 aa  146  4.0000000000000006e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1701  glutamine amidotransferase, class II/dipeptidase  40.74 
 
 		 602 aa  144  2e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0444  glutamine amidotransferase class I  34.78 
 
 		 241 aa  142  9e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000517  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0799  peptidase C26  40.27 
 
 		 235 aa  142  9e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1963  peptidase C26  41.63 
 
 		 254 aa  141  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.153313  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3356  peptidase C26  37.69 
 
 		 238 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.95955  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1017  putative glutamine amidotransferase  37.4 
 
 		 238 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1349  peptidase C26  33.86 
 
 		 240 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000385212  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04810  predicted glutamine amidotransferase  36.77 
 
 		 279 aa  139  7e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00756632  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2718  peptidase C26  36.22 
 
 		 242 aa  139  7e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0577548  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1964  peptidase C26  38.14 
 
 		 239 aa  139  7e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.918763 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1757  peptidase C26  40.81 
 
 		 231 aa  138  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.721348  normal  0.077261 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3742  peptidase C26  34.98 
 
 		 237 aa  137  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0143  peptidase C26  40.93 
 
 		 238 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1636  peptidase C26  39.32 
 
 		 252 aa  135  8e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.370641  normal  0.14821 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4064  peptidase C26  37.79 
 
 		 256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.529097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2816  peptidase C26  40.28 
 
 		 255 aa  132  6.999999999999999e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2536  peptidase C26  35.81 
 
 		 237 aa  132  7.999999999999999e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2058  peptidase C26  40.44 
 
 		 251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12875  amidotransferase  37.5 
 
 		 272 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.853598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2041  peptidase C26  40.44 
 
 		 240 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.755428  normal  0.5084 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2104  peptidase C26  40.44 
 
 		 240 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.297238  normal  0.0236912 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1141  putative transferase  44.97 
 
 		 266 aa  130  3e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0928367 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0082  peptidase C26  40.19 
 
 		 236 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.831872  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0094  peptidase C26  40.19 
 
 		 236 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000432288  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0076  peptidase C26  40.19 
 
 		 236 aa  129  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1797  glutamine amidotransferase  37.27 
 
 		 238 aa  129  8.000000000000001e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.239238  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0416  peptidase C26  40.28 
 
 		 264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0393355  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1378  peptidase C26  33.86 
 
 		 253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.735257  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1477  peptidase C26  37.5 
 
 		 237 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0813  peptidase C26  36.28 
 
 		 264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.540694  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2010  peptidase C26  40.91 
 
 		 243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0361829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0063  peptidase C26  37.68 
 
 		 242 aa  127  3e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.542911  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1297  peptidase C26  35.81 
 
 		 259 aa  125  6e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.266099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0076  peptidase C26  38.32 
 
 		 236 aa  126  6e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.0652283 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0108  peptidase C26  41.5 
 
 		 258 aa  125  7e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2261  peptidase C26  32.09 
 
 		 312 aa  125  8.000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3033  peptidase C26  36.11 
 
 		 254 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.008786  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0455  glutamine amidotransferase, class I  41.04 
 
 		 356 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1429  glutamine amidotransferase (class I), putative  35.68 
 
 		 231 aa  125  1e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4137  peptidase C26  38.97 
 
 		 251 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0608  peptidase C26  42.78 
 
 		 237 aa  124  2e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.982002  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0983  peptidase C26  38.97 
 
 		 396 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.290196  normal  0.093467 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2970  peptidase C26  40.45 
 
 		 442 aa  123  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.397336  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3097  peptidase C26  39.25 
 
 		 269 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.925767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0545  peptidase C26  38.97 
 
 		 396 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.839837  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2910  peptidase C26  41.04 
 
 		 442 aa  123  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.486072  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3375  peptidase C26  39.25 
 
 		 259 aa  123  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.290232 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1024  peptidase C26  38.97 
 
 		 396 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3017  glutamine amidotransferase, class I  40.45 
 
 		 442 aa  123  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0973  glutamine amidotransferase, class I  41.04 
 
 		 444 aa  123  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0173  peptidase C26  41.04 
 
 		 444 aa  123  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2602  peptidase C26  41.04 
 
 		 444 aa  123  4e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.160668  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1617  glutamine amidotransferase, class I  40.46 
 
 		 444 aa  122  6e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0954  putative amidotransferase  40.46 
 
 		 251 aa  122  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.716357 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0888  peptidase C26  38.46 
 
 		 427 aa  122  6e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2371  peptidase C26  40.46 
 
 		 405 aa  122  7e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.167921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0900  peptidase C26  38.46 
 
 		 399 aa  122  7e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.332784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4227  peptidase C26  38.8 
 
 		 260 aa  122  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135339  normal  0.255877 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1082  peptidase C26  39.25 
 
 		 259 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.3752 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1367  peptidase C26  36.29 
 
 		 239 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3033  peptidase C26  41.34 
 
 		 493 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.998523  decreased coverage  0.0021965 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3677  Gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  38.79 
 
 		 259 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.272698 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3598  peptidase C26  38.32 
 
 		 269 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.420407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1549  peptidase C26  40.48 
 
 		 258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3195  peptidase C26  38.36 
 
 		 241 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2813  peptidase C26  37.12 
 
 		 269 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1072  peptidase C26  33.51 
 
 		 259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2184  peptidase C26  37.67 
 
 		 275 aa  120  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.297323  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0982  glutamine amidotransferase, class I  36.19 
 
 		 278 aa  120  3e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0921  glutamine amidotransferase, class I  36.19 
 
 		 278 aa  120  3e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.216457  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0616  peptidase C26  35.71 
 
 		 245 aa  120  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.206585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1775  glutamine amidotransferase  37.78 
 
 		 227 aa  120  3.9999999999999996e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000113696 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12430  predicted glutamine amidotransferase  37.26 
 
 		 247 aa  119  3.9999999999999996e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124059  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2528  glutamine amidotransferase, class I  37.56 
 
 		 250 aa  119  6e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2155  peptidase C26  37.56 
 
 		 250 aa  119  6e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159832 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0710  peptidase C26  33.2 
 
 		 263 aa  119  6e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.391948  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>